MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011901	TGA	2	6	168136	168141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933341
4002	NC_011901	ATG	2	6	168226	168231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933342
4003	NC_011901	GT	4	8	168233	168240	0 %	50 %	50 %	0 %	220933342
4004	NC_011901	CG	3	6	168245	168250	0 %	0 %	50 %	50 %	220933342
4005	NC_011901	TGA	2	6	168299	168304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933342
4006	NC_011901	ATC	2	6	168330	168335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933342
4007	NC_011901	TA	3	6	168456	168461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011901	A	6	6	168527	168532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011901	GA	3	6	168609	168614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011901	TCT	2	6	168639	168644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011901	ATG	2	6	168750	168755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011901	CTG	2	6	168858	168863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4013	NC_011901	CAG	2	6	168896	168901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4014	NC_011901	GAT	2	6	168950	168955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933343
4015	NC_011901	CCGG	2	8	168968	168975	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4016	NC_011901	GGC	2	6	169004	169009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4017	NC_011901	GC	3	6	169008	169013	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4018	NC_011901	GCC	2	6	169052	169057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
4019	NC_011901	CGA	2	6	169087	169092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4020	NC_011901	GCCG	2	8	169133	169140	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4021	NC_011901	GGC	2	6	169187	169192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4022	NC_011901	GCCT	2	8	169217	169224	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
4023	NC_011901	GTC	2	6	169229	169234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4024	NC_011901	CGG	2	6	169317	169322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4025	NC_011901	CTC	2	6	169334	169339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
4026	NC_011901	GCC	2	6	169373	169378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
4027	NC_011901	GCC	2	6	169398	169403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
4028	NC_011901	CAG	2	6	169430	169435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4029	NC_011901	GCTC	2	8	169489	169496	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
4030	NC_011901	CCG	2	6	169512	169517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
4031	NC_011901	CGC	2	6	169531	169536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
4032	NC_011901	GCG	2	6	169641	169646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4033	NC_011901	CGG	2	6	169654	169659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4034	NC_011901	CGG	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4035	NC_011901	TTCCAG	2	12	169694	169705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933343
4036	NC_011901	GCGCC	2	10	169716	169725	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
4037	NC_011901	CAG	2	6	169739	169744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4038	NC_011901	GGTGC	2	10	169745	169754	0 %	20 %	60 %	20 %	220933343
4039	NC_011901	CGG	2	6	169777	169782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4040	NC_011901	CAG	2	6	169790	169795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4041	NC_011901	GC	3	6	169800	169805	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4042	NC_011901	CCCG	2	8	169825	169832	0 %	0 %	25 %	75 %	220933343
4043	NC_011901	CCCA	2	8	169857	169864	25 %	0 %	0 %	75 %	220933343
4044	NC_011901	CAC	2	6	169865	169870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933343
4045	NC_011901	GGC	3	9	169880	169888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4046	NC_011901	CGGG	2	8	169923	169930	0 %	0 %	75 %	25 %	220933343
4047	NC_011901	CAGGG	2	10	169956	169965	20 %	0 %	60 %	20 %	220933343
4048	NC_011901	CCA	2	6	169984	169989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933343
4049	NC_011901	GCCGC	2	10	169999	170008	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
4050	NC_011901	GGC	2	6	170090	170095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4051	NC_011901	CGCC	2	8	170169	170176	0 %	0 %	25 %	75 %	220933343
4052	NC_011901	GC	3	6	170220	170225	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4053	NC_011901	GCG	2	6	170265	170270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4054	NC_011901	GCG	2	6	170309	170314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4055	NC_011901	CAG	2	6	170315	170320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4056	NC_011901	CGGGCA	2	12	170335	170346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933343
4057	NC_011901	G	6	6	170369	170374	0 %	0 %	100 %	0 %	220933343
4058	NC_011901	CGG	2	6	170416	170421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4059	NC_011901	CGG	3	9	170452	170460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4060	NC_011901	CCAG	2	8	170485	170492	25 %	0 %	25 %	50 %	220933343
4061	NC_011901	GCG	2	6	170513	170518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4062	NC_011901	GCA	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4063	NC_011901	TCG	2	6	170571	170576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4064	NC_011901	CGTC	2	8	170596	170603	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
4065	NC_011901	TCC	2	6	170628	170633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
4066	NC_011901	CAG	2	6	170648	170653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4067	NC_011901	CAG	2	6	170675	170680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4068	NC_011901	GCG	2	6	170734	170739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4069	NC_011901	GGC	2	6	170759	170764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4070	NC_011901	CACCCG	2	12	170825	170836	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220933343
4071	NC_011901	CAG	2	6	170855	170860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4072	NC_011901	CAG	2	6	170954	170959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4073	NC_011901	GCG	2	6	171036	171041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4074	NC_011901	GGT	2	6	171071	171076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933343
4075	NC_011901	TCG	2	6	171129	171134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4076	NC_011901	GCA	2	6	171166	171171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
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4078	NC_011901	GC	4	8	171263	171270	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4079	NC_011901	GC	3	6	171291	171296	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4080	NC_011901	TCG	2	6	171309	171314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4081	NC_011901	GCA	2	6	171349	171354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4082	NC_011901	TGC	2	6	171363	171368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
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4086	NC_011901	TG	3	6	171424	171429	0 %	50 %	50 %	0 %	220933343
4087	NC_011901	CCAG	2	8	171433	171440	25 %	0 %	25 %	50 %	220933343
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4089	NC_011901	GC	3	6	171484	171489	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
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4091	NC_011901	CGGGG	2	10	171563	171572	0 %	0 %	80 %	20 %	220933343
4092	NC_011901	TCC	2	6	171600	171605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
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4095	NC_011901	GC	3	6	171769	171774	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
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4102	NC_011901	CAG	2	6	172073	172078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4103	NC_011901	CCA	2	6	172183	172188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933343
4104	NC_011901	TGG	2	6	172237	172242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933343
4105	NC_011901	CGA	2	6	172243	172248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4106	NC_011901	CTC	2	6	172277	172282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
4107	NC_011901	CGGCG	2	10	172288	172297	0 %	0 %	60 %	40 %	220933343
4108	NC_011901	GTG	2	6	172316	172321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933343
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4118	NC_011901	CAG	3	9	172853	172861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
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4122	NC_011901	GCG	2	6	173014	173019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
4123	NC_011901	CG	3	6	173018	173023	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
4124	NC_011901	CGT	2	6	173038	173043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
4125	NC_011901	GCG	2	6	173059	173064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
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4133	NC_011901	GTGG	2	8	173261	173268	0 %	25 %	75 %	0 %	220933343
4134	NC_011901	TGA	2	6	173284	173289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_011901	TGA	2	6	173399	173404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_011901	GTA	2	6	173497	173502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_011901	A	8	8	173502	173509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_011901	GC	3	6	173523	173528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4154	NC_011901	ATCT	2	8	174244	174251	25 %	50 %	0 %	25 %	220933344
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4242	NC_011901	CAT	2	6	178068	178073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_011901	GCAA	2	8	178093	178100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4244	NC_011901	AATCA	2	10	178136	178145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4245	NC_011901	TCC	2	6	178154	178159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_011901	C	7	7	178240	178246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4247	NC_011901	CCA	2	6	178256	178261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933349
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4260	NC_011901	ATG	2	6	178827	178832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_011901	C	7	7	178949	178955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4263	NC_011901	GCG	2	6	178980	178985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4347	NC_011901	AGG	2	6	182447	182452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4348	NC_011901	GCA	2	6	182456	182461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4349	NC_011901	TC	3	6	182578	182583	0 %	50 %	0 %	50 %	220933355
4350	NC_011901	CGC	2	6	182598	182603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933355
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4352	NC_011901	ATC	2	6	182617	182622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933355
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4354	NC_011901	GC	3	6	182673	182678	0 %	0 %	50 %	50 %	220933355
4355	NC_011901	CGT	2	6	182695	182700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933355
4356	NC_011901	GC	3	6	182722	182727	0 %	0 %	50 %	50 %	220933355
4357	NC_011901	GAG	2	6	182731	182736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933355
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4361	NC_011901	AGC	2	6	182876	182881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933355
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4363	NC_011901	GTG	2	6	183014	183019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_011901	CG	3	6	183066	183071	0 %	0 %	50 %	50 %	220933356
4365	NC_011901	GTA	2	6	183099	183104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933356
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4367	NC_011901	CGG	2	6	183161	183166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933356
4368	NC_011901	CGC	2	6	183200	183205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933356
4369	NC_011901	GGC	2	6	183212	183217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933356
4370	NC_011901	AGT	2	6	183227	183232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933356
4371	NC_011901	CAG	2	6	183246	183251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933356
4372	NC_011901	GGT	2	6	183272	183277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933356
4373	NC_011901	GCC	2	6	183292	183297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933356
4374	NC_011901	GGC	2	6	183327	183332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933356
4375	NC_011901	ATCA	2	8	183354	183361	50 %	25 %	0 %	25 %	220933356
4376	NC_011901	CCG	2	6	183437	183442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933357
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4406	NC_011901	CGC	2	6	184304	184309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933357
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4417	NC_011901	AGC	2	6	184682	184687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4419	NC_011901	GGC	2	6	184867	184872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933358
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4423	NC_011901	TACC	2	8	185034	185041	25 %	25 %	0 %	50 %	220933358
4424	NC_011901	GCA	2	6	185054	185059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933358
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4472	NC_011901	A	6	6	187251	187256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4473	NC_011901	GCG	2	6	187264	187269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4474	NC_011901	C	6	6	187356	187361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4475	NC_011901	GC	3	6	187373	187378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4476	NC_011901	TTGT	2	8	187398	187405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4477	NC_011901	TGA	2	6	187481	187486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933359
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4479	NC_011901	CGT	2	6	187610	187615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933359
4480	NC_011901	GCCCC	2	10	187672	187681	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4481	NC_011901	T	8	8	187691	187698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_011901	CAT	2	6	187877	187882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933360
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4484	NC_011901	AACCTG	2	12	188004	188015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220933360
4485	NC_011901	GCG	2	6	188050	188055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
4486	NC_011901	CTGG	2	8	188075	188082	0 %	25 %	50 %	25 %	220933360
4487	NC_011901	GCT	2	6	188114	188119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933360
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4489	NC_011901	TCA	2	6	188146	188151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933360
4490	NC_011901	GAC	2	6	188163	188168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933360
4491	NC_011901	CAA	2	6	188216	188221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933360
4492	NC_011901	TGG	2	6	188485	188490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933360
4493	NC_011901	GCG	2	6	188500	188505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
4494	NC_011901	CGG	2	6	188525	188530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
4495	NC_011901	GCG	2	6	188587	188592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
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4498	NC_011901	ACA	2	6	188850	188855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_011901	GCG	2	6	188917	188922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_011901	ATCC	2	8	188963	188970	25 %	25 %	0 %	50 %	220933361

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