MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013522	ACGT	2	8	171155	171162	25 %	25 %	25 %	25 %	269791775
4003	NC_013522	AGG	2	6	171189	171194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791775
4004	NC_013522	GAC	2	6	171224	171229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791775
4005	NC_013522	GTG	2	6	171233	171238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791775
4006	NC_013522	TGACC	2	10	171256	171265	20 %	20 %	20 %	40 %	269791775
4007	NC_013522	GCT	2	6	171346	171351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791775
4008	NC_013522	CCG	2	6	171355	171360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791775
4009	NC_013522	GGA	2	6	171376	171381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791775
4010	NC_013522	GTCC	2	8	171397	171404	0 %	25 %	25 %	50 %	269791775
4011	NC_013522	G	6	6	171409	171414	0 %	0 %	100 %	0 %	269791775
4012	NC_013522	ATG	2	6	171431	171436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791775
4013	NC_013522	TCC	2	6	171495	171500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791775
4014	NC_013522	CCG	2	6	171511	171516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791775
4015	NC_013522	ACG	2	6	171540	171545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791775
4016	NC_013522	TGG	2	6	171546	171551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791775
4017	NC_013522	G	7	7	171560	171566	0 %	0 %	100 %	0 %	269791775
4018	NC_013522	TCC	2	6	171573	171578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791775
4019	NC_013522	GAG	2	6	171631	171636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791775
4020	NC_013522	ACG	2	6	171663	171668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791775
4021	NC_013522	CAA	2	6	171739	171744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791775
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4023	NC_013522	AGG	2	6	171863	171868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791776
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4032	NC_013522	GGT	2	6	172069	172074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791776
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4034	NC_013522	GGC	2	6	172177	172182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791776
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4043	NC_013522	GGAG	2	8	172338	172345	25 %	0 %	75 %	0 %	269791776
4044	NC_013522	AGC	2	6	172373	172378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791776
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4055	NC_013522	GGC	2	6	172987	172992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791776
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4057	NC_013522	CAC	2	6	173011	173016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791776
4058	NC_013522	GCC	2	6	173023	173028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791776
4059	NC_013522	CAT	2	6	173054	173059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_013522	C	6	6	173113	173118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4062	NC_013522	CTT	2	6	173135	173140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_013522	CCG	2	6	173204	173209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_013522	AG	3	6	173234	173239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013522	TCC	2	6	173247	173252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_013522	CCAG	2	8	173346	173353	25 %	0 %	25 %	50 %	269791777
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4104	NC_013522	CGG	3	9	174826	174834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791777
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4106	NC_013522	G	6	6	174954	174959	0 %	0 %	100 %	0 %	269791777
4107	NC_013522	GGA	2	6	174970	174975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791777
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4114	NC_013522	CGG	2	6	175133	175138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791778
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4119	NC_013522	GGGCCC	2	12	175352	175363	0 %	0 %	50 %	50 %	269791778
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4123	NC_013522	GGC	3	9	175483	175491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791778
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4247	NC_013522	AGCAGG	2	12	180291	180302	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269791780
4248	NC_013522	C	7	7	180365	180371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4249	NC_013522	TAT	2	6	180409	180414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_013522	AGGCC	2	10	180432	180441	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4251	NC_013522	CGG	2	6	180443	180448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_013522	GGCCT	2	10	180455	180464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4253	NC_013522	CGT	2	6	180478	180483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791781
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4263	NC_013522	CAT	2	6	180935	180940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791781
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4265	NC_013522	C	6	6	181083	181088	0 %	0 %	0 %	100 %	269791781
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4272	NC_013522	GTA	2	6	181436	181441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791781
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4278	NC_013522	G	16	16	181882	181897	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4279	NC_013522	TCC	2	6	182018	182023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791782
4280	NC_013522	C	6	6	182057	182062	0 %	0 %	0 %	100 %	269791782
4281	NC_013522	GGA	2	6	182094	182099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791782
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4290	NC_013522	CGG	2	6	182395	182400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791782
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4350	NC_013522	CAGGTT	2	12	184554	184565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269791783
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4353	NC_013522	AGGCGG	2	12	184699	184710	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269791783
4354	NC_013522	AGGCGG	2	12	184798	184809	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269791783
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4358	NC_013522	GGTC	2	8	184891	184898	0 %	25 %	50 %	25 %	269791783
4359	NC_013522	G	6	6	184904	184909	0 %	0 %	100 %	0 %	269791783
4360	NC_013522	GGT	2	6	184913	184918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791783
4361	NC_013522	GGTCCG	2	12	185000	185011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269791783
4362	NC_013522	CGACCC	2	12	185050	185061	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	269791783
4363	NC_013522	CCG	2	6	185076	185081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791783
4364	NC_013522	TCA	2	6	185122	185127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791783
4365	NC_013522	CGC	2	6	185150	185155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791783
4366	NC_013522	GGA	2	6	185203	185208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791783
4367	NC_013522	G	6	6	185240	185245	0 %	0 %	100 %	0 %	269791783
4368	NC_013522	TCC	2	6	185285	185290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791784
4369	NC_013522	GAGG	2	8	185313	185320	25 %	0 %	75 %	0 %	269791784
4370	NC_013522	CCA	2	6	185333	185338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791784
4371	NC_013522	G	6	6	185357	185362	0 %	0 %	100 %	0 %	269791784
4372	NC_013522	TCC	2	6	185497	185502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791784
4373	NC_013522	GGA	2	6	185508	185513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791784
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4375	NC_013522	GGA	2	6	185733	185738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791784
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4377	NC_013522	G	6	6	185782	185787	0 %	0 %	100 %	0 %	269791784
4378	NC_013522	CCT	2	6	185813	185818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791784
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4388	NC_013522	CGG	2	6	186310	186315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791784
4389	NC_013522	CAT	2	6	186336	186341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791784
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4393	NC_013522	C	6	6	186425	186430	0 %	0 %	0 %	100 %	269791784
4394	NC_013522	G	7	7	186435	186441	0 %	0 %	100 %	0 %	269791784
4395	NC_013522	TGG	3	9	186443	186451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791784
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4397	NC_013522	CTGCC	2	10	186476	186485	0 %	20 %	20 %	60 %	269791784
4398	NC_013522	AGG	2	6	186488	186493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791784
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4400	NC_013522	CGG	2	6	186554	186559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791784
4401	NC_013522	GAGGT	2	10	186589	186598	20 %	20 %	60 %	0 %	269791784
4402	NC_013522	GGC	4	12	186637	186648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791785
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4404	NC_013522	GTC	2	6	186676	186681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791785
4405	NC_013522	GTGG	2	8	186688	186695	0 %	25 %	75 %	0 %	269791785
4406	NC_013522	TGG	2	6	186717	186722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791785
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4409	NC_013522	CTG	2	6	186791	186796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791785
4410	NC_013522	GAG	2	6	186803	186808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791785
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4414	NC_013522	CACC	2	8	186958	186965	25 %	0 %	0 %	75 %	269791785
4415	NC_013522	GCG	2	6	186968	186973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791785
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4420	NC_013522	TCG	2	6	187055	187060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791785
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4422	NC_013522	GGT	2	6	187093	187098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791785
4423	NC_013522	CCT	2	6	187119	187124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791785
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4426	NC_013522	GGC	2	6	187225	187230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791785
4427	NC_013522	AAC	2	6	187304	187309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791785
4428	NC_013522	CGG	2	6	187334	187339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791785
4429	NC_013522	ACT	2	6	187413	187418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791785
4430	NC_013522	CGGT	2	8	187430	187437	0 %	25 %	50 %	25 %	269791785
4431	NC_013522	C	6	6	187481	187486	0 %	0 %	0 %	100 %	269791785
4432	NC_013522	CTT	2	6	187498	187503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791785
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4434	NC_013522	CCAT	2	8	187574	187581	25 %	25 %	0 %	50 %	269791785
4435	NC_013522	GGA	2	6	187590	187595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791785
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4438	NC_013522	TCA	2	6	187677	187682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791785
4439	NC_013522	CTG	2	6	187760	187765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791785
4440	NC_013522	CTG	2	6	187817	187822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791785
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4442	NC_013522	CGG	2	6	187869	187874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791785
4443	NC_013522	TGG	2	6	187887	187892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791785
4444	NC_013522	CTC	2	6	187909	187914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791785
4445	NC_013522	TGG	2	6	187925	187930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791785
4446	NC_013522	GGAAG	2	10	187938	187947	40 %	0 %	60 %	0 %	269791785
4447	NC_013522	AGGG	2	8	188014	188021	25 %	0 %	75 %	0 %	269791786
4448	NC_013522	TCC	2	6	188027	188032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791786
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4450	NC_013522	G	6	6	188120	188125	0 %	0 %	100 %	0 %	269791786
4451	NC_013522	TGG	2	6	188126	188131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791786
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4453	NC_013522	TTC	2	6	188227	188232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791786
4454	NC_013522	GGGAG	2	10	188237	188246	20 %	0 %	80 %	0 %	269791786
4455	NC_013522	TGGCCA	2	12	188288	188299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269791786
4456	NC_013522	GAG	2	6	188317	188322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791786
4457	NC_013522	TCG	2	6	188359	188364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791786
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4461	NC_013522	CTG	2	6	188647	188652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791786
4462	NC_013522	GTCC	2	8	188685	188692	0 %	25 %	25 %	50 %	269791786
4463	NC_013522	GAG	2	6	188764	188769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791786
4464	NC_013522	TTC	2	6	188776	188781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791786
4465	NC_013522	TCC	2	6	188863	188868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791786
4466	NC_013522	CTA	2	6	188931	188936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791786
4467	NC_013522	CAC	2	6	188989	188994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791786
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4470	NC_013522	TGG	2	6	189026	189031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791786
4471	NC_013522	TTC	2	6	189199	189204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791786
4472	NC_013522	G	6	6	189217	189222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_013522	CAG	2	6	189332	189337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791787
4474	NC_013522	CTC	2	6	189347	189352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791787
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4476	NC_013522	TCGCCT	2	12	189424	189435	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	269791787
4477	NC_013522	GTG	2	6	189441	189446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791787
4478	NC_013522	CTC	2	6	189488	189493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791787
4479	NC_013522	CTG	2	6	189504	189509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791787
4480	NC_013522	TGC	2	6	189610	189615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791787
4481	NC_013522	GCC	2	6	189660	189665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791787
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4484	NC_013522	GAG	2	6	190035	190040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791787
4485	NC_013522	CCG	2	6	190115	190120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791787
4486	NC_013522	GGT	2	6	190151	190156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791787
4487	NC_013522	CTC	2	6	190163	190168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791787
4488	NC_013522	GCG	2	6	190238	190243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791787
4489	NC_013522	GGC	2	6	190244	190249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791787
4490	NC_013522	GAG	2	6	190251	190256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791787
4491	NC_013522	ATG	2	6	190257	190262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791787
4492	NC_013522	CGG	2	6	190305	190310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791787
4493	NC_013522	GAG	3	9	190317	190325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791787
4494	NC_013522	GGC	2	6	190330	190335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791787
4495	NC_013522	TG	3	6	190360	190365	0 %	50 %	50 %	0 %	269791787
4496	NC_013522	ACG	2	6	190402	190407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791787
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4498	NC_013522	CGG	2	6	190473	190478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791787
4499	NC_013522	GGGGA	2	10	190498	190507	20 %	0 %	80 %	0 %	269791787
4500	NC_013522	GTG	2	6	190515	190520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791787

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