MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 38547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013525	CCA	2	6	54850	54855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013525	ATA	2	6	54900	54905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013525	AGG	2	6	54931	54936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013525	AT	3	6	54938	54943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013525	GATA	2	8	55032	55039	50 %	25 %	25 %	0 %	269925174
1006	NC_013525	AGA	2	6	55056	55061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925174
1007	NC_013525	ACT	2	6	55074	55079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925174
1008	NC_013525	CATA	2	8	55113	55120	50 %	25 %	0 %	25 %	269925174
1009	NC_013525	CGG	2	6	55157	55162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925174
1010	NC_013525	GAA	2	6	55167	55172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925174
1011	NC_013525	GCT	2	6	55203	55208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925174
1012	NC_013525	AAG	2	6	55211	55216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925174
1013	NC_013525	GCT	2	6	55264	55269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925174
1014	NC_013525	ATA	2	6	55324	55329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925174
1015	NC_013525	AAG	2	6	55337	55342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925174
1016	NC_013525	TGC	2	6	55349	55354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925174
1017	NC_013525	CAA	2	6	55500	55505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925174
1018	NC_013525	TAT	2	6	55674	55679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925174
1019	NC_013525	AAGAG	2	10	55680	55689	60 %	0 %	40 %	0 %	269925174
1020	NC_013525	GGTG	2	8	55713	55720	0 %	25 %	75 %	0 %	269925174
1021	NC_013525	GGC	2	6	55780	55785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925174
1022	NC_013525	A	6	6	55851	55856	100 %	0 %	0 %	0 %	269925174
1023	NC_013525	AGC	2	6	55878	55883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925174
1024	NC_013525	ACA	2	6	55913	55918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925174
1025	NC_013525	ATA	2	6	55921	55926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925174
1026	NC_013525	CAG	2	6	55968	55973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925175
1027	NC_013525	AGG	2	6	56065	56070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925175
1028	NC_013525	TTG	2	6	56090	56095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925175
1029	NC_013525	GGAT	2	8	56127	56134	25 %	25 %	50 %	0 %	269925175
1030	NC_013525	G	6	6	56149	56154	0 %	0 %	100 %	0 %	269925175
1031	NC_013525	CTC	2	6	56166	56171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925175
1032	NC_013525	AGA	2	6	56212	56217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925175
1033	NC_013525	TGAGCT	2	12	56227	56238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269925175
1034	NC_013525	GCTA	2	8	56278	56285	25 %	25 %	25 %	25 %	269925175
1035	NC_013525	TGG	2	6	56320	56325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925175
1036	NC_013525	CT	3	6	56328	56333	0 %	50 %	0 %	50 %	269925175
1037	NC_013525	AAG	2	6	56398	56403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925175
1038	NC_013525	AAG	2	6	56430	56435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925175
1039	NC_013525	CAT	2	6	56489	56494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925175
1040	NC_013525	ATA	2	6	56552	56557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925175
1041	NC_013525	GGA	2	6	56623	56628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925175
1042	NC_013525	TCA	2	6	56661	56666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925175
1043	NC_013525	AGCT	2	8	56671	56678	25 %	25 %	25 %	25 %	269925175
1044	NC_013525	ATTT	2	8	56748	56755	25 %	75 %	0 %	0 %	269925176
1045	NC_013525	TGC	2	6	56787	56792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925176
1046	NC_013525	TA	3	6	56844	56849	50 %	50 %	0 %	0 %	269925176
1047	NC_013525	TACA	2	8	56877	56884	50 %	25 %	0 %	25 %	269925176
1048	NC_013525	TTC	2	6	56901	56906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925176
1049	NC_013525	TTA	2	6	56977	56982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925176
1050	NC_013525	GAG	2	6	57004	57009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925176
1051	NC_013525	CTA	2	6	57080	57085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925176
1052	NC_013525	CAC	2	6	57086	57091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925176
1053	NC_013525	A	6	6	57096	57101	100 %	0 %	0 %	0 %	269925176
1054	NC_013525	TCC	2	6	57144	57149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925176
1055	NC_013525	AG	3	6	57168	57173	50 %	0 %	50 %	0 %	269925176
1056	NC_013525	ATC	2	6	57287	57292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013525	AGGA	2	8	57299	57306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013525	GCT	2	6	57414	57419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925177
1059	NC_013525	TGG	2	6	57488	57493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925177
1060	NC_013525	GA	3	6	57553	57558	50 %	0 %	50 %	0 %	269925177
1061	NC_013525	TAC	2	6	57589	57594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925177
1062	NC_013525	CAA	2	6	57614	57619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925177
1063	NC_013525	GCA	2	6	57678	57683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925177
1064	NC_013525	TA	3	6	57700	57705	50 %	50 %	0 %	0 %	269925177
1065	NC_013525	ATG	2	6	57747	57752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925177
1066	NC_013525	TGG	2	6	57764	57769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925177
1067	NC_013525	ACA	2	6	57781	57786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925177
1068	NC_013525	TCC	2	6	57828	57833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925177
1069	NC_013525	AAG	2	6	57879	57884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925177
1070	NC_013525	CAA	2	6	57953	57958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925177
1071	NC_013525	AAGA	2	8	58080	58087	75 %	0 %	25 %	0 %	269925177
1072	NC_013525	AGA	2	6	58163	58168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925177
1073	NC_013525	GAT	2	6	58182	58187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925177
1074	NC_013525	GAC	2	6	58245	58250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925177
1075	NC_013525	AGGGA	2	10	58278	58287	40 %	0 %	60 %	0 %	269925177
1076	NC_013525	GCT	2	6	58299	58304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925177
1077	NC_013525	GGCT	2	8	58379	58386	0 %	25 %	50 %	25 %	269925177
1078	NC_013525	GGACA	2	10	58459	58468	40 %	0 %	40 %	20 %	269925177
1079	NC_013525	TGA	2	6	58547	58552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925177
1080	NC_013525	GAAG	2	8	58582	58589	50 %	0 %	50 %	0 %	269925177
1081	NC_013525	CCA	2	6	58643	58648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_013525	TGG	2	6	58651	58656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013525	TAC	2	6	58662	58667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013525	ATC	2	6	58676	58681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013525	CAT	2	6	58693	58698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013525	TAA	2	6	58771	58776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013525	AC	3	6	58795	58800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_013525	TGG	2	6	58805	58810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925178
1089	NC_013525	GCCA	2	8	58859	58866	25 %	0 %	25 %	50 %	269925178
1090	NC_013525	AAGT	2	8	58902	58909	50 %	25 %	25 %	0 %	269925178
1091	NC_013525	TTG	3	9	58970	58978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925178
1092	NC_013525	A	6	6	59034	59039	100 %	0 %	0 %	0 %	269925178
1093	NC_013525	GCC	2	6	59050	59055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925178
1094	NC_013525	CAG	3	9	59083	59091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925178
1095	NC_013525	GCC	2	6	59140	59145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925179
1096	NC_013525	TTC	2	6	59183	59188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925179
1097	NC_013525	TGT	2	6	59208	59213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925179
1098	NC_013525	CT	4	8	59293	59300	0 %	50 %	0 %	50 %	269925179
1099	NC_013525	TTCC	2	8	59315	59322	0 %	50 %	0 %	50 %	269925179
1100	NC_013525	ACA	2	6	59326	59331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925179
1101	NC_013525	CCT	2	6	59365	59370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925179
1102	NC_013525	CT	3	6	59388	59393	0 %	50 %	0 %	50 %	269925179
1103	NC_013525	CAA	2	6	59437	59442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925179
1104	NC_013525	CAAAG	2	10	59447	59456	60 %	0 %	20 %	20 %	269925179
1105	NC_013525	AGC	2	6	59459	59464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925179
1106	NC_013525	TTC	2	6	59546	59551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_013525	TAAG	2	8	59595	59602	50 %	25 %	25 %	0 %	269925180
1108	NC_013525	AGT	2	6	59665	59670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925180
1109	NC_013525	TCA	2	6	59677	59682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925180
1110	NC_013525	AAG	2	6	59694	59699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925180
1111	NC_013525	ATC	2	6	59718	59723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925180
1112	NC_013525	ATA	2	6	59908	59913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925180
1113	NC_013525	CAT	2	6	59945	59950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925180
1114	NC_013525	CT	3	6	60018	60023	0 %	50 %	0 %	50 %	269925180
1115	NC_013525	CGA	2	6	60105	60110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925180
1116	NC_013525	ATG	2	6	60127	60132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925180
1117	NC_013525	AT	3	6	60170	60175	50 %	50 %	0 %	0 %	269925180
1118	NC_013525	CTA	2	6	60176	60181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925180
1119	NC_013525	CT	3	6	60216	60221	0 %	50 %	0 %	50 %	269925180
1120	NC_013525	CAA	2	6	60254	60259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925180
1121	NC_013525	CTCA	2	8	60300	60307	25 %	25 %	0 %	50 %	269925180
1122	NC_013525	TAG	2	6	60344	60349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925180
1123	NC_013525	TCT	2	6	60397	60402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925180
1124	NC_013525	AG	3	6	60433	60438	50 %	0 %	50 %	0 %	269925180
1125	NC_013525	CA	3	6	60503	60508	50 %	0 %	0 %	50 %	269925180
1126	NC_013525	CTG	2	6	60569	60574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925180
1127	NC_013525	CCG	2	6	60578	60583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925180
1128	NC_013525	CCG	2	6	60604	60609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925180
1129	NC_013525	T	6	6	60634	60639	0 %	100 %	0 %	0 %	269925180
1130	NC_013525	CA	3	6	60711	60716	50 %	0 %	0 %	50 %	269925180
1131	NC_013525	CAT	2	6	60749	60754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925180
1132	NC_013525	TA	3	6	60762	60767	50 %	50 %	0 %	0 %	269925180
1133	NC_013525	GATCT	2	10	60934	60943	20 %	40 %	20 %	20 %	269925180
1134	NC_013525	TTC	2	6	60962	60967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925180
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1137	NC_013525	TAT	2	6	61058	61063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925180
1138	NC_013525	TCT	2	6	61109	61114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925181
1139	NC_013525	TAGC	2	8	61128	61135	25 %	25 %	25 %	25 %	269925181
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1159	NC_013525	GAG	2	6	62260	62265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925182
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1176	NC_013525	CA	4	8	63272	63279	50 %	0 %	0 %	50 %	269925183
1177	NC_013525	AG	3	6	63300	63305	50 %	0 %	50 %	0 %	269925183
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1179	NC_013525	TCC	2	6	63587	63592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1180	NC_013525	TCT	2	6	63733	63738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925184
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1191	NC_013525	CTT	2	6	64192	64197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1192	NC_013525	CT	3	6	64214	64219	0 %	50 %	0 %	50 %	269925185
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1219	NC_013525	GAA	2	6	65653	65658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1236	NC_013525	CTG	2	6	66620	66625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925187
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1238	NC_013525	CTC	2	6	66647	66652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925187
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1241	NC_013525	ATC	2	6	66791	66796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925187
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1249	NC_013525	ACC	2	6	67199	67204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925187
1250	NC_013525	TCA	2	6	67212	67217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925187
1251	NC_013525	AGC	2	6	67226	67231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925187
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1253	NC_013525	AGG	2	6	67289	67294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925187
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1372	NC_013525	CTT	2	6	73321	73326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925194
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1374	NC_013525	TGC	2	6	73476	73481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925194
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1378	NC_013525	TTCC	2	8	73997	74004	0 %	50 %	0 %	50 %	269925194
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