MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 1095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	TTCTAA	2	12	1737	1748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076134
2	NC_011653	CTTTTT	2	12	7390	7401	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076139
3	NC_011653	TTGAGT	2	12	7589	7600	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	217076139
4	NC_011653	ATTTAA	2	12	9181	9192	50 %	50 %	0 %	0 %	217076139
5	NC_011653	TCATTT	2	12	10286	10297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076140
6	NC_011653	TTATTT	2	12	10634	10645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076140
7	NC_011653	TTATTT	2	12	11180	11191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076140
8	NC_011653	TAAAAA	2	12	11259	11270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011653	ATTTTT	2	12	11391	11402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076141
10	NC_011653	TGAAAA	2	12	11577	11588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076141
11	NC_011653	AGATTT	2	12	12739	12750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076142
12	NC_011653	AAAGAA	2	12	15561	15572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217076146
13	NC_011653	CCAATT	2	12	17470	17481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076149
14	NC_011653	ATACGA	2	12	19544	19555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076152
15	NC_011653	TTGAAA	2	12	19576	19587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076152
16	NC_011653	ACCAAA	2	12	22604	22615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076155
17	NC_011653	TCTTTT	2	12	24212	24223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076157
18	NC_011653	AAAATT	2	12	24872	24883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011653	TAAAGA	2	12	25962	25973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076158
20	NC_011653	CTATTC	2	12	33645	33656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217076163
21	NC_011653	CTATCA	2	12	38122	38133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076167
22	NC_011653	AATATA	2	12	38994	39005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076167
23	NC_011653	CCTTCA	2	12	39680	39691	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	217076169
24	NC_011653	TGATAT	2	12	40230	40241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076170
25	NC_011653	CCCAAA	2	12	42728	42739	50 %	0 %	0 %	50 %	217076172
26	NC_011653	AACTTC	2	12	48956	48967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076177
27	NC_011653	AATTAA	2	12	49013	49024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076177
28	NC_011653	TAAATT	2	12	50027	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	217076179
29	NC_011653	ATTTAA	2	12	50766	50777	50 %	50 %	0 %	0 %	217076180
30	NC_011653	TTCAAA	2	12	50820	50831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217076180
31	NC_011653	TAAAAA	2	12	51822	51833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076182
32	NC_011653	TCATTA	2	12	53105	53116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076183
33	NC_011653	TTATAA	2	12	53162	53173	50 %	50 %	0 %	0 %	217076183
34	NC_011653	AGATAG	2	12	54531	54542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	217076186
35	NC_011653	TGATAG	2	12	56181	56192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076186
36	NC_011653	ATAGAA	2	12	58005	58016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076188
37	NC_011653	ACATCC	2	12	58460	58471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	217076188
38	NC_011653	ATAAAT	2	12	59003	59014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076189
39	NC_011653	ATAGAA	2	12	59632	59643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076190
40	NC_011653	TTAATT	2	12	60062	60073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076191
41	NC_011653	TTATTT	2	12	62711	62722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076195
42	NC_011653	TGCAAC	2	12	63100	63111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217076195
43	NC_011653	ATCAAC	2	12	63491	63502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	217076197
44	NC_011653	TTTATC	2	12	64048	64059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076198
45	NC_011653	TTTTCC	2	12	64918	64929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076198
46	NC_011653	TTATCT	2	12	67112	67123	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076201
47	NC_011653	TATATT	2	12	67136	67147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076201
48	NC_011653	AAAAAT	2	12	67830	67841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076201
49	NC_011653	TCATTA	2	12	69383	69394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076203
50	NC_011653	ATCAAA	2	12	70501	70512	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076203
51	NC_011653	TTTTTA	2	12	71784	71795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076204
52	NC_011653	AATGTA	2	12	72913	72924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011653	ATTTCA	2	12	74650	74661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076206
54	NC_011653	TTTAAT	2	12	75242	75253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076208
55	NC_011653	GATGCA	2	12	76230	76241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217076208
56	NC_011653	TATGAA	2	12	76602	76613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076208
57	NC_011653	AAAAGA	2	12	80081	80092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217076213
58	NC_011653	TGAAAA	2	12	81465	81476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076216
59	NC_011653	ATCTTT	2	12	84229	84240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076220
60	NC_011653	CTTTTT	2	12	84910	84921	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076221
61	NC_011653	TGTAAA	2	12	86552	86563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076224
62	NC_011653	CTTGTT	2	12	87881	87892	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	217076225
63	NC_011653	GTTTTT	2	12	89907	89918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011653	TGCCAC	2	12	91006	91017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	217076226
65	NC_011653	GTAATA	2	12	91969	91980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076227
66	NC_011653	TCTTTT	2	12	92170	92181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076227
67	NC_011653	ATCACC	2	12	93819	93830	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	217076230
68	NC_011653	AAATAC	2	12	95353	95364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076232
69	NC_011653	GATATT	2	12	95991	96002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076232
70	NC_011653	AAAAGA	2	12	96567	96578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217076233
71	NC_011653	TATTGA	2	12	99496	99507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076235
72	NC_011653	AAATAC	2	12	102638	102649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076239
73	NC_011653	TCTTTA	2	12	105124	105135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076244
74	NC_011653	AAAAGA	2	12	106217	106228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217076245
75	NC_011653	CTTTAA	2	12	108596	108607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076247
76	NC_011653	GAAAAT	2	12	108726	108737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076247
77	NC_011653	TACAAT	2	12	109125	109136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217076247
78	NC_011653	AGAATT	2	12	109199	109210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076247
79	NC_011653	TTATCA	2	12	114611	114622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076252
80	NC_011653	CAAAAT	2	12	116327	116338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076255
81	NC_011653	TAAATA	2	12	117851	117862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
82	NC_011653	TAAAGT	2	12	118939	118950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011653	AAAATC	2	12	119053	119064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076258
84	NC_011653	CCAGGA	2	12	124114	124125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076263
85	NC_011653	AATTAT	2	12	124320	124331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011653	TGAAAC	2	12	127033	127044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076265
87	NC_011653	ATTCTT	2	12	130782	130793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076270
88	NC_011653	ATTTTT	2	12	130797	130808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076270
89	NC_011653	TCATCT	2	12	136102	136113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217076276
90	NC_011653	CTTCAT	2	12	138936	138947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217076277
91	NC_011653	TCTGGG	2	12	139975	139986	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	217076278
92	NC_011653	TTCCAT	2	12	140408	140419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217076278
93	NC_011653	ACAAGA	2	12	149945	149956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254555130
94	NC_011653	AACTGC	2	12	151503	151514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217076286
95	NC_011653	TTTTTG	2	12	151843	151854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	217076287
96	NC_011653	TTTTTC	2	12	153310	153321	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076287
97	NC_011653	ATTTTC	2	12	154449	154460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076290
98	NC_011653	CTTCAG	2	12	156888	156899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217076292
99	NC_011653	CATTTG	2	12	157653	157664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217076292
100	NC_011653	TTTCAA	2	12	158628	158639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076293
101	NC_011653	TACTTT	2	12	159441	159452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076294
102	NC_011653	AATTTT	2	12	164147	164158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076299
103	NC_011653	TTAAAC	2	12	164204	164215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217076299
104	NC_011653	GCGGAA	2	12	166509	166520	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	217076301
105	NC_011653	TGGTGC	2	12	168603	168614	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	217076304
106	NC_011653	AAATCA	2	12	169145	169156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076305
107	NC_011653	AAATAA	2	12	169656	169667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076305
108	NC_011653	TTAATC	2	12	170761	170772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076306
109	NC_011653	ATTGAA	2	12	178082	178093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076312
110	NC_011653	CATATA	2	12	179878	179889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217076313
111	NC_011653	ACTGAA	2	12	180156	180167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076313
112	NC_011653	ATGAAA	2	12	181484	181495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076315
113	NC_011653	TTTTAC	2	12	182555	182566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076315
114	NC_011653	TAAAAG	2	12	184632	184643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076317
115	NC_011653	ATTCTT	2	12	189709	189720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217076322
116	NC_011653	TGCTAT	2	12	190200	190211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217076322
117	NC_011653	CAGCAA	2	12	190226	190237	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	217076322
118	NC_011653	TTTATT	2	12	190324	190335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011653	ATAATT	2	12	190463	190474	50 %	50 %	0 %	0 %	217076323
120	NC_011653	TTTCAA	2	12	190699	190710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076323
121	NC_011653	TTTCAA	2	12	192335	192346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076325
122	NC_011653	TTTTTC	2	12	196548	196559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076328
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227	NC_011653	CTATTG	2	12	408093	408104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217076521
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235	NC_011653	ATCCAA	2	12	420702	420713	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	217076533
236	NC_011653	AAGATG	2	12	421713	421724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	217076535
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238	NC_011653	ACCAAA	2	12	422757	422768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076536
239	NC_011653	ATTTTG	2	12	424851	424862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217076540
240	NC_011653	ATGAAG	2	12	426526	426537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	217076542
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242	NC_011653	AAAATA	2	12	433336	433347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076549
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273	NC_011653	AACAAA	2	12	492250	492261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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279	NC_011653	AATTAA	2	12	503999	504010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011653	CTTTTG	2	12	510118	510129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254555136
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333	NC_011653	CATTTT	2	12	588246	588257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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337	NC_011653	GCAACT	2	12	596251	596262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217076704
338	NC_011653	TTGCAC	2	12	596294	596305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217076704
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340	NC_011653	AAATCA	2	12	597828	597839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076705
341	NC_011653	CTTTTG	2	12	598903	598914	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254555140
342	NC_011653	ATCTTT	2	12	599145	599156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254555140
343	NC_011653	ATAGTT	2	12	600094	600105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076706
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345	NC_011653	TCAATT	2	12	601226	601237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076706
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348	NC_011653	ATTTAA	2	12	609908	609919	50 %	50 %	0 %	0 %	217076713
349	NC_011653	ATTTAA	2	12	610474	610485	50 %	50 %	0 %	0 %	217076713
350	NC_011653	TAAAAA	2	12	613935	613946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076714
351	NC_011653	AATAGA	2	12	616496	616507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
352	NC_011653	TAAAAT	2	12	618186	618197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076718
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354	NC_011653	GGTTTT	2	12	628754	628765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076729
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470	NC_011653	CCTTGG	2	12	877266	877277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076939
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