MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006462	CTA	2	6	19847	19852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978213
502	NC_006462	TCC	2	6	19867	19872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
503	NC_006462	ACCA	2	8	19902	19909	50 %	0 %	0 %	50 %	55978213
504	NC_006462	GCC	3	9	19959	19967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978213
505	NC_006462	G	6	6	19975	19980	0 %	0 %	100 %	0 %	55978213
506	NC_006462	TCGCCC	2	12	20008	20019	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978213
507	NC_006462	CTC	2	6	20058	20063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
508	NC_006462	CTT	2	6	20096	20101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978213
509	NC_006462	GGA	2	6	20114	20119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978213
510	NC_006462	CGGG	2	8	20124	20131	0 %	0 %	75 %	25 %	55978213
511	NC_006462	CCT	2	6	20152	20157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
512	NC_006462	GTG	2	6	20190	20195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978213
513	NC_006462	CCT	2	6	20207	20212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
514	NC_006462	GGA	2	6	20279	20284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978213
515	NC_006462	CCA	2	6	20290	20295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978213
516	NC_006462	CGC	2	6	20306	20311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978213
517	NC_006462	GGC	2	6	20321	20326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978213
518	NC_006462	CCTCC	2	10	20327	20336	0 %	20 %	0 %	80 %	55978213
519	NC_006462	CTC	2	6	20340	20345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
520	NC_006462	G	6	6	20368	20373	0 %	0 %	100 %	0 %	55978213
521	NC_006462	GGC	2	6	20385	20390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978213
522	NC_006462	CCT	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
523	NC_006462	CTC	3	9	20420	20428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
524	NC_006462	CTC	2	6	20456	20461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978213
525	NC_006462	TGG	2	6	20472	20477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978213
526	NC_006462	GGT	2	6	20512	20517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978213
527	NC_006462	CTA	2	6	20575	20580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978214
528	NC_006462	TGG	2	6	20586	20591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978214
529	NC_006462	GGGCC	2	10	20599	20608	0 %	0 %	60 %	40 %	55978214
530	NC_006462	TGG	2	6	20619	20624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978214
531	NC_006462	CTC	2	6	20639	20644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978214
532	NC_006462	GGC	2	6	20695	20700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978214
533	NC_006462	TGG	2	6	20712	20717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978214
534	NC_006462	GGT	2	6	20719	20724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978214
535	NC_006462	TCC	2	6	20739	20744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978214
536	NC_006462	ACC	2	6	20810	20815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978215
537	NC_006462	CGAGGC	2	12	20880	20891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978215
538	NC_006462	CGG	2	6	20895	20900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978215
539	NC_006462	C	7	7	20934	20940	0 %	0 %	0 %	100 %	55978215
540	NC_006462	TGGG	2	8	20971	20978	0 %	25 %	75 %	0 %	55978215
541	NC_006462	CGG	2	6	21025	21030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978215
542	NC_006462	TCC	2	6	21035	21040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
543	NC_006462	G	7	7	21105	21111	0 %	0 %	100 %	0 %	55978215
544	NC_006462	GAC	2	6	21181	21186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978215
545	NC_006462	C	6	6	21203	21208	0 %	0 %	0 %	100 %	55978215
546	NC_006462	TCT	2	6	21242	21247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978215
547	NC_006462	CAC	2	6	21255	21260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978215
548	NC_006462	CTGG	2	8	21279	21286	0 %	25 %	50 %	25 %	55978215
549	NC_006462	CGC	2	6	21309	21314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978215
550	NC_006462	C	6	6	21425	21430	0 %	0 %	0 %	100 %	55978215
551	NC_006462	CTGG	2	8	21444	21451	0 %	25 %	50 %	25 %	55978215
552	NC_006462	CTC	2	6	21466	21471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
553	NC_006462	G	6	6	21472	21477	0 %	0 %	100 %	0 %	55978215
554	NC_006462	CCT	2	6	21525	21530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
555	NC_006462	GGC	2	6	21533	21538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978215
556	NC_006462	GCCTCC	2	12	21566	21577	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978215
557	NC_006462	G	6	6	21616	21621	0 %	0 %	100 %	0 %	55978215
558	NC_006462	GCC	2	6	21634	21639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978215
559	NC_006462	TCC	2	6	21653	21658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
560	NC_006462	CGC	2	6	21738	21743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978215
561	NC_006462	CGG	2	6	21748	21753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978215
562	NC_006462	GGA	2	6	21810	21815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978215
563	NC_006462	CCT	2	6	21849	21854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
564	NC_006462	CTT	2	6	21876	21881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978215
565	NC_006462	GGC	2	6	21897	21902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978215
566	NC_006462	ACC	2	6	21950	21955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978215
567	NC_006462	TGG	2	6	21962	21967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978215
568	NC_006462	TCC	2	6	22028	22033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
569	NC_006462	TCC	2	6	22043	22048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
570	NC_006462	CCT	2	6	22074	22079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
571	NC_006462	ACG	2	6	22088	22093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978215
572	NC_006462	CCT	2	6	22119	22124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
573	NC_006462	GCC	2	6	22199	22204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978215
574	NC_006462	TCC	2	6	22224	22229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
575	NC_006462	CCGGGC	2	12	22279	22290	0 %	0 %	50 %	50 %	55978215
576	NC_006462	GGA	2	6	22308	22313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978215
577	NC_006462	GAG	2	6	22315	22320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978215
578	NC_006462	GCC	2	6	22367	22372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978215
579	NC_006462	AGG	2	6	22412	22417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978215
580	NC_006462	CCT	2	6	22425	22430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
581	NC_006462	C	6	6	22456	22461	0 %	0 %	0 %	100 %	55978215
582	NC_006462	GCGAG	2	10	22490	22499	20 %	0 %	60 %	20 %	55978215
583	NC_006462	GAA	2	6	22556	22561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006462	GCG	2	6	22572	22577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_006462	GGC	2	6	22583	22588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978216
586	NC_006462	CCT	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
587	NC_006462	TCC	3	9	22606	22614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
588	NC_006462	C	6	6	22668	22673	0 %	0 %	0 %	100 %	55978216
589	NC_006462	CGG	2	6	22715	22720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978216
590	NC_006462	GCCGAG	2	12	22737	22748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55978216
591	NC_006462	CCT	2	6	22775	22780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
592	NC_006462	GCC	2	6	22811	22816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
593	NC_006462	GAG	2	6	22830	22835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
594	NC_006462	C	6	6	22840	22845	0 %	0 %	0 %	100 %	55978216
595	NC_006462	TCC	2	6	22885	22890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978216
596	NC_006462	CGC	2	6	22896	22901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
597	NC_006462	CTCGCC	2	12	22902	22913	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978216
598	NC_006462	GAG	2	6	22920	22925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
599	NC_006462	AGGG	2	8	22944	22951	25 %	0 %	75 %	0 %	55978216
600	NC_006462	AGG	2	6	22966	22971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
601	NC_006462	GCGG	2	8	22982	22989	0 %	0 %	75 %	25 %	55978216
602	NC_006462	GGC	2	6	22999	23004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978216
603	NC_006462	CCG	2	6	23069	23074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
604	NC_006462	G	6	6	23108	23113	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
605	NC_006462	GGA	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
606	NC_006462	CTCC	2	8	23165	23172	0 %	25 %	0 %	75 %	55978216
607	NC_006462	G	6	6	23181	23186	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
608	NC_006462	CCG	2	6	23209	23214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
609	NC_006462	G	6	6	23233	23238	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
610	NC_006462	AGG	2	6	23239	23244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
611	NC_006462	TGGG	2	8	23247	23254	0 %	25 %	75 %	0 %	55978216
612	NC_006462	G	7	7	23262	23268	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
613	NC_006462	CTA	2	6	23276	23281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978216
614	NC_006462	GGC	2	6	23303	23308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978216
615	NC_006462	C	6	6	23340	23345	0 %	0 %	0 %	100 %	55978216
616	NC_006462	C	7	7	23349	23355	0 %	0 %	0 %	100 %	55978216
617	NC_006462	GAG	2	6	23403	23408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
618	NC_006462	GGA	2	6	23411	23416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
619	NC_006462	GCGG	2	8	23453	23460	0 %	0 %	75 %	25 %	55978216
620	NC_006462	C	6	6	23615	23620	0 %	0 %	0 %	100 %	55978216
621	NC_006462	GAG	2	6	23625	23630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978216
622	NC_006462	GAGG	2	8	23636	23643	25 %	0 %	75 %	0 %	55978216
623	NC_006462	GCC	2	6	23653	23658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
624	NC_006462	GGT	2	6	23672	23677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978216
625	NC_006462	CGC	2	6	23702	23707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
626	NC_006462	TGG	2	6	23742	23747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978216
627	NC_006462	G	6	6	23746	23751	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
628	NC_006462	CTGG	2	8	23792	23799	0 %	25 %	50 %	25 %	55978216
629	NC_006462	GCCC	2	8	23810	23817	0 %	0 %	25 %	75 %	55978216
630	NC_006462	CGC	2	6	23822	23827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978216
631	NC_006462	G	6	6	23830	23835	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
632	NC_006462	G	7	7	23880	23886	0 %	0 %	100 %	0 %	55978216
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759	NC_006462	CAA	2	6	28288	28293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
760	NC_006462	CCCTAC	2	12	28319	28330	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
761	NC_006462	CGGGA	2	10	28343	28352	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
762	NC_006462	CCGGG	2	10	28398	28407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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764	NC_006462	GGC	2	6	28554	28559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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892	NC_006462	GAG	2	6	33006	33011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978222
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