MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

< Previous1234567891011121314Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_006462	GAA	2	6	73661	73666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978265
2003	NC_006462	GAT	2	6	73730	73735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978265
2004	NC_006462	GGC	2	6	73764	73769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978265
2005	NC_006462	CCG	2	6	73783	73788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978265
2006	NC_006462	CCG	2	6	73816	73821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978265
2007	NC_006462	CTT	2	6	73841	73846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978265
2008	NC_006462	CTC	2	6	73905	73910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978265
2009	NC_006462	CAG	2	6	74004	74009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978265
2010	NC_006462	CCT	2	6	74062	74067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978265
2011	NC_006462	GCA	2	6	74102	74107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978265
2012	NC_006462	TGG	2	6	74128	74133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978265
2013	NC_006462	TGAGG	2	10	74206	74215	20 %	20 %	60 %	0 %	55978265
2014	NC_006462	G	6	6	74220	74225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_006462	C	6	6	74234	74239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2016	NC_006462	TTC	2	6	74243	74248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_006462	CTC	2	6	74318	74323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2018	NC_006462	TCC	2	6	74439	74444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2019	NC_006462	CAC	2	6	74491	74496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978266
2020	NC_006462	CCT	2	6	74497	74502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2021	NC_006462	TGG	2	6	74511	74516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978266
2022	NC_006462	TGG	2	6	74547	74552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978266
2023	NC_006462	CCT	2	6	74557	74562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2024	NC_006462	TCC	2	6	74577	74582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2025	NC_006462	TCC	3	9	74604	74612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
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2028	NC_006462	AGG	2	6	74667	74672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978266
2029	NC_006462	TCA	2	6	74676	74681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978266
2030	NC_006462	ACC	2	6	74682	74687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978266
2031	NC_006462	CCT	2	6	74707	74712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978266
2032	NC_006462	G	6	6	74792	74797	0 %	0 %	100 %	0 %	55978267
2033	NC_006462	TCT	2	6	74816	74821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978267
2034	NC_006462	CCT	2	6	74828	74833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978267
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2036	NC_006462	CCG	2	6	74958	74963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978267
2037	NC_006462	CAC	2	6	75075	75080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978267
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2039	NC_006462	CCT	2	6	75113	75118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978267
2040	NC_006462	CTT	2	6	75134	75139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978267
2041	NC_006462	TCC	2	6	75172	75177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978267
2042	NC_006462	CAG	2	6	75180	75185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978267
2043	NC_006462	CAC	2	6	75234	75239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978267
2044	NC_006462	CGC	2	6	75325	75330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978267
2045	NC_006462	TCCCA	2	10	75364	75373	20 %	20 %	0 %	60 %	55978267
2046	NC_006462	GCC	2	6	75559	75564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978267
2047	NC_006462	CGTC	2	8	75575	75582	0 %	25 %	25 %	50 %	55978267
2048	NC_006462	GCC	2	6	75640	75645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978267
2049	NC_006462	CTGA	2	8	75651	75658	25 %	25 %	25 %	25 %	55978267
2050	NC_006462	CGG	2	6	75662	75667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978267
2051	NC_006462	CCA	2	6	75698	75703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978267
2052	NC_006462	GGC	2	6	75704	75709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978267
2053	NC_006462	GGT	2	6	75786	75791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978267
2054	NC_006462	GTA	2	6	75807	75812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978267
2055	NC_006462	AAG	2	6	75841	75846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978267
2056	NC_006462	CCT	2	6	75948	75953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978267
2057	NC_006462	C	6	6	75968	75973	0 %	0 %	0 %	100 %	55978267
2058	NC_006462	GTG	2	6	76028	76033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978268
2059	NC_006462	ACCT	2	8	76070	76077	25 %	25 %	0 %	50 %	55978268
2060	NC_006462	CGC	2	6	76078	76083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978268
2061	NC_006462	GGC	2	6	76114	76119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978268
2062	NC_006462	CGG	2	6	76188	76193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978268
2063	NC_006462	TCC	3	9	76194	76202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978268
2064	NC_006462	ATG	2	6	76247	76252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978268
2065	NC_006462	GGGC	2	8	76263	76270	0 %	0 %	75 %	25 %	55978268
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2068	NC_006462	GCG	3	9	76349	76357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978268
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2071	NC_006462	GC	3	6	76426	76431	0 %	0 %	50 %	50 %	55978268
2072	NC_006462	TCCTCG	2	12	76482	76493	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978269
2073	NC_006462	CCTC	2	8	76536	76543	0 %	25 %	0 %	75 %	55978269
2074	NC_006462	GGC	2	6	76558	76563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978269
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2076	NC_006462	TCCT	2	8	76652	76659	0 %	50 %	0 %	50 %	55978269
2077	NC_006462	CGGAG	2	10	76738	76747	20 %	0 %	60 %	20 %	55978269
2078	NC_006462	CAT	2	6	76813	76818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978269
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2080	NC_006462	G	6	6	76886	76891	0 %	0 %	100 %	0 %	55978269
2081	NC_006462	CTT	2	6	76912	76917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978269
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2083	NC_006462	GGA	2	6	76975	76980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978269
2084	NC_006462	GGC	2	6	76981	76986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978269
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2087	NC_006462	CAC	2	6	77119	77124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978269
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2090	NC_006462	CGTCCT	2	12	77227	77238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978269
2091	NC_006462	CTT	3	9	77239	77247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978269
2092	NC_006462	CCG	2	6	77277	77282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978269
2093	NC_006462	GGA	2	6	77306	77311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2097	NC_006462	CCG	2	6	77488	77493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978270
2098	NC_006462	GAG	2	6	77498	77503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978270
2099	NC_006462	TGGCC	2	10	77553	77562	0 %	20 %	40 %	40 %	55978270
2100	NC_006462	TCC	2	6	77568	77573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978270
2101	NC_006462	TGG	2	6	77625	77630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978270
2102	NC_006462	GGA	2	6	77698	77703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978270
2103	NC_006462	CGCCTT	2	12	77731	77742	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55978270
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2106	NC_006462	CCA	2	6	77896	77901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978270
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2108	NC_006462	CTT	2	6	78040	78045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978270
2109	NC_006462	C	6	6	78094	78099	0 %	0 %	0 %	100 %	55978270
2110	NC_006462	ACT	2	6	78165	78170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978270
2111	NC_006462	CGGGGA	2	12	78192	78203	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55978270
2112	NC_006462	CGGCCA	2	12	78237	78248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978270
2113	NC_006462	ACC	2	6	78279	78284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978270
2114	NC_006462	GCC	2	6	78341	78346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978270
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2116	NC_006462	GCC	2	6	78422	78427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978270
2117	NC_006462	GAA	2	6	78440	78445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978270
2118	NC_006462	CTA	2	6	78529	78534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978270
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2120	NC_006462	CG	3	6	78598	78603	0 %	0 %	50 %	50 %	55978270
2121	NC_006462	GGGC	2	8	78631	78638	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2122	NC_006462	AAG	2	6	78650	78655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978271
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2124	NC_006462	CGG	2	6	78702	78707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978271
2125	NC_006462	GCTCC	2	10	78736	78745	0 %	20 %	20 %	60 %	55978271
2126	NC_006462	CAC	2	6	78781	78786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978271
2127	NC_006462	GGAG	2	8	78831	78838	25 %	0 %	75 %	0 %	55978271
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2129	NC_006462	CGC	2	6	78853	78858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978271
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