MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011901	TGG	2	6	105200	105205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933289
2502	NC_011901	GTG	2	6	105214	105219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933289
2503	NC_011901	GCATC	2	10	105294	105303	20 %	20 %	20 %	40 %	220933289
2504	NC_011901	GGCGA	2	10	105331	105340	20 %	0 %	60 %	20 %	220933289
2505	NC_011901	AGC	2	6	105362	105367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933289
2506	NC_011901	CCG	2	6	105428	105433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933289
2507	NC_011901	CGA	2	6	105495	105500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933289
2508	NC_011901	CAG	2	6	105535	105540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933289
2509	NC_011901	CGC	3	9	105567	105575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933289
2510	NC_011901	CTG	3	9	105607	105615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933289
2511	NC_011901	CGC	3	9	105629	105637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933289
2512	NC_011901	CCCG	2	8	105656	105663	0 %	0 %	25 %	75 %	220933289
2513	NC_011901	CG	3	6	105679	105684	0 %	0 %	50 %	50 %	220933289
2514	NC_011901	GCCGCT	2	12	105726	105737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933289
2515	NC_011901	GTG	2	6	105772	105777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933289
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2517	NC_011901	CGA	2	6	105879	105884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933289
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2520	NC_011901	GCCCC	2	10	105915	105924	0 %	0 %	20 %	80 %	220933289
2521	NC_011901	CCG	2	6	106040	106045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933289
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2523	NC_011901	CG	3	6	106053	106058	0 %	0 %	50 %	50 %	220933289
2524	NC_011901	TTG	2	6	106170	106175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011901	GTCC	2	8	106187	106194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_011901	GC	3	6	106206	106211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_011901	TCA	2	6	106220	106225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011901	GA	3	6	106230	106235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011901	TCA	2	6	106269	106274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933290
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2559	NC_011901	GTC	2	6	107280	107285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2561	NC_011901	CATTC	2	10	107350	107359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_011901	A	7	7	107384	107390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2570	NC_011901	TGA	2	6	107772	107777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2574	NC_011901	TGG	2	6	107853	107858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2580	NC_011901	CAT	2	6	108088	108093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2582	NC_011901	ATC	2	6	108158	108163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_011901	CTG	2	6	108248	108253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_011901	CCGG	2	8	108286	108293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2591	NC_011901	TGG	2	6	108459	108464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_011901	TGG	2	6	108531	108536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_011901	TGG	2	6	108576	108581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_011901	GAC	2	6	108638	108643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_011901	TTA	2	6	108666	108671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_011901	AGG	2	6	108696	108701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_011901	CCAC	2	8	108720	108727	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2598	NC_011901	GCCT	2	8	108741	108748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_011901	CTGGAC	2	12	108830	108841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_011901	GGAG	2	8	108877	108884	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011901	GAAG	2	8	108895	108902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011901	CG	3	6	108904	108909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_011901	CGG	2	6	108955	108960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_011901	TGA	2	6	108961	108966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011901	TCA	2	6	108969	108974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_011901	TGT	2	6	108978	108983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011901	GCC	2	6	109010	109015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_011901	CGA	2	6	109114	109119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_011901	CGA	2	6	109126	109131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_011901	CTT	2	6	109202	109207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_011901	TGG	2	6	109249	109254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011901	TGG	2	6	109309	109314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011901	GTC	2	6	109332	109337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_011901	CTG	2	6	109350	109355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_011901	GAG	2	6	109368	109373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011901	CGGTC	2	10	109376	109385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2617	NC_011901	CGC	2	6	109406	109411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_011901	TGC	2	6	109450	109455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_011901	GC	3	6	109454	109459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_011901	GGC	2	6	109472	109477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_011901	CAG	2	6	109542	109547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_011901	TGG	2	6	109552	109557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011901	GC	3	6	109565	109570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_011901	GC	3	6	109588	109593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_011901	TGGCCC	2	12	109645	109656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_011901	CAG	2	6	109659	109664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_011901	GAC	2	6	109704	109709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_011901	TCC	2	6	109725	109730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_011901	GC	3	6	109826	109831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_011901	GTG	2	6	109866	109871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_011901	GGCT	2	8	109938	109945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_011901	GCA	2	6	110012	110017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_011901	GCC	2	6	110056	110061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_011901	AGA	2	6	110069	110074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_011901	GGGC	2	8	110087	110094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2636	NC_011901	CCG	2	6	110100	110105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2637	NC_011901	CAG	2	6	110125	110130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2639	NC_011901	AGC	2	6	110217	110222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933291
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2739	NC_011901	CCA	2	6	114451	114456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933295
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2747	NC_011901	GTG	2	6	114723	114728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933295
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2749	NC_011901	TCA	2	6	114772	114777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933295
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2751	NC_011901	G	6	6	114819	114824	0 %	0 %	100 %	0 %	220933295
2752	NC_011901	AC	3	6	114846	114851	50 %	0 %	0 %	50 %	220933295
2753	NC_011901	GC	3	6	114854	114859	0 %	0 %	50 %	50 %	220933295
2754	NC_011901	ATC	2	6	114885	114890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933295
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2872	NC_011901	GAG	2	6	119633	119638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933301
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2994	NC_011901	GGCGC	2	10	124643	124652	0 %	0 %	60 %	40 %	220933307
2995	NC_011901	CGG	2	6	124763	124768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933307
2996	NC_011901	GCC	2	6	124796	124801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933307
2997	NC_011901	AGG	2	6	124897	124902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933307
2998	NC_011901	GCC	2	6	125039	125044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933308
2999	NC_011901	GCAG	2	8	125139	125146	25 %	0 %	50 %	25 %	220933308
3000	NC_011901	CGGT	2	8	125234	125241	0 %	25 %	50 %	25 %	220933308

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