MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008698	CCT	2	6	179903	179908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3502	NC_008698	ACG	2	6	179954	179959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719118
3503	NC_008698	ATAC	2	8	179988	179995	50 %	25 %	0 %	25 %	119719118
3504	NC_008698	AGAA	2	8	179999	180006	75 %	0 %	25 %	0 %	119719118
3505	NC_008698	TCC	2	6	180061	180066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3506	NC_008698	CCT	2	6	180082	180087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3507	NC_008698	AAG	2	6	180136	180141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719118
3508	NC_008698	GAA	2	6	180211	180216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719118
3509	NC_008698	ATG	2	6	180260	180265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719118
3510	NC_008698	CTC	2	6	180276	180281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3511	NC_008698	ACG	2	6	180317	180322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719118
3512	NC_008698	CT	3	6	180421	180426	0 %	50 %	0 %	50 %	119719118
3513	NC_008698	CTT	2	6	180438	180443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719118
3514	NC_008698	GCC	2	6	180458	180463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719118
3515	NC_008698	CCG	2	6	180465	180470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719118
3516	NC_008698	ACG	2	6	180491	180496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719118
3517	NC_008698	CTC	2	6	180522	180527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719119
3518	NC_008698	CTA	2	6	180534	180539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719119
3519	NC_008698	ACGT	2	8	180576	180583	25 %	25 %	25 %	25 %	119719119
3520	NC_008698	GA	3	6	180602	180607	50 %	0 %	50 %	0 %	119719119
3521	NC_008698	TG	4	8	180659	180666	0 %	50 %	50 %	0 %	119719119
3522	NC_008698	CGC	2	6	180690	180695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719119
3523	NC_008698	GCC	2	6	180717	180722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719119
3524	NC_008698	GA	3	6	180723	180728	50 %	0 %	50 %	0 %	119719119
3525	NC_008698	CTCA	2	8	180796	180803	25 %	25 %	0 %	50 %	119719119
3526	NC_008698	TTC	2	6	180830	180835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719119
3527	NC_008698	AGT	2	6	180839	180844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719119
3528	NC_008698	CGT	2	6	180852	180857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719119
3529	NC_008698	ATA	2	6	180917	180922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719119
3530	NC_008698	CGTTCT	2	12	180948	180959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119719119
3531	NC_008698	AGT	2	6	181062	181067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008698	C	6	6	181089	181094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3533	NC_008698	GAC	2	6	181147	181152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719120
3534	NC_008698	G	6	6	181168	181173	0 %	0 %	100 %	0 %	119719120
3535	NC_008698	CTC	2	6	181182	181187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719120
3536	NC_008698	AGC	2	6	181216	181221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719120
3537	NC_008698	GTT	2	6	181244	181249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719120
3538	NC_008698	TAC	2	6	181268	181273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719120
3539	NC_008698	AGCA	2	8	181289	181296	50 %	0 %	25 %	25 %	119719120
3540	NC_008698	GAG	2	6	181346	181351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719120
3541	NC_008698	GA	3	6	181424	181429	50 %	0 %	50 %	0 %	119719120
3542	NC_008698	GA	3	6	181436	181441	50 %	0 %	50 %	0 %	119719120
3543	NC_008698	GA	3	6	181447	181452	50 %	0 %	50 %	0 %	119719120
3544	NC_008698	GAA	2	6	181471	181476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719120
3545	NC_008698	ATT	2	6	181484	181489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008698	AGA	2	6	181502	181507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
3547	NC_008698	CTT	2	6	181595	181600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719121
3548	NC_008698	GAA	2	6	181604	181609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
3549	NC_008698	GAG	2	6	181631	181636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719121
3550	NC_008698	TAT	2	6	181664	181669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719121
3551	NC_008698	GCG	2	6	181674	181679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719121
3552	NC_008698	CAG	2	6	181721	181726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719121
3553	NC_008698	GAA	2	6	181850	181855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
3554	NC_008698	AGTA	2	8	181859	181866	50 %	25 %	25 %	0 %	119719121
3555	NC_008698	C	6	6	181903	181908	0 %	0 %	0 %	100 %	119719121
3556	NC_008698	TGAAGT	2	12	181924	181935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719121
3557	NC_008698	T	6	6	182037	182042	0 %	100 %	0 %	0 %	119719121
3558	NC_008698	TAG	2	6	182072	182077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719121
3559	NC_008698	CGA	2	6	182098	182103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719121
3560	NC_008698	CTC	2	6	182129	182134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719121
3561	NC_008698	AGG	2	6	182160	182165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719121
3562	NC_008698	TGA	2	6	182200	182205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719121
3563	NC_008698	GAA	2	6	182213	182218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
3564	NC_008698	CGG	2	6	182233	182238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719121
3565	NC_008698	AAG	2	6	182262	182267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
3566	NC_008698	CG	3	6	182274	182279	0 %	0 %	50 %	50 %	119719121
3567	NC_008698	GAA	2	6	182305	182310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719121
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3569	NC_008698	AGT	2	6	182413	182418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719121
3570	NC_008698	TAGG	2	8	182440	182447	25 %	25 %	50 %	0 %	119719121
3571	NC_008698	TAC	2	6	182531	182536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719121
3572	NC_008698	GTC	2	6	182586	182591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_008698	GGT	2	6	182603	182608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_008698	T	6	6	182608	182613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008698	TAA	2	6	182615	182620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_008698	GA	4	8	182682	182689	50 %	0 %	50 %	0 %	119719122
3577	NC_008698	TAG	2	6	182693	182698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719122
3578	NC_008698	AGAGGC	2	12	182778	182789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119719122
3579	NC_008698	G	6	6	182791	182796	0 %	0 %	100 %	0 %	119719122
3580	NC_008698	GAG	2	6	182802	182807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719122
3581	NC_008698	GAG	2	6	182809	182814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719122
3582	NC_008698	GA	3	6	182872	182877	50 %	0 %	50 %	0 %	119719122
3583	NC_008698	AGA	2	6	183002	183007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719122
3584	NC_008698	TAGC	2	8	183119	183126	25 %	25 %	25 %	25 %	119719122
3585	NC_008698	ACA	2	6	183143	183148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719122
3586	NC_008698	GAC	2	6	183223	183228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719122
3587	NC_008698	CTT	2	6	183279	183284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719122
3588	NC_008698	CTA	2	6	183285	183290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719122
3589	NC_008698	AGG	2	6	183377	183382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719122
3590	NC_008698	TGG	2	6	183524	183529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719122
3591	NC_008698	GA	3	6	183695	183700	50 %	0 %	50 %	0 %	119719122
3592	NC_008698	CGA	2	6	183705	183710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719122
3593	NC_008698	GTC	2	6	183718	183723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719122
3594	NC_008698	GGC	2	6	183747	183752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719122
3595	NC_008698	GAG	2	6	183840	183845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719122
3596	NC_008698	AGG	2	6	183871	183876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719122
3597	NC_008698	GAC	2	6	183928	183933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719122
3598	NC_008698	GTT	2	6	183934	183939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719122
3599	NC_008698	CATAGT	2	12	184007	184018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119719123
3600	NC_008698	GCGA	2	8	184227	184234	25 %	0 %	50 %	25 %	119719123
3601	NC_008698	AGTA	2	8	184242	184249	50 %	25 %	25 %	0 %	119719123
3602	NC_008698	ACG	2	6	184267	184272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719123
3603	NC_008698	CCG	2	6	184312	184317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719123
3604	NC_008698	GGAT	2	8	184378	184385	25 %	25 %	50 %	0 %	119719123
3605	NC_008698	TACG	2	8	184427	184434	25 %	25 %	25 %	25 %	119719123
3606	NC_008698	AGAGA	2	10	184440	184449	60 %	0 %	40 %	0 %	119719123
3607	NC_008698	GTT	2	6	184469	184474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719123
3608	NC_008698	ACG	3	9	184555	184563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719123
3609	NC_008698	CCT	2	6	184607	184612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719123
3610	NC_008698	GAA	2	6	184727	184732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719123
3611	NC_008698	CTG	2	6	184746	184751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719123
3612	NC_008698	CTT	2	6	184826	184831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719123
3613	NC_008698	GTC	2	6	184832	184837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719123
3614	NC_008698	CGT	2	6	184844	184849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719123
3615	NC_008698	GAA	2	6	184925	184930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719123
3616	NC_008698	AGGA	2	8	184941	184948	50 %	0 %	50 %	0 %	119719123
3617	NC_008698	GAA	2	6	185000	185005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719123
3618	NC_008698	CGG	2	6	185049	185054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_008698	CG	3	6	185065	185070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_008698	GA	3	6	185083	185088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_008698	AAG	2	6	185089	185094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3993	NC_008698	TACCT	2	10	203636	203645	20 %	40 %	0 %	40 %	119719144
3994	NC_008698	GAA	2	6	203655	203660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719144
3995	NC_008698	GGA	2	6	203667	203672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719144
3996	NC_008698	GAG	2	6	203689	203694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719144
3997	NC_008698	ACT	2	6	203798	203803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719144
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