MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008698	GGC	2	6	228691	228696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719178
4502	NC_008698	GC	3	6	228695	228700	0 %	0 %	50 %	50 %	119719178
4503	NC_008698	ACC	2	6	228814	228819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719178
4504	NC_008698	CCT	2	6	228831	228836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719178
4505	NC_008698	CCTG	2	8	228843	228850	0 %	25 %	25 %	50 %	119719178
4506	NC_008698	CGCGG	2	10	228942	228951	0 %	0 %	60 %	40 %	119719178
4507	NC_008698	CT	3	6	229014	229019	0 %	50 %	0 %	50 %	119719178
4508	NC_008698	TG	3	6	229062	229067	0 %	50 %	50 %	0 %	119719178
4509	NC_008698	CGA	2	6	229106	229111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719178
4510	NC_008698	AGCCC	2	10	229155	229164	20 %	0 %	20 %	60 %	119719178
4511	NC_008698	CTC	3	9	229167	229175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719178
4512	NC_008698	CCG	2	6	229232	229237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719178
4513	NC_008698	TGGC	2	8	229280	229287	0 %	25 %	50 %	25 %	119719178
4514	NC_008698	ACG	3	9	229486	229494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719178
4515	NC_008698	CGA	2	6	229571	229576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719178
4516	NC_008698	CT	3	6	229617	229622	0 %	50 %	0 %	50 %	119719178
4517	NC_008698	TGT	2	6	229628	229633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719178
4518	NC_008698	CTT	3	9	229800	229808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719178
4519	NC_008698	CCT	2	6	229818	229823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719178
4520	NC_008698	TGG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719178
4521	NC_008698	CCT	2	6	229874	229879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719178
4522	NC_008698	TCA	2	6	229922	229927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719178
4523	NC_008698	TTCA	2	8	229932	229939	25 %	50 %	0 %	25 %	119719178
4524	NC_008698	CCT	2	6	229950	229955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_008698	TGG	2	6	229960	229965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008698	GC	4	8	229984	229991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_008698	GGGA	2	8	230010	230017	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_008698	TG	3	6	230018	230023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_008698	TCG	3	9	230047	230055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008698	CGGG	2	8	230059	230066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_008698	C	6	6	230101	230106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4532	NC_008698	CGG	2	6	230115	230120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_008698	CAGC	2	8	230174	230181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_008698	TC	3	6	230201	230206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_008698	GA	3	6	230218	230223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008698	CGC	2	6	230265	230270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_008698	GC	3	6	230285	230290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_008698	CGC	3	9	230306	230314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_008698	CCG	2	6	230329	230334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_008698	GC	3	6	230441	230446	0 %	0 %	50 %	50 %	119719179
4541	NC_008698	CCTCTC	2	12	230455	230466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719179
4542	NC_008698	GGGA	2	8	230486	230493	25 %	0 %	75 %	0 %	119719179
4543	NC_008698	A	7	7	230511	230517	100 %	0 %	0 %	0 %	119719179
4544	NC_008698	GCG	2	6	230528	230533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719179
4545	NC_008698	CTC	2	6	230587	230592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719179
4546	NC_008698	TCC	2	6	230598	230603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719179
4547	NC_008698	G	12	12	230695	230706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008698	T	6	6	230807	230812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_008698	GGT	2	6	230828	230833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_008698	GTGA	2	8	230852	230859	25 %	25 %	50 %	0 %	119719180
4551	NC_008698	GC	3	6	230939	230944	0 %	0 %	50 %	50 %	119719180
4552	NC_008698	TCG	2	6	230946	230951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719180
4553	NC_008698	GAG	2	6	230969	230974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719180
4554	NC_008698	GCGCG	2	10	230989	230998	0 %	0 %	60 %	40 %	119719180
4555	NC_008698	GAG	2	6	231011	231016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719180
4556	NC_008698	AG	3	6	231032	231037	50 %	0 %	50 %	0 %	119719180
4557	NC_008698	AGA	2	6	231040	231045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719180
4558	NC_008698	GAG	2	6	231053	231058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719180
4559	NC_008698	CCT	2	6	231085	231090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_008698	T	6	6	231090	231095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_008698	CG	4	8	231109	231116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_008698	GCCGGG	2	12	231138	231149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_008698	TATC	2	8	231262	231269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_008698	AAAT	2	8	231290	231297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008698	AGG	2	6	231299	231304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008698	AGA	2	6	231380	231385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719181
4567	NC_008698	GGA	2	6	231440	231445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4568	NC_008698	G	6	6	231449	231454	0 %	0 %	100 %	0 %	119719181
4569	NC_008698	GAG	2	6	231456	231461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4570	NC_008698	TGG	2	6	231559	231564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719181
4571	NC_008698	GAG	2	6	231576	231581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4572	NC_008698	TGG	2	6	231601	231606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719181
4573	NC_008698	CTG	2	6	231637	231642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719181
4574	NC_008698	GAG	2	6	231645	231650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4575	NC_008698	GCT	2	6	231653	231658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719181
4576	NC_008698	GGAGG	2	10	231677	231686	20 %	0 %	80 %	0 %	119719181
4577	NC_008698	CAGG	2	8	231713	231720	25 %	0 %	50 %	25 %	119719181
4578	NC_008698	GAG	2	6	231762	231767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4579	NC_008698	AG	3	6	231774	231779	50 %	0 %	50 %	0 %	119719181
4580	NC_008698	AGG	3	9	231783	231791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4581	NC_008698	ACG	2	6	231838	231843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719181
4582	NC_008698	GAG	2	6	231867	231872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4583	NC_008698	GA	3	6	231920	231925	50 %	0 %	50 %	0 %	119719181
4584	NC_008698	ACG	2	6	231988	231993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719181
4585	NC_008698	TG	3	6	232037	232042	0 %	50 %	50 %	0 %	119719181
4586	NC_008698	TGG	2	6	232075	232080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719181
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4588	NC_008698	CGTT	2	8	232258	232265	0 %	50 %	25 %	25 %	119719181
4589	NC_008698	AGG	2	6	232365	232370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719181
4590	NC_008698	AG	4	8	232393	232400	50 %	0 %	50 %	0 %	119719181
4591	NC_008698	GAG	2	6	232464	232469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719182
4592	NC_008698	CGT	2	6	232472	232477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719182
4593	NC_008698	CCT	2	6	232532	232537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719182
4594	NC_008698	ACG	2	6	232546	232551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719182
4595	NC_008698	GGA	2	6	232613	232618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719182
4596	NC_008698	AGG	2	6	232635	232640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719182
4597	NC_008698	TAC	2	6	232684	232689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719182
4598	NC_008698	GGA	2	6	232762	232767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719182
4599	NC_008698	GAAC	2	8	232837	232844	50 %	0 %	25 %	25 %	119719182
4600	NC_008698	GACG	2	8	232883	232890	25 %	0 %	50 %	25 %	119719182
4601	NC_008698	GC	3	6	232967	232972	0 %	0 %	50 %	50 %	119719182
4602	NC_008698	C	6	6	233052	233057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4603	NC_008698	CG	3	6	233070	233075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_008698	ACG	2	6	233150	233155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719183
4605	NC_008698	CG	3	6	233160	233165	0 %	0 %	50 %	50 %	119719183
4606	NC_008698	ATA	2	6	233176	233181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719183
4607	NC_008698	TAG	2	6	233199	233204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719183
4608	NC_008698	TTA	2	6	233276	233281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719183
4609	NC_008698	TCC	2	6	233400	233405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719183
4610	NC_008698	CGAA	2	8	233440	233447	50 %	0 %	25 %	25 %	119719183
4611	NC_008698	TAA	2	6	233570	233575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719183
4612	NC_008698	AGCCT	2	10	233713	233722	20 %	20 %	20 %	40 %	119719183
4613	NC_008698	CGA	2	6	233823	233828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719183
4614	NC_008698	GAG	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719183
4615	NC_008698	GGA	2	6	233856	233861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719183
4616	NC_008698	GAT	2	6	233871	233876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719183
4617	NC_008698	TAC	2	6	233950	233955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719183
4618	NC_008698	AG	3	6	233983	233988	50 %	0 %	50 %	0 %	119719183
4619	NC_008698	TAC	2	6	233993	233998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719183
4620	NC_008698	GTG	2	6	234016	234021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719183
4621	NC_008698	TAC	2	6	234032	234037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719183
4622	NC_008698	CGA	2	6	234048	234053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719183
4623	NC_008698	GCTACT	2	12	234087	234098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119719183
4624	NC_008698	TAC	2	6	234116	234121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719183
4625	NC_008698	GA	3	6	234194	234199	50 %	0 %	50 %	0 %	119719183
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4627	NC_008698	GA	3	6	234281	234286	50 %	0 %	50 %	0 %	119719183
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4802	NC_008698	CAG	2	6	242663	242668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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