MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007520	TTCA	2	8	309255	309262	25 %	50 %	0 %	25 %	78484604
6002	NC_007520	AAG	2	6	309343	309348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484604
6003	NC_007520	GTTG	2	8	309370	309377	0 %	50 %	50 %	0 %	78484604
6004	NC_007520	AGC	2	6	309388	309393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484604
6005	NC_007520	CAG	2	6	309412	309417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484604
6006	NC_007520	GTC	2	6	309494	309499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484605
6007	NC_007520	CCAG	2	8	309545	309552	25 %	0 %	25 %	50 %	78484605
6008	NC_007520	CAAA	2	8	309577	309584	75 %	0 %	0 %	25 %	78484605
6009	NC_007520	TGG	2	6	309626	309631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484605
6010	NC_007520	AAAT	2	8	309658	309665	75 %	25 %	0 %	0 %	78484605
6011	NC_007520	G	7	7	309671	309677	0 %	0 %	100 %	0 %	78484605
6012	NC_007520	AGTGGC	2	12	309681	309692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78484605
6013	NC_007520	TCG	2	6	309792	309797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484605
6014	NC_007520	TATCT	2	10	309825	309834	20 %	60 %	0 %	20 %	78484605
6015	NC_007520	T	6	6	309841	309846	0 %	100 %	0 %	0 %	78484605
6016	NC_007520	GCAG	2	8	309865	309872	25 %	0 %	50 %	25 %	78484605
6017	NC_007520	GGT	2	6	309967	309972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484605
6018	NC_007520	ATG	2	6	309989	309994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484605
6019	NC_007520	TTG	2	6	310010	310015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484605
6020	NC_007520	CTC	2	6	310052	310057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484605
6021	NC_007520	ATC	2	6	310113	310118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484605
6022	NC_007520	AAT	2	6	310127	310132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484605
6023	NC_007520	ATG	3	9	310181	310189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484605
6024	NC_007520	A	6	6	310191	310196	100 %	0 %	0 %	0 %	78484605
6025	NC_007520	TAA	2	6	310204	310209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484605
6026	NC_007520	A	6	6	310219	310224	100 %	0 %	0 %	0 %	78484605
6027	NC_007520	GTG	2	6	310291	310296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484606
6028	NC_007520	ATT	2	6	310344	310349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484606
6029	NC_007520	AGC	2	6	310389	310394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484606
6030	NC_007520	TCC	2	6	310515	310520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484606
6031	NC_007520	CAA	2	6	310529	310534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484606
6032	NC_007520	TGTT	2	8	310542	310549	0 %	75 %	25 %	0 %	78484606
6033	NC_007520	GTTT	2	8	310591	310598	0 %	75 %	25 %	0 %	78484606
6034	NC_007520	TGGC	2	8	310628	310635	0 %	25 %	50 %	25 %	78484606
6035	NC_007520	AC	3	6	310650	310655	50 %	0 %	0 %	50 %	78484606
6036	NC_007520	TGG	2	6	310687	310692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484606
6037	NC_007520	A	7	7	310860	310866	100 %	0 %	0 %	0 %	78484606
6038	NC_007520	GGT	2	6	310878	310883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484606
6039	NC_007520	AAG	2	6	310896	310901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484606
6040	NC_007520	GC	3	6	310934	310939	0 %	0 %	50 %	50 %	78484607
6041	NC_007520	CTT	2	6	310978	310983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484607
6042	NC_007520	CCGGG	2	10	310993	311002	0 %	0 %	60 %	40 %	78484607
6043	NC_007520	AAT	2	6	311032	311037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484607
6044	NC_007520	TTGT	2	8	311048	311055	0 %	75 %	25 %	0 %	78484607
6045	NC_007520	ATA	2	6	311190	311195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484607
6046	NC_007520	CTTT	2	8	311266	311273	0 %	75 %	0 %	25 %	78484607
6047	NC_007520	TTAAC	2	10	311281	311290	40 %	40 %	0 %	20 %	78484607
6048	NC_007520	CTT	2	6	311293	311298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484607
6049	NC_007520	TCA	2	6	311313	311318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484607
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6051	NC_007520	T	7	7	311422	311428	0 %	100 %	0 %	0 %	78484607
6052	NC_007520	CTA	2	6	311449	311454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484607
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6054	NC_007520	ATC	2	6	311567	311572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484607
6055	NC_007520	TTC	2	6	311604	311609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484607
6056	NC_007520	TCAG	2	8	311628	311635	25 %	25 %	25 %	25 %	78484607
6057	NC_007520	GCA	2	6	311665	311670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484607
6058	NC_007520	TCA	2	6	311721	311726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484607
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6061	NC_007520	ATC	2	6	311906	311911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484608
6062	NC_007520	TGG	2	6	311916	311921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484608
6063	NC_007520	ATC	2	6	311933	311938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484608
6064	NC_007520	AAT	2	6	311989	311994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484608
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6068	NC_007520	GAT	2	6	312181	312186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484608
6069	NC_007520	TAC	2	6	312201	312206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484608
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6072	NC_007520	TTG	2	6	312383	312388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_007520	GCG	2	6	312404	312409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6089	NC_007520	TAAAAG	2	12	313295	313306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_007520	TTA	2	6	313324	313329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_007520	ATG	2	6	313442	313447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484610
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6107	NC_007520	CAAG	2	8	314034	314041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6108	NC_007520	TGAAA	2	10	314052	314061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_007520	ATGA	2	8	314195	314202	50 %	25 %	25 %	0 %	78484611
6110	NC_007520	GCC	2	6	314213	314218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484611
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6112	NC_007520	GGT	2	6	314345	314350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484611
6113	NC_007520	ATT	2	6	314372	314377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484611
6114	NC_007520	GTA	2	6	314444	314449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484611
6115	NC_007520	AGC	2	6	314451	314456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484611
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6117	NC_007520	CGG	2	6	314542	314547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484611
6118	NC_007520	TGG	2	6	314550	314555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484611
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6121	NC_007520	TTG	2	6	314667	314672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484611
6122	NC_007520	CAG	2	6	314783	314788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484611
6123	NC_007520	GATGC	2	10	314915	314924	20 %	20 %	40 %	20 %	78484611
6124	NC_007520	CTC	2	6	315055	315060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484611
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