MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008696	CTT	2	6	22674	22679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008696	TC	3	6	22763	22768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_008696	C	6	6	22774	22779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_008696	C	6	6	22787	22792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_008696	T	6	6	22858	22863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008696	A	6	6	22904	22909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008696	C	6	6	22993	22998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_008696	A	6	6	23045	23050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008696	G	6	6	23052	23057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008696	A	7	7	23102	23108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008696	GT	3	6	23174	23179	0 %	50 %	50 %	0 %	119709794
512	NC_008696	GTA	2	6	23260	23265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709794
513	NC_008696	TAGC	2	8	23276	23283	25 %	25 %	25 %	25 %	119709794
514	NC_008696	CTC	2	6	23368	23373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709794
515	NC_008696	CTT	2	6	23380	23385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709794
516	NC_008696	CTC	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709794
517	NC_008696	TCG	2	6	23402	23407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709794
518	NC_008696	CGT	2	6	23427	23432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709794
519	NC_008696	TAA	2	6	23568	23573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008696	CTC	2	6	23659	23664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_008696	TCA	2	6	23685	23690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008696	GA	4	8	23696	23703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008696	A	6	6	23703	23708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008696	TTC	2	6	23727	23732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709795
525	NC_008696	TCC	2	6	23749	23754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709795
526	NC_008696	TCC	3	9	23758	23766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709795
527	NC_008696	TCC	2	6	23770	23775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709795
528	NC_008696	GTA	2	6	23787	23792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709795
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531	NC_008696	TAT	2	6	23949	23954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119709795
532	NC_008696	CTT	2	6	24108	24113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709795
533	NC_008696	CT	3	6	24135	24140	0 %	50 %	0 %	50 %	119709795
534	NC_008696	GTT	2	6	24175	24180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709795
535	NC_008696	TAA	2	6	24218	24223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008696	CTC	2	6	24290	24295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_008696	TCA	2	6	24317	24322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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539	NC_008696	GA	3	6	24386	24391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008696	A	7	7	24391	24397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008696	CTC	2	6	24419	24424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709796
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543	NC_008696	TCC	2	6	24435	24440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709796
544	NC_008696	GTC	2	6	24476	24481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709796
545	NC_008696	CTT	2	6	24490	24495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709796
546	NC_008696	AGA	2	6	24527	24532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709796
547	NC_008696	CTCGTC	2	12	24551	24562	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119709796
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551	NC_008696	GC	3	6	24768	24773	0 %	0 %	50 %	50 %	119709796
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559	NC_008696	CTC	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709797
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563	NC_008696	TCC	2	6	25233	25238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709797
564	NC_008696	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
565	NC_008696	ATC	2	6	25316	25321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709797
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569	NC_008696	CTT	2	6	25438	25443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709797
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571	NC_008696	CG	3	6	25485	25490	0 %	0 %	50 %	50 %	119709797
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573	NC_008696	TCT	2	6	25518	25523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709797
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588	NC_008696	TA	3	6	26186	26191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008696	CCAC	2	8	26309	26316	25 %	0 %	0 %	75 %	119709799
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599	NC_008696	CTC	2	6	26750	26755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709800
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602	NC_008696	AAG	2	6	26843	26848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709800
603	NC_008696	GAG	2	6	26885	26890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119709800
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609	NC_008696	CCT	2	6	27272	27277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
610	NC_008696	CCT	2	6	27290	27295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
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612	NC_008696	CTC	2	6	27360	27365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709801
613	NC_008696	C	6	6	27506	27511	0 %	0 %	0 %	100 %	119709801
614	NC_008696	GTG	2	6	27525	27530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709801
615	NC_008696	ACCT	2	8	27580	27587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_008696	AG	3	6	27606	27611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008696	A	6	6	27612	27617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008696	GCC	2	6	27706	27711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709802
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621	NC_008696	GAA	2	6	27865	27870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709803
622	NC_008696	GCG	2	6	27971	27976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709803
623	NC_008696	GTA	2	6	28136	28141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709804
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626	NC_008696	TGT	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709804
627	NC_008696	CTA	2	6	28270	28275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709804
628	NC_008696	C	6	6	28331	28336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
629	NC_008696	TC	3	6	28352	28357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_008696	CTT	2	6	28359	28364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_008696	GCC	2	6	28486	28491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709805
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