MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 6818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	CTTT	2	8	500	507	0 %	75 %	0 %	25 %	78484347
2	NC_007520	GAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	25 %	0 %	78484347
3	NC_007520	TTCA	2	8	602	609	25 %	50 %	0 %	25 %	78484347
4	NC_007520	GGAA	2	8	774	781	50 %	0 %	50 %	0 %	78484347
5	NC_007520	TGGA	2	8	824	831	25 %	25 %	50 %	0 %	78484347
6	NC_007520	AATT	2	8	1399	1406	50 %	50 %	0 %	0 %	78484347
7	NC_007520	GTTC	2	8	1415	1422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007520	ATTT	2	8	1471	1478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007520	GTTC	2	8	1814	1821	0 %	50 %	25 %	25 %	78484348
10	NC_007520	GACT	2	8	1833	1840	25 %	25 %	25 %	25 %	78484348
11	NC_007520	GCCA	2	8	2018	2025	25 %	0 %	25 %	50 %	78484348
12	NC_007520	ATTG	2	8	2197	2204	25 %	50 %	25 %	0 %	78484348
13	NC_007520	ACCG	2	8	2354	2361	25 %	0 %	25 %	50 %	78484348
14	NC_007520	GATT	2	8	2503	2510	25 %	50 %	25 %	0 %	78484348
15	NC_007520	TCAT	2	8	3224	3231	25 %	50 %	0 %	25 %	78484349
16	NC_007520	CTGG	2	8	3455	3462	0 %	25 %	50 %	25 %	78484349
17	NC_007520	GCAA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	25 %	25 %	78484349
18	NC_007520	TTGA	2	8	3691	3698	25 %	50 %	25 %	0 %	78484349
19	NC_007520	CTGA	2	8	4745	4752	25 %	25 %	25 %	25 %	78484351
20	NC_007520	CGTT	2	8	4931	4938	0 %	50 %	25 %	25 %	78484351
21	NC_007520	AACG	2	8	5097	5104	50 %	0 %	25 %	25 %	78484351
22	NC_007520	GCCA	2	8	5327	5334	25 %	0 %	25 %	50 %	78484351
23	NC_007520	GCCA	2	8	5769	5776	25 %	0 %	25 %	50 %	78484351
24	NC_007520	TCAA	2	8	6079	6086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007520	ACTT	2	8	6172	6179	25 %	50 %	0 %	25 %	78484352
26	NC_007520	CAAA	2	8	6489	6496	75 %	0 %	0 %	25 %	78484352
27	NC_007520	AGTC	2	8	6506	6513	25 %	25 %	25 %	25 %	78484352
28	NC_007520	AAAC	2	8	6537	6544	75 %	0 %	0 %	25 %	78484352
29	NC_007520	AGAA	2	8	6655	6662	75 %	0 %	25 %	0 %	78484352
30	NC_007520	ACCC	2	8	7305	7312	25 %	0 %	0 %	75 %	78484353
31	NC_007520	TTAT	2	8	8250	8257	25 %	75 %	0 %	0 %	78484353
32	NC_007520	GATT	2	8	8437	8444	25 %	50 %	25 %	0 %	78484354
33	NC_007520	AGTC	2	8	8663	8670	25 %	25 %	25 %	25 %	78484354
34	NC_007520	CGTT	2	8	8673	8680	0 %	50 %	25 %	25 %	78484354
35	NC_007520	TTAC	2	8	9777	9784	25 %	50 %	0 %	25 %	78484354
36	NC_007520	GGAA	2	8	9797	9804	50 %	0 %	50 %	0 %	78484354
37	NC_007520	TGTT	2	8	9808	9815	0 %	75 %	25 %	0 %	78484354
38	NC_007520	TGGT	2	8	9927	9934	0 %	50 %	50 %	0 %	78484354
39	NC_007520	TCCA	2	8	10112	10119	25 %	25 %	0 %	50 %	78484354
40	NC_007520	TCGG	2	8	11163	11170	0 %	25 %	50 %	25 %	78484354
41	NC_007520	GCTT	2	8	11332	11339	0 %	50 %	25 %	25 %	78484354
42	NC_007520	TATC	2	8	11450	11457	25 %	50 %	0 %	25 %	78484354
43	NC_007520	GTCA	2	8	11539	11546	25 %	25 %	25 %	25 %	78484355
44	NC_007520	TTGA	2	8	11558	11565	25 %	50 %	25 %	0 %	78484355
45	NC_007520	TTTC	2	8	11619	11626	0 %	75 %	0 %	25 %	78484355
46	NC_007520	CAAG	2	8	12345	12352	50 %	0 %	25 %	25 %	78484356
47	NC_007520	GTGC	2	8	12559	12566	0 %	25 %	50 %	25 %	78484357
48	NC_007520	TTGA	2	8	12703	12710	25 %	50 %	25 %	0 %	78484357
49	NC_007520	ATCA	2	8	13291	13298	50 %	25 %	0 %	25 %	78484357
50	NC_007520	GACC	2	8	13437	13444	25 %	0 %	25 %	50 %	78484357
51	NC_007520	ATTT	2	8	13742	13749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007520	AAAC	2	8	14336	14343	75 %	0 %	0 %	25 %	78484358
53	NC_007520	CTTT	2	8	14489	14496	0 %	75 %	0 %	25 %	78484358
54	NC_007520	GCGG	2	8	15191	15198	0 %	0 %	75 %	25 %	78484358
55	NC_007520	CTTA	2	8	15540	15547	25 %	50 %	0 %	25 %	78484358
56	NC_007520	ATTT	2	8	16413	16420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007520	GAAA	2	8	16661	16668	75 %	0 %	25 %	0 %	78484359
58	NC_007520	GCAA	2	8	16783	16790	50 %	0 %	25 %	25 %	78484359
59	NC_007520	GCAT	2	8	16963	16970	25 %	25 %	25 %	25 %	78484359
60	NC_007520	ATCA	2	8	17012	17019	50 %	25 %	0 %	25 %	78484359
61	NC_007520	CGTC	2	8	17261	17268	0 %	25 %	25 %	50 %	78484359
62	NC_007520	CCAA	2	8	17881	17888	50 %	0 %	0 %	50 %	78484360
63	NC_007520	ACCA	2	8	17936	17943	50 %	0 %	0 %	50 %	78484360
64	NC_007520	TTCT	2	8	18507	18514	0 %	75 %	0 %	25 %	78484360
65	NC_007520	GAAT	2	8	19178	19185	50 %	25 %	25 %	0 %	78484360
66	NC_007520	AAAT	2	8	20106	20113	75 %	25 %	0 %	0 %	78484361
67	NC_007520	GGGT	2	8	20262	20269	0 %	25 %	75 %	0 %	78484361
68	NC_007520	TTGG	2	8	20487	20494	0 %	50 %	50 %	0 %	78484362
69	NC_007520	CCGA	2	8	21133	21140	25 %	0 %	25 %	50 %	78484363
70	NC_007520	CCAA	2	8	21171	21178	50 %	0 %	0 %	50 %	78484363
71	NC_007520	TTTA	2	8	21817	21824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007520	TTAA	2	8	22205	22212	50 %	50 %	0 %	0 %	78484364
73	NC_007520	CGAT	2	8	23879	23886	25 %	25 %	25 %	25 %	78484366
74	NC_007520	ACAA	2	8	24556	24563	75 %	0 %	0 %	25 %	78484366
75	NC_007520	TTAA	2	8	24638	24645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007520	AATT	2	8	24994	25001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007520	GAAT	2	8	25046	25053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007520	ATCA	2	8	25742	25749	50 %	25 %	0 %	25 %	78484367
79	NC_007520	TGAT	2	8	25971	25978	25 %	50 %	25 %	0 %	78484367
80	NC_007520	ATTG	2	8	25979	25986	25 %	50 %	25 %	0 %	78484367
81	NC_007520	TCAT	2	8	26268	26275	25 %	50 %	0 %	25 %	78484367
82	NC_007520	ACAT	2	8	26618	26625	50 %	25 %	0 %	25 %	118139509
83	NC_007520	ATTT	2	8	26742	26749	25 %	75 %	0 %	0 %	118139509
84	NC_007520	TGGC	2	8	26783	26790	0 %	25 %	50 %	25 %	118139509
85	NC_007520	ATTT	2	8	26837	26844	25 %	75 %	0 %	0 %	78484369
86	NC_007520	TTTC	2	8	27203	27210	0 %	75 %	0 %	25 %	78484369
87	NC_007520	CATG	2	8	27871	27878	25 %	25 %	25 %	25 %	78484370
88	NC_007520	CAAA	2	8	28354	28361	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
89	NC_007520	ACAA	2	8	28875	28882	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
90	NC_007520	CCAA	2	8	29609	29616	50 %	0 %	0 %	50 %	78484371
91	NC_007520	CCAA	2	8	30161	30168	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
92	NC_007520	TTCC	2	8	31153	31160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007520	CTGG	2	8	31208	31215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007520	CATC	2	8	31244	31251	25 %	25 %	0 %	50 %	78484373
95	NC_007520	TTCA	2	8	31917	31924	25 %	50 %	0 %	25 %	78484373
96	NC_007520	TGGT	2	8	31948	31955	0 %	50 %	50 %	0 %	78484373
97	NC_007520	ATGA	2	8	32184	32191	50 %	25 %	25 %	0 %	78484373
98	NC_007520	TCAT	2	8	32353	32360	25 %	50 %	0 %	25 %	78484373
99	NC_007520	CAAA	2	8	32600	32607	75 %	0 %	0 %	25 %	78484373
100	NC_007520	TTCT	2	8	32636	32643	0 %	75 %	0 %	25 %	78484373
101	NC_007520	TACG	2	8	33196	33203	25 %	25 %	25 %	25 %	78484373
102	NC_007520	ATTT	2	8	33218	33225	25 %	75 %	0 %	0 %	78484373
103	NC_007520	AACT	2	8	33312	33319	50 %	25 %	0 %	25 %	78484373
104	NC_007520	TGAT	2	8	33785	33792	25 %	50 %	25 %	0 %	78484373
105	NC_007520	AATT	2	8	34034	34041	50 %	50 %	0 %	0 %	78484373
106	NC_007520	GCTT	2	8	34571	34578	0 %	50 %	25 %	25 %	78484374
107	NC_007520	TCAT	2	8	35222	35229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007520	TTAA	2	8	36740	36747	50 %	50 %	0 %	0 %	78484376
109	NC_007520	GCAA	2	8	37046	37053	50 %	0 %	25 %	25 %	78484376
110	NC_007520	ATTT	2	8	38014	38021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007520	TTTG	2	8	38047	38054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007520	GATT	2	8	38114	38121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007520	ATGG	2	8	38136	38143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007520	ACCA	2	8	38314	38321	50 %	0 %	0 %	50 %	78484377
115	NC_007520	ACGT	2	8	38325	38332	25 %	25 %	25 %	25 %	78484377
116	NC_007520	GGTT	2	8	38572	38579	0 %	50 %	50 %	0 %	78484377
117	NC_007520	ATCC	2	8	38704	38711	25 %	25 %	0 %	50 %	78484377
118	NC_007520	AACA	2	8	39526	39533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007520	TAAA	2	8	39629	39636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007520	GAAA	2	8	40376	40383	75 %	0 %	25 %	0 %	78484378
121	NC_007520	CAAA	2	8	40418	40425	75 %	0 %	0 %	25 %	78484378
122	NC_007520	TTGA	2	8	40787	40794	25 %	50 %	25 %	0 %	78484379
123	NC_007520	CCAT	2	8	41239	41246	25 %	25 %	0 %	50 %	78484379
124	NC_007520	GGCT	2	8	41806	41813	0 %	25 %	50 %	25 %	78484380
125	NC_007520	TTGA	2	8	41956	41963	25 %	50 %	25 %	0 %	78484380
126	NC_007520	GTTA	2	8	42559	42566	25 %	50 %	25 %	0 %	78484380
127	NC_007520	GTTG	2	8	42747	42754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007520	TCAG	2	8	42935	42942	25 %	25 %	25 %	25 %	78484381
129	NC_007520	CTAT	2	8	43226	43233	25 %	50 %	0 %	25 %	78484381
130	NC_007520	ATTT	2	8	43981	43988	25 %	75 %	0 %	0 %	78484381
131	NC_007520	GATT	2	8	44230	44237	25 %	50 %	25 %	0 %	78484381
132	NC_007520	CATT	2	8	46002	46009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007520	GTTG	2	8	46200	46207	0 %	50 %	50 %	0 %	78484383
134	NC_007520	CGTG	2	8	46239	46246	0 %	25 %	50 %	25 %	78484383
135	NC_007520	GGTT	2	8	46482	46489	0 %	50 %	50 %	0 %	78484383
136	NC_007520	TTTC	2	8	46653	46660	0 %	75 %	0 %	25 %	78484383
137	NC_007520	GCGT	2	8	47237	47244	0 %	25 %	50 %	25 %	78484383
138	NC_007520	TTAC	2	8	47318	47325	25 %	50 %	0 %	25 %	78484383
139	NC_007520	TCAA	2	8	47720	47727	50 %	25 %	0 %	25 %	78484384
140	NC_007520	TTTA	2	8	47890	47897	25 %	75 %	0 %	0 %	78484384
141	NC_007520	CATT	2	8	48296	48303	25 %	50 %	0 %	25 %	78484384
142	NC_007520	CAAA	2	8	48405	48412	75 %	0 %	0 %	25 %	78484384
143	NC_007520	TTTG	2	8	48776	48783	0 %	75 %	25 %	0 %	78484385
144	NC_007520	GTTT	2	8	48847	48854	0 %	75 %	25 %	0 %	78484385
145	NC_007520	AGGA	2	8	49132	49139	50 %	0 %	50 %	0 %	78484385
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