MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 53059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011653	ATT	2	6	16502	16507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076147
502	NC_011653	TTTC	2	8	16508	16515	0 %	75 %	0 %	25 %	217076147
503	NC_011653	TAA	2	6	16536	16541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076147
504	NC_011653	CTT	2	6	16594	16599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076147
505	NC_011653	TAT	2	6	16613	16618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555127
506	NC_011653	ATGA	2	8	16630	16637	50 %	25 %	25 %	0 %	254555127
507	NC_011653	T	8	8	16641	16648	0 %	100 %	0 %	0 %	254555127
508	NC_011653	TTGC	3	12	16665	16676	0 %	50 %	25 %	25 %	254555127
509	NC_011653	TCTT	2	8	16701	16708	0 %	75 %	0 %	25 %	254555127
510	NC_011653	TGC	2	6	16717	16722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555127
511	NC_011653	GAA	2	6	16727	16732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555127
512	NC_011653	T	7	7	16839	16845	0 %	100 %	0 %	0 %	254555127
513	NC_011653	CAG	2	6	16884	16889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555127
514	NC_011653	CTT	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555127
515	NC_011653	CT	3	6	16936	16941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_011653	TCTG	2	8	17017	17024	0 %	50 %	25 %	25 %	217076148
517	NC_011653	AAT	2	6	17045	17050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076148
518	NC_011653	ATC	2	6	17070	17075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076148
519	NC_011653	A	7	7	17118	17124	100 %	0 %	0 %	0 %	217076148
520	NC_011653	AT	4	8	17127	17134	50 %	50 %	0 %	0 %	217076148
521	NC_011653	ATAA	2	8	17136	17143	75 %	25 %	0 %	0 %	217076148
522	NC_011653	GAT	2	6	17162	17167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076148
523	NC_011653	ATT	2	6	17238	17243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076148
524	NC_011653	A	7	7	17282	17288	100 %	0 %	0 %	0 %	217076148
525	NC_011653	GTT	2	6	17290	17295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076148
526	NC_011653	AAT	2	6	17298	17303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076148
527	NC_011653	ATA	2	6	17309	17314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076148
528	NC_011653	AAT	2	6	17319	17324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076148
529	NC_011653	ATTAA	2	10	17378	17387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011653	A	7	7	17386	17392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011653	CCT	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_011653	AGG	2	6	17405	17410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217076149
533	NC_011653	ACA	2	6	17434	17439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076149
534	NC_011653	CCAATT	2	12	17470	17481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076149
535	NC_011653	AAT	2	6	17482	17487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076149
536	NC_011653	CAA	2	6	17492	17497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076149
537	NC_011653	GAT	2	6	17506	17511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076149
538	NC_011653	A	6	6	17517	17522	100 %	0 %	0 %	0 %	217076149
539	NC_011653	TAA	2	6	17538	17543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076149
540	NC_011653	CAA	2	6	17555	17560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076149
541	NC_011653	ATT	2	6	17593	17598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011653	TTAA	2	8	17601	17608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011653	TAT	2	6	17626	17631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011653	T	7	7	17669	17675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011653	GAT	2	6	17677	17682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011653	TTG	2	6	17691	17696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011653	AT	4	8	17702	17709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011653	TA	3	6	17711	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011653	TTA	2	6	17755	17760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011653	TA	4	8	17768	17775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011653	TTA	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011653	TAA	2	6	17853	17858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011653	TCAA	2	8	17861	17868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_011653	TTA	2	6	17883	17888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
555	NC_011653	TTA	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
556	NC_011653	AAC	2	6	17981	17986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076150
557	NC_011653	TTC	2	6	17998	18003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076150
558	NC_011653	TTA	2	6	18066	18071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
559	NC_011653	A	7	7	18071	18077	100 %	0 %	0 %	0 %	217076150
560	NC_011653	ATT	2	6	18171	18176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
561	NC_011653	AGTT	2	8	18210	18217	25 %	50 %	25 %	0 %	217076150
562	NC_011653	TGT	2	6	18238	18243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076150
563	NC_011653	AG	3	6	18284	18289	50 %	0 %	50 %	0 %	217076150
564	NC_011653	GAAA	2	8	18344	18351	75 %	0 %	25 %	0 %	217076150
565	NC_011653	GTAG	2	8	18356	18363	25 %	25 %	50 %	0 %	217076150
566	NC_011653	ATA	2	6	18439	18444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076150
567	NC_011653	A	6	6	18464	18469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011653	TAA	2	6	18501	18506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011653	TA	3	6	18509	18514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011653	T	6	6	18522	18527	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
571	NC_011653	ACA	3	9	18555	18563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076151
572	NC_011653	TCA	2	6	18600	18605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076151
573	NC_011653	A	6	6	18605	18610	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
574	NC_011653	ATT	2	6	18651	18656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076151
575	NC_011653	TCTT	2	8	18679	18686	0 %	75 %	0 %	25 %	217076151
576	NC_011653	AAT	2	6	18694	18699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
577	NC_011653	AGT	2	6	18735	18740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076151
578	NC_011653	TAA	2	6	18753	18758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
579	NC_011653	TA	3	6	18772	18777	50 %	50 %	0 %	0 %	217076151
580	NC_011653	T	7	7	18866	18872	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
581	NC_011653	TAA	2	6	18892	18897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
582	NC_011653	TGC	2	6	18914	18919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076151
583	NC_011653	TAA	2	6	18929	18934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
584	NC_011653	T	6	6	18970	18975	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
585	NC_011653	ATA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
586	NC_011653	TAAAT	2	10	19025	19034	60 %	40 %	0 %	0 %	217076151
587	NC_011653	TA	3	6	19051	19056	50 %	50 %	0 %	0 %	217076151
588	NC_011653	AAAAC	2	10	19096	19105	80 %	0 %	0 %	20 %	217076151
589	NC_011653	AAAAG	2	10	19141	19150	80 %	0 %	20 %	0 %	217076151
590	NC_011653	A	6	6	19190	19195	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
591	NC_011653	T	6	6	19221	19226	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
592	NC_011653	A	6	6	19235	19240	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
593	NC_011653	AAT	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
594	NC_011653	A	7	7	19261	19267	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
595	NC_011653	TGA	3	9	19340	19348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076151
596	NC_011653	ATT	2	6	19359	19364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076151
597	NC_011653	ATT	2	6	19383	19388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011653	ATTT	2	8	19424	19431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011653	TAT	2	6	19501	19506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011653	ATACGA	2	12	19544	19555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076152
601	NC_011653	TTGAAA	2	12	19576	19587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076152
602	NC_011653	CTA	2	6	19605	19610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
603	NC_011653	A	8	8	19649	19656	100 %	0 %	0 %	0 %	217076152
604	NC_011653	GGC	2	6	19836	19841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217076152
605	NC_011653	ATC	2	6	19852	19857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
606	NC_011653	TGT	2	6	19874	19879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076152
607	NC_011653	CCA	2	6	19886	19891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076152
608	NC_011653	AGA	2	6	19908	19913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
609	NC_011653	AAAT	2	8	19940	19947	75 %	25 %	0 %	0 %	217076152
610	NC_011653	TGG	2	6	19976	19981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076152
611	NC_011653	CTA	2	6	19990	19995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
612	NC_011653	GGT	2	6	20046	20051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076152
613	NC_011653	AATG	2	8	20121	20128	50 %	25 %	25 %	0 %	217076152
614	NC_011653	AGA	2	6	20165	20170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
615	NC_011653	A	6	6	20195	20200	100 %	0 %	0 %	0 %	217076152
616	NC_011653	T	6	6	20212	20217	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
617	NC_011653	T	6	6	20286	20291	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
618	NC_011653	AAT	2	6	20331	20336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076152
619	NC_011653	ACA	2	6	20351	20356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076152
620	NC_011653	ATC	2	6	20390	20395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
621	NC_011653	T	6	6	20400	20405	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
622	NC_011653	AGA	2	6	20406	20411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
623	NC_011653	T	6	6	20435	20440	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
624	NC_011653	AT	4	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	217076152
625	NC_011653	ATC	2	6	20494	20499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076153
626	NC_011653	CTG	2	6	20579	20584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076153
627	NC_011653	AT	3	6	20603	20608	50 %	50 %	0 %	0 %	217076153
628	NC_011653	TAA	2	6	20622	20627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076153
629	NC_011653	A	7	7	20626	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
630	NC_011653	ACA	2	6	20662	20667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076153
631	NC_011653	TAA	2	6	20690	20695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076153
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633	NC_011653	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
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