MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006462	AGGG	2	8	129683	129690	25 %	0 %	75 %	0 %	55978325
3502	NC_006462	CCT	2	6	129738	129743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3503	NC_006462	G	6	6	129750	129755	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3504	NC_006462	TGG	2	6	129815	129820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3505	NC_006462	CCA	2	6	129857	129862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978326
3506	NC_006462	CTC	2	6	129865	129870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3507	NC_006462	G	7	7	129874	129880	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3508	NC_006462	CCG	2	6	129915	129920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978326
3509	NC_006462	GTG	2	6	129934	129939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3510	NC_006462	GGT	2	6	129960	129965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3511	NC_006462	C	6	6	129977	129982	0 %	0 %	0 %	100 %	55978326
3512	NC_006462	C	6	6	130010	130015	0 %	0 %	0 %	100 %	55978326
3513	NC_006462	CTA	2	6	130038	130043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978326
3514	NC_006462	CCT	2	6	130068	130073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3515	NC_006462	GAG	2	6	130117	130122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3516	NC_006462	G	6	6	130158	130163	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3517	NC_006462	G	6	6	130235	130240	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3518	NC_006462	CTC	2	6	130273	130278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3519	NC_006462	G	7	7	130284	130290	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3520	NC_006462	G	6	6	130298	130303	0 %	0 %	100 %	0 %	55978326
3521	NC_006462	GGT	2	6	130305	130310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3522	NC_006462	GAAG	2	8	130329	130336	50 %	0 %	50 %	0 %	55978326
3523	NC_006462	GTG	2	6	130357	130362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3524	NC_006462	GCC	2	6	130394	130399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978326
3525	NC_006462	C	7	7	130417	130423	0 %	0 %	0 %	100 %	55978326
3526	NC_006462	CCT	2	6	130479	130484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3527	NC_006462	TCC	2	6	130517	130522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3528	NC_006462	CTC	2	6	130543	130548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3529	NC_006462	CAC	2	6	130551	130556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978326
3530	NC_006462	CCG	2	6	130565	130570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978326
3531	NC_006462	CCT	2	6	130577	130582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3532	NC_006462	GAG	3	9	130597	130605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3533	NC_006462	CCT	2	6	130614	130619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3534	NC_006462	GGA	2	6	130620	130625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3535	NC_006462	ACC	2	6	130780	130785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978326
3536	NC_006462	GCCAC	2	10	130859	130868	20 %	0 %	20 %	60 %	55978326
3537	NC_006462	CTC	2	6	130873	130878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3538	NC_006462	GGGGC	2	10	130879	130888	0 %	0 %	80 %	20 %	55978326
3539	NC_006462	C	7	7	130894	130900	0 %	0 %	0 %	100 %	55978326
3540	NC_006462	GAG	2	6	130912	130917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3541	NC_006462	GCG	2	6	130918	130923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978326
3542	NC_006462	CGG	2	6	130924	130929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978326
3543	NC_006462	CTC	2	6	130987	130992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978326
3544	NC_006462	GGAG	2	8	131010	131017	25 %	0 %	75 %	0 %	55978326
3545	NC_006462	GCG	2	6	131034	131039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978326
3546	NC_006462	GCG	2	6	131073	131078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978326
3547	NC_006462	AGA	2	6	131105	131110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978326
3548	NC_006462	GGT	2	6	131130	131135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978326
3549	NC_006462	AGG	2	6	131192	131197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3550	NC_006462	GAG	2	6	131200	131205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978326
3551	NC_006462	TCCTCA	2	12	131253	131264	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55978327
3552	NC_006462	CAC	2	6	131272	131277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978327
3553	NC_006462	C	6	6	131313	131318	0 %	0 %	0 %	100 %	55978327
3554	NC_006462	GGT	2	6	131323	131328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978327
3555	NC_006462	GGC	2	6	131359	131364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978327
3556	NC_006462	CGG	2	6	131383	131388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978327
3557	NC_006462	CAC	2	6	131399	131404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978327
3558	NC_006462	CCT	2	6	131455	131460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978327
3559	NC_006462	TCG	2	6	131499	131504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978327
3560	NC_006462	CGGGG	2	10	131559	131568	0 %	0 %	80 %	20 %	55978327
3561	NC_006462	GGA	2	6	131653	131658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978327
3562	NC_006462	GGGC	2	8	131688	131695	0 %	0 %	75 %	25 %	55978327
3563	NC_006462	GTG	2	6	131810	131815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978327
3564	NC_006462	CCCTGG	2	12	131883	131894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978327
3565	NC_006462	CCT	2	6	131953	131958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978327
3566	NC_006462	TCC	4	12	132003	132014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978327
3567	NC_006462	GCC	2	6	132044	132049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978327
3568	NC_006462	GAC	2	6	132062	132067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978327
3569	NC_006462	CGC	2	6	132229	132234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978327
3570	NC_006462	GACCTG	2	12	132239	132250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55978327
3571	NC_006462	CTC	2	6	132314	132319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978327
3572	NC_006462	GGC	2	6	132324	132329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978327
3573	NC_006462	C	6	6	132431	132436	0 %	0 %	0 %	100 %	55978327
3574	NC_006462	GGA	3	9	132517	132525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978328
3575	NC_006462	CCCG	2	8	132548	132555	0 %	0 %	25 %	75 %	55978328
3576	NC_006462	TCC	2	6	132615	132620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978328
3577	NC_006462	CGC	2	6	132724	132729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978328
3578	NC_006462	GTG	2	6	132758	132763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978328
3579	NC_006462	GTG	2	6	132824	132829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978328
3580	NC_006462	G	6	6	132876	132881	0 %	0 %	100 %	0 %	55978328
3581	NC_006462	AGGGG	2	10	132886	132895	20 %	0 %	80 %	0 %	55978328
3582	NC_006462	CTC	2	6	132926	132931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978328
3583	NC_006462	CGC	2	6	132985	132990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978328
3584	NC_006462	CTC	2	6	133010	133015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978328
3585	NC_006462	GGA	2	6	133120	133125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978328
3586	NC_006462	GTG	2	6	133139	133144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978328
3587	NC_006462	GGT	2	6	133150	133155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978328
3588	NC_006462	CGG	2	6	133169	133174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978328
3589	NC_006462	CCT	2	6	133177	133182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978328
3590	NC_006462	G	6	6	133210	133215	0 %	0 %	100 %	0 %	55978328
3591	NC_006462	GAG	2	6	133229	133234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978328
3592	NC_006462	GGC	2	6	133242	133247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978328
3593	NC_006462	GAG	2	6	133262	133267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978328
3594	NC_006462	TTG	2	6	133271	133276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978328
3595	NC_006462	GGC	2	6	133351	133356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978328
3596	NC_006462	GGGGCG	2	12	133363	133374	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	55978328
3597	NC_006462	CTTT	2	8	133448	133455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_006462	CAAA	2	8	133465	133472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_006462	TTC	2	6	133491	133496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_006462	GT	3	6	133527	133532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_006462	CGGG	2	8	133559	133566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_006462	TTTTC	2	10	133612	133621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_006462	ATT	2	6	133674	133679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_006462	C	7	7	133718	133724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3605	NC_006462	GGC	2	6	133728	133733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_006462	G	6	6	133756	133761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_006462	ACG	3	9	133815	133823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_006462	ATG	2	6	133880	133885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_006462	GTA	2	6	133996	134001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978329
3610	NC_006462	CAT	2	6	134017	134022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978329
3611	NC_006462	GAG	2	6	134029	134034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
3612	NC_006462	CCA	2	6	134049	134054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978329
3613	NC_006462	CTT	2	6	134062	134067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978329
3614	NC_006462	GGT	2	6	134091	134096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978329
3615	NC_006462	CCA	2	6	134130	134135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978329
3616	NC_006462	CGC	2	6	134156	134161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978329
3617	NC_006462	AGG	2	6	134162	134167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
3618	NC_006462	T	6	6	134176	134181	0 %	100 %	0 %	0 %	55978329
3619	NC_006462	CTC	2	6	134192	134197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978329
3620	NC_006462	CTC	2	6	134215	134220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978329
3621	NC_006462	AGG	2	6	134244	134249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
3622	NC_006462	AGG	2	6	134285	134290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
3623	NC_006462	GCC	2	6	134303	134308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978329
3624	NC_006462	CCTCGG	2	12	134343	134354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978329
3625	NC_006462	GAG	2	6	134365	134370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
3626	NC_006462	GGA	2	6	134430	134435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978329
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3754	NC_006462	AGG	2	6	139721	139726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978332
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3833	NC_006462	CTC	2	6	142906	142911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978335
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3866	NC_006462	GGC	2	6	144190	144195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3867	NC_006462	CGA	2	6	144316	144321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3869	NC_006462	ACC	2	6	144422	144427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3870	NC_006462	GAC	2	6	144487	144492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3871	NC_006462	GGA	2	6	144572	144577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3872	NC_006462	CCG	2	6	144719	144724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3873	NC_006462	AGA	4	12	144794	144805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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