MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 38217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012883	TTCAGT	2	12	245643	245654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	242398243
5002	NC_012883	TGA	2	6	245663	245668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398243
5003	NC_012883	ACC	2	6	245739	245744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_012883	CTT	2	6	245792	245797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_012883	AT	3	6	245808	245813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012883	AG	3	6	245839	245844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012883	TTG	2	6	245939	245944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398244
5008	NC_012883	TCTA	2	8	245961	245968	25 %	50 %	0 %	25 %	242398244
5009	NC_012883	TTC	3	9	246015	246023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398244
5010	NC_012883	GCTC	2	8	246034	246041	0 %	25 %	25 %	50 %	242398244
5011	NC_012883	ATCT	2	8	246075	246082	25 %	50 %	0 %	25 %	242398244
5012	NC_012883	GCT	2	6	246115	246120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398244
5013	NC_012883	ATA	2	6	246131	246136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398244
5014	NC_012883	CTT	2	6	246149	246154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398244
5015	NC_012883	AGT	2	6	246179	246184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398244
5016	NC_012883	AGG	2	6	246232	246237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398244
5017	NC_012883	ATG	2	6	246250	246255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398244
5018	NC_012883	GTCTC	2	10	246292	246301	0 %	40 %	20 %	40 %	242398244
5019	NC_012883	TAT	2	6	246303	246308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398244
5020	NC_012883	TTCA	2	8	246333	246340	25 %	50 %	0 %	25 %	242398244
5021	NC_012883	TTA	2	6	246533	246538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398244
5022	NC_012883	T	6	6	246563	246568	0 %	100 %	0 %	0 %	242398244
5023	NC_012883	ATC	2	6	246615	246620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398244
5024	NC_012883	GTTC	2	8	246707	246714	0 %	50 %	25 %	25 %	242398244
5025	NC_012883	TCT	2	6	246715	246720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398244
5026	NC_012883	CTT	2	6	246728	246733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398244
5027	NC_012883	TTCCT	2	10	246753	246762	0 %	60 %	0 %	40 %	242398244
5028	NC_012883	CTC	2	6	246857	246862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398244
5029	NC_012883	ATT	2	6	246877	246882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398244
5030	NC_012883	CATCC	2	10	246908	246917	20 %	20 %	0 %	60 %	242398244
5031	NC_012883	CTT	2	6	246988	246993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398244
5032	NC_012883	CCA	2	6	247000	247005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398244
5033	NC_012883	TC	3	6	247029	247034	0 %	50 %	0 %	50 %	242398244
5034	NC_012883	TAA	2	6	247046	247051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398244
5035	NC_012883	TCC	2	6	247085	247090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398244
5036	NC_012883	ATC	2	6	247098	247103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398244
5037	NC_012883	TTA	2	6	247105	247110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398244
5038	NC_012883	TGT	2	6	247136	247141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398244
5039	NC_012883	AT	3	6	247201	247206	50 %	50 %	0 %	0 %	242398244
5040	NC_012883	CT	3	6	247228	247233	0 %	50 %	0 %	50 %	242398244
5041	NC_012883	TAA	2	6	247287	247292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012883	GAT	3	9	247337	247345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398245
5043	NC_012883	GATTG	2	10	247355	247364	20 %	40 %	40 %	0 %	242398245
5044	NC_012883	TCA	2	6	247371	247376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398245
5045	NC_012883	CAA	2	6	247438	247443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398245
5046	NC_012883	TGA	2	6	247589	247594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398245
5047	NC_012883	ATT	2	6	247680	247685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398245
5048	NC_012883	AGA	2	6	247738	247743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398245
5049	NC_012883	TAGA	2	8	247771	247778	50 %	25 %	25 %	0 %	242398245
5050	NC_012883	A	7	7	247778	247784	100 %	0 %	0 %	0 %	242398245
5051	NC_012883	CAAAT	2	10	247801	247810	60 %	20 %	0 %	20 %	242398245
5052	NC_012883	ACT	2	6	247826	247831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398245
5053	NC_012883	CAA	2	6	247922	247927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398245
5054	NC_012883	GAA	2	6	247932	247937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398245
5055	NC_012883	GTA	2	6	247950	247955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398245
5056	NC_012883	A	6	6	247971	247976	100 %	0 %	0 %	0 %	242398245
5057	NC_012883	ATCC	2	8	247989	247996	25 %	25 %	0 %	50 %	242398245
5058	NC_012883	A	6	6	248092	248097	100 %	0 %	0 %	0 %	242398245
5059	NC_012883	AGG	2	6	248141	248146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398245
5060	NC_012883	ATG	2	6	248155	248160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398245
5061	NC_012883	AGA	2	6	248171	248176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398245
5062	NC_012883	T	6	6	248184	248189	0 %	100 %	0 %	0 %	242398245
5063	NC_012883	AGA	2	6	248207	248212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_012883	TCC	2	6	248271	248276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398246
5065	NC_012883	CAT	2	6	248311	248316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398246
5066	NC_012883	CTT	2	6	248344	248349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398246
5067	NC_012883	TTC	2	6	248354	248359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398246
5068	NC_012883	CAC	2	6	248377	248382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398246
5069	NC_012883	CT	3	6	248418	248423	0 %	50 %	0 %	50 %	242398246
5070	NC_012883	CTT	2	6	248452	248457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398246
5071	NC_012883	GTA	2	6	248576	248581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398246
5072	NC_012883	CTT	2	6	248587	248592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398246
5073	NC_012883	TTA	2	6	248696	248701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012883	AGT	2	6	248773	248778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012883	AAAG	2	8	248815	248822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012883	TCA	2	6	248835	248840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_012883	G	6	6	248849	248854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_012883	ATTA	2	8	248877	248884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012883	A	6	6	248961	248966	100 %	0 %	0 %	0 %	242398247
5080	NC_012883	ATG	2	6	249070	249075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398248
5081	NC_012883	TC	3	6	249094	249099	0 %	50 %	0 %	50 %	242398248
5082	NC_012883	AAG	2	6	249259	249264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398248
5083	NC_012883	TAA	2	6	249293	249298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398248
5084	NC_012883	TAT	2	6	249320	249325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398248
5085	NC_012883	TTG	2	6	249386	249391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398248
5086	NC_012883	TAA	2	6	249447	249452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398248
5087	NC_012883	AGGGGA	2	12	249474	249485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398248
5088	NC_012883	ATA	2	6	249532	249537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398248
5089	NC_012883	GCA	2	6	249583	249588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398248
5090	NC_012883	GAT	2	6	249606	249611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398248
5091	NC_012883	GTT	2	6	249639	249644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398248
5092	NC_012883	T	6	6	249643	249648	0 %	100 %	0 %	0 %	242398248
5093	NC_012883	ATT	2	6	249790	249795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398248
5094	NC_012883	GTA	2	6	249803	249808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398248
5095	NC_012883	CAA	2	6	249887	249892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398248
5096	NC_012883	CAT	2	6	249908	249913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398248
5097	NC_012883	AAC	2	6	250058	250063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398248
5098	NC_012883	ATT	2	6	250101	250106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398248
5099	NC_012883	ACA	2	6	250186	250191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398248
5100	NC_012883	ATTCT	2	10	250236	250245	20 %	60 %	0 %	20 %	242398248
5101	NC_012883	GTG	2	6	250259	250264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398248
5102	NC_012883	AGC	2	6	250296	250301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398248
5103	NC_012883	TAA	2	6	250334	250339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398248
5104	NC_012883	AAAAG	2	10	250344	250353	80 %	0 %	20 %	0 %	242398248
5105	NC_012883	T	6	6	250361	250366	0 %	100 %	0 %	0 %	242398248
5106	NC_012883	CTGA	2	8	250387	250394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_012883	TCT	2	6	250395	250400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_012883	GAAAAA	2	12	250424	250435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012883	A	7	7	250518	250524	100 %	0 %	0 %	0 %	242398249
5110	NC_012883	AAG	2	6	250531	250536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398249
5111	NC_012883	G	6	6	250618	250623	0 %	0 %	100 %	0 %	242398249
5112	NC_012883	TTA	2	6	250664	250669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012883	CT	3	6	250695	250700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_012883	TTG	2	6	250701	250706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_012883	AAC	2	6	250735	250740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_012883	AGG	2	6	250745	250750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_012883	GAA	2	6	250779	250784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398250
5118	NC_012883	ATGGC	2	10	250977	250986	20 %	20 %	40 %	20 %	242398250
5119	NC_012883	TA	3	6	251056	251061	50 %	50 %	0 %	0 %	242398250
5120	NC_012883	TCA	2	6	251155	251160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398250
5121	NC_012883	AG	3	6	251187	251192	50 %	0 %	50 %	0 %	242398250
5122	NC_012883	TAC	2	6	251198	251203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398250
5123	NC_012883	GAA	2	6	251394	251399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398250
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5125	NC_012883	AACA	2	8	251459	251466	75 %	0 %	0 %	25 %	242398250
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5231	NC_012883	AG	4	8	257186	257193	50 %	0 %	50 %	0 %	242398254
5232	NC_012883	GAA	2	6	257194	257199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398254
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5237	NC_012883	GA	3	6	257492	257497	50 %	0 %	50 %	0 %	242398254
5238	NC_012883	CAGG	2	8	257509	257516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5239	NC_012883	TTTA	2	8	257521	257528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_012883	TA	3	6	257559	257564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_012883	T	6	6	257569	257574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_012883	GA	3	6	257575	257580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_012883	TGG	2	6	257656	257661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398255
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5245	NC_012883	TCT	2	6	257817	257822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398255
5246	NC_012883	TAG	2	6	257834	257839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398255
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5248	NC_012883	TCCTT	2	10	258275	258284	0 %	60 %	0 %	40 %	242398255
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