MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011901	GCA	2	6	41098	41103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933231
1002	NC_011901	GGC	2	6	41162	41167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933231
1003	NC_011901	GC	4	8	41197	41204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_011901	CTG	2	6	41313	41318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933232
1005	NC_011901	GTG	3	9	41341	41349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933232
1006	NC_011901	GCT	2	6	41367	41372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933232
1007	NC_011901	CGAGGC	2	12	41409	41420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933232
1008	NC_011901	GCCG	2	8	41424	41431	0 %	0 %	50 %	50 %	220933232
1009	NC_011901	CGC	2	6	41450	41455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933232
1010	NC_011901	ACG	2	6	41475	41480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011901	TGC	2	6	41590	41595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1012	NC_011901	CGC	3	9	41624	41632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1013	NC_011901	CATCT	2	10	41718	41727	20 %	40 %	0 %	40 %	220933233
1014	NC_011901	GC	3	6	41775	41780	0 %	0 %	50 %	50 %	220933233
1015	NC_011901	TGC	2	6	41827	41832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1016	NC_011901	GC	3	6	41831	41836	0 %	0 %	50 %	50 %	220933233
1017	NC_011901	CGG	2	6	41837	41842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933233
1018	NC_011901	GTG	2	6	41856	41861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933233
1019	NC_011901	GC	3	6	41879	41884	0 %	0 %	50 %	50 %	220933233
1020	NC_011901	CGA	2	6	41885	41890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1021	NC_011901	GC	3	6	41952	41957	0 %	0 %	50 %	50 %	220933233
1022	NC_011901	GCC	2	6	42114	42119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1023	NC_011901	ACCTGG	2	12	42259	42270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1024	NC_011901	GCG	2	6	42271	42276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933233
1025	NC_011901	CTG	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1026	NC_011901	GCCGG	2	10	42380	42389	0 %	0 %	60 %	40 %	220933233
1027	NC_011901	TGC	2	6	42412	42417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1028	NC_011901	GTG	2	6	42465	42470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933233
1029	NC_011901	CGC	2	6	42473	42478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1030	NC_011901	ACG	2	6	42565	42570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1031	NC_011901	TGG	2	6	42571	42576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933233
1032	NC_011901	GC	3	6	42614	42619	0 %	0 %	50 %	50 %	220933233
1033	NC_011901	GAC	2	6	42636	42641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1034	NC_011901	CTG	2	6	42642	42647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1035	NC_011901	CCG	2	6	42658	42663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1036	NC_011901	ACA	2	6	42694	42699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933233
1037	NC_011901	CGC	2	6	42710	42715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1038	NC_011901	TGG	2	6	42724	42729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933233
1039	NC_011901	CCG	2	6	42755	42760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933233
1040	NC_011901	GCT	2	6	42794	42799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933233
1041	NC_011901	T	6	6	42921	42926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011901	CCCGAA	2	12	42941	42952	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933234
1043	NC_011901	TCG	2	6	43020	43025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933234
1044	NC_011901	GCCT	2	8	43232	43239	0 %	25 %	25 %	50 %	220933234
1045	NC_011901	CGG	2	6	43242	43247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933234
1046	NC_011901	GCCCC	2	10	43250	43259	0 %	0 %	20 %	80 %	220933234
1047	NC_011901	CTG	2	6	43292	43297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933234
1048	NC_011901	CCG	2	6	43314	43319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933234
1049	NC_011901	CGG	2	6	43354	43359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933234
1050	NC_011901	TCA	2	6	43368	43373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933234
1051	NC_011901	CCG	2	6	43404	43409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933234
1052	NC_011901	TGG	2	6	43416	43421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933234
1053	NC_011901	CGA	2	6	43435	43440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933234
1054	NC_011901	GCC	2	6	43441	43446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933234
1055	NC_011901	TTC	2	6	43463	43468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933234
1056	NC_011901	CTG	2	6	43475	43480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933234
1057	NC_011901	GCG	2	6	43481	43486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933234
1058	NC_011901	GGCC	2	8	43531	43538	0 %	0 %	50 %	50 %	220933234
1059	NC_011901	TGG	2	6	43569	43574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933234
1060	NC_011901	GC	3	6	43588	43593	0 %	0 %	50 %	50 %	220933234
1061	NC_011901	CGC	2	6	43620	43625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933235
1062	NC_011901	TGA	2	6	43646	43651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933235
1063	NC_011901	CGC	2	6	43655	43660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933235
1064	NC_011901	CTCGGC	2	12	43662	43673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933235
1065	NC_011901	GAA	2	6	43728	43733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933235
1066	NC_011901	ACG	2	6	43770	43775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933235
1067	NC_011901	CG	3	6	43818	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	220933235
1068	NC_011901	CTC	2	6	43863	43868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933235
1069	NC_011901	GGTG	2	8	43904	43911	0 %	25 %	75 %	0 %	220933235
1070	NC_011901	GTCCT	2	10	43920	43929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_011901	CGA	2	6	43941	43946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933236
1072	NC_011901	CAG	2	6	43976	43981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933236
1073	NC_011901	CTG	2	6	43996	44001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933236
1074	NC_011901	CGT	2	6	44086	44091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933236
1075	NC_011901	GCG	2	6	44146	44151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933236
1076	NC_011901	TTA	2	6	44218	44223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011901	GAT	2	6	44268	44273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011901	C	6	6	44348	44353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1079	NC_011901	CCAT	2	8	44434	44441	25 %	25 %	0 %	50 %	220933237
1080	NC_011901	CTG	2	6	44475	44480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933237
1081	NC_011901	TGG	2	6	44521	44526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933237
1082	NC_011901	CGG	2	6	44542	44547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933237
1083	NC_011901	GCT	2	6	44617	44622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933237
1084	NC_011901	CAT	2	6	44690	44695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933237
1085	NC_011901	GCCC	2	8	44740	44747	0 %	0 %	25 %	75 %	220933237
1086	NC_011901	CCT	2	6	44794	44799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933237
1087	NC_011901	TGGAGG	2	12	44806	44817	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	220933237
1088	NC_011901	TGC	2	6	44866	44871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933237
1089	NC_011901	GGT	2	6	44969	44974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933237
1090	NC_011901	GGT	2	6	45056	45061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933237
1091	NC_011901	CTG	2	6	45081	45086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933237
1092	NC_011901	CCGTGG	2	12	45094	45105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933237
1093	NC_011901	AAG	2	6	45145	45150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933237
1094	NC_011901	TGA	3	9	45160	45168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933237
1095	NC_011901	GCA	2	6	45196	45201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933237
1096	NC_011901	T	6	6	45286	45291	0 %	100 %	0 %	0 %	220933238
1097	NC_011901	CTG	2	6	45308	45313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933238
1098	NC_011901	CGG	2	6	45340	45345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933238
1099	NC_011901	GGCT	2	8	45374	45381	0 %	25 %	50 %	25 %	220933238
1100	NC_011901	GAAA	2	8	45404	45411	75 %	0 %	25 %	0 %	220933238
1101	NC_011901	CCA	2	6	45519	45524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933238
1102	NC_011901	AGC	2	6	45531	45536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933238
1103	NC_011901	GTG	2	6	45563	45568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933238
1104	NC_011901	GCT	2	6	45574	45579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933238
1105	NC_011901	CGC	2	6	45659	45664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1106	NC_011901	CCG	2	6	45735	45740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1107	NC_011901	CCG	2	6	45766	45771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1108	NC_011901	GA	3	6	45852	45857	50 %	0 %	50 %	0 %	220933238
1109	NC_011901	GC	3	6	45905	45910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_011901	TTC	2	6	46016	46021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011901	CCCTT	2	10	46038	46047	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1112	NC_011901	GATC	2	8	46091	46098	25 %	25 %	25 %	25 %	220933239
1113	NC_011901	GAG	2	6	46119	46124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933239
1114	NC_011901	C	6	6	46135	46140	0 %	0 %	0 %	100 %	220933239
1115	NC_011901	CGC	2	6	46170	46175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933239
1116	NC_011901	TG	3	6	46177	46182	0 %	50 %	50 %	0 %	220933239
1117	NC_011901	GCA	2	6	46264	46269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1118	NC_011901	CTG	2	6	46284	46289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1119	NC_011901	CTT	2	6	46304	46309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933239
1120	NC_011901	GC	4	8	46361	46368	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
1121	NC_011901	GCT	2	6	46421	46426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1122	NC_011901	TGG	2	6	46450	46455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
1123	NC_011901	TGG	2	6	46513	46518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
1124	NC_011901	TGG	2	6	46528	46533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
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1126	NC_011901	GC	3	6	46643	46648	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
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1252	NC_011901	CCT	2	6	50470	50475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_011901	GCG	2	6	50549	50554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_011901	CGC	2	6	50559	50564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_011901	CA	3	6	50626	50631	50 %	0 %	0 %	50 %	220933244
1256	NC_011901	GCT	2	6	50638	50643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1257	NC_011901	GC	4	8	50650	50657	0 %	0 %	50 %	50 %	220933244
1258	NC_011901	GCT	3	9	50665	50673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1259	NC_011901	GCT	2	6	50689	50694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1260	NC_011901	GGC	2	6	50695	50700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
1261	NC_011901	GGC	2	6	50706	50711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
1262	NC_011901	GGCC	2	8	50773	50780	0 %	0 %	50 %	50 %	220933244
1263	NC_011901	CTGGC	2	10	50813	50822	0 %	20 %	40 %	40 %	220933244
1264	NC_011901	TGC	2	6	50823	50828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1265	NC_011901	GCC	2	6	50831	50836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
1266	NC_011901	G	6	6	50892	50897	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
1267	NC_011901	TGCTGG	2	12	50910	50921	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220933244
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1270	NC_011901	CTG	2	6	50978	50983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
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1272	NC_011901	TGG	2	6	51030	51035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933244
1273	NC_011901	GC	3	6	51046	51051	0 %	0 %	50 %	50 %	220933244
1274	NC_011901	CGCCC	2	10	51061	51070	0 %	0 %	20 %	80 %	220933244
1275	NC_011901	CCG	2	6	51079	51084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
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1278	NC_011901	GCG	2	6	51201	51206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
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1280	NC_011901	GCC	2	6	51260	51265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
1281	NC_011901	G	6	6	51325	51330	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
1282	NC_011901	GCCGGT	2	12	51337	51348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933244
1283	NC_011901	CTG	2	6	51368	51373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1284	NC_011901	G	6	6	51379	51384	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
1285	NC_011901	CGG	3	9	51439	51447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
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1290	NC_011901	CTG	3	9	51599	51607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1291	NC_011901	CGCGCC	2	12	51625	51636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
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1293	NC_011901	GCCC	2	8	51676	51683	0 %	0 %	25 %	75 %	220933244
1294	NC_011901	CGA	2	6	51694	51699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933244
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1314	NC_011901	GGCGGT	2	12	52385	52396	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933245
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1329	NC_011901	CTGGC	2	10	52825	52834	0 %	20 %	40 %	40 %	220933245
1330	NC_011901	GCT	2	6	52971	52976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933245
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1334	NC_011901	GCCA	2	8	53143	53150	25 %	0 %	25 %	50 %	220933245
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1342	NC_011901	GCCTGC	2	12	53414	53425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933245
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1360	NC_011901	GCG	2	6	54344	54349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933246
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1362	NC_011901	TGATT	2	10	54377	54386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1363	NC_011901	AGC	2	6	54393	54398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1364	NC_011901	GTG	2	6	54522	54527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933247
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1368	NC_011901	CGGAA	2	10	54704	54713	40 %	0 %	40 %	20 %	220933247
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1370	NC_011901	CCA	2	6	54821	54826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933247
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1372	NC_011901	CCCGTG	2	12	54913	54924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933247
1373	NC_011901	CAG	2	6	54927	54932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933247
1374	NC_011901	GCA	2	6	54950	54955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933247
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1378	NC_011901	TCT	2	6	55211	55216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933247
1379	NC_011901	TAA	2	6	55319	55324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_011901	CGG	2	6	55366	55371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_011901	ACC	2	6	55462	55467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933248
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1441	NC_011901	CTTT	2	8	58036	58043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1442	NC_011901	TGAC	2	8	58109	58116	25 %	25 %	25 %	25 %	220933251
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1462	NC_011901	GACATG	2	12	58871	58882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220933252
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1498	NC_011901	CGC	2	6	60217	60222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933253
1499	NC_011901	GTCATG	2	12	60226	60237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220933253
1500	NC_011901	GC	3	6	60279	60284	0 %	0 %	50 %	50 %	220933253

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