MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011901	GCT	2	6	125301	125306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3002	NC_011901	GC	4	8	125390	125397	0 %	0 %	50 %	50 %	220933308
3003	NC_011901	CGC	3	9	125395	125403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3004	NC_011901	CAGG	2	8	125443	125450	25 %	0 %	50 %	25 %	220933308
3005	NC_011901	GAGGTT	2	12	125527	125538	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220933308
3006	NC_011901	GCA	3	9	125694	125702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3007	NC_011901	GTC	2	6	125723	125728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3008	NC_011901	CTG	2	6	125776	125781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3009	NC_011901	GC	3	6	125831	125836	0 %	0 %	50 %	50 %	220933308
3010	NC_011901	GC	3	6	125879	125884	0 %	0 %	50 %	50 %	220933308
3011	NC_011901	GGC	2	6	125887	125892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3012	NC_011901	GGC	2	6	125956	125961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3013	NC_011901	GCA	2	6	126018	126023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3014	NC_011901	GCC	2	6	126024	126029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3015	NC_011901	CCG	2	6	126035	126040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3016	NC_011901	GGTC	2	8	126063	126070	0 %	25 %	50 %	25 %	220933308
3017	NC_011901	GC	3	6	126106	126111	0 %	0 %	50 %	50 %	220933308
3018	NC_011901	CCA	2	6	126159	126164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933308
3019	NC_011901	CGG	2	6	126189	126194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3020	NC_011901	GGTCCA	2	12	126216	126227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3021	NC_011901	GCA	3	9	126228	126236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3022	NC_011901	GC	3	6	126265	126270	0 %	0 %	50 %	50 %	220933308
3023	NC_011901	TCG	2	6	126326	126331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3024	NC_011901	CCA	2	6	126393	126398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933308
3025	NC_011901	TGC	2	6	126438	126443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3026	NC_011901	GTC	2	6	126459	126464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3027	NC_011901	C	6	6	126494	126499	0 %	0 %	0 %	100 %	220933308
3028	NC_011901	CGC	2	6	126507	126512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3029	NC_011901	CGG	2	6	126544	126549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3030	NC_011901	GGC	2	6	126643	126648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3031	NC_011901	TGA	2	6	126654	126659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933308
3032	NC_011901	CGCC	2	8	126699	126706	0 %	0 %	25 %	75 %	220933308
3033	NC_011901	GGC	2	6	126718	126723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3034	NC_011901	TGG	2	6	126731	126736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933308
3035	NC_011901	TCG	2	6	126866	126871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3036	NC_011901	GGC	2	6	126906	126911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933308
3037	NC_011901	AGT	2	6	126969	126974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933308
3038	NC_011901	CCA	2	6	126975	126980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933308
3039	NC_011901	AGC	2	6	127067	127072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3040	NC_011901	AGA	2	6	127080	127085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933308
3041	NC_011901	GTC	2	6	127102	127107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3042	NC_011901	CAG	2	6	127111	127116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3043	NC_011901	CAG	2	6	127165	127170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3044	NC_011901	GCC	2	6	127187	127192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3045	NC_011901	CAC	2	6	127213	127218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933308
3046	NC_011901	GCC	2	6	127230	127235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3047	NC_011901	CAG	2	6	127276	127281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933308
3048	NC_011901	CAC	2	6	127282	127287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933308
3049	NC_011901	GAG	2	6	127324	127329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933308
3050	NC_011901	GGTCCC	2	12	127335	127346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933308
3051	NC_011901	CCAGC	2	10	127360	127369	20 %	0 %	20 %	60 %	220933308
3052	NC_011901	GCC	2	6	127421	127426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
3053	NC_011901	GT	3	6	127430	127435	0 %	50 %	50 %	0 %	220933308
3054	NC_011901	CTC	2	6	127504	127509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933308
3055	NC_011901	CTC	2	6	127536	127541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_011901	CTGT	2	8	127559	127566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_011901	CCCG	2	8	127582	127589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3058	NC_011901	GCG	2	6	127612	127617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_011901	CAG	2	6	127719	127724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_011901	CAC	2	6	127816	127821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_011901	GC	3	6	127860	127865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_011901	CGG	2	6	127945	127950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011901	GTG	2	6	127964	127969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011901	GAT	2	6	128083	128088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933309
3065	NC_011901	AGCTG	2	10	128117	128126	20 %	20 %	40 %	20 %	220933309
3066	NC_011901	CTG	3	9	128221	128229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933309
3067	NC_011901	GCC	2	6	128314	128319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933309
3068	NC_011901	GCGG	2	8	128349	128356	0 %	0 %	75 %	25 %	220933309
3069	NC_011901	CAC	2	6	128421	128426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933309
3070	NC_011901	CGA	2	6	128448	128453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933309
3071	NC_011901	ACG	2	6	128471	128476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933309
3072	NC_011901	CAG	2	6	128497	128502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933309
3073	NC_011901	GTG	2	6	128533	128538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933309
3074	NC_011901	ATG	2	6	128551	128556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933309
3075	NC_011901	CAA	2	6	128703	128708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933309
3076	NC_011901	CGA	2	6	128739	128744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933309
3077	NC_011901	GGA	2	6	128772	128777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933309
3078	NC_011901	GC	3	6	128852	128857	0 %	0 %	50 %	50 %	220933309
3079	NC_011901	GCG	2	6	128879	128884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933309
3080	NC_011901	GGCT	2	8	128917	128924	0 %	25 %	50 %	25 %	220933309
3081	NC_011901	GC	3	6	128931	128936	0 %	0 %	50 %	50 %	220933309
3082	NC_011901	GC	3	6	128967	128972	0 %	0 %	50 %	50 %	220933309
3083	NC_011901	CTA	2	6	128994	128999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933309
3084	NC_011901	TC	3	6	129098	129103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_011901	TGG	2	6	129252	129257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933310
3086	NC_011901	CGCT	2	8	129337	129344	0 %	25 %	25 %	50 %	220933310
3087	NC_011901	GAC	2	6	129377	129382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933310
3088	NC_011901	GCT	2	6	129388	129393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933310
3089	NC_011901	AAC	2	6	129437	129442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933310
3090	NC_011901	GCCG	2	8	129458	129465	0 %	0 %	50 %	50 %	220933310
3091	NC_011901	TGG	2	6	129471	129476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933310
3092	NC_011901	GCGG	2	8	129485	129492	0 %	0 %	75 %	25 %	220933310
3093	NC_011901	GCG	2	6	129501	129506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933310
3094	NC_011901	GCT	2	6	129517	129522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933310
3095	NC_011901	CGG	2	6	129616	129621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933310
3096	NC_011901	CCG	2	6	129675	129680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933310
3097	NC_011901	GCC	2	6	129697	129702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933310
3098	NC_011901	GGC	2	6	129731	129736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933310
3099	NC_011901	ATG	2	6	129746	129751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933310
3100	NC_011901	TGC	2	6	129799	129804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933310
3101	NC_011901	TGG	2	6	129831	129836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933310
3102	NC_011901	GGC	2	6	129841	129846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933310
3103	NC_011901	TGGCG	2	10	129863	129872	0 %	20 %	60 %	20 %	220933310
3104	NC_011901	CAC	2	6	130090	130095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933311
3105	NC_011901	AGC	2	6	130116	130121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933311
3106	NC_011901	GCC	3	9	130157	130165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933311
3107	NC_011901	GC	3	6	130236	130241	0 %	0 %	50 %	50 %	220933311
3108	NC_011901	GCC	2	6	130250	130255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933311
3109	NC_011901	CAG	2	6	130274	130279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933311
3110	NC_011901	GCGTGA	2	12	130314	130325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933311
3111	NC_011901	CGA	2	6	130387	130392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933311
3112	NC_011901	GCACCG	2	12	130488	130499	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220933311
3113	NC_011901	GCGCC	2	10	130525	130534	0 %	0 %	40 %	60 %	220933311
3114	NC_011901	CCT	2	6	130552	130557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933311
3115	NC_011901	CCA	2	6	130587	130592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933311
3116	NC_011901	ACA	3	9	130623	130631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933311
3117	NC_011901	GAG	2	6	130720	130725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011901	TCC	2	6	130742	130747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_011901	TCC	2	6	130906	130911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_011901	CGA	2	6	130929	130934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_011901	TCA	2	6	130974	130979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933312
3122	NC_011901	GCG	2	6	130992	130997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933312
3123	NC_011901	CCA	2	6	131005	131010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933312
3124	NC_011901	GCC	2	6	131036	131041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933312
3125	NC_011901	GCG	3	9	131058	131066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933312
3126	NC_011901	GC	3	6	131118	131123	0 %	0 %	50 %	50 %	220933312
3127	NC_011901	GCT	2	6	131239	131244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933312
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3129	NC_011901	GGC	2	6	131350	131355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933312
3130	NC_011901	TGC	2	6	131424	131429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933312
3131	NC_011901	CGA	2	6	131467	131472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933312
3132	NC_011901	TGC	2	6	131580	131585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933313
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3158	NC_011901	CTG	3	9	133100	133108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933314
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3223	NC_011901	T	6	6	135870	135875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_011901	ACCTAG	2	12	135886	135897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3226	NC_011901	GC	3	6	135928	135933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3227	NC_011901	CGG	2	6	135952	135957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933317
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3229	NC_011901	GC	3	6	136049	136054	0 %	0 %	50 %	50 %	220933317
3230	NC_011901	CTGCC	2	10	136059	136068	0 %	20 %	20 %	60 %	220933317
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3237	NC_011901	GCA	2	6	136294	136299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933317
3238	NC_011901	TGC	2	6	136318	136323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933317
3239	NC_011901	GC	4	8	136322	136329	0 %	0 %	50 %	50 %	220933317
3240	NC_011901	CGC	2	6	136351	136356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933317
3241	NC_011901	CAC	2	6	136358	136363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933317
3242	NC_011901	CCAC	2	8	136429	136436	25 %	0 %	0 %	75 %	220933317
3243	NC_011901	GCA	2	6	136639	136644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933318
3244	NC_011901	TCG	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933318
3245	NC_011901	GAT	2	6	136664	136669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933318
3246	NC_011901	GC	3	6	136672	136677	0 %	0 %	50 %	50 %	220933318
3247	NC_011901	CCA	2	6	136678	136683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933318
3248	NC_011901	TGA	2	6	136705	136710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933318
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3255	NC_011901	ATC	2	6	137078	137083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933318
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3271	NC_011901	TGA	2	6	137937	137942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_011901	CTG	2	6	137985	137990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933319
3273	NC_011901	CTG	2	6	138021	138026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933319
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3351	NC_011901	CTG	2	6	140769	140774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3352	NC_011901	CAG	2	6	140775	140780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933322
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3362	NC_011901	CATC	2	8	141083	141090	25 %	25 %	0 %	50 %	220933322
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3365	NC_011901	ACC	2	6	141208	141213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3366	NC_011901	AGG	2	6	141216	141221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_011901	GGC	2	6	141403	141408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3368	NC_011901	ACC	2	6	141485	141490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3369	NC_011901	GCC	2	6	141491	141496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3370	NC_011901	TGA	2	6	141627	141632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_011901	CGC	2	6	141663	141668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3373	NC_011901	CGC	2	6	141722	141727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
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3487	NC_011901	CTG	2	6	146764	146769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3488	NC_011901	CGC	2	6	146853	146858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933326
3489	NC_011901	CCA	2	6	146927	146932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933326
3490	NC_011901	GCG	2	6	146990	146995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933326
3491	NC_011901	CGGG	2	8	147017	147024	0 %	0 %	75 %	25 %	220933326
3492	NC_011901	CCAG	2	8	147110	147117	25 %	0 %	25 %	50 %	220933326
3493	NC_011901	AGC	2	6	147160	147165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3494	NC_011901	CAG	2	6	147210	147215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3495	NC_011901	CTG	2	6	147264	147269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3496	NC_011901	CGGATC	2	12	147345	147356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3497	NC_011901	GTC	2	6	147372	147377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3498	NC_011901	AGA	2	6	147502	147507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933327
3499	NC_011901	GGT	2	6	147560	147565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933327
3500	NC_011901	GCG	2	6	147599	147604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327

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