MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010483	GAG	2	6	268345	268350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288088
6002	NC_010483	CCT	2	6	268361	268366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_010483	TG	3	6	268409	268414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010483	GA	3	6	268427	268432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010483	AT	3	6	268450	268455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010483	AC	3	6	268461	268466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_010483	AAC	2	6	268537	268542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_010483	GGAT	2	8	268549	268556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010483	AG	3	6	268567	268572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010483	CAA	2	6	268608	268613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010483	CAC	2	6	268648	268653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_010483	TGAA	2	8	268704	268711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010483	GAA	2	6	268799	268804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010483	CAA	2	6	268824	268829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_010483	TCCA	2	8	268890	268897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_010483	ATC	2	6	269089	269094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_010483	GAA	2	6	269111	269116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010483	CAT	2	6	269283	269288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_010483	ACC	2	6	269336	269341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_010483	T	8	8	269351	269358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_010483	TTG	2	6	269408	269413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010483	CCACA	2	10	269425	269434	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6023	NC_010483	GA	3	6	269448	269453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010483	CTT	2	6	269523	269528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010483	A	7	7	269535	269541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_010483	TCT	2	6	269582	269587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010483	GTA	2	6	269593	269598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010483	T	6	6	269612	269617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010483	CAC	2	6	269728	269733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_010483	CAA	2	6	269787	269792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_010483	AAG	2	6	269812	269817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010483	ACC	2	6	269820	269825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_010483	CCTC	2	8	269837	269844	0 %	25 %	0 %	75 %	170288089
6034	NC_010483	CTTC	2	8	269880	269887	0 %	50 %	0 %	50 %	170288089
6035	NC_010483	AAAGA	2	10	269898	269907	80 %	0 %	20 %	0 %	170288089
6036	NC_010483	TTC	2	6	269913	269918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288089
6037	NC_010483	T	7	7	269948	269954	0 %	100 %	0 %	0 %	170288089
6038	NC_010483	CTC	2	6	269963	269968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288089
6039	NC_010483	GT	3	6	269992	269997	0 %	50 %	50 %	0 %	170288089
6040	NC_010483	GGAG	2	8	270128	270135	25 %	0 %	75 %	0 %	170288089
6041	NC_010483	TGT	2	6	270160	270165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288089
6042	NC_010483	GGAA	2	8	270180	270187	50 %	0 %	50 %	0 %	170288089
6043	NC_010483	GTC	2	6	270329	270334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288089
6044	NC_010483	GTT	2	6	270425	270430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288089
6045	NC_010483	CCG	2	6	270477	270482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288089
6046	NC_010483	ATC	2	6	270483	270488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288089
6047	NC_010483	GA	3	6	270577	270582	50 %	0 %	50 %	0 %	170288089
6048	NC_010483	GTT	2	6	270908	270913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288089
6049	NC_010483	TC	3	6	270943	270948	0 %	50 %	0 %	50 %	170288089
6050	NC_010483	GAAA	2	8	270962	270969	75 %	0 %	25 %	0 %	170288089
6051	NC_010483	AG	3	6	271025	271030	50 %	0 %	50 %	0 %	170288089
6052	NC_010483	A	7	7	271075	271081	100 %	0 %	0 %	0 %	170288089
6053	NC_010483	TC	4	8	271110	271117	0 %	50 %	0 %	50 %	170288089
6054	NC_010483	GAA	2	6	271132	271137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288089
6055	NC_010483	AAAAC	2	10	271213	271222	80 %	0 %	0 %	20 %	170288089
6056	NC_010483	AGA	2	6	271223	271228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288089
6057	NC_010483	CAC	2	6	271251	271256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288089
6058	NC_010483	ATC	2	6	271266	271271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_010483	CT	3	6	271293	271298	0 %	50 %	0 %	50 %	170288090
6060	NC_010483	TC	3	6	271355	271360	0 %	50 %	0 %	50 %	170288090
6061	NC_010483	GT	3	6	271382	271387	0 %	50 %	50 %	0 %	170288090
6062	NC_010483	CT	3	6	271402	271407	0 %	50 %	0 %	50 %	170288090
6063	NC_010483	TCT	2	6	271425	271430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288090
6064	NC_010483	GAA	2	6	271509	271514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288090
6065	NC_010483	T	7	7	271583	271589	0 %	100 %	0 %	0 %	170288090
6066	NC_010483	GAA	2	6	271598	271603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288090
6067	NC_010483	CT	3	6	271668	271673	0 %	50 %	0 %	50 %	170288090
6068	NC_010483	CT	4	8	271686	271693	0 %	50 %	0 %	50 %	170288090
6069	NC_010483	TCT	3	9	271691	271699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288090
6070	NC_010483	GAA	2	6	271721	271726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288090
6071	NC_010483	TTC	2	6	271867	271872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288090
6072	NC_010483	CCA	2	6	271927	271932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288091
6073	NC_010483	TCC	2	6	271945	271950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288091
6074	NC_010483	AAG	2	6	271961	271966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288091
6075	NC_010483	GT	3	6	271988	271993	0 %	50 %	50 %	0 %	170288091
6076	NC_010483	TCT	2	6	271994	271999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288091
6077	NC_010483	G	6	6	272029	272034	0 %	0 %	100 %	0 %	170288091
6078	NC_010483	CTC	2	6	272056	272061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288091
6079	NC_010483	GA	3	6	272104	272109	50 %	0 %	50 %	0 %	170288091
6080	NC_010483	AG	3	6	272120	272125	50 %	0 %	50 %	0 %	170288091
6081	NC_010483	ATC	2	6	272177	272182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288091
6082	NC_010483	CCG	2	6	272312	272317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288091
6083	NC_010483	TCC	2	6	272350	272355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288091
6084	NC_010483	GTC	2	6	272383	272388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288091
6085	NC_010483	GCGTTC	2	12	272453	272464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288091
6086	NC_010483	TC	3	6	272474	272479	0 %	50 %	0 %	50 %	170288091
6087	NC_010483	CCT	2	6	272490	272495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288091
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6089	NC_010483	GTA	2	6	272545	272550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288091
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6091	NC_010483	TCG	2	6	272648	272653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288091
6092	NC_010483	GTT	2	6	272686	272691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288091
6093	NC_010483	GTT	2	6	272737	272742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288091
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6095	NC_010483	GTA	2	6	272845	272850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288091
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6097	NC_010483	TCG	2	6	272945	272950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288091
6098	NC_010483	CA	3	6	272954	272959	50 %	0 %	0 %	50 %	170288091
6099	NC_010483	AAGA	2	8	273000	273007	75 %	0 %	25 %	0 %	170288091
6100	NC_010483	ACC	2	6	273082	273087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288092
6101	NC_010483	AGAA	2	8	273230	273237	75 %	0 %	25 %	0 %	170288092
6102	NC_010483	GA	3	6	273243	273248	50 %	0 %	50 %	0 %	170288092
6103	NC_010483	TCC	2	6	273275	273280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288092
6104	NC_010483	GGC	2	6	273305	273310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170288092
6105	NC_010483	TCTG	2	8	273311	273318	0 %	50 %	25 %	25 %	170288092
6106	NC_010483	TCA	2	6	273334	273339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288092
6107	NC_010483	CACGTA	2	12	273404	273415	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170288092
6108	NC_010483	GTAC	2	8	273433	273440	25 %	25 %	25 %	25 %	170288092
6109	NC_010483	TC	3	6	273511	273516	0 %	50 %	0 %	50 %	170288092
6110	NC_010483	CCG	2	6	273561	273566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288092
6111	NC_010483	ACC	2	6	273627	273632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288092
6112	NC_010483	ACG	2	6	273639	273644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288092
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6114	NC_010483	CTT	2	6	273736	273741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288092
6115	NC_010483	TCT	2	6	273742	273747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288092
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6117	NC_010483	AGCTG	2	10	273949	273958	20 %	20 %	40 %	20 %	170288092
6118	NC_010483	CCG	2	6	273981	273986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288092
6119	NC_010483	TC	3	6	273987	273992	0 %	50 %	0 %	50 %	170288092
6120	NC_010483	AG	3	6	274018	274023	50 %	0 %	50 %	0 %	170288092
6121	NC_010483	TCT	2	6	274026	274031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288092
6122	NC_010483	AG	3	6	274066	274071	50 %	0 %	50 %	0 %	170288092
6123	NC_010483	CTT	2	6	274141	274146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288092
6124	NC_010483	CTT	2	6	274250	274255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288092
6125	NC_010483	GA	3	6	274397	274402	50 %	0 %	50 %	0 %	170288092
6126	NC_010483	TCC	2	6	274407	274412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288092
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