MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006462	GTC	2	6	208792	208797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5502	NC_006462	GCC	2	6	208822	208827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5503	NC_006462	GCG	2	6	208830	208835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5504	NC_006462	GGC	2	6	208839	208844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5505	NC_006462	TCT	2	6	208848	208853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5506	NC_006462	GGGCAG	2	12	208906	208917	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55978382
5507	NC_006462	TGG	2	6	208922	208927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5508	NC_006462	CGT	2	6	208928	208933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5509	NC_006462	CG	5	10	208958	208967	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5510	NC_006462	CGA	2	6	208992	208997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5511	NC_006462	CTC	2	6	209032	209037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5512	NC_006462	CGA	2	6	209046	209051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5513	NC_006462	CTT	2	6	209068	209073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5514	NC_006462	GCG	2	6	209074	209079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5515	NC_006462	G	6	6	209177	209182	0 %	0 %	100 %	0 %	55978382
5516	NC_006462	GCC	2	6	209201	209206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5517	NC_006462	CGT	2	6	209211	209216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5518	NC_006462	CG	3	6	209227	209232	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5519	NC_006462	TGC	2	6	209267	209272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5520	NC_006462	AGC	2	6	209273	209278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5521	NC_006462	AGG	2	6	209297	209302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5522	NC_006462	GCGCC	2	10	209304	209313	0 %	0 %	40 %	60 %	55978382
5523	NC_006462	GCG	2	6	209314	209319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5524	NC_006462	CCCG	2	8	209338	209345	0 %	0 %	25 %	75 %	55978382
5525	NC_006462	CCA	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978382
5526	NC_006462	CTC	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978382
5527	NC_006462	CG	3	6	209381	209386	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5528	NC_006462	TGC	2	6	209409	209414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5529	NC_006462	TGG	2	6	209456	209461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5530	NC_006462	CCG	2	6	209544	209549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5531	NC_006462	CTG	2	6	209572	209577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5532	NC_006462	GC	3	6	209605	209610	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5533	NC_006462	GAGGC	2	10	209680	209689	20 %	0 %	60 %	20 %	55978382
5534	NC_006462	GCC	2	6	209712	209717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5535	NC_006462	TGG	2	6	209747	209752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978382
5536	NC_006462	TTC	2	6	209755	209760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978382
5537	NC_006462	CG	3	6	209764	209769	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5538	NC_006462	GAG	2	6	209770	209775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5539	NC_006462	CGC	3	9	209780	209788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5540	NC_006462	ATC	2	6	209794	209799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978382
5541	NC_006462	CAG	2	6	209896	209901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5542	NC_006462	GGA	2	6	209916	209921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978382
5543	NC_006462	GCT	2	6	209943	209948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5544	NC_006462	GAA	2	6	209968	209973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978382
5545	NC_006462	GGC	2	6	209974	209979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5546	NC_006462	GCT	2	6	209994	209999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5547	NC_006462	GCG	2	6	210024	210029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978382
5548	NC_006462	CG	3	6	210075	210080	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5549	NC_006462	CAA	2	6	210091	210096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978382
5550	NC_006462	GAA	2	6	210097	210102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978382
5551	NC_006462	GCC	2	6	210121	210126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978382
5552	NC_006462	GC	3	6	210196	210201	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382
5553	NC_006462	CTG	2	6	210247	210252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978382
5554	NC_006462	AAGG	2	8	210285	210292	50 %	0 %	50 %	0 %	55978382
5555	NC_006462	GGC	2	6	210446	210451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_006462	GGC	2	6	210511	210516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_006462	TCC	2	6	210517	210522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_006462	CGC	2	6	210540	210545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_006462	GCC	2	6	210613	210618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_006462	G	6	6	210678	210683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_006462	GAA	2	6	210743	210748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_006462	CTTG	2	8	210846	210853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_006462	GTA	2	6	210884	210889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_006462	GCC	2	6	210898	210903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_006462	GCA	2	6	210915	210920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_006462	GCCT	2	8	210944	210951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_006462	CGC	2	6	210952	210957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_006462	G	6	6	211152	211157	0 %	0 %	100 %	0 %	55978383
5569	NC_006462	TCT	2	6	211176	211181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978383
5570	NC_006462	CCT	2	6	211188	211193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
5571	NC_006462	AAG	2	6	211261	211266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978383
5572	NC_006462	CCG	2	6	211318	211323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978383
5573	NC_006462	CAC	2	6	211435	211440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978383
5574	NC_006462	GGC	2	6	211462	211467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978383
5575	NC_006462	CCT	2	6	211473	211478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
5576	NC_006462	CTT	2	6	211494	211499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978383
5577	NC_006462	TCC	2	6	211532	211537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978383
5578	NC_006462	CAG	2	6	211540	211545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978383
5579	NC_006462	CAC	2	6	211594	211599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978383
5580	NC_006462	CGC	2	6	211685	211690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978383
5581	NC_006462	TCCCA	2	10	211724	211733	20 %	20 %	0 %	60 %	55978383
5582	NC_006462	GCC	2	6	211920	211925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978384
5583	NC_006462	CGTC	2	8	211936	211943	0 %	25 %	25 %	50 %	55978384
5584	NC_006462	GCC	2	6	212001	212006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978384
5585	NC_006462	CTGA	2	8	212012	212019	25 %	25 %	25 %	25 %	55978384
5586	NC_006462	CGG	2	6	212023	212028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978384
5587	NC_006462	CCA	2	6	212059	212064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978384
5588	NC_006462	GGC	2	6	212065	212070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978384
5589	NC_006462	GGT	2	6	212147	212152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978384
5590	NC_006462	GTA	2	6	212168	212173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978384
5591	NC_006462	AAG	2	6	212202	212207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978384
5592	NC_006462	CCT	2	6	212309	212314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978384
5593	NC_006462	C	6	6	212329	212334	0 %	0 %	0 %	100 %	55978384
5594	NC_006462	GGC	2	6	212423	212428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978385
5595	NC_006462	GAG	2	6	212543	212548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978385
5596	NC_006462	CCA	2	6	212596	212601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978385
5597	NC_006462	G	6	6	212617	212622	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5598	NC_006462	G	6	6	212624	212629	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5599	NC_006462	GGA	2	6	212635	212640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978385
5600	NC_006462	CCG	2	6	212650	212655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978385
5601	NC_006462	CGGAG	2	10	212680	212689	20 %	0 %	60 %	20 %	55978385
5602	NC_006462	G	6	6	212693	212698	0 %	0 %	100 %	0 %	55978385
5603	NC_006462	CCA	4	12	212704	212715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978385
5604	NC_006462	GGA	2	6	212743	212748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_006462	TCC	2	6	212798	212803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978386
5606	NC_006462	ACC	2	6	212843	212848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978386
5607	NC_006462	GCC	2	6	212936	212941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978386
5608	NC_006462	CCT	2	6	213090	213095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_006462	GAG	3	9	213115	213123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_006462	AGCA	2	8	213177	213184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_006462	GGCG	2	8	213244	213251	0 %	0 %	75 %	25 %	55978387
5612	NC_006462	CTC	3	9	213254	213262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978387
5613	NC_006462	CGG	2	6	213331	213336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978387
5614	NC_006462	CCTC	2	8	213351	213358	0 %	25 %	0 %	75 %	55978387
5615	NC_006462	CCA	2	6	213370	213375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978387
5616	NC_006462	GAG	2	6	213410	213415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978387
5617	NC_006462	CCT	2	6	213630	213635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978388
5618	NC_006462	GCA	2	6	213641	213646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978388
5619	NC_006462	GGC	2	6	213669	213674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978388
5620	NC_006462	GGCG	2	8	213704	213711	0 %	0 %	75 %	25 %	55978388
5621	NC_006462	C	6	6	213721	213726	0 %	0 %	0 %	100 %	55978388
5622	NC_006462	GA	3	6	213782	213787	50 %	0 %	50 %	0 %	55978388
5623	NC_006462	C	6	6	213865	213870	0 %	0 %	0 %	100 %	55978388
5624	NC_006462	C	6	6	213889	213894	0 %	0 %	0 %	100 %	55978389
5625	NC_006462	CCA	2	6	213906	213911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978389
5626	NC_006462	CCT	2	6	213966	213971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978389
5627	NC_006462	CGCCCC	2	12	213981	213992	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	55978389
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5629	NC_006462	CCT	2	6	214041	214046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978389
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5631	NC_006462	C	7	7	214110	214116	0 %	0 %	0 %	100 %	55978389
5632	NC_006462	CAC	2	6	214147	214152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978389
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5635	NC_006462	CGC	2	6	214229	214234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978389
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5643	NC_006462	GAAGG	2	10	214482	214491	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5646	NC_006462	AGG	2	6	214563	214568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5647	NC_006462	GGC	2	6	214600	214605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5649	NC_006462	CCT	2	6	214669	214674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5650	NC_006462	GAAG	2	8	214693	214700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5651	NC_006462	GA	4	8	214718	214725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5652	NC_006462	TCC	2	6	214736	214741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5653	NC_006462	GCAAG	2	10	214750	214759	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5654	NC_006462	CCGG	2	8	214945	214952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5657	NC_006462	AGG	2	6	215109	215114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5703	NC_006462	CCTC	2	8	216910	216917	0 %	25 %	0 %	75 %	55978392
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5730	NC_006462	GGA	2	6	218197	218202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5731	NC_006462	GGCGG	2	10	218203	218212	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5732	NC_006462	CCCCCA	2	12	218226	218237	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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5735	NC_006462	GGGGT	2	10	218382	218391	0 %	20 %	80 %	0 %	55978393
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5738	NC_006462	TCACGT	2	12	218636	218647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55978393
5739	NC_006462	G	6	6	218659	218664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_006462	CCAGGC	2	12	218689	218700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5741	NC_006462	CCTT	2	8	218740	218747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5742	NC_006462	CCT	2	6	218757	218762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5743	NC_006462	GTG	2	6	218808	218813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5744	NC_006462	CCGG	2	8	218826	218833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5745	NC_006462	CCG	2	6	218875	218880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228861784
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5749	NC_006462	GAG	2	6	218928	218933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228861784
5750	NC_006462	GC	3	6	218982	218987	0 %	0 %	50 %	50 %	228861784
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6000	NC_006462	GAG	2	6	229121	229126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978407

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