MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 32311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	GGA	2	6	85	90	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013522	GTG	2	6	94	99	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
3	NC_013522	GCG	2	6	187	192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
4	NC_013522	CGG	2	6	231	236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
5	NC_013522	TCC	2	6	293	298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791620
6	NC_013522	GGA	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
7	NC_013522	AGA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
8	NC_013522	GCG	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
9	NC_013522	GTG	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
10	NC_013522	GGC	3	9	504	512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
11	NC_013522	GGT	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
12	NC_013522	AAC	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791620
13	NC_013522	CGA	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791620
14	NC_013522	AGG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
15	NC_013522	AAG	2	6	820	825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
16	NC_013522	GGT	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
17	NC_013522	GGA	2	6	873	878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
18	NC_013522	AGA	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
19	NC_013522	TCT	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791620
20	NC_013522	GTG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
21	NC_013522	CGC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791620
22	NC_013522	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
23	NC_013522	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791620
24	NC_013522	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791620
25	NC_013522	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791620
26	NC_013522	CAC	2	6	1344	1349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791620
27	NC_013522	GAA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
28	NC_013522	CGG	2	6	1444	1449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013522	GAG	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013522	TCT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013522	AGA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013522	AGA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013522	CCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
34	NC_013522	TCC	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
35	NC_013522	GCT	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791621
36	NC_013522	AAG	2	6	1923	1928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791621
37	NC_013522	GAG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
38	NC_013522	ACG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791621
39	NC_013522	CTC	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
40	NC_013522	CTC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
41	NC_013522	TGC	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791621
42	NC_013522	AGG	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
43	NC_013522	CGA	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791621
44	NC_013522	CAC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791621
45	NC_013522	GAT	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791621
46	NC_013522	TGG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791621
47	NC_013522	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791621
48	NC_013522	TGG	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791621
49	NC_013522	GAG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
50	NC_013522	GGA	2	6	2603	2608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
51	NC_013522	TCC	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
52	NC_013522	CCT	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
53	NC_013522	GGA	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
54	NC_013522	TTC	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791622
55	NC_013522	CCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791622
56	NC_013522	GCC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
57	NC_013522	CCG	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
58	NC_013522	GAG	3	9	3052	3060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
59	NC_013522	GCT	2	6	3093	3098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791622
60	NC_013522	GCC	2	6	3175	3180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
61	NC_013522	TGG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
62	NC_013522	GCC	2	6	3192	3197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
63	NC_013522	GGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
64	NC_013522	CGG	2	6	3274	3279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
65	NC_013522	GAG	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
66	NC_013522	CCT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791622
67	NC_013522	GCC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
68	NC_013522	GAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
69	NC_013522	CGG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
70	NC_013522	AGG	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
71	NC_013522	CGC	2	6	3645	3650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
72	NC_013522	GGT	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
73	NC_013522	GGT	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
74	NC_013522	TGG	3	9	3920	3928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
75	NC_013522	GGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
76	NC_013522	CTG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791623
77	NC_013522	GGC	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
78	NC_013522	TCC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791623
79	NC_013522	GGA	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
80	NC_013522	GGT	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
81	NC_013522	AGG	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
82	NC_013522	GAG	3	9	4552	4560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
83	NC_013522	TCT	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791623
84	NC_013522	GTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
85	NC_013522	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791623
86	NC_013522	GGT	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
87	NC_013522	CGT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791623
88	NC_013522	ACG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
89	NC_013522	GAG	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
90	NC_013522	TGG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
91	NC_013522	CGA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
92	NC_013522	CGA	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
93	NC_013522	GAC	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
94	NC_013522	GTG	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
95	NC_013522	GGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
96	NC_013522	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
97	NC_013522	GAG	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791624
98	NC_013522	CGT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791624
99	NC_013522	TCT	2	6	5900	5905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791624
100	NC_013522	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
101	NC_013522	CTC	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791624
102	NC_013522	GAT	3	9	5939	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791624
103	NC_013522	AAG	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791624
104	NC_013522	TGG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
105	NC_013522	GGA	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791624
106	NC_013522	GGT	2	6	6011	6016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
107	NC_013522	GCG	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791624
108	NC_013522	GTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791624
109	NC_013522	TAA	2	6	6285	6290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013522	CCA	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013522	TGA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013522	GGA	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013522	GGA	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013522	TGG	3	9	6582	6590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013522	CGC	2	6	6632	6637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013522	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013522	GGC	2	6	6879	6884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013522	GGC	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
119	NC_013522	GCG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
120	NC_013522	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791625
121	NC_013522	GGC	2	6	7244	7249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
122	NC_013522	CCG	2	6	7262	7267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791625
123	NC_013522	AGC	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791625
124	NC_013522	GCC	2	6	7285	7290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791625
125	NC_013522	GTG	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791625
126	NC_013522	CCA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791625
127	NC_013522	GGT	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791625
128	NC_013522	GGA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791625
129	NC_013522	GCC	2	6	7452	7457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791625
130	NC_013522	GAG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791625
131	NC_013522	AGG	2	6	7573	7578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791625
132	NC_013522	CCG	2	6	7594	7599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791625
133	NC_013522	ACG	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791625
134	NC_013522	TGG	2	6	7606	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791625
135	NC_013522	TCA	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791625
136	NC_013522	TGG	2	6	7771	7776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791625
137	NC_013522	GAG	2	6	7797	7802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791625
138	NC_013522	CTT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791625
139	NC_013522	GCG	2	6	7816	7821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
140	NC_013522	CAC	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791626
141	NC_013522	GGC	2	6	8349	8354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791626
142	NC_013522	CGT	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013522	GGC	2	6	8712	8717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791627
144	NC_013522	CAC	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791627
145	NC_013522	ACC	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791627
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147	NC_013522	GGA	2	6	9228	9233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791627
148	NC_013522	GTG	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791627
149	NC_013522	TAC	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791627
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152	NC_013522	GTG	2	6	9961	9966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791627
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154	NC_013522	ACT	2	6	10034	10039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791627
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159	NC_013522	CCA	2	6	10175	10180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791627
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163	NC_013522	TTG	2	6	10337	10342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013522	GGT	2	6	10411	10416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013522	TCA	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013522	GTA	2	6	10485	10490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013522	GGC	2	6	10563	10568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791628
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172	NC_013522	GTG	2	6	11173	11178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791628
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259	NC_013522	CTG	2	6	16547	16552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791633
260	NC_013522	GGC	2	6	16713	16718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791633
261	NC_013522	TGG	2	6	16725	16730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791633
262	NC_013522	GTT	2	6	16839	16844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269791633
263	NC_013522	GGA	2	6	16867	16872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791633
264	NC_013522	TGA	2	6	16890	16895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791633
265	NC_013522	CGG	2	6	16938	16943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791633
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267	NC_013522	GGA	2	6	17061	17066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791633
268	NC_013522	TGT	2	6	17225	17230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269791634
269	NC_013522	AAG	2	6	17281	17286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791634
270	NC_013522	GAA	2	6	17287	17292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791634
271	NC_013522	GGA	2	6	17321	17326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791634
272	NC_013522	GTC	2	6	17331	17336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791634
273	NC_013522	TGG	2	6	17432	17437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791634
274	NC_013522	GTT	2	6	17442	17447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269791634
275	NC_013522	TGG	2	6	17451	17456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791634
276	NC_013522	GGA	3	9	17493	17501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791634
277	NC_013522	GGC	2	6	17520	17525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791634
278	NC_013522	TGA	2	6	17603	17608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791634
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280	NC_013522	CTC	2	6	17622	17627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791634
281	NC_013522	GTG	2	6	17740	17745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791634
282	NC_013522	GTG	3	9	18109	18117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
283	NC_013522	CTG	2	6	18244	18249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791635
284	NC_013522	TGG	2	6	18281	18286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
285	NC_013522	CAT	2	6	18300	18305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791635
286	NC_013522	GGT	2	6	18372	18377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
287	NC_013522	GGA	2	6	18507	18512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791635
288	NC_013522	TAC	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791635
289	NC_013522	GGA	2	6	18588	18593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791635
290	NC_013522	GGC	2	6	18845	18850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791635
291	NC_013522	GCT	2	6	18856	18861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791635
292	NC_013522	TGG	3	9	18881	18889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
293	NC_013522	GGC	2	6	19078	19083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791635
294	NC_013522	CAT	2	6	19096	19101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791635
295	NC_013522	TGG	3	9	19256	19264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
296	NC_013522	TGG	2	6	19287	19292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
297	NC_013522	TCT	2	6	19420	19425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791636
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300	NC_013522	GTT	2	6	19528	19533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269791636
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309	NC_013522	TGG	2	6	20238	20243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791636
310	NC_013522	GGA	2	6	20344	20349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791636
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321	NC_013522	TGG	2	6	21499	21504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_013522	AGG	2	6	21508	21513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_013522	GGA	2	6	22087	22092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_013522	CGG	2	6	22346	22351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_013522	ATG	2	6	22373	22378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_013522	GCG	2	6	22710	22715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_013522	CCT	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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365	NC_013522	TGA	2	6	25124	25129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791639
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372	NC_013522	GAG	2	6	25633	25638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791639
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498	NC_013522	CTT	2	6	32151	32156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_013522	CAG	2	6	32199	32204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791646
500	NC_013522	CAG	2	6	32217	32222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791646

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