MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 47602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007520	GTC	2	6	259023	259028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484564
5002	NC_007520	GAA	2	6	259061	259066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484564
5003	NC_007520	CT	3	6	259154	259159	0 %	50 %	0 %	50 %	78484564
5004	NC_007520	GCGG	2	8	259166	259173	0 %	0 %	75 %	25 %	78484564
5005	NC_007520	ATT	2	6	259236	259241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484564
5006	NC_007520	ATG	2	6	259278	259283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484564
5007	NC_007520	GAA	2	6	259376	259381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484564
5008	NC_007520	A	7	7	259397	259403	100 %	0 %	0 %	0 %	78484564
5009	NC_007520	ATCG	2	8	259430	259437	25 %	25 %	25 %	25 %	78484564
5010	NC_007520	TGGC	2	8	259444	259451	0 %	25 %	50 %	25 %	78484564
5011	NC_007520	CACT	2	8	259464	259471	25 %	25 %	0 %	50 %	78484564
5012	NC_007520	AGG	2	6	259546	259551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78484564
5013	NC_007520	GCG	2	6	259592	259597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484564
5014	NC_007520	CCG	2	6	259643	259648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484564
5015	NC_007520	AGC	2	6	259808	259813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484564
5016	NC_007520	ACG	2	6	259851	259856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484564
5017	NC_007520	ATT	2	6	259939	259944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484564
5018	NC_007520	AGA	2	6	259963	259968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484564
5019	NC_007520	TTA	2	6	259975	259980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484564
5020	NC_007520	TTGG	2	8	260009	260016	0 %	50 %	50 %	0 %	78484564
5021	NC_007520	AGA	2	6	260023	260028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484564
5022	NC_007520	CGT	2	6	260104	260109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484564
5023	NC_007520	TGAG	2	8	260146	260153	25 %	25 %	50 %	0 %	78484564
5024	NC_007520	GT	3	6	260170	260175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_007520	GA	3	6	260187	260192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_007520	AT	3	6	260307	260312	50 %	50 %	0 %	0 %	78484565
5027	NC_007520	GCG	2	6	260371	260376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484565
5028	NC_007520	TTG	2	6	260378	260383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484565
5029	NC_007520	ATG	2	6	260422	260427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484565
5030	NC_007520	TTA	2	6	260447	260452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484565
5031	NC_007520	GCG	2	6	260539	260544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484565
5032	NC_007520	GC	3	6	260554	260559	0 %	0 %	50 %	50 %	78484565
5033	NC_007520	GGC	3	9	260713	260721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484565
5034	NC_007520	TCC	2	6	260761	260766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78484565
5035	NC_007520	GGC	2	6	260767	260772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484565
5036	NC_007520	GAC	2	6	260899	260904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484565
5037	NC_007520	ATT	2	6	260933	260938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484565
5038	NC_007520	GACA	2	8	261043	261050	50 %	0 %	25 %	25 %	78484565
5039	NC_007520	T	7	7	261126	261132	0 %	100 %	0 %	0 %	78484565
5040	NC_007520	CAA	2	6	261181	261186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484565
5041	NC_007520	ATG	2	6	261247	261252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484565
5042	NC_007520	TGTGG	2	10	261334	261343	0 %	40 %	60 %	0 %	78484565
5043	NC_007520	CCG	2	6	261367	261372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484565
5044	NC_007520	GAA	3	9	261385	261393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484565
5045	NC_007520	CAGG	2	8	261397	261404	25 %	0 %	50 %	25 %	78484565
5046	NC_007520	GAT	2	6	261465	261470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484566
5047	NC_007520	CCTTT	2	10	261475	261484	0 %	60 %	0 %	40 %	78484566
5048	NC_007520	ATT	2	6	261552	261557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484566
5049	NC_007520	GAC	2	6	261596	261601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484566
5050	NC_007520	TGG	2	6	261625	261630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484566
5051	NC_007520	GAA	2	6	261672	261677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484566
5052	NC_007520	CG	3	6	261689	261694	0 %	0 %	50 %	50 %	78484566
5053	NC_007520	TGG	2	6	261763	261768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484566
5054	NC_007520	T	6	6	261815	261820	0 %	100 %	0 %	0 %	78484566
5055	NC_007520	ATC	2	6	261829	261834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484566
5056	NC_007520	ACC	2	6	261849	261854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484566
5057	NC_007520	TGA	2	6	261934	261939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484566
5058	NC_007520	AGC	2	6	261944	261949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484566
5059	NC_007520	GGC	2	6	262020	262025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484566
5060	NC_007520	AGCCA	2	10	262032	262041	40 %	0 %	20 %	40 %	78484566
5061	NC_007520	CGGC	2	8	262048	262055	0 %	0 %	50 %	50 %	78484566
5062	NC_007520	CGG	2	6	262066	262071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484566
5063	NC_007520	GAT	2	6	262199	262204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484566
5064	NC_007520	GCG	2	6	262219	262224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484566
5065	NC_007520	CTGA	2	8	262227	262234	25 %	25 %	25 %	25 %	78484566
5066	NC_007520	A	6	6	262288	262293	100 %	0 %	0 %	0 %	78484566
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5068	NC_007520	CAT	2	6	262340	262345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484566
5069	NC_007520	GTTT	2	8	262441	262448	0 %	75 %	25 %	0 %	78484566
5070	NC_007520	GAT	2	6	262584	262589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484566
5071	NC_007520	A	7	7	262665	262671	100 %	0 %	0 %	0 %	78484566
5072	NC_007520	A	6	6	262674	262679	100 %	0 %	0 %	0 %	78484566
5073	NC_007520	TCA	2	6	262745	262750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484567
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5075	NC_007520	GAA	2	6	262887	262892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484567
5076	NC_007520	TGA	2	6	262906	262911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484567
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5078	NC_007520	CTGG	2	8	263105	263112	0 %	25 %	50 %	25 %	78484567
5079	NC_007520	TGA	2	6	263158	263163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484567
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5081	NC_007520	CAT	2	6	263462	263467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484567
5082	NC_007520	CGC	2	6	263489	263494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484567
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5084	NC_007520	AAG	2	6	263629	263634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484567
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5088	NC_007520	GGAA	2	8	263702	263709	50 %	0 %	50 %	0 %	78484567
5089	NC_007520	CTT	2	6	263714	263719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484567
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5094	NC_007520	CGGATA	2	12	263881	263892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78484567
5095	NC_007520	TCG	2	6	263897	263902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484567
5096	NC_007520	GCC	2	6	263907	263912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484567
5097	NC_007520	GCA	2	6	264044	264049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78484567
5098	NC_007520	CGGTC	2	10	264059	264068	0 %	20 %	40 %	40 %	78484567
5099	NC_007520	T	6	6	264094	264099	0 %	100 %	0 %	0 %	78484568
5100	NC_007520	CGC	2	6	264210	264215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78484568
5101	NC_007520	GCG	2	6	264259	264264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484568
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5103	NC_007520	CAA	2	6	264301	264306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78484568
5104	NC_007520	GT	3	6	264336	264341	0 %	50 %	50 %	0 %	78484568
5105	NC_007520	AATA	2	8	264511	264518	75 %	25 %	0 %	0 %	78484568
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5108	NC_007520	AAAT	2	8	264661	264668	75 %	25 %	0 %	0 %	78484568
5109	NC_007520	AGCC	2	8	264692	264699	25 %	0 %	25 %	50 %	78484568
5110	NC_007520	TGG	2	6	264840	264845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484568
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5112	NC_007520	TGAT	2	8	264875	264882	25 %	50 %	25 %	0 %	78484568
5113	NC_007520	GTT	2	6	264949	264954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484568
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5116	NC_007520	TGT	2	6	265017	265022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484568
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5119	NC_007520	TGT	2	6	265134	265139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484568
5120	NC_007520	GTTG	2	8	265175	265182	0 %	50 %	50 %	0 %	78484568
5121	NC_007520	AG	4	8	265227	265234	50 %	0 %	50 %	0 %	78484569
5122	NC_007520	CCA	2	6	265249	265254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78484569
5123	NC_007520	AAT	2	6	265321	265326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484569
5124	NC_007520	TTC	2	6	265341	265346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484569
5125	NC_007520	AAAT	2	8	265467	265474	75 %	25 %	0 %	0 %	78484569
5126	NC_007520	ATTG	2	8	265519	265526	25 %	50 %	25 %	0 %	78484569
5127	NC_007520	T	6	6	265578	265583	0 %	100 %	0 %	0 %	78484569
5128	NC_007520	TCG	2	6	265602	265607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78484569
5129	NC_007520	CATG	2	8	265709	265716	25 %	25 %	25 %	25 %	78484569
5130	NC_007520	TCA	2	6	265750	265755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78484569
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5133	NC_007520	GT	3	6	265861	265866	0 %	50 %	50 %	0 %	78484569
5134	NC_007520	TCT	2	6	265870	265875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78484569
5135	NC_007520	GCG	2	6	265998	266003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78484569
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5137	NC_007520	A	7	7	266115	266121	100 %	0 %	0 %	0 %	78484569
5138	NC_007520	T	7	7	266163	266169	0 %	100 %	0 %	0 %	78484569
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5144	NC_007520	GCTAT	2	10	266503	266512	20 %	40 %	20 %	20 %	78484569
5145	NC_007520	CTAAA	2	10	266646	266655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5146	NC_007520	GCCAG	2	10	266745	266754	20 %	0 %	40 %	40 %	78484570
5147	NC_007520	AAG	2	6	266805	266810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78484570
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5154	NC_007520	GACA	2	8	267106	267113	50 %	0 %	25 %	25 %	78484570
5155	NC_007520	TGGC	2	8	267125	267132	0 %	25 %	50 %	25 %	78484570
5156	NC_007520	TAA	2	6	267250	267255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78484570
5157	NC_007520	GCGA	2	8	267280	267287	25 %	0 %	50 %	25 %	78484570
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5162	NC_007520	GC	3	6	267752	267757	0 %	0 %	50 %	50 %	78484570
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5164	NC_007520	CCT	2	6	267828	267833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5165	NC_007520	T	7	7	267854	267860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_007520	ATG	2	6	267861	267866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_007520	AAACAA	2	12	267878	267889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5168	NC_007520	GTC	2	6	267890	267895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5169	NC_007520	CAA	2	6	267928	267933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5170	NC_007520	AC	3	6	267934	267939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5171	NC_007520	TA	3	6	267969	267974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_007520	TA	3	6	268027	268032	50 %	50 %	0 %	0 %	78484571
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5177	NC_007520	ATTTAT	2	12	268119	268130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78484571
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5242	NC_007520	TTTG	2	8	270665	270672	0 %	75 %	25 %	0 %	78484571
5243	NC_007520	TGG	2	6	270694	270699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78484571
5244	NC_007520	GAT	3	9	270702	270710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484571
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5247	NC_007520	A	7	7	270850	270856	100 %	0 %	0 %	0 %	78484571
5248	NC_007520	TTG	2	6	270877	270882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78484571
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5250	NC_007520	GAT	2	6	270968	270973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78484571
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5324	NC_007520	TGGA	2	8	275059	275066	25 %	25 %	50 %	0 %	78484575
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