MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008698	GAGG	2	8	278747	278754	25 %	0 %	75 %	0 %	119719229
5502	NC_008698	GAT	2	6	278815	278820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719229
5503	NC_008698	GAGAA	2	10	278902	278911	60 %	0 %	40 %	0 %	119719230
5504	NC_008698	A	7	7	278993	278999	100 %	0 %	0 %	0 %	119719230
5505	NC_008698	GGA	3	9	279067	279075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719230
5506	NC_008698	TGAGGG	2	12	279078	279089	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119719230
5507	NC_008698	TC	3	6	279182	279187	0 %	50 %	0 %	50 %	119719230
5508	NC_008698	AAG	2	6	279198	279203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719230
5509	NC_008698	AATT	2	8	279223	279230	50 %	50 %	0 %	0 %	119719230
5510	NC_008698	CT	3	6	279281	279286	0 %	50 %	0 %	50 %	119719231
5511	NC_008698	GTT	2	6	279486	279491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719231
5512	NC_008698	T	7	7	279490	279496	0 %	100 %	0 %	0 %	119719231
5513	NC_008698	GAA	2	6	279535	279540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719231
5514	NC_008698	CCA	2	6	279545	279550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719231
5515	NC_008698	CT	3	6	279565	279570	0 %	50 %	0 %	50 %	119719231
5516	NC_008698	CCT	2	6	279629	279634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719231
5517	NC_008698	AG	3	6	279640	279645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008698	ACCC	2	8	279721	279728	25 %	0 %	0 %	75 %	119719232
5519	NC_008698	TAC	2	6	279746	279751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719232
5520	NC_008698	CTC	2	6	279786	279791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5521	NC_008698	TCC	2	6	279816	279821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5522	NC_008698	TCC	2	6	279873	279878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5523	NC_008698	TTC	2	6	279887	279892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719232
5524	NC_008698	TCC	2	6	279909	279914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719232
5525	NC_008698	TCA	2	6	279937	279942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719232
5526	NC_008698	TC	3	6	279970	279975	0 %	50 %	0 %	50 %	119719232
5527	NC_008698	TCT	2	6	280031	280036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719233
5528	NC_008698	ACG	2	6	280097	280102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5529	NC_008698	TCCAT	2	10	280103	280112	20 %	40 %	0 %	40 %	119719233
5530	NC_008698	TCG	2	6	280115	280120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5531	NC_008698	CCG	2	6	280149	280154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5532	NC_008698	CAG	2	6	280185	280190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5533	NC_008698	CGAA	2	8	280205	280212	50 %	0 %	25 %	25 %	119719233
5534	NC_008698	TTC	2	6	280220	280225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719233
5535	NC_008698	TAT	2	6	280249	280254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719233
5536	NC_008698	CT	3	6	280312	280317	0 %	50 %	0 %	50 %	119719233
5537	NC_008698	TCC	3	9	280334	280342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719233
5538	NC_008698	CAC	2	6	280367	280372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719233
5539	NC_008698	TGT	2	6	280389	280394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719233
5540	NC_008698	AAGT	2	8	280434	280441	50 %	25 %	25 %	0 %	119719233
5541	NC_008698	CTC	2	6	280500	280505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719233
5542	NC_008698	CGC	2	6	280629	280634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5543	NC_008698	GCC	2	6	280710	280715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719233
5544	NC_008698	C	6	6	280727	280732	0 %	0 %	0 %	100 %	119719233
5545	NC_008698	GACCAC	2	12	280750	280761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119719233
5546	NC_008698	TCG	2	6	280815	280820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5547	NC_008698	GTC	2	6	280837	280842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5548	NC_008698	C	6	6	280848	280853	0 %	0 %	0 %	100 %	119719233
5549	NC_008698	G	6	6	280881	280886	0 %	0 %	100 %	0 %	119719233
5550	NC_008698	TCCT	2	8	280902	280909	0 %	50 %	0 %	50 %	119719233
5551	NC_008698	CGT	2	6	280941	280946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5552	NC_008698	AACG	2	8	280954	280961	50 %	0 %	25 %	25 %	119719233
5553	NC_008698	CCTC	2	8	281021	281028	0 %	25 %	0 %	75 %	119719233
5554	NC_008698	GC	3	6	281071	281076	0 %	0 %	50 %	50 %	119719233
5555	NC_008698	CAG	2	6	281085	281090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719233
5556	NC_008698	GTA	2	6	281098	281103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719233
5557	NC_008698	CCT	2	6	281104	281109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719233
5558	NC_008698	GTA	2	6	281128	281133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719233
5559	NC_008698	TCA	2	6	281187	281192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719233
5560	NC_008698	TAA	2	6	281212	281217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008698	CA	3	6	281228	281233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_008698	CT	3	6	281237	281242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_008698	ATCAGA	2	12	281243	281254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119719234
5564	NC_008698	AGC	2	6	281266	281271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5565	NC_008698	AGT	2	6	281363	281368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719234
5566	NC_008698	AC	3	6	281409	281414	50 %	0 %	0 %	50 %	119719234
5567	NC_008698	GGTAC	2	10	281876	281885	20 %	20 %	40 %	20 %	119719234
5568	NC_008698	GA	3	6	281917	281922	50 %	0 %	50 %	0 %	119719234
5569	NC_008698	CCT	2	6	281952	281957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719234
5570	NC_008698	G	6	6	281965	281970	0 %	0 %	100 %	0 %	119719234
5571	NC_008698	CGA	2	6	281976	281981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5572	NC_008698	GAC	2	6	281982	281987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719234
5573	NC_008698	GC	3	6	282179	282184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_008698	CA	3	6	282226	282231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_008698	CGT	2	6	282250	282255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_008698	GTA	2	6	282293	282298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
5577	NC_008698	G	6	6	282330	282335	0 %	0 %	100 %	0 %	119719235
5578	NC_008698	ATT	2	6	282390	282395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719235
5579	NC_008698	GC	3	6	282434	282439	0 %	0 %	50 %	50 %	119719235
5580	NC_008698	TC	3	6	282504	282509	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5581	NC_008698	GAC	2	6	282563	282568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719235
5582	NC_008698	AG	3	6	282603	282608	50 %	0 %	50 %	0 %	119719235
5583	NC_008698	TC	3	6	282659	282664	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5584	NC_008698	GCC	2	6	282681	282686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
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5588	NC_008698	GCC	2	6	282816	282821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
5589	NC_008698	GTA	2	6	282872	282877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
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5591	NC_008698	CCCCA	2	10	282961	282970	20 %	0 %	0 %	80 %	119719235
5592	NC_008698	CGT	2	6	282979	282984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
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5594	NC_008698	CGC	3	9	283046	283054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719235
5595	NC_008698	GTG	2	6	283067	283072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719235
5596	NC_008698	TC	3	6	283089	283094	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5597	NC_008698	CTC	2	6	283112	283117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
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5599	NC_008698	GTA	2	6	283136	283141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
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5602	NC_008698	CCGT	2	8	283410	283417	0 %	25 %	25 %	50 %	119719235
5603	NC_008698	AAC	2	6	283424	283429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719235
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5605	NC_008698	AGT	2	6	283474	283479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719235
5606	NC_008698	CCT	2	6	283507	283512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
5607	NC_008698	TAT	2	6	283523	283528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719235
5608	NC_008698	CG	3	6	283573	283578	0 %	0 %	50 %	50 %	119719235
5609	NC_008698	CAA	2	6	283589	283594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719235
5610	NC_008698	AG	3	6	283662	283667	50 %	0 %	50 %	0 %	119719235
5611	NC_008698	TCG	2	6	283731	283736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
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5613	NC_008698	CTT	2	6	283802	283807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719235
5614	NC_008698	CCT	2	6	283820	283825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
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5617	NC_008698	CCT	2	6	284018	284023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719235
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5619	NC_008698	CT	3	6	284112	284117	0 %	50 %	0 %	50 %	119719235
5620	NC_008698	ACC	2	6	284170	284175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719235
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5622	NC_008698	GTC	2	6	284207	284212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719235
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5624	NC_008698	CTT	2	6	284305	284310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719235
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5996	NC_008698	TGG	2	6	302168	302173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719251
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5998	NC_008698	AG	3	6	302223	302228	50 %	0 %	50 %	0 %	119719251
5999	NC_008698	AG	3	6	302245	302250	50 %	0 %	50 %	0 %	119719251
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