MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006462	GCGG	2	8	188944	188951	0 %	0 %	75 %	25 %	55978368
5002	NC_006462	CCA	2	6	188955	188960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978368
5003	NC_006462	CCCT	2	8	188999	189006	0 %	25 %	0 %	75 %	55978368
5004	NC_006462	CCT	2	6	189051	189056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
5005	NC_006462	G	6	6	189068	189073	0 %	0 %	100 %	0 %	55978368
5006	NC_006462	C	6	6	189223	189228	0 %	0 %	0 %	100 %	55978368
5007	NC_006462	GCG	2	6	189314	189319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978368
5008	NC_006462	GAG	2	6	189349	189354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978368
5009	NC_006462	CTC	2	6	189373	189378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978368
5010	NC_006462	CGGA	2	8	189480	189487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_006462	GTCC	2	8	189505	189512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_006462	CGTG	2	8	189520	189527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_006462	ACT	2	6	189531	189536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_006462	TCG	2	6	189548	189553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_006462	CCT	2	6	189558	189563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_006462	CGG	2	6	189565	189570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_006462	GT	3	6	189582	189587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_006462	GGCCC	2	10	189603	189612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5019	NC_006462	CG	3	6	189643	189648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_006462	GCG	2	6	189671	189676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_006462	CGTG	2	8	189705	189712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_006462	CGTG	2	8	189766	189773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_006462	ACT	2	6	189777	189782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_006462	ATTACT	2	12	189787	189798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_006462	CGTG	2	8	189826	189833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_006462	CGTG	2	8	189887	189894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_006462	CGTG	2	8	189948	189955	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_006462	CGG	2	6	189987	189992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_006462	CGTG	2	8	190010	190017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_006462	CGTG	2	8	190072	190079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_006462	GGA	2	6	190089	190094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_006462	GCC	2	6	190106	190111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_006462	CGTG	2	8	190133	190140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_006462	GTC	2	6	190157	190162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_006462	CGTG	2	8	190194	190201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_006462	GCT	2	6	190215	190220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_006462	CGTG	2	8	190256	190263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_006462	CCA	2	6	190286	190291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_006462	CGTG	2	8	190318	190325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_006462	TC	3	6	190343	190348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_006462	GCC	2	6	190351	190356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_006462	GGTC	2	8	190363	190370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_006462	CGTG	2	8	190379	190386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_006462	ACC	2	6	190393	190398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_006462	CCTTGG	2	12	190400	190411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_006462	CGTG	2	8	190441	190448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_006462	CGTG	2	8	190503	190510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_006462	CCT	2	6	190524	190529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_006462	CGTG	2	8	190564	190571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_006462	GAG	2	6	190599	190604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006462	CGTG	2	8	190626	190633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_006462	ACT	2	6	190637	190642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_006462	GTC	2	6	190651	190656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_006462	CCGG	2	8	190670	190677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_006462	CGTG	2	8	190688	190695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_006462	ACT	2	6	190699	190704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_006462	GGC	2	6	190722	190727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_006462	CGTG	2	8	190749	190756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_006462	GGC	2	6	190770	190775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_006462	CGTG	2	8	190810	190817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_006462	AG	3	6	190826	190831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_006462	TCG	2	6	190854	190859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_006462	CGTG	2	8	190871	190878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_006462	CGTG	2	8	190932	190939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_006462	C	6	6	190979	190984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5066	NC_006462	AGGA	2	8	191000	191007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_006462	GGGGGA	2	12	191045	191056	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_006462	GCTT	2	8	191119	191126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_006462	CCT	2	6	191164	191169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978369
5070	NC_006462	CGCC	2	8	191218	191225	0 %	0 %	25 %	75 %	55978369
5071	NC_006462	GAGC	2	8	191236	191243	25 %	0 %	50 %	25 %	55978369
5072	NC_006462	CTT	2	6	191270	191275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978369
5073	NC_006462	C	6	6	191332	191337	0 %	0 %	0 %	100 %	55978369
5074	NC_006462	GGCCCT	2	12	191356	191367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55978369
5075	NC_006462	CGC	2	6	191371	191376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978369
5076	NC_006462	CTC	2	6	191384	191389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978369
5077	NC_006462	ACC	2	6	191391	191396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978369
5078	NC_006462	TCC	2	6	191472	191477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978369
5079	NC_006462	GC	3	6	191498	191503	0 %	0 %	50 %	50 %	55978369
5080	NC_006462	TGG	2	6	191529	191534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978369
5081	NC_006462	CCT	2	6	191542	191547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978369
5082	NC_006462	GCG	2	6	191551	191556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978369
5083	NC_006462	GGC	2	6	191598	191603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978369
5084	NC_006462	ACC	2	6	191682	191687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978369
5085	NC_006462	CGCC	2	8	191725	191732	0 %	0 %	25 %	75 %	55978369
5086	NC_006462	G	6	6	191796	191801	0 %	0 %	100 %	0 %	55978369
5087	NC_006462	GGC	2	6	191854	191859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978369
5088	NC_006462	GAG	3	9	191900	191908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978369
5089	NC_006462	CGCC	2	8	191929	191936	0 %	0 %	25 %	75 %	55978369
5090	NC_006462	GCC	2	6	191942	191947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978369
5091	NC_006462	CCTGG	2	10	191977	191986	0 %	20 %	40 %	40 %	55978369
5092	NC_006462	C	6	6	192022	192027	0 %	0 %	0 %	100 %	55978369
5093	NC_006462	GGC	2	6	192036	192041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978369
5094	NC_006462	GGA	2	6	192049	192054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978369
5095	NC_006462	AGG	2	6	192090	192095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978369
5096	NC_006462	CCT	2	6	192107	192112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978369
5097	NC_006462	GC	3	6	192118	192123	0 %	0 %	50 %	50 %	55978369
5098	NC_006462	GCC	2	6	192139	192144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978370
5099	NC_006462	CTC	2	6	192184	192189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5100	NC_006462	CGG	2	6	192206	192211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978370
5101	NC_006462	TCC	2	6	192227	192232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5102	NC_006462	GAG	2	6	192286	192291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5103	NC_006462	GCC	2	6	192310	192315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978370
5104	NC_006462	GAG	2	6	192370	192375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5105	NC_006462	GGGC	2	8	192395	192402	0 %	0 %	75 %	25 %	55978370
5106	NC_006462	CTC	2	6	192469	192474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5107	NC_006462	GCGG	2	8	192495	192502	0 %	0 %	75 %	25 %	55978370
5108	NC_006462	CGC	3	9	192513	192521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978370
5109	NC_006462	CAC	2	6	192532	192537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978370
5110	NC_006462	GAG	2	6	192556	192561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5111	NC_006462	GGA	2	6	192591	192596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5112	NC_006462	GGA	2	6	192630	192635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5113	NC_006462	C	6	6	192656	192661	0 %	0 %	0 %	100 %	55978370
5114	NC_006462	C	6	6	192664	192669	0 %	0 %	0 %	100 %	55978370
5115	NC_006462	CCT	2	6	192725	192730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5116	NC_006462	CCCT	2	8	192754	192761	0 %	25 %	0 %	75 %	55978370
5117	NC_006462	G	6	6	192788	192793	0 %	0 %	100 %	0 %	55978370
5118	NC_006462	AGG	2	6	192803	192808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5119	NC_006462	GCTC	2	8	192816	192823	0 %	25 %	25 %	50 %	55978370
5120	NC_006462	AGG	2	6	192871	192876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978370
5121	NC_006462	CCT	2	6	192939	192944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5122	NC_006462	TCC	3	9	192965	192973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5123	NC_006462	TGG	2	6	192974	192979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978370
5124	NC_006462	CATGGG	2	12	192987	192998	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55978370
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5126	NC_006462	CAC	2	6	193024	193029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978370
5127	NC_006462	CTC	2	6	193030	193035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
5128	NC_006462	CCCA	2	8	193075	193082	25 %	0 %	0 %	75 %	55978370
5129	NC_006462	GCC	2	6	193145	193150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978370
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5131	NC_006462	CTC	2	6	193180	193185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978370
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5256	NC_006462	CCT	2	6	197891	197896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978373
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5263	NC_006462	GCC	2	6	198226	198231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978374
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5265	NC_006462	CGGA	2	8	198304	198311	25 %	0 %	50 %	25 %	55978374
5266	NC_006462	AG	3	6	198339	198344	50 %	0 %	50 %	0 %	55978374
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5298	NC_006462	C	6	6	199445	199450	0 %	0 %	0 %	100 %	55978376
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5324	NC_006462	AGT	2	6	201364	201369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5328	NC_006462	CTC	2	6	201535	201540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5329	NC_006462	AGT	2	6	201611	201616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5330	NC_006462	GACC	2	8	201636	201643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5331	NC_006462	GCG	2	6	201648	201653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5332	NC_006462	GCC	2	6	201719	201724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5368	NC_006462	C	6	6	203664	203669	0 %	0 %	0 %	100 %	55978379
5369	NC_006462	GCCTCC	2	12	203726	203737	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55978380
5370	NC_006462	C	6	6	203736	203741	0 %	0 %	0 %	100 %	55978380
5371	NC_006462	G	6	6	203787	203792	0 %	0 %	100 %	0 %	55978380
5372	NC_006462	CCA	2	6	203808	203813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978380
5373	NC_006462	CGGC	2	8	203876	203883	0 %	0 %	50 %	50 %	55978380
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5375	NC_006462	GGCG	2	8	203937	203944	0 %	0 %	75 %	25 %	55978380
5376	NC_006462	GGTCCT	2	12	203994	204005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978380
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5379	NC_006462	GGGGCA	2	12	204078	204089	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55978380
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5381	NC_006462	GAAGCG	2	12	204253	204264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55978380
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5395	NC_006462	GAG	2	6	204811	204816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978380
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5500	NC_006462	CG	3	6	208774	208779	0 %	0 %	50 %	50 %	55978382

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