MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 2388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	ACCAC	2	10	1400	1409	40 %	0 %	0 %	60 %	220933194
2	NC_011901	TGCCC	2	10	2081	2090	0 %	20 %	20 %	60 %	220933195
3	NC_011901	CCCTG	2	10	2102	2111	0 %	20 %	20 %	60 %	220933195
4	NC_011901	TCGGG	2	10	3957	3966	0 %	20 %	60 %	20 %	220933196
5	NC_011901	TCACG	2	10	6806	6815	20 %	20 %	20 %	40 %	220933198
6	NC_011901	TGCGC	2	10	8425	8434	0 %	20 %	40 %	40 %	220933199
7	NC_011901	TTTGC	2	10	10690	10699	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011901	GCCTG	2	10	12489	12498	0 %	20 %	40 %	40 %	220933202
9	NC_011901	TGACC	2	10	13779	13788	20 %	20 %	20 %	40 %	220933205
10	NC_011901	TTCGC	2	10	16737	16746	0 %	40 %	20 %	40 %	220933209
11	NC_011901	GCACC	2	10	16791	16800	20 %	0 %	20 %	60 %	220933209
12	NC_011901	CCCGG	2	10	18581	18590	0 %	0 %	40 %	60 %	220933212
13	NC_011901	GATCG	2	10	20872	20881	20 %	20 %	40 %	20 %	220933214
14	NC_011901	GCCCC	2	10	22410	22419	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_011901	GGGGC	2	10	22428	22437	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011901	CGTGC	2	10	22998	23007	0 %	20 %	40 %	40 %	220933216
17	NC_011901	GCCCT	2	10	23624	23633	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
18	NC_011901	CCCTG	2	10	23835	23844	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
19	NC_011901	GGCGC	2	10	25145	25154	0 %	0 %	60 %	40 %	220933218
20	NC_011901	GCGCG	2	10	27195	27204	0 %	0 %	60 %	40 %	220933220
21	NC_011901	CGGCC	2	10	27961	27970	0 %	0 %	40 %	60 %	220933221
22	NC_011901	GAGAC	2	10	30269	30278	40 %	0 %	40 %	20 %	220933223
23	NC_011901	CCGGG	2	10	30283	30292	0 %	0 %	60 %	40 %	220933223
24	NC_011901	GGCAG	2	10	37717	37726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011901	GGCCA	2	10	40130	40139	20 %	0 %	40 %	40 %	220933231
26	NC_011901	GCGCG	2	10	40858	40867	0 %	0 %	60 %	40 %	220933231
27	NC_011901	CATCT	2	10	41718	41727	20 %	40 %	0 %	40 %	220933233
28	NC_011901	GCCGG	2	10	42380	42389	0 %	0 %	60 %	40 %	220933233
29	NC_011901	GCCCC	2	10	43250	43259	0 %	0 %	20 %	80 %	220933234
30	NC_011901	GTCCT	2	10	43920	43929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011901	CCCTT	2	10	46038	46047	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011901	GCCCC	3	15	48112	48126	0 %	0 %	20 %	80 %	220933241
33	NC_011901	GCCCC	2	10	48291	48300	0 %	0 %	20 %	80 %	220933241
34	NC_011901	GCCCC	2	10	49240	49249	0 %	0 %	20 %	80 %	220933242
35	NC_011901	CGAGC	2	10	50146	50155	20 %	0 %	40 %	40 %	220933243
36	NC_011901	CTGGC	2	10	50813	50822	0 %	20 %	40 %	40 %	220933244
37	NC_011901	CGCCC	2	10	51061	51070	0 %	0 %	20 %	80 %	220933244
38	NC_011901	GGGCC	2	10	51487	51496	0 %	0 %	60 %	40 %	220933244
39	NC_011901	GCGCC	2	10	52072	52081	0 %	0 %	40 %	60 %	220933244
40	NC_011901	GGGCC	2	10	52222	52231	0 %	0 %	60 %	40 %	220933244
41	NC_011901	CTGGC	2	10	52825	52834	0 %	20 %	40 %	40 %	220933245
42	NC_011901	CCGGG	2	10	53385	53394	0 %	0 %	60 %	40 %	220933245
43	NC_011901	TGATT	2	10	54377	54386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011901	CGGAA	2	10	54704	54713	40 %	0 %	40 %	20 %	220933247
45	NC_011901	TCACC	2	10	55953	55962	20 %	20 %	0 %	60 %	220933248
46	NC_011901	CGGCC	2	10	57478	57487	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_011901	GCGTG	2	10	60315	60324	0 %	20 %	60 %	20 %	220933253
48	NC_011901	CAAAA	2	10	61405	61414	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011901	GGTGG	2	10	64369	64378	0 %	20 %	80 %	0 %	220933259
50	NC_011901	GGTGT	2	10	66186	66195	0 %	40 %	60 %	0 %	220933260
51	NC_011901	TGCCA	2	10	67008	67017	20 %	20 %	20 %	40 %	220933261
52	NC_011901	GCTGG	2	10	67169	67178	0 %	20 %	60 %	20 %	220933261
53	NC_011901	TTCCG	2	10	69301	69310	0 %	40 %	20 %	40 %	220933264
54	NC_011901	TGAAC	2	10	71195	71204	40 %	20 %	20 %	20 %	220933265
55	NC_011901	GAGGC	2	10	73537	73546	20 %	0 %	60 %	20 %	220933267
56	NC_011901	TTGCC	2	10	74009	74018	0 %	40 %	20 %	40 %	220933267
57	NC_011901	GGCGC	2	10	75036	75045	0 %	0 %	60 %	40 %	220933268
58	NC_011901	CCATG	2	10	75744	75753	20 %	20 %	20 %	40 %	220933269
59	NC_011901	CCGGC	2	10	76472	76481	0 %	0 %	40 %	60 %	220933269
60	NC_011901	GGCGG	2	10	76587	76596	0 %	0 %	80 %	20 %	220933269
61	NC_011901	GCGGG	2	10	77463	77472	0 %	0 %	80 %	20 %	220933270
62	NC_011901	GGCTG	2	10	77489	77498	0 %	20 %	60 %	20 %	220933270
63	NC_011901	CTGTC	2	10	78986	78995	0 %	40 %	20 %	40 %	220933271
64	NC_011901	GGCCG	2	10	80407	80416	0 %	0 %	60 %	40 %	220933271
65	NC_011901	GGCGC	2	10	81746	81755	0 %	0 %	60 %	40 %	220933272
66	NC_011901	GGTGC	2	10	87186	87195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011901	GCACG	2	10	88841	88850	20 %	0 %	40 %	40 %	220933276
68	NC_011901	GCCCA	2	10	94698	94707	20 %	0 %	20 %	60 %	220933280
69	NC_011901	CAAGA	2	10	96121	96130	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011901	CCATG	2	10	97494	97503	20 %	20 %	20 %	40 %	220933282
71	NC_011901	GGCAA	2	10	103675	103684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011901	GCGCC	2	10	103893	103902	0 %	0 %	40 %	60 %	220933288
73	NC_011901	GTGGA	2	10	104812	104821	20 %	20 %	60 %	0 %	220933289
74	NC_011901	GCATC	2	10	105294	105303	20 %	20 %	20 %	40 %	220933289
75	NC_011901	GGCGA	2	10	105331	105340	20 %	0 %	60 %	20 %	220933289
76	NC_011901	GCCCC	2	10	105915	105924	0 %	0 %	20 %	80 %	220933289
77	NC_011901	GACCA	2	10	106538	106547	40 %	0 %	20 %	40 %	220933290
78	NC_011901	GGCGC	2	10	107061	107070	0 %	0 %	60 %	40 %	220933290
79	NC_011901	CATTC	2	10	107350	107359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011901	CGGTC	2	10	109376	109385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011901	CCCAG	2	10	111136	111145	20 %	0 %	20 %	60 %	220933292
82	NC_011901	GGCGC	2	10	111649	111658	0 %	0 %	60 %	40 %	220933292
83	NC_011901	GCGGG	2	10	112268	112277	0 %	0 %	80 %	20 %	220933292
84	NC_011901	CGGAT	2	10	112301	112310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011901	TGGTG	2	10	117217	117226	0 %	40 %	60 %	0 %	220933298
86	NC_011901	GCTGG	2	10	118583	118592	0 %	20 %	60 %	20 %	220933300
87	NC_011901	CGGGG	2	10	122299	122308	0 %	0 %	80 %	20 %	220933304
88	NC_011901	CCCCG	2	10	122334	122343	0 %	0 %	20 %	80 %	220933304
89	NC_011901	GGCCT	2	10	122396	122405	0 %	20 %	40 %	40 %	220933304
90	NC_011901	CCCGG	2	10	123032	123041	0 %	0 %	40 %	60 %	220933306
91	NC_011901	CTGAT	2	10	123085	123094	20 %	40 %	20 %	20 %	220933306
92	NC_011901	TCTTG	2	10	123686	123695	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011901	GCCGA	2	10	124347	124356	20 %	0 %	40 %	40 %	220933307
94	NC_011901	GGCGC	2	10	124643	124652	0 %	0 %	60 %	40 %	220933307
95	NC_011901	CCAGC	2	10	127360	127369	20 %	0 %	20 %	60 %	220933308
96	NC_011901	AGCTG	2	10	128117	128126	20 %	20 %	40 %	20 %	220933309
97	NC_011901	TGGCG	2	10	129863	129872	0 %	20 %	60 %	20 %	220933310
98	NC_011901	GCGCC	2	10	130525	130534	0 %	0 %	40 %	60 %	220933311
99	NC_011901	TGGCG	2	10	134378	134387	0 %	20 %	60 %	20 %	220933316
100	NC_011901	GTTCA	2	10	135311	135320	20 %	40 %	20 %	20 %	220933316
101	NC_011901	CTGCC	2	10	136059	136068	0 %	20 %	20 %	60 %	220933317
102	NC_011901	CAGGC	2	10	140568	140577	20 %	0 %	40 %	40 %	220933322
103	NC_011901	CGCCA	2	10	142894	142903	20 %	0 %	20 %	60 %	220933324
104	NC_011901	CGCCA	2	10	145613	145622	20 %	0 %	20 %	60 %	220933326
105	NC_011901	CAGGC	2	10	148665	148674	20 %	0 %	40 %	40 %	220933327
106	NC_011901	GGCCC	2	10	156858	156867	0 %	0 %	40 %	60 %	220933334
107	NC_011901	CAGGC	2	10	163372	163381	20 %	0 %	40 %	40 %	220933338
108	NC_011901	ACAAA	2	10	164170	164179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011901	GCGCT	2	10	165019	165028	0 %	20 %	40 %	40 %	220933339
110	NC_011901	ACGGG	2	10	165489	165498	20 %	0 %	60 %	20 %	220933340
111	NC_011901	GGTCC	2	10	165776	165785	0 %	20 %	40 %	40 %	220933340
112	NC_011901	CTGGC	2	10	166131	166140	0 %	20 %	40 %	40 %	220933340
113	NC_011901	TCGCC	2	10	166262	166271	0 %	20 %	20 %	60 %	220933340
114	NC_011901	GCGCC	2	10	169716	169725	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
115	NC_011901	GGTGC	2	10	169745	169754	0 %	20 %	60 %	20 %	220933343
116	NC_011901	CAGGG	2	10	169956	169965	20 %	0 %	60 %	20 %	220933343
117	NC_011901	GCCGC	2	10	169999	170008	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
118	NC_011901	CGGGG	2	10	171563	171572	0 %	0 %	80 %	20 %	220933343
119	NC_011901	CGGCG	2	10	172288	172297	0 %	0 %	60 %	40 %	220933343
120	NC_011901	GCGCG	2	10	174174	174183	0 %	0 %	60 %	40 %	220933344
121	NC_011901	AGCTG	2	10	174422	174431	20 %	20 %	40 %	20 %	220933344
122	NC_011901	ATCAC	2	10	175331	175340	40 %	20 %	0 %	40 %	220933344
123	NC_011901	AGGTC	2	10	175834	175843	20 %	20 %	40 %	20 %	220933345
124	NC_011901	AATCA	2	10	178136	178145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011901	CCTGC	2	10	178545	178554	0 %	20 %	20 %	60 %	220933349
126	NC_011901	GGCGC	2	10	180783	180792	0 %	0 %	60 %	40 %	220933353
127	NC_011901	GCCCT	2	10	181452	181461	0 %	20 %	20 %	60 %	220933354
128	NC_011901	GGGCG	2	10	182372	182381	0 %	0 %	80 %	20 %	220933354
129	NC_011901	GGGCC	2	10	183582	183591	0 %	0 %	60 %	40 %	220933357
130	NC_011901	CCGTG	2	10	184260	184269	0 %	20 %	40 %	40 %	220933357
131	NC_011901	CGGCA	2	10	185233	185242	20 %	0 %	40 %	40 %	220933358
132	NC_011901	TCCCG	2	10	186406	186415	0 %	20 %	20 %	60 %	220933358
133	NC_011901	GCCCC	2	10	187672	187681	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
134	NC_011901	GTCCG	2	10	190463	190472	0 %	20 %	40 %	40 %	220933361
135	NC_011901	TTCCA	2	10	200465	200474	20 %	40 %	0 %	40 %	220933369
136	NC_011901	GAAAT	2	10	201192	201201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011901	CGAGC	2	10	201720	201729	20 %	0 %	40 %	40 %	220933371
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139	NC_011901	CGCGG	2	10	202450	202459	0 %	0 %	60 %	40 %	220933371
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399	NC_011901	GCGCG	2	10	585642	585651	0 %	0 %	60 %	40 %	220933740
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401	NC_011901	GCTGG	2	10	587200	587209	0 %	20 %	60 %	20 %	220933742
402	NC_011901	CGGGT	2	10	587620	587629	0 %	20 %	60 %	20 %	220933742
403	NC_011901	CCGGG	2	10	587690	587699	0 %	0 %	60 %	40 %	220933742
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436	NC_011901	GCCCG	2	10	646204	646213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
437	NC_011901	GTGTC	2	10	647086	647095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_011901	GTCTT	2	10	655177	655186	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
444	NC_011901	ATTCC	2	10	656156	656165	20 %	40 %	0 %	40 %	220933802
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497	NC_011901	ATGCC	2	10	739679	739688	20 %	20 %	20 %	40 %	220933866
498	NC_011901	CCGAA	2	10	740050	740059	40 %	0 %	20 %	40 %	220933867
499	NC_011901	AATTA	2	10	742296	742305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011901	CGATC	2	10	742927	742936	20 %	20 %	20 %	40 %	220933870

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