MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 53059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_011653	T	6	6	2014807	2014812	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53002	NC_011653	TAA	2	6	2014815	2014820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217078044
53003	NC_011653	ATTTT	2	10	2014823	2014832	20 %	80 %	0 %	0 %	217078044
53004	NC_011653	TCA	2	6	2014853	2014858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217078044
53005	NC_011653	AAT	2	6	2014863	2014868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217078044
53006	NC_011653	T	6	6	2014882	2014887	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53007	NC_011653	A	6	6	2014901	2014906	100 %	0 %	0 %	0 %	217078044
53008	NC_011653	GGA	2	6	2014964	2014969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217078044
53009	NC_011653	A	6	6	2014984	2014989	100 %	0 %	0 %	0 %	217078044
53010	NC_011653	GAG	2	6	2014998	2015003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217078044
53011	NC_011653	TCT	2	6	2015012	2015017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53012	NC_011653	CTT	2	6	2015054	2015059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53013	NC_011653	TA	3	6	2015066	2015071	50 %	50 %	0 %	0 %	217078044
53014	NC_011653	TATT	2	8	2015166	2015173	25 %	75 %	0 %	0 %	217078044
53015	NC_011653	CATC	2	8	2015211	2015218	25 %	25 %	0 %	50 %	217078044
53016	NC_011653	ATTCT	2	10	2015303	2015312	20 %	60 %	0 %	20 %	217078044
53017	NC_011653	AAT	2	6	2015315	2015320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217078044
53018	NC_011653	GGA	2	6	2015387	2015392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217078044
53019	NC_011653	TTGT	2	8	2015403	2015410	0 %	75 %	25 %	0 %	217078044
53020	NC_011653	CCAT	2	8	2015473	2015480	25 %	25 %	0 %	50 %	217078044
53021	NC_011653	TTC	2	6	2015485	2015490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53022	NC_011653	AAT	2	6	2015504	2015509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217078044
53023	NC_011653	TATC	2	8	2015547	2015554	25 %	50 %	0 %	25 %	217078044
53024	NC_011653	GTATTT	2	12	2015560	2015571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217078044
53025	NC_011653	TTG	2	6	2015614	2015619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217078044
53026	NC_011653	AT	3	6	2015620	2015625	50 %	50 %	0 %	0 %	217078044
53027	NC_011653	TTC	2	6	2015626	2015631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53028	NC_011653	T	6	6	2015632	2015637	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53029	NC_011653	TCA	2	6	2015645	2015650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217078044
53030	NC_011653	TGT	2	6	2015681	2015686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217078044
53031	NC_011653	TCC	2	6	2015728	2015733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217078044
53032	NC_011653	CTA	2	6	2015742	2015747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217078044
53033	NC_011653	CTAT	2	8	2015750	2015757	25 %	50 %	0 %	25 %	217078044
53034	NC_011653	TTA	2	6	2015760	2015765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217078044
53035	NC_011653	GTTC	2	8	2015814	2015821	0 %	50 %	25 %	25 %	217078044
53036	NC_011653	TAT	2	6	2015842	2015847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217078044
53037	NC_011653	T	7	7	2015859	2015865	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53038	NC_011653	ATAC	2	8	2015931	2015938	50 %	25 %	0 %	25 %	217078044
53039	NC_011653	TTTG	2	8	2016000	2016007	0 %	75 %	25 %	0 %	217078044
53040	NC_011653	TCT	2	6	2016035	2016040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53041	NC_011653	GTT	2	6	2016041	2016046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217078044
53042	NC_011653	TTA	2	6	2016075	2016080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217078044
53043	NC_011653	TCTT	2	8	2016096	2016103	0 %	75 %	0 %	25 %	217078044
53044	NC_011653	AT	3	6	2016115	2016120	50 %	50 %	0 %	0 %	217078044
53045	NC_011653	TTTGTC	2	12	2016139	2016150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	217078044
53046	NC_011653	ATT	2	6	2016170	2016175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217078044
53047	NC_011653	T	6	6	2016178	2016183	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53048	NC_011653	T	6	6	2016193	2016198	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53049	NC_011653	TTTATC	2	12	2016254	2016265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217078044
53050	NC_011653	T	7	7	2016281	2016287	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044
53051	NC_011653	ACA	2	6	2016303	2016308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217078044
53052	NC_011653	AT	3	6	2016361	2016366	50 %	50 %	0 %	0 %	217078044
53053	NC_011653	GT	3	6	2016381	2016386	0 %	50 %	50 %	0 %	217078044
53054	NC_011653	TAA	2	6	2016392	2016397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217078044
53055	NC_011653	ATTA	2	8	2016496	2016503	50 %	50 %	0 %	0 %	217078044
53056	NC_011653	TTC	2	6	2016505	2016510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53057	NC_011653	TCT	2	6	2016590	2016595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217078044
53058	NC_011653	TAAA	2	8	2016600	2016607	75 %	25 %	0 %	0 %	217078044
53059	NC_011653	T	7	7	2016648	2016654	0 %	100 %	0 %	0 %	217078044

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.