MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_011529	GCT	2	6	1823900	1823905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225094
36002	NC_011529	TTCC	2	8	1823912	1823919	0 %	50 %	0 %	50 %	212225094
36003	NC_011529	CTT	2	6	1823976	1823981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225094
36004	NC_011529	GCACG	2	10	1824057	1824066	20 %	0 %	40 %	40 %	212225094
36005	NC_011529	CGTG	2	8	1824074	1824081	0 %	25 %	50 %	25 %	212225094
36006	NC_011529	GAG	2	6	1824108	1824113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225094
36007	NC_011529	ATC	2	6	1824120	1824125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225094
36008	NC_011529	TAT	2	6	1824153	1824158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225094
36009	NC_011529	CGT	2	6	1824218	1824223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225094
36010	NC_011529	GAG	2	6	1824348	1824353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225094
36011	NC_011529	GTC	2	6	1824409	1824414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225094
36012	NC_011529	AGT	2	6	1824419	1824424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225094
36013	NC_011529	TCG	2	6	1824466	1824471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225094
36014	NC_011529	TCC	2	6	1824472	1824477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225094
36015	NC_011529	TC	4	8	1824491	1824498	0 %	50 %	0 %	50 %	212225094
36016	NC_011529	CCCA	2	8	1824526	1824533	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36017	NC_011529	GTT	2	6	1824598	1824603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36018	NC_011529	TCT	2	6	1824653	1824658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225095
36019	NC_011529	CG	3	6	1824690	1824695	0 %	0 %	50 %	50 %	212225095
36020	NC_011529	GTC	2	6	1824771	1824776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225095
36021	NC_011529	CAGC	2	8	1824824	1824831	25 %	0 %	25 %	50 %	212225095
36022	NC_011529	TTC	2	6	1824832	1824837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225095
36023	NC_011529	CTTT	2	8	1824873	1824880	0 %	75 %	0 %	25 %	212225095
36024	NC_011529	GAG	2	6	1824990	1824995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225095
36025	NC_011529	ACC	2	6	1825039	1825044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36026	NC_011529	AG	3	6	1825055	1825060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36027	NC_011529	TGA	2	6	1825071	1825076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225096
36028	NC_011529	CTG	2	6	1825100	1825105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225096
36029	NC_011529	CCTG	2	8	1825110	1825117	0 %	25 %	25 %	50 %	212225096
36030	NC_011529	GAG	2	6	1825231	1825236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225096
36031	NC_011529	CCT	2	6	1825246	1825251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36032	NC_011529	CTC	3	9	1825273	1825281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36033	NC_011529	GAG	2	6	1825300	1825305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225096
36034	NC_011529	CGG	2	6	1825336	1825341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225096
36035	NC_011529	ACG	2	6	1825361	1825366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225096
36036	NC_011529	GCCGAC	2	12	1825414	1825425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212225096
36037	NC_011529	CCT	2	6	1825443	1825448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36038	NC_011529	CGA	2	6	1825449	1825454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225096
36039	NC_011529	TCC	2	6	1825459	1825464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36040	NC_011529	GGT	2	6	1825486	1825491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225096
36041	NC_011529	CTC	2	6	1825519	1825524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36042	NC_011529	TCG	2	6	1825553	1825558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225096
36043	NC_011529	CCG	2	6	1825589	1825594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225096
36044	NC_011529	CCG	2	6	1825601	1825606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225096
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36046	NC_011529	GGC	2	6	1825670	1825675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225096
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36048	NC_011529	ATT	2	6	1825766	1825771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225096
36049	NC_011529	TTG	2	6	1825859	1825864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225096
36050	NC_011529	TTG	2	6	1825995	1826000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225096
36051	NC_011529	TCA	2	6	1826001	1826006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225096
36052	NC_011529	CTCTC	2	10	1826040	1826049	0 %	40 %	0 %	60 %	212225096
36053	NC_011529	CTC	2	6	1826170	1826175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225096
36054	NC_011529	ACCA	2	8	1826242	1826249	50 %	0 %	0 %	50 %	212225096
36055	NC_011529	CTT	3	9	1826281	1826289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225096
36056	NC_011529	TCT	2	6	1826295	1826300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225096
36057	NC_011529	AG	3	6	1826316	1826321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36058	NC_011529	TTA	2	6	1826331	1826336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36059	NC_011529	GAA	2	6	1826351	1826356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36060	NC_011529	AGG	2	6	1826405	1826410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36061	NC_011529	AGA	2	6	1826417	1826422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225097
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36068	NC_011529	CCTG	2	8	1826738	1826745	0 %	25 %	25 %	50 %	212225097
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36071	NC_011529	CCT	2	6	1826802	1826807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36072	NC_011529	CCA	2	6	1826844	1826849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36073	NC_011529	T	6	6	1826892	1826897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36074	NC_011529	CT	3	6	1826902	1826907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36075	NC_011529	GGT	2	6	1826908	1826913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36076	NC_011529	GA	4	8	1826930	1826937	50 %	0 %	50 %	0 %	212225098
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36083	NC_011529	GCT	2	6	1827367	1827372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225099
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36088	NC_011529	TC	3	6	1827481	1827486	0 %	50 %	0 %	50 %	212225099
36089	NC_011529	TCT	3	9	1827565	1827573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225099
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36092	NC_011529	ATT	2	6	1827780	1827785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36108	NC_011529	TTGG	2	8	1828599	1828606	0 %	50 %	50 %	0 %	212225101
36109	NC_011529	CTT	2	6	1828637	1828642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225101
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36112	NC_011529	GAT	2	6	1828729	1828734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225101
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36117	NC_011529	C	6	6	1829076	1829081	0 %	0 %	0 %	100 %	212225102
36118	NC_011529	AG	3	6	1829117	1829122	50 %	0 %	50 %	0 %	212225102
36119	NC_011529	CGG	2	6	1829144	1829149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225102
36120	NC_011529	GAC	2	6	1829165	1829170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225102
36121	NC_011529	CCT	2	6	1829171	1829176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225102
36122	NC_011529	C	6	6	1829258	1829263	0 %	0 %	0 %	100 %	212225102
36123	NC_011529	AGCTT	2	10	1829274	1829283	20 %	40 %	20 %	20 %	212225102
36124	NC_011529	ACT	2	6	1829332	1829337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225102
36125	NC_011529	CCAG	2	8	1829356	1829363	25 %	0 %	25 %	50 %	212225102
36126	NC_011529	TAC	2	6	1829441	1829446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225102
36127	NC_011529	CT	3	6	1829541	1829546	0 %	50 %	0 %	50 %	212225102
36128	NC_011529	CT	3	6	1829562	1829567	0 %	50 %	0 %	50 %	212225102
36129	NC_011529	GAGG	2	8	1829621	1829628	25 %	0 %	75 %	0 %	212225102
36130	NC_011529	G	6	6	1829656	1829661	0 %	0 %	100 %	0 %	212225102
36131	NC_011529	AAT	2	6	1829700	1829705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212225102
36132	NC_011529	CGGAA	2	10	1829717	1829726	40 %	0 %	40 %	20 %	212225102
36133	NC_011529	TCTG	2	8	1829795	1829802	0 %	50 %	25 %	25 %	212225102
36134	NC_011529	AGCG	2	8	1829811	1829818	25 %	0 %	50 %	25 %	212225102
36135	NC_011529	CGT	2	6	1829825	1829830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225102
36136	NC_011529	TGGT	2	8	1829914	1829921	0 %	50 %	50 %	0 %	212225102
36137	NC_011529	AGA	2	6	1830017	1830022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225102
36138	NC_011529	GA	3	6	1830027	1830032	50 %	0 %	50 %	0 %	212225102
36139	NC_011529	GCG	2	6	1830073	1830078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225102
36140	NC_011529	GAG	2	6	1830102	1830107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225102
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36142	NC_011529	GGA	2	6	1830311	1830316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225103
36143	NC_011529	GATA	2	8	1830346	1830353	50 %	25 %	25 %	0 %	212225103
36144	NC_011529	G	6	6	1830384	1830389	0 %	0 %	100 %	0 %	212225103
36145	NC_011529	CTA	2	6	1830412	1830417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225103
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36148	NC_011529	AG	3	6	1830665	1830670	50 %	0 %	50 %	0 %	212225103
36149	NC_011529	TTA	2	6	1830672	1830677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225103
36150	NC_011529	GAA	2	6	1830742	1830747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225103
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36152	NC_011529	TTCC	2	8	1830800	1830807	0 %	50 %	0 %	50 %	212225103
36153	NC_011529	CTA	2	6	1830832	1830837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225103
36154	NC_011529	GCT	2	6	1830928	1830933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225103
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36159	NC_011529	GCTG	2	8	1831125	1831132	0 %	25 %	50 %	25 %	212225104
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36161	NC_011529	A	6	6	1831200	1831205	100 %	0 %	0 %	0 %	212225104
36162	NC_011529	TCA	2	6	1831285	1831290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225104
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36165	NC_011529	TGG	2	6	1831315	1831320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225104
36166	NC_011529	TCAT	2	8	1831339	1831346	25 %	50 %	0 %	25 %	212225104
36167	NC_011529	AAAGAG	2	12	1831414	1831425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36168	NC_011529	GTA	2	6	1831439	1831444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225105
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36172	NC_011529	GAT	2	6	1831538	1831543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225105
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36194	NC_011529	GTC	2	6	1832536	1832541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225106
36195	NC_011529	CGG	2	6	1832571	1832576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225106
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36199	NC_011529	CCT	2	6	1832628	1832633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225107
36200	NC_011529	TC	4	8	1832658	1832665	0 %	50 %	0 %	50 %	212225107
36201	NC_011529	GTC	2	6	1832719	1832724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225107
36202	NC_011529	ACG	2	6	1832726	1832731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225107
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36205	NC_011529	CTC	3	9	1832773	1832781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225107
36206	NC_011529	CTG	2	6	1832792	1832797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225107
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36209	NC_011529	TCG	2	6	1832885	1832890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225107
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36211	NC_011529	GTC	2	6	1832923	1832928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225107
36212	NC_011529	GAT	2	6	1832941	1832946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225107
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36220	NC_011529	TAT	2	6	1833202	1833207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225107
36221	NC_011529	CT	3	6	1833250	1833255	0 %	50 %	0 %	50 %	212225107
36222	NC_011529	GAT	2	6	1833268	1833273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225107
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36224	NC_011529	GTA	2	6	1833304	1833309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225107
36225	NC_011529	CGG	2	6	1833418	1833423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225107
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36227	NC_011529	TCC	2	6	1833527	1833532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225107
36228	NC_011529	TCCTC	2	10	1833591	1833600	0 %	40 %	0 %	60 %	212225107
36229	NC_011529	ATC	2	6	1833635	1833640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225107
36230	NC_011529	GAT	2	6	1833643	1833648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225107
36231	NC_011529	GTG	2	6	1833699	1833704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36232	NC_011529	TCC	2	6	1833755	1833760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36233	NC_011529	TCT	2	6	1833822	1833827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225108
36234	NC_011529	TCT	2	6	1833831	1833836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225108
36235	NC_011529	ACC	2	6	1833879	1833884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225108
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36307	NC_011529	GGA	2	6	1837667	1837672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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