MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 49437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011296	AAC	2	6	161562	161567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889477
4002	NC_011296	AAG	2	6	161578	161583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889477
4003	NC_011296	TTG	2	6	161589	161594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889477
4004	NC_011296	CTT	2	6	161654	161659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889477
4005	NC_011296	A	6	6	161690	161695	100 %	0 %	0 %	0 %	206889477
4006	NC_011296	ATT	2	6	161705	161710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889477
4007	NC_011296	AGA	2	6	161743	161748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889477
4008	NC_011296	A	8	8	161859	161866	100 %	0 %	0 %	0 %	206889477
4009	NC_011296	TCC	2	6	161890	161895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889477
4010	NC_011296	CTAT	2	8	161904	161911	25 %	50 %	0 %	25 %	206889477
4011	NC_011296	TGG	2	6	162124	162129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889477
4012	NC_011296	TGGC	2	8	162175	162182	0 %	25 %	50 %	25 %	206889477
4013	NC_011296	TTTGA	2	10	162248	162257	20 %	60 %	20 %	0 %	206889477
4014	NC_011296	AAAT	2	8	162259	162266	75 %	25 %	0 %	0 %	206889477
4015	NC_011296	T	6	6	162269	162274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011296	ATT	2	6	162282	162287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011296	CATC	2	8	162354	162361	25 %	25 %	0 %	50 %	206890317
4018	NC_011296	AGA	2	6	162365	162370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890317
4019	NC_011296	TGC	2	6	162377	162382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890317
4020	NC_011296	CTA	2	6	162400	162405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890317
4021	NC_011296	A	6	6	162484	162489	100 %	0 %	0 %	0 %	206890317
4022	NC_011296	TAC	2	6	162509	162514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890317
4023	NC_011296	CAT	3	9	162516	162524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890317
4024	NC_011296	T	6	6	162559	162564	0 %	100 %	0 %	0 %	206890317
4025	NC_011296	TA	3	6	162594	162599	50 %	50 %	0 %	0 %	206890317
4026	NC_011296	TCCT	2	8	162749	162756	0 %	50 %	0 %	50 %	206890317
4027	NC_011296	AGA	2	6	162776	162781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890317
4028	NC_011296	A	6	6	162793	162798	100 %	0 %	0 %	0 %	206890317
4029	NC_011296	TAAA	2	8	162810	162817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011296	AGG	2	6	162825	162830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011296	GCA	2	6	162914	162919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889337
4032	NC_011296	CAAT	2	8	162976	162983	50 %	25 %	0 %	25 %	206889337
4033	NC_011296	A	6	6	163000	163005	100 %	0 %	0 %	0 %	206889337
4034	NC_011296	GGA	2	6	163029	163034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206889337
4035	NC_011296	A	6	6	163070	163075	100 %	0 %	0 %	0 %	206889337
4036	NC_011296	A	6	6	163101	163106	100 %	0 %	0 %	0 %	206889337
4037	NC_011296	GAA	2	6	163113	163118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889337
4038	NC_011296	GAA	2	6	163203	163208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889337
4039	NC_011296	CTT	2	6	163239	163244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889337
4040	NC_011296	GAG	2	6	163245	163250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206889337
4041	NC_011296	CTC	2	6	163338	163343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890570
4042	NC_011296	AAC	2	6	163358	163363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890570
4043	NC_011296	TGA	2	6	163375	163380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890570
4044	NC_011296	AT	3	6	163422	163427	50 %	50 %	0 %	0 %	206890570
4045	NC_011296	A	6	6	163461	163466	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4046	NC_011296	A	6	6	163468	163473	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4047	NC_011296	TAT	2	6	163474	163479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890570
4048	NC_011296	A	6	6	163518	163523	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4049	NC_011296	TA	3	6	163553	163558	50 %	50 %	0 %	0 %	206890570
4050	NC_011296	A	6	6	163571	163576	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4051	NC_011296	GAT	2	6	163681	163686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890570
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4053	NC_011296	A	6	6	163725	163730	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4054	NC_011296	TCA	2	6	163734	163739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890570
4055	NC_011296	GA	3	6	163775	163780	50 %	0 %	50 %	0 %	206890570
4056	NC_011296	TGA	3	9	163783	163791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890570
4057	NC_011296	AAT	2	6	163799	163804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890570
4058	NC_011296	ACT	2	6	163839	163844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890570
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4062	NC_011296	AAGCAA	2	12	164001	164012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	206890570
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4064	NC_011296	GTA	2	6	164127	164132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890570
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4066	NC_011296	A	6	6	164260	164265	100 %	0 %	0 %	0 %	206890570
4067	NC_011296	ATGG	2	8	164292	164299	25 %	25 %	50 %	0 %	206890570
4068	NC_011296	AT	3	6	164319	164324	50 %	50 %	0 %	0 %	206890570
4069	NC_011296	GTT	2	6	164353	164358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890570
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4072	NC_011296	AGG	2	6	164472	164477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011296	AAT	2	6	164481	164486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889669
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4078	NC_011296	ATT	2	6	164601	164606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889669
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4082	NC_011296	AAG	2	6	164693	164698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889669
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4087	NC_011296	A	6	6	164860	164865	100 %	0 %	0 %	0 %	206889669
4088	NC_011296	ACT	2	6	164876	164881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889669
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4091	NC_011296	CTCC	2	8	164989	164996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4092	NC_011296	GGAG	2	8	165002	165009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_011296	A	7	7	165106	165112	100 %	0 %	0 %	0 %	206890758
4095	NC_011296	GATG	2	8	165170	165177	25 %	25 %	50 %	0 %	206890758
4096	NC_011296	TGA	2	6	165205	165210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890758
4097	NC_011296	GA	3	6	165235	165240	50 %	0 %	50 %	0 %	206890758
4098	NC_011296	ATT	3	9	165251	165259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890758
4099	NC_011296	T	9	9	165272	165280	0 %	100 %	0 %	0 %	206890758
4100	NC_011296	AT	3	6	165340	165345	50 %	50 %	0 %	0 %	206890758
4101	NC_011296	A	8	8	165349	165356	100 %	0 %	0 %	0 %	206890758
4102	NC_011296	A	8	8	165374	165381	100 %	0 %	0 %	0 %	206890758
4103	NC_011296	A	6	6	165410	165415	100 %	0 %	0 %	0 %	206890758
4104	NC_011296	T	6	6	165457	165462	0 %	100 %	0 %	0 %	206890758
4105	NC_011296	AG	3	6	165479	165484	50 %	0 %	50 %	0 %	206890758
4106	NC_011296	ATG	2	6	165510	165515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890758
4107	NC_011296	TAG	2	6	165540	165545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890758
4108	NC_011296	A	6	6	165583	165588	100 %	0 %	0 %	0 %	206890758
4109	NC_011296	TAA	2	6	165626	165631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890569
4110	NC_011296	GAA	2	6	165681	165686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890569
4111	NC_011296	AAAAT	2	10	165718	165727	80 %	20 %	0 %	0 %	206890569
4112	NC_011296	GGT	2	6	165747	165752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890569
4113	NC_011296	TA	3	6	165763	165768	50 %	50 %	0 %	0 %	206890569
4114	NC_011296	A	6	6	165788	165793	100 %	0 %	0 %	0 %	206890569
4115	NC_011296	A	6	6	165854	165859	100 %	0 %	0 %	0 %	206890569
4116	NC_011296	ATCA	2	8	165902	165909	50 %	25 %	0 %	25 %	206890569
4117	NC_011296	GGA	2	6	165923	165928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890569
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4120	NC_011296	ATT	2	6	166039	166044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890569
4121	NC_011296	GAAA	2	8	166064	166071	75 %	0 %	25 %	0 %	206890569
4122	NC_011296	ATTT	2	8	166132	166139	25 %	75 %	0 %	0 %	206890569
4123	NC_011296	TCT	2	6	166256	166261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890569
4124	NC_011296	GAA	2	6	166272	166277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890569
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4126	NC_011296	AT	3	6	166363	166368	50 %	50 %	0 %	0 %	206890569
4127	NC_011296	ATA	2	6	166372	166377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890569
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4130	NC_011296	ATT	2	6	166428	166433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890569
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4132	NC_011296	GGA	2	6	166481	166486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890569
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4134	NC_011296	GAT	2	6	166492	166497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890569
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4155	NC_011296	TA	3	6	167165	167170	50 %	50 %	0 %	0 %	206891006
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4241	NC_011296	GCAA	2	8	170604	170611	50 %	0 %	25 %	25 %	206889219
4242	NC_011296	GTT	2	6	170622	170627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889219
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4245	NC_011296	CTT	2	6	170742	170747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891054
4246	NC_011296	ATT	2	6	170753	170758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206891054
4247	NC_011296	TTTC	2	8	170835	170842	0 %	75 %	0 %	25 %	206891054
4248	NC_011296	TCT	2	6	170900	170905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206891054
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4250	NC_011296	TCA	2	6	170921	170926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206891054
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