MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008698	GCG	2	6	152672	152677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719095
3002	NC_008698	CACG	2	8	152704	152711	25 %	0 %	25 %	50 %	119719095
3003	NC_008698	GGA	2	6	152716	152721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
3004	NC_008698	AGG	2	6	152778	152783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
3005	NC_008698	CTC	2	6	152832	152837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719095
3006	NC_008698	G	6	6	152847	152852	0 %	0 %	100 %	0 %	119719095
3007	NC_008698	GGA	2	6	152875	152880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
3008	NC_008698	GAG	2	6	152912	152917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
3009	NC_008698	GC	3	6	152918	152923	0 %	0 %	50 %	50 %	119719095
3010	NC_008698	GA	3	6	152975	152980	50 %	0 %	50 %	0 %	119719095
3011	NC_008698	CGA	2	6	153007	153012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719095
3012	NC_008698	GAA	2	6	153064	153069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719095
3013	NC_008698	CGT	3	9	153076	153084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719095
3014	NC_008698	AGG	3	9	153099	153107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
3015	NC_008698	TCC	2	6	153122	153127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719095
3016	NC_008698	CTC	2	6	153201	153206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719095
3017	NC_008698	CCG	2	6	153240	153245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719095
3018	NC_008698	GAT	2	6	153265	153270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719095
3019	NC_008698	AGCA	2	8	153271	153278	50 %	0 %	25 %	25 %	119719095
3020	NC_008698	GACG	2	8	153358	153365	25 %	0 %	50 %	25 %	119719095
3021	NC_008698	GAA	2	6	153451	153456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719095
3022	NC_008698	TCC	2	6	153557	153562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719096
3023	NC_008698	CGT	2	6	153768	153773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719096
3024	NC_008698	CTC	2	6	153788	153793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719096
3025	NC_008698	GCG	2	6	153894	153899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719096
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3028	NC_008698	GCT	2	6	154019	154024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719096
3029	NC_008698	CCG	2	6	154053	154058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719096
3030	NC_008698	CCG	2	6	154094	154099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719096
3031	NC_008698	CCAG	2	8	154118	154125	25 %	0 %	25 %	50 %	119719096
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3033	NC_008698	CAT	2	6	154184	154189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719097
3034	NC_008698	ACG	2	6	154210	154215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719097
3035	NC_008698	CCTCT	2	10	154271	154280	0 %	40 %	0 %	60 %	119719097
3036	NC_008698	AGCT	2	8	154284	154291	25 %	25 %	25 %	25 %	119719097
3037	NC_008698	TCA	2	6	154420	154425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719097
3038	NC_008698	TC	3	6	154461	154466	0 %	50 %	0 %	50 %	119719097
3039	NC_008698	AACA	2	8	154467	154474	75 %	0 %	0 %	25 %	119719097
3040	NC_008698	ACC	2	6	154486	154491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719097
3041	NC_008698	CTT	2	6	154505	154510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_008698	ATAAA	2	10	154524	154533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008698	A	6	6	154531	154536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008698	TTG	2	6	154623	154628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719098
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3047	NC_008698	GAT	2	6	154744	154749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719098
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3049	NC_008698	CGG	2	6	154767	154772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719098
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3052	NC_008698	CTA	2	6	154941	154946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719098
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3054	NC_008698	AG	3	6	155021	155026	50 %	0 %	50 %	0 %	119719098
3055	NC_008698	TCG	2	6	155067	155072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719098
3056	NC_008698	CGA	2	6	155190	155195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719098
3057	NC_008698	TAGG	2	8	155209	155216	25 %	25 %	50 %	0 %	119719098
3058	NC_008698	GCC	2	6	155234	155239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719098
3059	NC_008698	GTAG	2	8	155244	155251	25 %	25 %	50 %	0 %	119719098
3060	NC_008698	ACC	2	6	155289	155294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719098
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3062	NC_008698	CAG	2	6	155335	155340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719098
3063	NC_008698	GAG	2	6	155341	155346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719098
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3066	NC_008698	GCCG	2	8	155425	155432	0 %	0 %	50 %	50 %	119719098
3067	NC_008698	GCG	2	6	155450	155455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719098
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3069	NC_008698	GTA	2	6	155509	155514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719098
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3072	NC_008698	CGA	2	6	155578	155583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719098
3073	NC_008698	GTA	2	6	155629	155634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719098
3074	NC_008698	GTA	2	6	155788	155793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719098
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3077	NC_008698	AG	3	6	155835	155840	50 %	0 %	50 %	0 %	119719098
3078	NC_008698	G	6	6	155937	155942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_008698	ACC	2	6	155992	155997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719099
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3088	NC_008698	GTAG	2	8	156662	156669	25 %	25 %	50 %	0 %	119719099
3089	NC_008698	CGT	2	6	156686	156691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719099
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3091	NC_008698	CT	3	6	156905	156910	0 %	50 %	0 %	50 %	119719100
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3094	NC_008698	CCT	2	6	157218	157223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719100
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3099	NC_008698	TCC	2	6	157629	157634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719101
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3101	NC_008698	CTTC	2	8	157940	157947	0 %	50 %	0 %	50 %	119719101
3102	NC_008698	CTT	2	6	157962	157967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719101
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3108	NC_008698	CT	3	6	158194	158199	0 %	50 %	0 %	50 %	119719101
3109	NC_008698	TC	3	6	158277	158282	0 %	50 %	0 %	50 %	119719101
3110	NC_008698	GTCGAC	2	12	158364	158375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119719101
3111	NC_008698	TC	3	6	158381	158386	0 %	50 %	0 %	50 %	119719101
3112	NC_008698	TCG	2	6	158416	158421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719101
3113	NC_008698	CCTTCT	2	12	158461	158472	0 %	50 %	0 %	50 %	119719101
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3117	NC_008698	CCTC	2	8	158633	158640	0 %	25 %	0 %	75 %	119719101
3118	NC_008698	GAG	2	6	158677	158682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719101
3119	NC_008698	TAC	2	6	158712	158717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719101
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3122	NC_008698	CTC	2	6	158797	158802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719101
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3124	NC_008698	GTA	2	6	158844	158849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719101
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3131	NC_008698	AG	3	6	159183	159188	50 %	0 %	50 %	0 %	119719102
3132	NC_008698	GAA	2	6	159260	159265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719102
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3242	NC_008698	ACGC	2	8	165869	165876	25 %	0 %	25 %	50 %	119719107
3243	NC_008698	CA	3	6	165906	165911	50 %	0 %	0 %	50 %	119719107
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3364	NC_008698	AC	4	8	173559	173566	50 %	0 %	0 %	50 %	119719113
3365	NC_008698	CGA	2	6	173676	173681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719113
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3367	NC_008698	A	7	7	173754	173760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3490	NC_008698	CAG	2	6	179269	179274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719117
3491	NC_008698	C	6	6	179293	179298	0 %	0 %	0 %	100 %	119719117
3492	NC_008698	CT	3	6	179321	179326	0 %	50 %	0 %	50 %	119719117
3493	NC_008698	GCT	2	6	179338	179343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719117
3494	NC_008698	CTT	2	6	179366	179371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719117
3495	NC_008698	CTAGCT	2	12	179422	179433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119719117
3496	NC_008698	AAAC	2	8	179581	179588	75 %	0 %	0 %	25 %	119719117
3497	NC_008698	CTC	2	6	179674	179679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3498	NC_008698	CTC	2	6	179698	179703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719118
3499	NC_008698	AAC	2	6	179809	179814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719118
3500	NC_008698	CGG	2	6	179847	179852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719118

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