MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008698	TCC	2	6	48942	48947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718983
1003	NC_008698	CTC	2	6	48954	48959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718983
1004	NC_008698	AGC	2	6	48984	48989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718983
1005	NC_008698	TGG	2	6	49132	49137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718983
1006	NC_008698	GTT	2	6	49164	49169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119718983
1007	NC_008698	GGA	3	9	49252	49260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718983
1008	NC_008698	GGC	2	6	49302	49307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718983
1009	NC_008698	AGG	2	6	49314	49319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718983
1010	NC_008698	CTC	2	6	49374	49379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718983
1011	NC_008698	TGGGCT	2	12	49424	49435	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119718983
1012	NC_008698	GA	3	6	49438	49443	50 %	0 %	50 %	0 %	119718983
1013	NC_008698	G	6	6	49503	49508	0 %	0 %	100 %	0 %	119718983
1014	NC_008698	GAA	2	6	49559	49564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718983
1015	NC_008698	GC	3	6	49600	49605	0 %	0 %	50 %	50 %	119718983
1016	NC_008698	GCC	3	9	49629	49637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718983
1017	NC_008698	CG	3	6	49723	49728	0 %	0 %	50 %	50 %	119718984
1018	NC_008698	TCC	2	6	49840	49845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718984
1019	NC_008698	TC	3	6	49869	49874	0 %	50 %	0 %	50 %	119718984
1020	NC_008698	GCT	2	6	49939	49944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718984
1021	NC_008698	GTG	2	6	49977	49982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718984
1022	NC_008698	CGA	2	6	49984	49989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718984
1023	NC_008698	GAGTA	2	10	49998	50007	40 %	20 %	40 %	0 %	119718984
1024	NC_008698	CG	3	6	50020	50025	0 %	0 %	50 %	50 %	119718984
1025	NC_008698	GCG	2	6	50049	50054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718984
1026	NC_008698	AGT	2	6	50071	50076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718984
1027	NC_008698	TGTAGA	2	12	50077	50088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718984
1028	NC_008698	GCC	2	6	50130	50135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718984
1029	NC_008698	AGG	2	6	50175	50180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718984
1030	NC_008698	GGA	2	6	50183	50188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718984
1031	NC_008698	AGG	3	9	50190	50198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718984
1032	NC_008698	G	6	6	50393	50398	0 %	0 %	100 %	0 %	119718985
1033	NC_008698	GGC	2	6	50401	50406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718985
1034	NC_008698	ACG	3	9	50542	50550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718985
1035	NC_008698	GGA	2	6	50559	50564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718985
1036	NC_008698	TCG	2	6	50629	50634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718985
1037	NC_008698	CTC	2	6	50778	50783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718985
1038	NC_008698	CCT	2	6	50813	50818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718985
1039	NC_008698	TC	3	6	50829	50834	0 %	50 %	0 %	50 %	119718985
1040	NC_008698	TGG	2	6	50842	50847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718985
1041	NC_008698	CGA	2	6	50861	50866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718985
1042	NC_008698	TCC	2	6	50892	50897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718985
1043	NC_008698	CGC	2	6	50912	50917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718985
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1045	NC_008698	CTC	2	6	51004	51009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718985
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1047	NC_008698	TCG	2	6	51388	51393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718985
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1049	NC_008698	GAG	2	6	51654	51659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718985
1050	NC_008698	CTC	2	6	51663	51668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718985
1051	NC_008698	C	6	6	51682	51687	0 %	0 %	0 %	100 %	119718985
1052	NC_008698	CGC	2	6	51698	51703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718985
1053	NC_008698	CAG	2	6	51783	51788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718985
1054	NC_008698	A	6	6	51857	51862	100 %	0 %	0 %	0 %	119718985
1055	NC_008698	ATT	2	6	51870	51875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119718985
1056	NC_008698	AGT	2	6	51921	51926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718986
1057	NC_008698	AGC	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718986
1058	NC_008698	GGTT	2	8	52047	52054	0 %	50 %	50 %	0 %	119718986
1059	NC_008698	GAA	2	6	52153	52158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718986
1060	NC_008698	GTAGA	2	10	52192	52201	40 %	20 %	40 %	0 %	119718986
1061	NC_008698	CTA	2	6	52269	52274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718986
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1063	NC_008698	GTAAGC	2	12	52340	52351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119718986
1064	NC_008698	TTC	2	6	52444	52449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718986
1065	NC_008698	TTC	2	6	52462	52467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718986
1066	NC_008698	ATT	2	6	52533	52538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008698	TA	3	6	52540	52545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008698	GAA	2	6	52559	52564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008698	AGG	2	6	52702	52707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718987
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1071	NC_008698	GTA	2	6	52826	52831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718987
1072	NC_008698	GGCT	2	8	52914	52921	0 %	25 %	50 %	25 %	119718987
1073	NC_008698	TGG	2	6	52939	52944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718987
1074	NC_008698	AGTG	2	8	53002	53009	25 %	25 %	50 %	0 %	119718987
1075	NC_008698	TCC	2	6	53101	53106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718987
1076	NC_008698	ACG	2	6	53180	53185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718987
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1080	NC_008698	GAG	2	6	53341	53346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718987
1081	NC_008698	TAG	2	6	53382	53387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718987
1082	NC_008698	CAG	2	6	53411	53416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718987
1083	NC_008698	GCC	2	6	53425	53430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718987
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1087	NC_008698	TA	4	8	53595	53602	50 %	50 %	0 %	0 %	119718987
1088	NC_008698	CAAG	2	8	53644	53651	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_008698	CT	3	6	53675	53680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1092	NC_008698	GAG	2	6	53908	53913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718988
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1095	NC_008698	GGA	2	6	54042	54047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718988
1096	NC_008698	ACTCG	2	10	54108	54117	20 %	20 %	20 %	40 %	119718988
1097	NC_008698	GGC	2	6	54183	54188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718988
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1100	NC_008698	GAA	2	6	54276	54281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718988
1101	NC_008698	GTC	3	9	54310	54318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718988
1102	NC_008698	GC	3	6	54349	54354	0 %	0 %	50 %	50 %	119718988
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1104	NC_008698	GA	3	6	54391	54396	50 %	0 %	50 %	0 %	119718988
1105	NC_008698	TAG	2	6	54455	54460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718988
1106	NC_008698	CT	3	6	54506	54511	0 %	50 %	0 %	50 %	119718988
1107	NC_008698	AAG	2	6	54541	54546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718988
1108	NC_008698	GATA	2	8	54573	54580	50 %	25 %	25 %	0 %	119718988
1109	NC_008698	GC	3	6	54584	54589	0 %	0 %	50 %	50 %	119718988
1110	NC_008698	GGCT	2	8	54636	54643	0 %	25 %	50 %	25 %	119718988
1111	NC_008698	GGGC	2	8	54687	54694	0 %	0 %	75 %	25 %	119718988
1112	NC_008698	GGA	2	6	54708	54713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718988
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1117	NC_008698	CTC	2	6	54927	54932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718989
1118	NC_008698	CTTG	2	8	54954	54961	0 %	50 %	25 %	25 %	119718989
1119	NC_008698	GCC	2	6	54991	54996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718989
1120	NC_008698	TTC	2	6	55209	55214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718989
1121	NC_008698	GAA	2	6	55215	55220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718989
1122	NC_008698	TCC	2	6	55303	55308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718989
1123	NC_008698	TCG	2	6	55375	55380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718989
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