MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008698	CG	3	6	126681	126686	0 %	0 %	50 %	50 %	119719067
2502	NC_008698	CCT	2	6	126757	126762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719067
2503	NC_008698	ACA	2	6	126794	126799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719067
2504	NC_008698	GTA	2	6	126811	126816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719067
2505	NC_008698	CGC	2	6	127186	127191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719067
2506	NC_008698	CCTT	2	8	127265	127272	0 %	50 %	0 %	50 %	119719067
2507	NC_008698	AGGA	2	8	127274	127281	50 %	0 %	50 %	0 %	119719067
2508	NC_008698	AGT	2	6	127367	127372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719067
2509	NC_008698	ATT	2	6	127402	127407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_008698	ATG	2	6	127416	127421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008698	GTG	2	6	127493	127498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_008698	ACTCT	2	10	127503	127512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2513	NC_008698	A	6	6	127530	127535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_008698	CCA	2	6	127665	127670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719068
2515	NC_008698	CTT	2	6	127828	127833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719068
2516	NC_008698	CTT	2	6	127867	127872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719068
2517	NC_008698	AGC	2	6	128149	128154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719069
2518	NC_008698	CCG	2	6	128186	128191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719069
2519	NC_008698	CCA	2	6	128195	128200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719069
2520	NC_008698	TCC	2	6	128396	128401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719069
2521	NC_008698	GAC	2	6	128454	128459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719069
2522	NC_008698	GA	3	6	128482	128487	50 %	0 %	50 %	0 %	119719069
2523	NC_008698	CCTC	2	8	128492	128499	0 %	25 %	0 %	75 %	119719069
2524	NC_008698	TCCG	2	8	128523	128530	0 %	25 %	25 %	50 %	119719069
2525	NC_008698	CCTC	2	8	128543	128550	0 %	25 %	0 %	75 %	119719069
2526	NC_008698	CGA	2	6	128580	128585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719069
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2528	NC_008698	TACG	2	8	128703	128710	25 %	25 %	25 %	25 %	119719069
2529	NC_008698	ACGGCG	2	12	128728	128739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119719069
2530	NC_008698	GATG	2	8	128760	128767	25 %	25 %	50 %	0 %	119719069
2531	NC_008698	GCCC	2	8	128780	128787	0 %	0 %	25 %	75 %	119719069
2532	NC_008698	CGC	2	6	128828	128833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719069
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2535	NC_008698	GTC	2	6	128922	128927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719069
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2550	NC_008698	GGC	2	6	129549	129554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719069
2551	NC_008698	ACGT	2	8	129581	129588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_008698	AGG	2	6	129634	129639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719070
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2554	NC_008698	CCT	2	6	129747	129752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719070
2555	NC_008698	AG	3	6	129834	129839	50 %	0 %	50 %	0 %	119719070
2556	NC_008698	TCC	2	6	129868	129873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719070
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2558	NC_008698	CGA	2	6	129899	129904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719070
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2560	NC_008698	GAG	2	6	130011	130016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719070
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2562	NC_008698	GC	3	6	130197	130202	0 %	0 %	50 %	50 %	119719070
2563	NC_008698	CG	3	6	130223	130228	0 %	0 %	50 %	50 %	119719070
2564	NC_008698	CCCA	2	8	130239	130246	25 %	0 %	0 %	75 %	119719071
2565	NC_008698	GCG	2	6	130381	130386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719071
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2594	NC_008698	AGA	2	6	131965	131970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008698	TAA	2	6	131987	131992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_008698	TC	3	6	132005	132010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2602	NC_008698	G	6	6	132313	132318	0 %	0 %	100 %	0 %	119719073
2603	NC_008698	TACCTC	2	12	132332	132343	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119719073
2604	NC_008698	CTT	2	6	132383	132388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_008698	ACC	2	6	132397	132402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_008698	GGC	2	6	132441	132446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_008698	CCT	2	6	132489	132494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_008698	CCT	2	6	132504	132509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_008698	CGG	2	6	132530	132535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_008698	GAC	2	6	132540	132545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_008698	CCT	2	6	132549	132554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_008698	GTC	2	6	132694	132699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719074
2613	NC_008698	CGT	2	6	132730	132735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719074
2614	NC_008698	TCCT	2	8	132740	132747	0 %	50 %	0 %	50 %	119719074
2615	NC_008698	CTC	2	6	132775	132780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719074
2616	NC_008698	TGCT	2	8	132893	132900	0 %	50 %	25 %	25 %	119719074
2617	NC_008698	GGCGTA	2	12	132970	132981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119719074
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2622	NC_008698	CTA	2	6	133203	133208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719074
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2624	NC_008698	TCC	2	6	133304	133309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719074
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2993	NC_008698	C	6	6	152263	152268	0 %	0 %	0 %	100 %	119719094
2994	NC_008698	CCT	2	6	152357	152362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719094
2995	NC_008698	GA	3	6	152453	152458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_008698	CTC	2	6	152485	152490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2997	NC_008698	TGT	2	6	152511	152516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719095
2998	NC_008698	GA	3	6	152565	152570	50 %	0 %	50 %	0 %	119719095
2999	NC_008698	GGA	2	6	152578	152583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719095
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