MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	AGCAA	2	10	2776	2785	60 %	0 %	20 %	20 %	206890766
2	NC_011296	ATGGT	2	10	5472	5481	20 %	40 %	40 %	0 %	206890334
3	NC_011296	CAATG	2	10	5982	5991	40 %	20 %	20 %	20 %	206890334
4	NC_011296	ACAAT	2	10	6322	6331	60 %	20 %	0 %	20 %	206891022
5	NC_011296	ACATC	2	10	7345	7354	40 %	20 %	0 %	40 %	206889766
6	NC_011296	AAAAG	2	10	8386	8395	80 %	0 %	20 %	0 %	206889766
7	NC_011296	TTTTG	2	10	8802	8811	0 %	80 %	20 %	0 %	206890613
8	NC_011296	ATTTT	2	10	9067	9076	20 %	80 %	0 %	0 %	206890613
9	NC_011296	TTATT	2	10	11516	11525	20 %	80 %	0 %	0 %	206889475
10	NC_011296	AAAAT	2	10	11561	11570	80 %	20 %	0 %	0 %	206889475
11	NC_011296	ATTTT	2	10	12055	12064	20 %	80 %	0 %	0 %	206889475
12	NC_011296	CAAAA	2	10	12381	12390	80 %	0 %	0 %	20 %	206889475
13	NC_011296	TTTAA	2	10	13925	13934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011296	TACAA	2	10	18502	18511	60 %	20 %	0 %	20 %	206889996
15	NC_011296	AGAGA	2	10	19447	19456	60 %	0 %	40 %	0 %	206890029
16	NC_011296	AAACA	2	10	20374	20383	80 %	0 %	0 %	20 %	206890925
17	NC_011296	AATAA	2	10	20460	20469	80 %	20 %	0 %	0 %	206890925
18	NC_011296	ATTTT	2	10	21806	21815	20 %	80 %	0 %	0 %	206889647
19	NC_011296	AACAG	2	10	22654	22663	60 %	0 %	20 %	20 %	206889393
20	NC_011296	ACCAT	2	10	24024	24033	40 %	20 %	0 %	40 %	206889393
21	NC_011296	CCTTT	2	10	24701	24710	0 %	60 %	0 %	40 %	206889524
22	NC_011296	AGATG	2	10	25625	25634	40 %	20 %	40 %	0 %	206889524
23	NC_011296	TACAA	2	10	27412	27421	60 %	20 %	0 %	20 %	206889293
24	NC_011296	AAACT	2	10	27634	27643	60 %	20 %	0 %	20 %	206889293
25	NC_011296	ATACC	2	10	27706	27715	40 %	20 %	0 %	40 %	206889293
26	NC_011296	AAAAT	2	10	28258	28267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011296	TAAAT	2	10	28329	28338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011296	AGAAA	2	10	28561	28570	80 %	0 %	20 %	0 %	206891045
29	NC_011296	CTTTT	2	10	31611	31620	0 %	80 %	0 %	20 %	206890784
30	NC_011296	AAAAC	2	10	33273	33282	80 %	0 %	0 %	20 %	206890152
31	NC_011296	CTTTC	2	10	33866	33875	0 %	60 %	0 %	40 %	206890301
32	NC_011296	AAAGG	2	10	38158	38167	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011296	AGTAA	2	10	38967	38976	60 %	20 %	20 %	0 %	206889671
34	NC_011296	TTTTG	2	10	39424	39433	0 %	80 %	20 %	0 %	206889671
35	NC_011296	TCCAA	2	10	40101	40110	40 %	20 %	0 %	40 %	206889671
36	NC_011296	TTGCA	2	10	40182	40191	20 %	40 %	20 %	20 %	206889671
37	NC_011296	TATAG	2	10	41826	41835	40 %	40 %	20 %	0 %	206889193
38	NC_011296	TAAAA	2	10	42606	42615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011296	TTTTA	2	10	43715	43724	20 %	80 %	0 %	0 %	206890129
40	NC_011296	GCAGA	2	10	46390	46399	40 %	0 %	40 %	20 %	206891146
41	NC_011296	TTTTC	2	10	48268	48277	0 %	80 %	0 %	20 %	206889694
42	NC_011296	AAAAG	2	10	49775	49784	80 %	0 %	20 %	0 %	206890921
43	NC_011296	TTTTA	2	10	53264	53273	20 %	80 %	0 %	0 %	206889733
44	NC_011296	AAGCA	2	10	55659	55668	60 %	0 %	20 %	20 %	206890623
45	NC_011296	TAATA	2	10	57211	57220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011296	AGTTA	2	10	58570	58579	40 %	40 %	20 %	0 %	206890528
47	NC_011296	TTTTA	2	10	59141	59150	20 %	80 %	0 %	0 %	206890331
48	NC_011296	AGAAA	2	10	60679	60688	80 %	0 %	20 %	0 %	206889375
49	NC_011296	AATTT	2	10	61156	61165	40 %	60 %	0 %	0 %	206889736
50	NC_011296	GGAGA	2	10	63647	63656	40 %	0 %	60 %	0 %	206889450
51	NC_011296	TTTTA	2	10	64411	64420	20 %	80 %	0 %	0 %	206889450
52	NC_011296	AGGAA	2	10	66508	66517	60 %	0 %	40 %	0 %	206890839
53	NC_011296	CTTTA	2	10	66916	66925	20 %	60 %	0 %	20 %	206890839
54	NC_011296	AGAAC	2	10	68676	68685	60 %	0 %	20 %	20 %	206889594
55	NC_011296	GGAAA	2	10	69025	69034	60 %	0 %	40 %	0 %	206889594
56	NC_011296	ATTTT	2	10	69196	69205	20 %	80 %	0 %	0 %	206890262
57	NC_011296	ATGTT	2	10	69996	70005	20 %	60 %	20 %	0 %	206890262
58	NC_011296	GAAAT	2	10	70397	70406	60 %	20 %	20 %	0 %	206890814
59	NC_011296	ACAGG	2	10	70414	70423	40 %	0 %	40 %	20 %	206890814
60	NC_011296	TTTTA	2	10	72284	72293	20 %	80 %	0 %	0 %	206891046
61	NC_011296	CCTTT	2	10	72453	72462	0 %	60 %	0 %	40 %	206891046
62	NC_011296	CTAAC	2	10	72653	72662	40 %	20 %	0 %	40 %	206891046
63	NC_011296	CTTCT	2	10	72813	72822	0 %	60 %	0 %	40 %	206891046
64	NC_011296	GCAGT	2	10	73105	73114	20 %	20 %	40 %	20 %	206891046
65	NC_011296	ACAGA	2	10	73646	73655	60 %	0 %	20 %	20 %	206891046
66	NC_011296	TTTAT	2	10	73768	73777	20 %	80 %	0 %	0 %	206891046
67	NC_011296	AATGA	2	10	76134	76143	60 %	20 %	20 %	0 %	206890330
68	NC_011296	GGAAG	2	10	77061	77070	40 %	0 %	60 %	0 %	206889412
69	NC_011296	ATTTT	2	10	77874	77883	20 %	80 %	0 %	0 %	206890988
70	NC_011296	GGTTC	2	10	78749	78758	0 %	40 %	40 %	20 %	206890451
71	NC_011296	TAAAA	2	10	80242	80251	80 %	20 %	0 %	0 %	206890296
72	NC_011296	ATATG	2	10	81584	81593	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011296	TTGAA	2	10	81607	81616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011296	GCTAC	2	10	83534	83543	20 %	20 %	20 %	40 %	206890761
75	NC_011296	AAAGC	2	10	83851	83860	60 %	0 %	20 %	20 %	206890761
76	NC_011296	TCATA	2	10	84852	84861	40 %	40 %	0 %	20 %	206889866
77	NC_011296	TTTGT	2	10	87163	87172	0 %	80 %	20 %	0 %	206890823
78	NC_011296	TTTGA	2	10	87656	87665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011296	AAAAC	2	10	87691	87700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011296	TTAAA	2	10	89130	89139	60 %	40 %	0 %	0 %	206890139
81	NC_011296	CTTTT	2	10	89148	89157	0 %	80 %	0 %	20 %	206890139
82	NC_011296	CATTG	2	10	90314	90323	20 %	40 %	20 %	20 %	206890139
83	NC_011296	AGAGT	2	10	91170	91179	40 %	20 %	40 %	0 %	206891170
84	NC_011296	TTTAG	2	10	91430	91439	20 %	60 %	20 %	0 %	206891170
85	NC_011296	AAGAA	3	15	91459	91473	80 %	0 %	20 %	0 %	206891170
86	NC_011296	TTAAA	2	10	92348	92357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011296	CTTCT	2	10	97446	97455	0 %	60 %	0 %	40 %	206891173
88	NC_011296	TTTAT	2	10	100233	100242	20 %	80 %	0 %	0 %	206890518
89	NC_011296	GTCAC	2	10	102762	102771	20 %	20 %	20 %	40 %	206890984
90	NC_011296	GTAAA	2	10	106470	106479	60 %	20 %	20 %	0 %	206889506
91	NC_011296	AATTA	2	10	107771	107780	60 %	40 %	0 %	0 %	206889208
92	NC_011296	TTTCA	2	10	111224	111233	20 %	60 %	0 %	20 %	206890455
93	NC_011296	AGCTC	2	10	114078	114087	20 %	20 %	20 %	40 %	206889799
94	NC_011296	TTAAA	2	10	114435	114444	60 %	40 %	0 %	0 %	206891120
95	NC_011296	TTTTC	2	10	115730	115739	0 %	80 %	0 %	20 %	206889991
96	NC_011296	TCATT	2	10	116432	116441	20 %	60 %	0 %	20 %	206889991
97	NC_011296	AAGAA	2	10	118238	118247	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011296	CAAAG	2	10	119892	119901	60 %	0 %	20 %	20 %	206890279
99	NC_011296	GAAAA	2	10	122973	122982	80 %	0 %	20 %	0 %	206891108
100	NC_011296	ATGGA	2	10	123305	123314	40 %	20 %	40 %	0 %	206891108
101	NC_011296	GAAAA	2	10	123493	123502	80 %	0 %	20 %	0 %	206891108
102	NC_011296	AGAAA	2	10	124113	124122	80 %	0 %	20 %	0 %	206890903
103	NC_011296	GCACA	2	10	124758	124767	40 %	0 %	20 %	40 %	206889670
104	NC_011296	ACAGG	2	10	125027	125036	40 %	0 %	40 %	20 %	206889670
105	NC_011296	AGTAA	2	10	127018	127027	60 %	20 %	20 %	0 %	206891001
106	NC_011296	TATTT	2	10	127517	127526	20 %	80 %	0 %	0 %	206889856
107	NC_011296	AGATA	2	10	127591	127600	60 %	20 %	20 %	0 %	206889856
108	NC_011296	TTTTC	2	10	127895	127904	0 %	80 %	0 %	20 %	206889856
109	NC_011296	AGTAA	2	10	129046	129055	60 %	20 %	20 %	0 %	206889856
110	NC_011296	TTATC	2	10	129607	129616	20 %	60 %	0 %	20 %	206889378
111	NC_011296	ATGAA	2	10	130668	130677	60 %	20 %	20 %	0 %	206889378
112	NC_011296	GATGC	2	10	130844	130853	20 %	20 %	40 %	20 %	206889378
113	NC_011296	TTTCA	2	10	131554	131563	20 %	60 %	0 %	20 %	206890811
114	NC_011296	GTTTC	2	10	132293	132302	0 %	60 %	20 %	20 %	206890811
115	NC_011296	AAATT	2	10	133087	133096	60 %	40 %	0 %	0 %	206890811
116	NC_011296	TTAAT	2	10	133412	133421	40 %	60 %	0 %	0 %	206890811
117	NC_011296	AATTA	2	10	133686	133695	60 %	40 %	0 %	0 %	206890811
118	NC_011296	TCTTT	2	10	133931	133940	0 %	80 %	0 %	20 %	206890320
119	NC_011296	TTGTT	2	10	136011	136020	0 %	80 %	20 %	0 %	206889598
120	NC_011296	GAACA	2	10	136735	136744	60 %	0 %	20 %	20 %	206889598
121	NC_011296	ATGGG	2	10	136777	136786	20 %	20 %	60 %	0 %	206889598
122	NC_011296	TCCTT	2	10	145526	145535	0 %	60 %	0 %	40 %	206890944
123	NC_011296	AAAAT	2	10	145636	145645	80 %	20 %	0 %	0 %	206890944
124	NC_011296	TGTTT	2	10	145729	145738	0 %	80 %	20 %	0 %	206890944
125	NC_011296	AACAA	2	10	146689	146698	80 %	0 %	0 %	20 %	206890944
126	NC_011296	GTTAT	2	10	146753	146762	20 %	60 %	20 %	0 %	206890944
127	NC_011296	GCAGA	2	10	147394	147403	40 %	0 %	40 %	20 %	206890058
128	NC_011296	GAAGG	2	10	149629	149638	40 %	0 %	60 %	0 %	206891166
129	NC_011296	CCATA	2	10	149930	149939	40 %	20 %	0 %	40 %	206891166
130	NC_011296	TACAA	2	10	150774	150783	60 %	20 %	0 %	20 %	206889344
131	NC_011296	TTTGG	2	10	152296	152305	0 %	60 %	40 %	0 %	206890510
132	NC_011296	ATTCA	2	10	152400	152409	40 %	40 %	0 %	20 %	206890510
133	NC_011296	TTATT	2	10	157858	157867	20 %	80 %	0 %	0 %	206890794
134	NC_011296	AGGAG	2	10	158204	158213	40 %	0 %	60 %	0 %	206890794
135	NC_011296	TTCTT	2	10	159613	159622	0 %	80 %	0 %	20 %	206889588
136	NC_011296	TTTGA	2	10	162248	162257	20 %	60 %	20 %	0 %	206889477
137	NC_011296	AAAAT	2	10	165718	165727	80 %	20 %	0 %	0 %	206890569
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