MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007520	TGA	2	6	25510	25515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484367
502	NC_007520	AG	3	6	25526	25531	50 %	0 %	50 %	0 %	78484367
503	NC_007520	GTT	2	6	25594	25599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484367
504	NC_007520	TTA	2	6	25685	25690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484367
505	NC_007520	ATG	2	6	25715	25720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484367
506	NC_007520	ATCA	2	8	25742	25749	50 %	25 %	0 %	25 %	78484367
507	NC_007520	AAG	2	6	25782	25787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484367
508	NC_007520	AGA	2	6	25822	25827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484367
509	NC_007520	CCT	2	6	25828	25833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484367
510	NC_007520	ATAAAA	2	12	25836	25847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	78484367
511	NC_007520	CCA	2	6	25863	25868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484367
512	NC_007520	AAC	2	6	25947	25952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484367
513	NC_007520	TGAT	2	8	25971	25978	25 %	50 %	25 %	0 %	78484367
514	NC_007520	ATTG	2	8	25979	25986	25 %	50 %	25 %	0 %	78484367
515	NC_007520	TGA	2	6	26026	26031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484367
516	NC_007520	A	6	6	26175	26180	100 %	0 %	0 %	0 %	78484367
517	NC_007520	TCAT	2	8	26268	26275	25 %	50 %	0 %	25 %	78484367
518	NC_007520	AAG	2	6	26387	26392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007520	TTA	2	6	26400	26405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118139509
520	NC_007520	TA	3	6	26426	26431	50 %	50 %	0 %	0 %	118139509
521	NC_007520	TTA	2	6	26586	26591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118139509
522	NC_007520	ACAT	2	8	26618	26625	50 %	25 %	0 %	25 %	118139509
523	NC_007520	T	6	6	26637	26642	0 %	100 %	0 %	0 %	118139509
524	NC_007520	CAT	2	6	26656	26661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118139509
525	NC_007520	TGA	2	6	26704	26709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118139509
526	NC_007520	TCA	2	6	26713	26718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118139509
527	NC_007520	ATTT	2	8	26742	26749	25 %	75 %	0 %	0 %	118139509
528	NC_007520	TTA	2	6	26750	26755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118139509
529	NC_007520	TTA	2	6	26759	26764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118139509
530	NC_007520	CAT	2	6	26770	26775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118139509
531	NC_007520	TGGC	2	8	26783	26790	0 %	25 %	50 %	25 %	118139509
532	NC_007520	TAAAA	2	10	26794	26803	80 %	20 %	0 %	0 %	118139509
533	NC_007520	CAT	2	6	26819	26824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484369
534	NC_007520	ATTT	2	8	26837	26844	25 %	75 %	0 %	0 %	78484369
535	NC_007520	ATT	2	6	27050	27055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484369
536	NC_007520	A	6	6	27116	27121	100 %	0 %	0 %	0 %	78484369
537	NC_007520	TTTC	2	8	27203	27210	0 %	75 %	0 %	25 %	78484369
538	NC_007520	GGC	2	6	27276	27281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484369
539	NC_007520	A	6	6	27341	27346	100 %	0 %	0 %	0 %	78484369
540	NC_007520	AGC	2	6	27389	27394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484369
541	NC_007520	CA	3	6	27466	27471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007520	ACC	2	6	27478	27483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_007520	AAT	2	6	27506	27511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007520	GCA	2	6	27590	27595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484370
545	NC_007520	A	6	6	27719	27724	100 %	0 %	0 %	0 %	78484370
546	NC_007520	CTG	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484370
547	NC_007520	AAG	2	6	27789	27794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
548	NC_007520	TAT	2	6	27808	27813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484370
549	NC_007520	CCA	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484370
550	NC_007520	CATG	2	8	27871	27878	25 %	25 %	25 %	25 %	78484370
551	NC_007520	A	6	6	27899	27904	100 %	0 %	0 %	0 %	78484370
552	NC_007520	CGA	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484370
553	NC_007520	CAA	2	6	28021	28026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484370
554	NC_007520	AGA	3	9	28096	28104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
555	NC_007520	GTT	2	6	28118	28123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484370
556	NC_007520	GCC	3	9	28162	28170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
557	NC_007520	ATC	2	6	28227	28232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
558	NC_007520	AAG	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484370
559	NC_007520	CTT	2	6	28311	28316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484370
560	NC_007520	CAAA	2	8	28354	28361	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
561	NC_007520	GAT	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
562	NC_007520	CCG	2	6	28382	28387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
563	NC_007520	ATG	2	6	28449	28454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
564	NC_007520	TCA	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
565	NC_007520	CCG	2	6	28511	28516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484370
566	NC_007520	ATG	2	6	28557	28562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484370
567	NC_007520	ATC	2	6	28577	28582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484370
568	NC_007520	TTC	2	6	28617	28622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484370
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570	NC_007520	TGG	2	6	28707	28712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484370
571	NC_007520	GC	3	6	28756	28761	0 %	0 %	50 %	50 %	78484370
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573	NC_007520	ACAA	2	8	28875	28882	75 %	0 %	0 %	25 %	78484370
574	NC_007520	TTG	2	6	28932	28937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484370
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577	NC_007520	ACT	2	6	29113	29118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007520	TAT	2	6	29146	29151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007520	T	6	6	29160	29165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007520	CAT	2	6	29180	29185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007520	A	7	7	29233	29239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007520	GAA	2	6	29260	29265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484371
583	NC_007520	GGT	2	6	29312	29317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484371
584	NC_007520	ATG	2	6	29342	29347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484371
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599	NC_007520	GGC	2	6	30021	30026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484372
600	NC_007520	GCC	2	6	30036	30041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484372
601	NC_007520	CCA	2	6	30086	30091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484372
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604	NC_007520	CCAA	2	8	30161	30168	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
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612	NC_007520	CAT	2	6	30692	30697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484372
613	NC_007520	C	6	6	30715	30720	0 %	0 %	0 %	100 %	78484372
614	NC_007520	CA	3	6	30894	30899	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
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618	NC_007520	CTT	2	6	31010	31015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484372
619	NC_007520	AAC	2	6	31116	31121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_007520	TTCC	2	8	31153	31160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_007520	AAC	2	6	31175	31180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_007520	CTGG	2	8	31208	31215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_007520	ACT	2	6	31217	31222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484373
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629	NC_007520	TGT	2	6	31442	31447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484373
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631	NC_007520	GGC	2	6	31533	31538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484373
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