MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010483	TC	4	8	158893	158900	0 %	50 %	0 %	50 %	170287972
3502	NC_010483	CT	3	6	158907	158912	0 %	50 %	0 %	50 %	170287972
3503	NC_010483	CT	3	6	158979	158984	0 %	50 %	0 %	50 %	170287972
3504	NC_010483	GA	4	8	159113	159120	50 %	0 %	50 %	0 %	170287972
3505	NC_010483	GAA	2	6	159146	159151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287972
3506	NC_010483	AC	3	6	159160	159165	50 %	0 %	0 %	50 %	170287972
3507	NC_010483	A	6	6	159183	159188	100 %	0 %	0 %	0 %	170287972
3508	NC_010483	TTTC	2	8	159215	159222	0 %	75 %	0 %	25 %	170287972
3509	NC_010483	TC	3	6	159277	159282	0 %	50 %	0 %	50 %	170287972
3510	NC_010483	CGA	2	6	159338	159343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287972
3511	NC_010483	GAC	2	6	159357	159362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287972
3512	NC_010483	TTATC	2	10	159365	159374	20 %	60 %	0 %	20 %	170287972
3513	NC_010483	T	6	6	159469	159474	0 %	100 %	0 %	0 %	170287972
3514	NC_010483	ATA	2	6	159546	159551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170287972
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3516	NC_010483	T	6	6	159666	159671	0 %	100 %	0 %	0 %	170287972
3517	NC_010483	ACCA	2	8	159683	159690	50 %	0 %	0 %	50 %	170287972
3518	NC_010483	GAT	2	6	159723	159728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287972
3519	NC_010483	CGT	2	6	159731	159736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287972
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3521	NC_010483	TTC	2	6	159758	159763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287972
3522	NC_010483	TAA	2	6	159772	159777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170287972
3523	NC_010483	GA	3	6	159787	159792	50 %	0 %	50 %	0 %	170287972
3524	NC_010483	AT	3	6	159814	159819	50 %	50 %	0 %	0 %	170287972
3525	NC_010483	TC	3	6	159820	159825	0 %	50 %	0 %	50 %	170287972
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3536	NC_010483	TTTC	2	8	160262	160269	0 %	75 %	0 %	25 %	170287973
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3545	NC_010483	CAT	2	6	160723	160728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287973
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3547	NC_010483	CCTC	2	8	160806	160813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3548	NC_010483	A	6	6	160826	160831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3550	NC_010483	GTT	2	6	160845	160850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3552	NC_010483	GA	3	6	161040	161045	50 %	0 %	50 %	0 %	170287974
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3559	NC_010483	CTG	2	6	161361	161366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287974
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3595	NC_010483	TAC	2	6	163206	163211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287975
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3601	NC_010483	GAA	2	6	163386	163391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287975
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3603	NC_010483	A	7	7	163466	163472	100 %	0 %	0 %	0 %	170287975
3604	NC_010483	AG	3	6	163520	163525	50 %	0 %	50 %	0 %	170287975
3605	NC_010483	TCT	2	6	163592	163597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287975
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3608	NC_010483	TAG	2	6	163903	163908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287975
3609	NC_010483	AAG	2	6	163911	163916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287975
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3611	NC_010483	GA	4	8	164009	164016	50 %	0 %	50 %	0 %	170287975
3612	NC_010483	GAAG	2	8	164025	164032	50 %	0 %	50 %	0 %	170287975
3613	NC_010483	TCA	2	6	164035	164040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287975
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3615	NC_010483	TGA	2	6	164063	164068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287975
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3618	NC_010483	AGA	2	6	164315	164320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287975
3619	NC_010483	ATCTC	2	10	164335	164344	20 %	40 %	0 %	40 %	170287975
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3622	NC_010483	CTT	2	6	164415	164420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287975
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3997	NC_010483	CTC	2	6	181229	181234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287992
3998	NC_010483	GAA	2	6	181267	181272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287992
3999	NC_010483	GAA	2	6	181346	181351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287992
4000	NC_010483	ACCTC	2	10	181381	181390	20 %	20 %	0 %	60 %	170287992

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