MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011901	CTG	2	6	147679	147684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3502	NC_011901	TGG	2	6	147738	147743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933327
3503	NC_011901	GCCC	2	8	147790	147797	0 %	0 %	25 %	75 %	220933327
3504	NC_011901	GGCT	2	8	147798	147805	0 %	25 %	50 %	25 %	220933327
3505	NC_011901	GTT	2	6	147806	147811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933327
3506	NC_011901	TGG	2	6	147846	147851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933327
3507	NC_011901	GCG	2	6	147896	147901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327
3508	NC_011901	ATCG	2	8	147911	147918	25 %	25 %	25 %	25 %	220933327
3509	NC_011901	ACC	2	6	148087	148092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933327
3510	NC_011901	TCGT	2	8	148116	148123	0 %	50 %	25 %	25 %	220933327
3511	NC_011901	CGC	2	6	148312	148317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
3512	NC_011901	GCTC	2	8	148357	148364	0 %	25 %	25 %	50 %	220933327
3513	NC_011901	TCC	2	6	148386	148391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933327
3514	NC_011901	GGCC	2	8	148571	148578	0 %	0 %	50 %	50 %	220933327
3515	NC_011901	CAGGC	2	10	148665	148674	20 %	0 %	40 %	40 %	220933327
3516	NC_011901	CGT	2	6	148696	148701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3517	NC_011901	GCT	2	6	148812	148817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3518	NC_011901	CGG	2	6	148877	148882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327
3519	NC_011901	TCC	2	6	148887	148892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933327
3520	NC_011901	GCT	2	6	148956	148961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3521	NC_011901	GCT	2	6	148983	148988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3522	NC_011901	GAAA	2	8	149109	149116	75 %	0 %	25 %	0 %	220933327
3523	NC_011901	GGC	2	6	149167	149172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327
3524	NC_011901	TG	3	6	149479	149484	0 %	50 %	50 %	0 %	220933327
3525	NC_011901	GCC	2	6	149499	149504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
3526	NC_011901	CCG	4	12	149590	149601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
3527	NC_011901	GCA	2	6	149625	149630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3528	NC_011901	CCG	2	6	149677	149682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
3529	NC_011901	GCA	2	6	149719	149724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3530	NC_011901	CGA	2	6	149725	149730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3531	NC_011901	CTGC	2	8	149737	149744	0 %	25 %	25 %	50 %	220933327
3532	NC_011901	AGA	2	6	149745	149750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933327
3533	NC_011901	GCT	2	6	149842	149847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3534	NC_011901	GCT	2	6	149855	149860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3535	NC_011901	GCA	2	6	149890	149895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3536	NC_011901	CG	3	6	149913	149918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_011901	GT	3	6	149939	149944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011901	TGA	2	6	150007	150012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011901	G	6	6	150151	150156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011901	GAAT	2	8	150191	150198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011901	CGG	2	6	150259	150264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_011901	G	7	7	150263	150269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011901	GCG	2	6	150272	150277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_011901	TGA	2	6	150288	150293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011901	GGT	4	12	150327	150338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011901	CGC	2	6	150399	150404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_011901	CTC	2	6	150450	150455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_011901	GCG	2	6	150490	150495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_011901	CCA	2	6	150551	150556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_011901	CCAGGC	2	12	150560	150571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_011901	CGT	2	6	150639	150644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_011901	GCCT	2	8	150649	150656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_011901	CTC	2	6	150700	150705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_011901	AGC	2	6	150730	150735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011901	CGAA	2	8	150820	150827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_011901	CGG	2	6	150911	150916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_011901	GCC	2	6	150926	150931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_011901	CGG	3	9	150959	150967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_011901	TCC	2	6	151024	151029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933328
3560	NC_011901	GGC	2	6	151030	151035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933328
3561	NC_011901	GCT	2	6	151074	151079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3562	NC_011901	CTG	3	9	151093	151101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3563	NC_011901	TGC	2	6	151142	151147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3564	NC_011901	CTG	2	6	151183	151188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3565	NC_011901	CCG	2	6	151209	151214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933328
3566	NC_011901	GCG	2	6	151268	151273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933328
3567	NC_011901	CTG	2	6	151276	151281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3568	NC_011901	TCA	2	6	151286	151291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933328
3569	NC_011901	CTG	2	6	151300	151305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3570	NC_011901	CCTGGC	2	12	151314	151325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933328
3571	NC_011901	CTG	2	6	151327	151332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3572	NC_011901	TCCC	2	8	151352	151359	0 %	25 %	0 %	75 %	220933328
3573	NC_011901	GTGCTG	2	12	151372	151383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220933328
3574	NC_011901	GAG	2	6	151447	151452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933328
3575	NC_011901	CTG	2	6	151477	151482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3576	NC_011901	GCC	2	6	151492	151497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933328
3577	NC_011901	TGC	2	6	151505	151510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3578	NC_011901	GGC	2	6	151535	151540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933328
3579	NC_011901	CGC	2	6	151590	151595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933328
3580	NC_011901	AGG	2	6	151601	151606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933328
3581	NC_011901	CTG	2	6	151618	151623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3582	NC_011901	CTG	2	6	151630	151635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3583	NC_011901	ACC	2	6	151642	151647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933328
3584	NC_011901	CTGG	2	8	151668	151675	0 %	25 %	50 %	25 %	220933328
3585	NC_011901	TGG	2	6	151730	151735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933328
3586	NC_011901	CTGC	2	8	151767	151774	0 %	25 %	25 %	50 %	220933328
3587	NC_011901	TC	3	6	151790	151795	0 %	50 %	0 %	50 %	220933328
3588	NC_011901	CTG	2	6	151874	151879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_011901	CGC	2	6	151888	151893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_011901	GCC	2	6	151898	151903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3591	NC_011901	CTG	2	6	151904	151909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3592	NC_011901	CCG	2	6	151920	151925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3593	NC_011901	GCTG	2	8	151938	151945	0 %	25 %	50 %	25 %	220933329
3594	NC_011901	CTG	2	6	152102	152107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3595	NC_011901	TAC	2	6	152150	152155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933329
3596	NC_011901	CTG	2	6	152180	152185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3597	NC_011901	GCC	2	6	152186	152191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3598	NC_011901	TGG	2	6	152229	152234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933329
3599	NC_011901	GGC	2	6	152284	152289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3600	NC_011901	GGC	2	6	152305	152310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3601	NC_011901	GGCT	2	8	152345	152352	0 %	25 %	50 %	25 %	220933329
3602	NC_011901	CTGG	2	8	152356	152363	0 %	25 %	50 %	25 %	220933329
3603	NC_011901	AGG	2	6	152388	152393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933329
3604	NC_011901	GCG	2	6	152399	152404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3605	NC_011901	GCA	2	6	152425	152430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3606	NC_011901	GCCGGC	2	12	152498	152509	0 %	0 %	50 %	50 %	220933329
3607	NC_011901	GCG	2	6	152525	152530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3608	NC_011901	GCC	4	12	152546	152557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3609	NC_011901	GCC	3	9	152567	152575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3610	NC_011901	CCG	2	6	152610	152615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933329
3611	NC_011901	GCG	2	6	152649	152654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3612	NC_011901	TGG	2	6	152655	152660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933329
3613	NC_011901	GGC	2	6	152669	152674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933329
3614	NC_011901	CGA	2	6	152707	152712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3615	NC_011901	CGA	2	6	152725	152730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933329
3616	NC_011901	CG	3	6	152791	152796	0 %	0 %	50 %	50 %	220933329
3617	NC_011901	CAG	2	6	152976	152981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933330
3618	NC_011901	GCA	2	6	153035	153040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933330
3619	NC_011901	CG	4	8	153061	153068	0 %	0 %	50 %	50 %	220933330
3620	NC_011901	ACC	2	6	153088	153093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933330
3621	NC_011901	CCG	2	6	153107	153112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933330
3622	NC_011901	AGA	2	6	153122	153127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933330
3623	NC_011901	CCT	2	6	153134	153139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933330
3624	NC_011901	TCC	2	6	153154	153159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933330
3625	NC_011901	CGC	2	6	153235	153240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933330
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3627	NC_011901	CGG	2	6	153425	153430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933330
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3642	NC_011901	GAT	2	6	153888	153893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933330
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3652	NC_011901	CAG	2	6	154422	154427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933331
3653	NC_011901	GAT	2	6	154663	154668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_011901	CAT	2	6	154686	154691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3655	NC_011901	GC	3	6	154782	154787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3656	NC_011901	CG	3	6	154802	154807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3657	NC_011901	CGG	2	6	154857	154862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3658	NC_011901	AAC	2	6	154895	154900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3659	NC_011901	TGCG	2	8	154904	154911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3660	NC_011901	GC	3	6	154943	154948	0 %	0 %	50 %	50 %	220933332
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3682	NC_011901	CAG	2	6	155582	155587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933333
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3709	NC_011901	GTG	2	6	156505	156510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3710	NC_011901	TGC	2	6	156529	156534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933334
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3720	NC_011901	GGC	2	6	156914	156919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933334
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3722	NC_011901	CCA	3	9	157160	157168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933334
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3727	NC_011901	GAT	3	9	157506	157514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933334
3728	NC_011901	CTC	2	6	157590	157595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933334
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3730	NC_011901	TGC	2	6	157610	157615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933334
3731	NC_011901	C	6	6	157699	157704	0 %	0 %	0 %	100 %	220933334
3732	NC_011901	CG	3	6	157789	157794	0 %	0 %	50 %	50 %	220933334
3733	NC_011901	GGT	2	6	157797	157802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933334
3734	NC_011901	CGG	2	6	157874	157879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933334
3735	NC_011901	GAT	2	6	157890	157895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933334
3736	NC_011901	CGACGT	2	12	157898	157909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933334
3737	NC_011901	GGT	2	6	157946	157951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3738	NC_011901	CG	3	6	158031	158036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3739	NC_011901	CCA	2	6	158046	158051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3740	NC_011901	TGC	2	6	158071	158076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3741	NC_011901	CAT	2	6	158118	158123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933335
3742	NC_011901	TCA	2	6	158189	158194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933335
3743	NC_011901	GGT	2	6	158196	158201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933335
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3745	NC_011901	CGC	2	6	158241	158246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933335
3746	NC_011901	CGG	2	6	158255	158260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933335
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3865	NC_011901	CGT	2	6	162782	162787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933338
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3992	NC_011901	GAC	2	6	167757	167762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3993	NC_011901	GCG	2	6	167779	167784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3994	NC_011901	CGG	2	6	167794	167799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3995	NC_011901	GT	3	6	167815	167820	0 %	50 %	50 %	0 %	220933340
3996	NC_011901	CGC	2	6	167832	167837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3997	NC_011901	TGC	2	6	167862	167867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_011901	GC	3	6	167866	167871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_011901	TG	3	6	168003	168008	0 %	50 %	50 %	0 %	220933341
4000	NC_011901	TGC	2	6	168012	168017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933341

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