MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_008698	GGA	3	9	1779782	1779790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720740
37502	NC_008698	CGT	2	6	1779818	1779823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720740
37503	NC_008698	CGA	2	6	1779832	1779837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720740
37504	NC_008698	CG	3	6	1779865	1779870	0 %	0 %	50 %	50 %	119720740
37505	NC_008698	AG	3	6	1779890	1779895	50 %	0 %	50 %	0 %	119720740
37506	NC_008698	ACG	2	6	1779940	1779945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720740
37507	NC_008698	GAG	2	6	1779968	1779973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720740
37508	NC_008698	GC	3	6	1780017	1780022	0 %	0 %	50 %	50 %	119720740
37509	NC_008698	GCT	2	6	1780028	1780033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720740
37510	NC_008698	AAG	2	6	1780041	1780046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720740
37511	NC_008698	GGC	2	6	1780049	1780054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720740
37512	NC_008698	CAT	2	6	1780058	1780063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720740
37513	NC_008698	TGA	2	6	1780075	1780080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720740
37514	NC_008698	GGC	2	6	1780127	1780132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720740
37515	NC_008698	GAA	2	6	1780139	1780144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720740
37516	NC_008698	AGA	3	9	1780296	1780304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720740
37517	NC_008698	CTGGG	2	10	1780318	1780327	0 %	20 %	60 %	20 %	119720740
37518	NC_008698	GAA	2	6	1780355	1780360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720740
37519	NC_008698	TTAT	2	8	1780377	1780384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37520	NC_008698	TTA	2	6	1780394	1780399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37521	NC_008698	GAA	2	6	1780427	1780432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720741
37522	NC_008698	CGA	2	6	1780570	1780575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720741
37523	NC_008698	CT	3	6	1780743	1780748	0 %	50 %	0 %	50 %	119720741
37524	NC_008698	TCC	2	6	1781026	1781031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720742
37525	NC_008698	AGA	2	6	1781032	1781037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720742
37526	NC_008698	CG	3	6	1781113	1781118	0 %	0 %	50 %	50 %	119720742
37527	NC_008698	ACG	2	6	1781122	1781127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720742
37528	NC_008698	GAG	3	9	1781135	1781143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720742
37529	NC_008698	CT	3	6	1781190	1781195	0 %	50 %	0 %	50 %	119720742
37530	NC_008698	GGCG	2	8	1781243	1781250	0 %	0 %	75 %	25 %	119720742
37531	NC_008698	CG	3	6	1781298	1781303	0 %	0 %	50 %	50 %	119720742
37532	NC_008698	ACG	2	6	1781362	1781367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720742
37533	NC_008698	TCC	2	6	1781581	1781586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720742
37534	NC_008698	GA	3	6	1781621	1781626	50 %	0 %	50 %	0 %	119720742
37535	NC_008698	TGA	2	6	1781701	1781706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720742
37536	NC_008698	GGC	2	6	1781717	1781722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720742
37537	NC_008698	AGG	2	6	1781727	1781732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720742
37538	NC_008698	CG	3	6	1781734	1781739	0 %	0 %	50 %	50 %	119720742
37539	NC_008698	G	9	9	1781824	1781832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.