MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010483	GAG	2	6	137292	137297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287947
3002	NC_010483	GCA	2	6	137307	137312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287947
3003	NC_010483	GAA	3	9	137403	137411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287947
3004	NC_010483	GTG	2	6	137471	137476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010483	CTC	2	6	137505	137510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287948
3006	NC_010483	ACA	2	6	137538	137543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287948
3007	NC_010483	AG	3	6	137549	137554	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3008	NC_010483	GGAA	2	8	137576	137583	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3009	NC_010483	TCG	2	6	137586	137591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287948
3010	NC_010483	GTG	2	6	137669	137674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287948
3011	NC_010483	GA	3	6	137756	137761	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3012	NC_010483	AGA	2	6	137791	137796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287948
3013	NC_010483	CTT	2	6	137870	137875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287948
3014	NC_010483	AG	3	6	137884	137889	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3015	NC_010483	CCT	2	6	137920	137925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287948
3016	NC_010483	TCT	2	6	137952	137957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287948
3017	NC_010483	AC	3	6	137982	137987	50 %	0 %	0 %	50 %	170287948
3018	NC_010483	GAAG	2	8	138022	138029	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3019	NC_010483	AG	3	6	138054	138059	50 %	0 %	50 %	0 %	170287948
3020	NC_010483	GAA	2	6	138062	138067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287948
3021	NC_010483	TCG	2	6	138117	138122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287948
3022	NC_010483	TC	3	6	138166	138171	0 %	50 %	0 %	50 %	170287948
3023	NC_010483	TTC	2	6	138261	138266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287948
3024	NC_010483	CTC	2	6	138287	138292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_010483	ACT	2	6	138346	138351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287949
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3027	NC_010483	CGAA	2	8	138446	138453	50 %	0 %	25 %	25 %	170287949
3028	NC_010483	TC	3	6	138506	138511	0 %	50 %	0 %	50 %	170287949
3029	NC_010483	CA	3	6	138532	138537	50 %	0 %	0 %	50 %	170287949
3030	NC_010483	GAA	2	6	138615	138620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287949
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3035	NC_010483	CT	3	6	138773	138778	0 %	50 %	0 %	50 %	170287949
3036	NC_010483	GCA	2	6	138811	138816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287949
3037	NC_010483	CCGG	2	8	138862	138869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_010483	GATAC	2	10	139011	139020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_010483	CTT	2	6	139045	139050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287950
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3041	NC_010483	CTTC	2	8	139131	139138	0 %	50 %	0 %	50 %	170287950
3042	NC_010483	GAC	2	6	139142	139147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287950
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3045	NC_010483	GAG	2	6	139232	139237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287950
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3048	NC_010483	CTTC	2	8	139413	139420	0 %	50 %	0 %	50 %	170287950
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3052	NC_010483	GAA	2	6	139682	139687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287950
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3054	NC_010483	T	7	7	139760	139766	0 %	100 %	0 %	0 %	170287950
3055	NC_010483	TCG	2	6	139785	139790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287950
3056	NC_010483	GTA	2	6	139829	139834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287950
3057	NC_010483	TGA	2	6	139927	139932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287950
3058	NC_010483	AAGT	2	8	139950	139957	50 %	25 %	25 %	0 %	170287950
3059	NC_010483	ATCG	2	8	139973	139980	25 %	25 %	25 %	25 %	170287950
3060	NC_010483	GAG	2	6	140024	140029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287950
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3062	NC_010483	C	6	6	140051	140056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3063	NC_010483	CAT	2	6	140097	140102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287951
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3071	NC_010483	CCG	2	6	140530	140535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287952
3072	NC_010483	ACC	2	6	140620	140625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287952
3073	NC_010483	GA	4	8	140647	140654	50 %	0 %	50 %	0 %	170287952
3074	NC_010483	TTCT	2	8	140673	140680	0 %	75 %	0 %	25 %	170287952
3075	NC_010483	AGCA	2	8	140712	140719	50 %	0 %	25 %	25 %	170287952
3076	NC_010483	ATCG	2	8	140784	140791	25 %	25 %	25 %	25 %	170287952
3077	NC_010483	ACC	2	6	140818	140823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_010483	ATC	2	6	140870	140875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3080	NC_010483	TTC	2	6	140928	140933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287953
3081	NC_010483	TCA	2	6	141031	141036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287953
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3088	NC_010483	GAAAA	2	10	141320	141329	80 %	0 %	20 %	0 %	170287953
3089	NC_010483	TAC	2	6	141345	141350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287953
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3094	NC_010483	TGTGG	2	10	141444	141453	0 %	40 %	60 %	0 %	170287953
3095	NC_010483	GAA	2	6	141459	141464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287953
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3100	NC_010483	GT	3	6	141540	141545	0 %	50 %	50 %	0 %	170287953
3101	NC_010483	GAA	2	6	141547	141552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287953
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3104	NC_010483	GAT	2	6	141616	141621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287953
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3106	NC_010483	GGTGCC	2	12	141706	141717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170287954
3107	NC_010483	GAA	2	6	141878	141883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287954
3108	NC_010483	AG	3	6	141990	141995	50 %	0 %	50 %	0 %	170287954
3109	NC_010483	GAAA	2	8	142041	142048	75 %	0 %	25 %	0 %	170287954
3110	NC_010483	AGT	2	6	142130	142135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287954
3111	NC_010483	TGT	2	6	142195	142200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287954
3112	NC_010483	AAG	2	6	142252	142257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287955
3113	NC_010483	TG	3	6	142293	142298	0 %	50 %	50 %	0 %	170287955
3114	NC_010483	GAA	2	6	142342	142347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287955
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3116	NC_010483	CT	3	6	142402	142407	0 %	50 %	0 %	50 %	170287955
3117	NC_010483	TTTG	2	8	142428	142435	0 %	75 %	25 %	0 %	170287955
3118	NC_010483	CTG	2	6	142504	142509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287955
3119	NC_010483	TAC	2	6	142558	142563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287955
3120	NC_010483	GAA	2	6	142588	142593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287955
3121	NC_010483	AGG	2	6	142600	142605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287955
3122	NC_010483	GAA	2	6	142680	142685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287956
3123	NC_010483	ACCGC	2	10	142690	142699	20 %	0 %	20 %	60 %	170287956
3124	NC_010483	ACA	2	6	142711	142716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287956
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3126	NC_010483	AAAG	2	8	142748	142755	75 %	0 %	25 %	0 %	170287956
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3151	NC_010483	GAG	2	6	143862	143867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_010483	TCC	2	6	143944	143949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287957
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3155	NC_010483	TCG	2	6	144016	144021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287957
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3157	NC_010483	CTT	2	6	144245	144250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287957
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3170	NC_010483	CGA	2	6	144968	144973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287957
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3192	NC_010483	GCT	2	6	145814	145819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287957
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3494	NC_010483	AGG	2	6	158386	158391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287971
3495	NC_010483	CT	3	6	158513	158518	0 %	50 %	0 %	50 %	170287971
3496	NC_010483	TC	3	6	158560	158565	0 %	50 %	0 %	50 %	170287971
3497	NC_010483	CCCAG	2	10	158598	158607	20 %	0 %	20 %	60 %	170287971
3498	NC_010483	GAA	2	6	158713	158718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287971
3499	NC_010483	T	7	7	158781	158787	0 %	100 %	0 %	0 %	170287971
3500	NC_010483	GCA	2	6	158808	158813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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