MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 49437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011296	AATAA	2	10	20460	20469	80 %	20 %	0 %	0 %	206890925
502	NC_011296	T	6	6	20479	20484	0 %	100 %	0 %	0 %	206890925
503	NC_011296	CAG	2	6	20487	20492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890925
504	NC_011296	TAA	2	6	20518	20523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890925
505	NC_011296	CTT	2	6	20526	20531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890925
506	NC_011296	A	6	6	20570	20575	100 %	0 %	0 %	0 %	206890925
507	NC_011296	ATT	2	6	20580	20585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890925
508	NC_011296	TTA	2	6	20628	20633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890925
509	NC_011296	GAA	2	6	20763	20768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890925
510	NC_011296	T	6	6	20841	20846	0 %	100 %	0 %	0 %	206890925
511	NC_011296	AGG	2	6	20879	20884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890925
512	NC_011296	AG	3	6	20910	20915	50 %	0 %	50 %	0 %	206890925
513	NC_011296	CA	3	6	20928	20933	50 %	0 %	0 %	50 %	206890925
514	NC_011296	AGA	2	6	20957	20962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890925
515	NC_011296	TCTT	2	8	20966	20973	0 %	75 %	0 %	25 %	206890925
516	NC_011296	T	6	6	21000	21005	0 %	100 %	0 %	0 %	206890925
517	NC_011296	AG	4	8	21066	21073	50 %	0 %	50 %	0 %	206890925
518	NC_011296	GAA	2	6	21126	21131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890925
519	NC_011296	AAG	2	6	21154	21159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890925
520	NC_011296	GTT	2	6	21242	21247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889780
521	NC_011296	AGA	2	6	21273	21278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889780
522	NC_011296	GCA	2	6	21295	21300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889780
523	NC_011296	AGA	2	6	21316	21321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889780
524	NC_011296	AT	3	6	21446	21451	50 %	50 %	0 %	0 %	206889647
525	NC_011296	GAAA	2	8	21466	21473	75 %	0 %	25 %	0 %	206889647
526	NC_011296	A	6	6	21471	21476	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
527	NC_011296	A	6	6	21496	21501	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
528	NC_011296	A	8	8	21523	21530	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
529	NC_011296	GGCTTT	2	12	21531	21542	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206889647
530	NC_011296	A	7	7	21571	21577	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
531	NC_011296	A	7	7	21621	21627	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
532	NC_011296	TTTC	2	8	21732	21739	0 %	75 %	0 %	25 %	206889647
533	NC_011296	A	8	8	21769	21776	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
534	NC_011296	ATTTT	2	10	21806	21815	20 %	80 %	0 %	0 %	206889647
535	NC_011296	TGA	2	6	21816	21821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889647
536	NC_011296	ATG	2	6	21956	21961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889647
537	NC_011296	ATA	2	6	22000	22005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889647
538	NC_011296	AATA	2	8	22008	22015	75 %	25 %	0 %	0 %	206889647
539	NC_011296	A	6	6	22066	22071	100 %	0 %	0 %	0 %	206889647
540	NC_011296	TTA	2	6	22139	22144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889647
541	NC_011296	TAG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889647
542	NC_011296	CTG	2	6	22199	22204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889647
543	NC_011296	TGT	2	6	22234	22239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011296	ATTTTA	2	12	22254	22265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011296	T	6	6	22284	22289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011296	AT	3	6	22296	22301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011296	CAGG	2	8	22355	22362	25 %	0 %	50 %	25 %	206889393
548	NC_011296	ATT	2	6	22406	22411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889393
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551	NC_011296	AACAG	2	10	22654	22663	60 %	0 %	20 %	20 %	206889393
552	NC_011296	T	6	6	22673	22678	0 %	100 %	0 %	0 %	206889393
553	NC_011296	ACA	2	6	22796	22801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889393
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555	NC_011296	CTC	2	6	22920	22925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889393
556	NC_011296	TGC	2	6	22945	22950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889393
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558	NC_011296	T	6	6	23040	23045	0 %	100 %	0 %	0 %	206889393
559	NC_011296	A	6	6	23126	23131	100 %	0 %	0 %	0 %	206889393
560	NC_011296	AGA	2	6	23167	23172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889393
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562	NC_011296	GAG	2	6	23264	23269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206889393
563	NC_011296	GAA	2	6	23277	23282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889393
564	NC_011296	TAA	2	6	23289	23294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889393
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566	NC_011296	CT	3	6	23335	23340	0 %	50 %	0 %	50 %	206889393
567	NC_011296	CA	3	6	23355	23360	50 %	0 %	0 %	50 %	206889393
568	NC_011296	A	7	7	23380	23386	100 %	0 %	0 %	0 %	206889393
569	NC_011296	A	6	6	23396	23401	100 %	0 %	0 %	0 %	206889393
570	NC_011296	TATG	2	8	23469	23476	25 %	50 %	25 %	0 %	206889393
571	NC_011296	A	6	6	23507	23512	100 %	0 %	0 %	0 %	206889393
572	NC_011296	T	6	6	23570	23575	0 %	100 %	0 %	0 %	206889393
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579	NC_011296	GA	3	6	23837	23842	50 %	0 %	50 %	0 %	206889393
580	NC_011296	AGGA	2	8	23889	23896	50 %	0 %	50 %	0 %	206889393
581	NC_011296	GAA	2	6	23999	24004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889393
582	NC_011296	ACCAT	2	10	24024	24033	40 %	20 %	0 %	40 %	206889393
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584	NC_011296	AT	3	6	24060	24065	50 %	50 %	0 %	0 %	206889393
585	NC_011296	CTA	2	6	24069	24074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889393
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595	NC_011296	TGA	3	9	24373	24381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890491
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597	NC_011296	TGA	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890491
598	NC_011296	A	6	6	24506	24511	100 %	0 %	0 %	0 %	206890491
599	NC_011296	GAAA	2	8	24548	24555	75 %	0 %	25 %	0 %	206889524
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601	NC_011296	TGA	2	6	24686	24691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889524
602	NC_011296	CCTTT	2	10	24701	24710	0 %	60 %	0 %	40 %	206889524
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605	NC_011296	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	206889524
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609	NC_011296	CCTT	2	8	24921	24928	0 %	50 %	0 %	50 %	206889524
610	NC_011296	GGA	2	6	24942	24947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206889524
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612	NC_011296	TGA	2	6	25169	25174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889524
613	NC_011296	GA	3	6	25195	25200	50 %	0 %	50 %	0 %	206889524
614	NC_011296	ATT	2	6	25221	25226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889524
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617	NC_011296	ATT	2	6	25317	25322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889524
618	NC_011296	CT	4	8	25342	25349	0 %	50 %	0 %	50 %	206889524
619	NC_011296	AGGA	2	8	25357	25364	50 %	0 %	50 %	0 %	206889524
620	NC_011296	GA	3	6	25363	25368	50 %	0 %	50 %	0 %	206889524
621	NC_011296	GAA	2	6	25465	25470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889524
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627	NC_011296	T	6	6	25709	25714	0 %	100 %	0 %	0 %	206889524
628	NC_011296	AGAA	2	8	25797	25804	75 %	0 %	25 %	0 %	206889524
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630	NC_011296	ACA	2	6	25899	25904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890876
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632	NC_011296	CTG	2	6	26008	26013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890876
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