MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 53059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011653	CAAA	2	8	124793	124800	75 %	0 %	0 %	25 %	217076264
3502	NC_011653	AGAT	2	8	124912	124919	50 %	25 %	25 %	0 %	217076264
3503	NC_011653	AT	3	6	124973	124978	50 %	50 %	0 %	0 %	217076264
3504	NC_011653	ACT	2	6	124989	124994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076264
3505	NC_011653	GAAT	2	8	125056	125063	50 %	25 %	25 %	0 %	217076264
3506	NC_011653	A	6	6	125121	125126	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3507	NC_011653	AAT	2	6	125141	125146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3508	NC_011653	TAC	2	6	125265	125270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3509	NC_011653	T	6	6	125308	125313	0 %	100 %	0 %	0 %	217076265
3510	NC_011653	CCA	2	6	125330	125335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076265
3511	NC_011653	AGT	2	6	125374	125379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076265
3512	NC_011653	CTC	2	6	125391	125396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076265
3513	NC_011653	CAA	2	6	125397	125402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076265
3514	NC_011653	A	6	6	125417	125422	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3515	NC_011653	TCA	2	6	125573	125578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3516	NC_011653	AGC	2	6	125587	125592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3517	NC_011653	TAC	2	6	125599	125604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3518	NC_011653	GCA	2	6	125642	125647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3519	NC_011653	TAT	2	6	125650	125655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076265
3520	NC_011653	TAT	2	6	125680	125685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076265
3521	NC_011653	AT	3	6	125706	125711	50 %	50 %	0 %	0 %	217076265
3522	NC_011653	A	6	6	125742	125747	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3523	NC_011653	TGC	2	6	125770	125775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3524	NC_011653	TGC	2	6	125779	125784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3525	NC_011653	GCA	2	6	125813	125818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3526	NC_011653	GTA	2	6	125819	125824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076265
3527	NC_011653	ACCA	2	8	125827	125834	50 %	0 %	0 %	50 %	217076265
3528	NC_011653	CAA	2	6	125946	125951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076265
3529	NC_011653	AAT	2	6	126000	126005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3530	NC_011653	TAA	2	6	126010	126015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3531	NC_011653	ATGCC	2	10	126066	126075	20 %	20 %	20 %	40 %	217076265
3532	NC_011653	ACT	2	6	126076	126081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3533	NC_011653	CTT	2	6	126099	126104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076265
3534	NC_011653	TAACT	2	10	126113	126122	40 %	40 %	0 %	20 %	217076265
3535	NC_011653	CT	3	6	126121	126126	0 %	50 %	0 %	50 %	217076265
3536	NC_011653	TCA	2	6	126140	126145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3537	NC_011653	AAG	2	6	126163	126168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076265
3538	NC_011653	AAT	3	9	126172	126180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3539	NC_011653	GAA	2	6	126203	126208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076265
3540	NC_011653	A	6	6	126268	126273	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3541	NC_011653	A	6	6	126287	126292	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3542	NC_011653	CCAG	2	8	126296	126303	25 %	0 %	25 %	50 %	217076265
3543	NC_011653	A	6	6	126308	126313	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3544	NC_011653	TG	3	6	126345	126350	0 %	50 %	50 %	0 %	217076265
3545	NC_011653	T	6	6	126364	126369	0 %	100 %	0 %	0 %	217076265
3546	NC_011653	TA	3	6	126376	126381	50 %	50 %	0 %	0 %	217076265
3547	NC_011653	TAT	2	6	126412	126417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076265
3548	NC_011653	A	6	6	126425	126430	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3549	NC_011653	A	6	6	126435	126440	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3550	NC_011653	T	6	6	126446	126451	0 %	100 %	0 %	0 %	217076265
3551	NC_011653	ATA	2	6	126460	126465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3552	NC_011653	CCA	2	6	126470	126475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076265
3553	NC_011653	AT	3	6	126488	126493	50 %	50 %	0 %	0 %	217076265
3554	NC_011653	TTG	2	6	126597	126602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076265
3555	NC_011653	ATC	2	6	126616	126621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076265
3556	NC_011653	CCAA	2	8	126647	126654	50 %	0 %	0 %	50 %	217076265
3557	NC_011653	GCC	2	6	126659	126664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217076265
3558	NC_011653	CTG	2	6	126669	126674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3559	NC_011653	AC	3	6	126684	126689	50 %	0 %	0 %	50 %	217076265
3560	NC_011653	ATT	2	6	126716	126721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076265
3561	NC_011653	AGC	2	6	126723	126728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076265
3562	NC_011653	T	7	7	126808	126814	0 %	100 %	0 %	0 %	217076265
3563	NC_011653	A	7	7	126833	126839	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3564	NC_011653	ACC	2	6	126892	126897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076265
3565	NC_011653	TGAAAC	2	12	127033	127044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076265
3566	NC_011653	AAT	2	6	127058	127063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3567	NC_011653	ATT	2	6	127070	127075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076265
3568	NC_011653	AAC	2	6	127099	127104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076265
3569	NC_011653	AAAT	2	8	127119	127126	75 %	25 %	0 %	0 %	217076265
3570	NC_011653	T	6	6	127187	127192	0 %	100 %	0 %	0 %	217076265
3571	NC_011653	A	6	6	127219	127224	100 %	0 %	0 %	0 %	217076265
3572	NC_011653	TAA	3	9	127240	127248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076265
3573	NC_011653	AT	3	6	127249	127254	50 %	50 %	0 %	0 %	217076265
3574	NC_011653	ATC	2	6	127261	127266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076266
3575	NC_011653	TAT	2	6	127330	127335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076266
3576	NC_011653	T	7	7	127362	127368	0 %	100 %	0 %	0 %	217076266
3577	NC_011653	A	6	6	127404	127409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011653	AAG	2	6	127426	127431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011653	GAG	2	6	127456	127461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011653	TGA	2	6	127497	127502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076267
3581	NC_011653	TTA	2	6	127523	127528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076267
3582	NC_011653	AAG	2	6	127544	127549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3583	NC_011653	GTT	2	6	127558	127563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076267
3584	NC_011653	AGA	2	6	127590	127595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3585	NC_011653	ATGG	2	8	127648	127655	25 %	25 %	50 %	0 %	217076267
3586	NC_011653	GAA	2	6	127732	127737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3587	NC_011653	GAT	2	6	127771	127776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076267
3588	NC_011653	TA	3	6	127777	127782	50 %	50 %	0 %	0 %	217076267
3589	NC_011653	AGA	2	6	127834	127839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3590	NC_011653	AGA	2	6	127863	127868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3591	NC_011653	A	7	7	127876	127882	100 %	0 %	0 %	0 %	217076267
3592	NC_011653	TTG	2	6	127883	127888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076267
3593	NC_011653	A	6	6	127939	127944	100 %	0 %	0 %	0 %	217076267
3594	NC_011653	CTC	2	6	127955	127960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076267
3595	NC_011653	TAC	2	6	128021	128026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076267
3596	NC_011653	ACT	2	6	128048	128053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076267
3597	NC_011653	AAG	2	6	128085	128090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3598	NC_011653	AGA	3	9	128106	128114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3599	NC_011653	AT	3	6	128130	128135	50 %	50 %	0 %	0 %	217076267
3600	NC_011653	GAA	2	6	128182	128187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076267
3601	NC_011653	CAA	2	6	128211	128216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076268
3602	NC_011653	AAT	2	6	128227	128232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076268
3603	NC_011653	TTA	2	6	128234	128239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076268
3604	NC_011653	ATA	2	6	128240	128245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076268
3605	NC_011653	A	7	7	128260	128266	100 %	0 %	0 %	0 %	217076268
3606	NC_011653	AAG	2	6	128289	128294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076268
3607	NC_011653	TAAA	2	8	128298	128305	75 %	25 %	0 %	0 %	217076268
3608	NC_011653	AGG	2	6	128322	128327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217076268
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3610	NC_011653	A	6	6	128358	128363	100 %	0 %	0 %	0 %	217076268
3611	NC_011653	A	8	8	128368	128375	100 %	0 %	0 %	0 %	217076268
3612	NC_011653	GAA	2	6	128390	128395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076268
3613	NC_011653	A	6	6	128419	128424	100 %	0 %	0 %	0 %	217076268
3614	NC_011653	TAT	2	6	128458	128463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076268
3615	NC_011653	AAT	2	6	128498	128503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076268
3616	NC_011653	GAA	2	6	128534	128539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076268
3617	NC_011653	ATT	2	6	128565	128570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076268
3618	NC_011653	TCAA	2	8	128574	128581	50 %	25 %	0 %	25 %	217076268
3619	NC_011653	TGA	2	6	128587	128592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076268
3620	NC_011653	TAA	3	9	128599	128607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076268
3621	NC_011653	A	8	8	128649	128656	100 %	0 %	0 %	0 %	217076268
3622	NC_011653	TAT	2	6	128657	128662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076268
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