MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008698	TCA	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718953
502	NC_008698	CTGC	2	8	26164	26171	0 %	25 %	25 %	50 %	119718953
503	NC_008698	G	6	6	26173	26178	0 %	0 %	100 %	0 %	119718953
504	NC_008698	CCAC	2	8	26277	26284	25 %	0 %	0 %	75 %	119718953
505	NC_008698	TTC	2	6	26285	26290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718953
506	NC_008698	CTC	2	6	26294	26299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718953
507	NC_008698	TCC	2	6	26330	26335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718953
508	NC_008698	ACT	2	6	26354	26359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718953
509	NC_008698	ACC	2	6	26426	26431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119718953
510	NC_008698	GAA	2	6	26461	26466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718953
511	NC_008698	GAA	2	6	26509	26514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718953
512	NC_008698	TGTAG	2	10	26542	26551	20 %	40 %	40 %	0 %	119718953
513	NC_008698	CCT	2	6	26659	26664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718953
514	NC_008698	CG	3	6	26712	26717	0 %	0 %	50 %	50 %	119718953
515	NC_008698	CGT	2	6	26722	26727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718953
516	NC_008698	ACG	2	6	26735	26740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718953
517	NC_008698	A	6	6	26909	26914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008698	GC	3	6	26927	26932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_008698	CTA	3	9	26986	26994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718954
520	NC_008698	AGG	2	6	26999	27004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718954
521	NC_008698	AG	3	6	27023	27028	50 %	0 %	50 %	0 %	119718954
522	NC_008698	GAG	3	9	27113	27121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718954
523	NC_008698	AGG	2	6	27122	27127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718954
524	NC_008698	GGA	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718954
525	NC_008698	CCA	2	6	27198	27203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119718954
526	NC_008698	GAG	2	6	27208	27213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718954
527	NC_008698	GGT	2	6	27220	27225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718954
528	NC_008698	CTC	2	6	27259	27264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718955
529	NC_008698	CTT	2	6	27331	27336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718955
530	NC_008698	GGA	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718955
531	NC_008698	ACT	2	6	27362	27367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718955
532	NC_008698	TCC	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718955
533	NC_008698	AGG	2	6	27482	27487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718955
534	NC_008698	TCC	2	6	27571	27576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718955
535	NC_008698	CGT	2	6	27627	27632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718955
536	NC_008698	AGG	2	6	27708	27713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718956
537	NC_008698	GCC	2	6	27732	27737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718956
538	NC_008698	GACG	2	8	27800	27807	25 %	0 %	50 %	25 %	119718956
539	NC_008698	ACT	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718956
540	NC_008698	AGG	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718956
541	NC_008698	GAA	2	6	27893	27898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718956
542	NC_008698	GAG	2	6	27903	27908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718956
543	NC_008698	GA	3	6	27954	27959	50 %	0 %	50 %	0 %	119718956
544	NC_008698	AG	3	6	27996	28001	50 %	0 %	50 %	0 %	119718956
545	NC_008698	CTT	2	6	28055	28060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718956
546	NC_008698	GCG	2	6	28081	28086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718956
547	NC_008698	GA	3	6	28100	28105	50 %	0 %	50 %	0 %	119718956
548	NC_008698	ACCT	2	8	28149	28156	25 %	25 %	0 %	50 %	119718956
549	NC_008698	GAG	2	6	28170	28175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718956
550	NC_008698	GCT	2	6	28223	28228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718957
551	NC_008698	CG	3	6	28254	28259	0 %	0 %	50 %	50 %	119718957
552	NC_008698	GTG	2	6	28264	28269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718957
553	NC_008698	GAA	2	6	28306	28311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718957
554	NC_008698	GAG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718957
555	NC_008698	ACG	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718957
556	NC_008698	TCG	2	6	28524	28529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718957
557	NC_008698	GAA	2	6	28702	28707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718958
558	NC_008698	ACG	2	6	28710	28715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718958
559	NC_008698	CCG	2	6	28749	28754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718958
560	NC_008698	GC	3	6	28766	28771	0 %	0 %	50 %	50 %	119718958
561	NC_008698	GGA	2	6	28808	28813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718958
562	NC_008698	CTC	2	6	28820	28825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718958
563	NC_008698	GGC	2	6	28865	28870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718958
564	NC_008698	CGA	2	6	28930	28935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718958
565	NC_008698	GAG	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718958
566	NC_008698	TCG	2	6	28968	28973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718958
567	NC_008698	GA	3	6	29058	29063	50 %	0 %	50 %	0 %	119718958
568	NC_008698	G	6	6	29079	29084	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
569	NC_008698	G	6	6	29148	29153	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
570	NC_008698	CA	3	6	29154	29159	50 %	0 %	0 %	50 %	119718958
571	NC_008698	CAT	2	6	29170	29175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718958
572	NC_008698	GAA	2	6	29234	29239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718958
573	NC_008698	CTA	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718958
574	NC_008698	CCG	2	6	29301	29306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718958
575	NC_008698	AG	3	6	29322	29327	50 %	0 %	50 %	0 %	119718958
576	NC_008698	TCG	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718958
577	NC_008698	TCG	2	6	29394	29399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718958
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579	NC_008698	GCAG	2	8	29542	29549	25 %	0 %	50 %	25 %	119718958
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582	NC_008698	G	6	6	29681	29686	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
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590	NC_008698	CTC	2	6	29914	29919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718959
591	NC_008698	CGG	2	6	29962	29967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718959
592	NC_008698	ATC	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718959
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595	NC_008698	TCG	3	9	30071	30079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718959
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597	NC_008698	GGC	2	6	30229	30234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718959
598	NC_008698	TCG	2	6	30254	30259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718959
599	NC_008698	CTT	2	6	30313	30318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718959
600	NC_008698	GC	3	6	30325	30330	0 %	0 %	50 %	50 %	119718959
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603	NC_008698	G	6	6	30428	30433	0 %	0 %	100 %	0 %	119718959
604	NC_008698	TAG	2	6	30434	30439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718959
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606	NC_008698	GA	3	6	30560	30565	50 %	0 %	50 %	0 %	119718959
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609	NC_008698	CCT	2	6	30688	30693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718959
610	NC_008698	GCC	2	6	30749	30754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718959
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614	NC_008698	GCC	2	6	31046	31051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718960
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625	NC_008698	ACC	2	6	31446	31451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119718960
626	NC_008698	TCTCGT	2	12	31476	31487	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119718960
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