MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007520	GAA	2	6	207821	207826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484518
4003	NC_007520	TTG	2	6	207906	207911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484518
4004	NC_007520	ATTAT	2	10	207966	207975	40 %	60 %	0 %	0 %	78484518
4005	NC_007520	TCA	2	6	208078	208083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484518
4006	NC_007520	CT	3	6	208142	208147	0 %	50 %	0 %	50 %	78484519
4007	NC_007520	GGC	2	6	208180	208185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484519
4008	NC_007520	TGG	2	6	208217	208222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484519
4009	NC_007520	TGA	2	6	208256	208261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484519
4010	NC_007520	ATC	2	6	208270	208275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484519
4011	NC_007520	GT	3	6	208277	208282	0 %	50 %	50 %	0 %	78484519
4012	NC_007520	GC	3	6	208382	208387	0 %	0 %	50 %	50 %	78484519
4013	NC_007520	T	6	6	208418	208423	0 %	100 %	0 %	0 %	78484519
4014	NC_007520	TTG	3	9	208429	208437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484519
4015	NC_007520	TTG	2	6	208553	208558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484519
4016	NC_007520	ATT	2	6	208579	208584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484519
4017	NC_007520	TGC	2	6	208595	208600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484519
4018	NC_007520	ATCG	2	8	208710	208717	25 %	25 %	25 %	25 %	78484519
4019	NC_007520	AT	3	6	208848	208853	50 %	50 %	0 %	0 %	78484519
4020	NC_007520	TGA	2	6	208895	208900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484520
4021	NC_007520	ACG	2	6	208994	208999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484520
4022	NC_007520	AGA	2	6	209052	209057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484520
4023	NC_007520	TGG	2	6	209069	209074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484520
4024	NC_007520	GT	3	6	209152	209157	0 %	50 %	50 %	0 %	78484520
4025	NC_007520	CAA	2	6	209176	209181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484520
4026	NC_007520	A	6	6	209180	209185	100 %	0 %	0 %	0 %	78484520
4027	NC_007520	CGT	2	6	209239	209244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484520
4028	NC_007520	TGGTA	2	10	209251	209260	20 %	40 %	40 %	0 %	78484520
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4033	NC_007520	ACA	2	6	209437	209442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484520
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4035	NC_007520	TGA	2	6	209552	209557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484520
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4037	NC_007520	TCGGT	2	10	209626	209635	0 %	40 %	40 %	20 %	78484520
4038	NC_007520	TTTA	2	8	209667	209674	25 %	75 %	0 %	0 %	78484520
4039	NC_007520	TGA	2	6	209676	209681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484520
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4041	NC_007520	TA	3	6	209850	209855	50 %	50 %	0 %	0 %	78484520
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4043	NC_007520	CCGG	2	8	209969	209976	0 %	0 %	50 %	50 %	78484521
4044	NC_007520	ATGG	2	8	210061	210068	25 %	25 %	50 %	0 %	78484521
4045	NC_007520	ATA	2	6	210075	210080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484521
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4047	NC_007520	T	6	6	210169	210174	0 %	100 %	0 %	0 %	78484521
4048	NC_007520	AT	3	6	210239	210244	50 %	50 %	0 %	0 %	78484521
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4052	NC_007520	T	8	8	210483	210490	0 %	100 %	0 %	0 %	78484521
4053	NC_007520	T	6	6	210493	210498	0 %	100 %	0 %	0 %	78484521
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4057	NC_007520	TGA	2	6	211054	211059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484522
4058	NC_007520	CTT	3	9	211075	211083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484522
4059	NC_007520	GTT	2	6	211087	211092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484522
4060	NC_007520	ATC	2	6	211167	211172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484522
4061	NC_007520	GGC	2	6	211239	211244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484522
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4063	NC_007520	CAGCG	2	10	211346	211355	20 %	0 %	40 %	40 %	78484522
4064	NC_007520	TAGA	2	8	211394	211401	50 %	25 %	25 %	0 %	78484522
4065	NC_007520	ATA	2	6	211412	211417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484522
4066	NC_007520	CTTG	2	8	211429	211436	0 %	50 %	25 %	25 %	78484522
4067	NC_007520	CCT	2	6	211476	211481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_007520	ATT	2	6	211499	211504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007520	AGA	2	6	211535	211540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_007520	TCAT	2	8	212524	212531	25 %	50 %	0 %	25 %	78484524
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4102	NC_007520	ACA	2	6	213560	213565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484525
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4109	NC_007520	A	6	6	213786	213791	100 %	0 %	0 %	0 %	78484525
4110	NC_007520	GTG	2	6	213822	213827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484525
4111	NC_007520	GCG	2	6	213846	213851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484525
4112	NC_007520	GTCG	2	8	213905	213912	0 %	25 %	50 %	25 %	78484525
4113	NC_007520	AGA	2	6	213938	213943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484525
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4123	NC_007520	GTT	2	6	214741	214746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4126	NC_007520	GCTG	2	8	215031	215038	0 %	25 %	50 %	25 %	78484527
4127	NC_007520	GGA	2	6	215130	215135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484527
4128	NC_007520	TGG	2	6	215138	215143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484527
4129	NC_007520	TTCT	2	8	215172	215179	0 %	75 %	0 %	25 %	78484527
4130	NC_007520	GC	4	8	215189	215196	0 %	0 %	50 %	50 %	78484527
4131	NC_007520	TGGCTC	2	12	215249	215260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484527
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4155	NC_007520	A	6	6	216210	216215	100 %	0 %	0 %	0 %	78484528
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4166	NC_007520	CGG	2	6	216723	216728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484529
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4232	NC_007520	CAA	2	6	220048	220053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484532
4233	NC_007520	T	7	7	220099	220105	0 %	100 %	0 %	0 %	78484532
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4236	NC_007520	TGT	2	6	220275	220280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484532
4237	NC_007520	GGT	2	6	220297	220302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484532
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4239	NC_007520	TGG	2	6	220336	220341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484532
4240	NC_007520	GT	3	6	220397	220402	0 %	50 %	50 %	0 %	78484532
4241	NC_007520	GGC	2	6	220403	220408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484532
4242	NC_007520	CTT	2	6	220423	220428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484532
4243	NC_007520	CAT	2	6	220543	220548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484532
4244	NC_007520	AGC	2	6	220563	220568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484532
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4246	NC_007520	ATTG	2	8	220698	220705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_007520	TTA	2	6	220773	220778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_007520	T	6	6	220832	220837	0 %	100 %	0 %	0 %	78484533
4249	NC_007520	TC	3	6	220879	220884	0 %	50 %	0 %	50 %	78484533
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4251	NC_007520	AGC	2	6	220934	220939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484533
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4372	NC_007520	ATC	2	6	227050	227055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484537
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