MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008698	ACC	2	6	74597	74602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719011
1502	NC_008698	TTA	2	6	74682	74687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008698	GGC	2	6	74696	74701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719012
1504	NC_008698	TGG	2	6	74709	74714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719012
1505	NC_008698	CGG	2	6	74771	74776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719012
1506	NC_008698	CTG	2	6	74871	74876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1507	NC_008698	ACG	2	6	75019	75024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1508	NC_008698	CGA	2	6	75101	75106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1509	NC_008698	CGG	2	6	75130	75135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719012
1510	NC_008698	GA	4	8	75196	75203	50 %	0 %	50 %	0 %	119719012
1511	NC_008698	CGG	2	6	75358	75363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719012
1512	NC_008698	CGA	2	6	75491	75496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1513	NC_008698	CGA	3	9	75590	75598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1514	NC_008698	GCAT	2	8	75881	75888	25 %	25 %	25 %	25 %	119719012
1515	NC_008698	GAG	2	6	75906	75911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719012
1516	NC_008698	TAAGCG	2	12	75934	75945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119719012
1517	NC_008698	CGC	2	6	75959	75964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719012
1518	NC_008698	CAC	2	6	76008	76013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719012
1519	NC_008698	CGAAGG	2	12	76066	76077	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119719012
1520	NC_008698	CTT	2	6	76115	76120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719012
1521	NC_008698	GCC	2	6	76138	76143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719012
1522	NC_008698	GTGG	2	8	76148	76155	0 %	25 %	75 %	0 %	119719012
1523	NC_008698	CGA	2	6	76223	76228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1524	NC_008698	AGGC	2	8	76298	76305	25 %	0 %	50 %	25 %	119719012
1525	NC_008698	ACG	2	6	76402	76407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719012
1526	NC_008698	CTC	2	6	76410	76415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719012
1527	NC_008698	ACT	2	6	76420	76425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719012
1528	NC_008698	CG	4	8	76459	76466	0 %	0 %	50 %	50 %	119719012
1529	NC_008698	T	6	6	76557	76562	0 %	100 %	0 %	0 %	119719013
1530	NC_008698	GAA	2	6	76631	76636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719013
1531	NC_008698	TCC	2	6	76746	76751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719013
1532	NC_008698	GGC	2	6	76773	76778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_008698	CTTC	2	8	76846	76853	0 %	50 %	0 %	50 %	119719014
1534	NC_008698	CTG	2	6	76863	76868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719014
1535	NC_008698	GCT	2	6	76925	76930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719014
1536	NC_008698	GCCC	2	8	76949	76956	0 %	0 %	25 %	75 %	119719014
1537	NC_008698	AAGC	2	8	76961	76968	50 %	0 %	25 %	25 %	119719014
1538	NC_008698	GCCT	2	8	77056	77063	0 %	25 %	25 %	50 %	119719014
1539	NC_008698	GGT	2	6	77180	77185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719014
1540	NC_008698	TGC	2	6	77290	77295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719015
1541	NC_008698	GAT	2	6	77307	77312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719015
1542	NC_008698	ACT	2	6	77313	77318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719015
1543	NC_008698	GGC	2	6	77386	77391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719015
1544	NC_008698	TTC	2	6	77428	77433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719015
1545	NC_008698	CGT	2	6	77496	77501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719015
1546	NC_008698	AGGC	2	8	77579	77586	25 %	0 %	50 %	25 %	119719015
1547	NC_008698	ATC	2	6	77763	77768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719016
1548	NC_008698	CT	3	6	77795	77800	0 %	50 %	0 %	50 %	119719016
1549	NC_008698	CTC	2	6	77859	77864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719016
1550	NC_008698	GAC	2	6	77993	77998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719016
1551	NC_008698	GGA	2	6	78023	78028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719016
1552	NC_008698	GTC	2	6	78047	78052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719016
1553	NC_008698	GC	3	6	78072	78077	0 %	0 %	50 %	50 %	119719016
1554	NC_008698	CT	3	6	78079	78084	0 %	50 %	0 %	50 %	119719016
1555	NC_008698	TCC	2	6	78106	78111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719016
1556	NC_008698	TC	3	6	78122	78127	0 %	50 %	0 %	50 %	119719016
1557	NC_008698	CTT	2	6	78139	78144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719016
1558	NC_008698	CTG	2	6	78145	78150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719016
1559	NC_008698	CGA	2	6	78154	78159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719016
1560	NC_008698	CTT	2	6	78161	78166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719016
1561	NC_008698	CGA	2	6	78229	78234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719016
1562	NC_008698	AGT	2	6	78258	78263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719016
1563	NC_008698	TAA	2	6	78324	78329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008698	ATG	2	6	78362	78367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719017
1565	NC_008698	GGCGTA	2	12	78424	78435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119719017
1566	NC_008698	TAA	2	6	78474	78479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719017
1567	NC_008698	GCG	2	6	78482	78487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719017
1568	NC_008698	GTGCAA	2	12	78504	78515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119719017
1569	NC_008698	C	6	6	78552	78557	0 %	0 %	0 %	100 %	119719017
1570	NC_008698	TAG	2	6	78568	78573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719017
1571	NC_008698	CCG	3	9	78594	78602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719017
1572	NC_008698	CGG	2	6	78645	78650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719017
1573	NC_008698	ACG	2	6	78666	78671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719017
1574	NC_008698	ATAG	2	8	78682	78689	50 %	25 %	25 %	0 %	119719017
1575	NC_008698	AGG	2	6	78719	78724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719017
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1577	NC_008698	A	6	6	78787	78792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008698	TTA	2	6	78816	78821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008698	GA	3	6	78877	78882	50 %	0 %	50 %	0 %	119719018
1580	NC_008698	TCG	2	6	78932	78937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719018
1581	NC_008698	TTC	2	6	78973	78978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719018
1582	NC_008698	GAA	2	6	79026	79031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719018
1583	NC_008698	AG	3	6	79055	79060	50 %	0 %	50 %	0 %	119719018
1584	NC_008698	GAG	2	6	79192	79197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719018
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1587	NC_008698	GCG	2	6	79348	79353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719018
1588	NC_008698	TAC	2	6	79363	79368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719018
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1591	NC_008698	CCT	2	6	79413	79418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719019
1592	NC_008698	GCA	2	6	79451	79456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719019
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1594	NC_008698	C	6	6	79670	79675	0 %	0 %	0 %	100 %	119719019
1595	NC_008698	CG	3	6	79684	79689	0 %	0 %	50 %	50 %	119719019
1596	NC_008698	CCGT	2	8	79690	79697	0 %	25 %	25 %	50 %	119719019
1597	NC_008698	GAC	2	6	79719	79724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719019
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1600	NC_008698	AAC	2	6	79866	79871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719019
1601	NC_008698	TTG	2	6	79913	79918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719019
1602	NC_008698	CG	4	8	79943	79950	0 %	0 %	50 %	50 %	119719019
1603	NC_008698	GTCT	2	8	79962	79969	0 %	50 %	25 %	25 %	119719019
1604	NC_008698	TTA	2	6	79970	79975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719019
1605	NC_008698	CCTT	2	8	80093	80100	0 %	50 %	0 %	50 %	119719019
1606	NC_008698	AGT	2	6	80214	80219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008698	GTG	2	6	80224	80229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008698	GAG	2	6	80254	80259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008698	TAC	2	6	80293	80298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_008698	CGA	2	6	80415	80420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719020
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1612	NC_008698	CTT	2	6	80593	80598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719021
1613	NC_008698	AGT	2	6	80610	80615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719021
1614	NC_008698	ATT	2	6	80670	80675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719021
1615	NC_008698	TTCCT	2	10	80708	80717	0 %	60 %	0 %	40 %	119719021
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1621	NC_008698	TCC	2	6	80839	80844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719021
1622	NC_008698	TAACG	2	10	80922	80931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1623	NC_008698	AAAGC	2	10	81053	81062	60 %	0 %	20 %	20 %	119719022
1624	NC_008698	GAA	2	6	81125	81130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719022
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