MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011901	GCC	2	6	21284	21289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933214
502	NC_011901	CGC	2	6	21378	21383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933214
503	NC_011901	GCC	4	12	21437	21448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933214
504	NC_011901	GC	3	6	21487	21492	0 %	0 %	50 %	50 %	220933214
505	NC_011901	CTACCC	2	12	21502	21513	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	220933214
506	NC_011901	GAG	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933214
507	NC_011901	CG	3	6	21619	21624	0 %	0 %	50 %	50 %	220933214
508	NC_011901	G	6	6	21648	21653	0 %	0 %	100 %	0 %	220933214
509	NC_011901	GGA	2	6	21685	21690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933214
510	NC_011901	GGGT	2	8	21717	21724	0 %	25 %	75 %	0 %	220933214
511	NC_011901	CAA	2	6	21727	21732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933214
512	NC_011901	GGC	2	6	21739	21744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933214
513	NC_011901	GCT	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933214
514	NC_011901	GGA	2	6	21974	21979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011901	CGC	3	9	22024	22032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933215
516	NC_011901	CCG	3	9	22044	22052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933215
517	NC_011901	CAG	2	6	22073	22078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933215
518	NC_011901	CGGC	2	8	22107	22114	0 %	0 %	50 %	50 %	220933215
519	NC_011901	AGC	2	6	22119	22124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933215
520	NC_011901	GC	3	6	22128	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	220933215
521	NC_011901	GATC	2	8	22135	22142	25 %	25 %	25 %	25 %	220933215
522	NC_011901	CGAGGC	2	12	22231	22242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933215
523	NC_011901	GCA	2	6	22252	22257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933215
524	NC_011901	AGG	2	6	22266	22271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933215
525	NC_011901	GAT	2	6	22273	22278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933215
526	NC_011901	GGA	2	6	22288	22293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933215
527	NC_011901	GGA	2	6	22309	22314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933215
528	NC_011901	ATG	2	6	22355	22360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933215
529	NC_011901	CAG	2	6	22370	22375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933215
530	NC_011901	GAA	2	6	22382	22387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933215
531	NC_011901	A	6	6	22404	22409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011901	GCCCC	2	10	22410	22419	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
533	NC_011901	GGGGC	2	10	22428	22437	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
534	NC_011901	T	6	6	22438	22443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011901	CAG	2	6	22483	22488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011901	GGTC	2	8	22496	22503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_011901	CGA	2	6	22512	22517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011901	GCT	2	6	22536	22541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011901	TGA	2	6	22658	22663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933216
540	NC_011901	CAT	2	6	22686	22691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933216
541	NC_011901	GGCG	2	8	22692	22699	0 %	0 %	75 %	25 %	220933216
542	NC_011901	G	7	7	22734	22740	0 %	0 %	100 %	0 %	220933216
543	NC_011901	GCG	2	6	22846	22851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
544	NC_011901	GGC	2	6	22952	22957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
545	NC_011901	CAC	2	6	22989	22994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933216
546	NC_011901	CGTGC	2	10	22998	23007	0 %	20 %	40 %	40 %	220933216
547	NC_011901	GC	3	6	23020	23025	0 %	0 %	50 %	50 %	220933216
548	NC_011901	CGG	2	6	23050	23055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
549	NC_011901	CGGT	2	8	23059	23066	0 %	25 %	50 %	25 %	220933216
550	NC_011901	GGGT	2	8	23075	23082	0 %	25 %	75 %	0 %	220933216
551	NC_011901	GT	3	6	23081	23086	0 %	50 %	50 %	0 %	220933216
552	NC_011901	GTG	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933216
553	NC_011901	GC	3	6	23148	23153	0 %	0 %	50 %	50 %	220933216
554	NC_011901	GGC	2	6	23172	23177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
555	NC_011901	GCC	2	6	23184	23189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933216
556	NC_011901	CCGG	2	8	23240	23247	0 %	0 %	50 %	50 %	220933216
557	NC_011901	CGG	2	6	23264	23269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
558	NC_011901	GCC	2	6	23317	23322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933216
559	NC_011901	GC	3	6	23332	23337	0 %	0 %	50 %	50 %	220933216
560	NC_011901	CAC	2	6	23349	23354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933216
561	NC_011901	GCG	2	6	23392	23397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933216
562	NC_011901	GAT	2	6	23421	23426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933216
563	NC_011901	ACT	2	6	23428	23433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933216
564	NC_011901	GCC	2	6	23499	23504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011901	C	6	6	23525	23530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
566	NC_011901	GAC	2	6	23582	23587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933217
567	NC_011901	GGC	2	6	23602	23607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
568	NC_011901	GCCCT	2	10	23624	23633	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
569	NC_011901	CCTG	2	8	23661	23668	0 %	25 %	25 %	50 %	220933217
570	NC_011901	CCG	2	6	23711	23716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
571	NC_011901	GCC	2	6	23810	23815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
572	NC_011901	TCA	2	6	23826	23831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933217
573	NC_011901	CCCTG	2	10	23835	23844	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
574	NC_011901	GTG	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933217
575	NC_011901	ACG	2	6	23874	23879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933217
576	NC_011901	TGC	2	6	23949	23954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933217
577	NC_011901	GCC	2	6	23964	23969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
578	NC_011901	CGG	2	6	24040	24045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
579	NC_011901	CTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933217
580	NC_011901	GAGG	2	8	24127	24134	25 %	0 %	75 %	0 %	220933217
581	NC_011901	CTG	2	6	24152	24157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933217
582	NC_011901	GCG	2	6	24162	24167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
583	NC_011901	GC	3	6	24253	24258	0 %	0 %	50 %	50 %	220933217
584	NC_011901	CGC	2	6	24447	24452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
585	NC_011901	GCC	2	6	24464	24469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
586	NC_011901	GGA	2	6	24499	24504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933217
587	NC_011901	CAG	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
588	NC_011901	GGGCGC	2	12	24720	24731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
589	NC_011901	GGC	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
590	NC_011901	CAG	3	9	24806	24814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
591	NC_011901	GGC	2	6	24815	24820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
592	NC_011901	TGC	2	6	24831	24836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933218
593	NC_011901	CGG	2	6	24850	24855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
594	NC_011901	GC	3	6	24934	24939	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
595	NC_011901	GCA	2	6	24943	24948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
596	NC_011901	CCA	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933218
597	NC_011901	GGC	2	6	25051	25056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
598	NC_011901	CGGCGT	2	12	25060	25071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933218
599	NC_011901	CGG	2	6	25072	25077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
600	NC_011901	AGC	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
601	NC_011901	GGA	2	6	25135	25140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933218
602	NC_011901	GGCGC	2	10	25145	25154	0 %	0 %	60 %	40 %	220933218
603	NC_011901	GCA	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
604	NC_011901	GGC	2	6	25178	25183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
605	NC_011901	TCGT	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	220933218
606	NC_011901	GC	3	6	25212	25217	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
607	NC_011901	GGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933218
608	NC_011901	CGG	2	6	25383	25388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
609	NC_011901	GCG	2	6	25410	25415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
610	NC_011901	GCG	2	6	25419	25424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
611	NC_011901	GC	3	6	25457	25462	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
612	NC_011901	CGGCCT	2	12	25543	25554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933218
613	NC_011901	CCG	2	6	25581	25586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933218
614	NC_011901	GCA	3	9	25615	25623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
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616	NC_011901	CAG	2	6	25640	25645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
617	NC_011901	CCA	2	6	25654	25659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933218
618	NC_011901	CAG	2	6	25703	25708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
619	NC_011901	GAA	2	6	25730	25735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933218
620	NC_011901	CAG	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
621	NC_011901	CAG	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
622	NC_011901	GCA	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
623	NC_011901	CAG	2	6	25820	25825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
624	NC_011901	CGG	2	6	25847	25852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
625	NC_011901	CAG	2	6	25934	25939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
626	NC_011901	CGT	2	6	25975	25980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933219
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628	NC_011901	GC	3	6	26000	26005	0 %	0 %	50 %	50 %	220933219
629	NC_011901	GCG	2	6	26115	26120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
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634	NC_011901	GCA	2	6	26353	26358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
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741	NC_011901	CGGT	2	8	30360	30367	0 %	25 %	50 %	25 %	220933224
742	NC_011901	TGT	2	6	30427	30432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933224
743	NC_011901	ACC	2	6	30489	30494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933224
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748	NC_011901	TCC	2	6	30780	30785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933224
749	NC_011901	GC	3	6	30869	30874	0 %	0 %	50 %	50 %	220933224
750	NC_011901	GGCCTC	2	12	30899	30910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933224
751	NC_011901	TGC	2	6	30930	30935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933224
752	NC_011901	CAG	2	6	31064	31069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933224
753	NC_011901	CAC	2	6	31085	31090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933224
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755	NC_011901	CGG	2	6	31114	31119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933224
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