MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	AG	3	6	18	23	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006461	GC	3	6	4155	4160	0 %	0 %	50 %	50 %	55979973
3	NC_006461	TC	3	6	9069	9074	0 %	50 %	0 %	50 %	55979979
4	NC_006461	AG	3	6	9583	9588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006461	GC	3	6	10929	10934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006461	CT	3	6	11063	11068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006461	CG	3	6	17453	17458	0 %	0 %	50 %	50 %	55979985
8	NC_006461	GA	3	6	17464	17469	50 %	0 %	50 %	0 %	55979985
9	NC_006461	GC	3	6	20825	20830	0 %	0 %	50 %	50 %	55979989
10	NC_006461	GC	3	6	22059	22064	0 %	0 %	50 %	50 %	55979991
11	NC_006461	GC	3	6	23232	23237	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
12	NC_006461	GC	3	6	23698	23703	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
13	NC_006461	GC	3	6	25590	25595	0 %	0 %	50 %	50 %	55979993
14	NC_006461	GC	3	6	27616	27621	0 %	0 %	50 %	50 %	55979994
15	NC_006461	TC	3	6	30497	30502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006461	GA	3	6	32550	32555	50 %	0 %	50 %	0 %	55979999
17	NC_006461	AG	3	6	33103	33108	50 %	0 %	50 %	0 %	55979999
18	NC_006461	GC	3	6	33885	33890	0 %	0 %	50 %	50 %	55980000
19	NC_006461	AG	3	6	34663	34668	50 %	0 %	50 %	0 %	55980001
20	NC_006461	AC	3	6	35365	35370	50 %	0 %	0 %	50 %	55980003
21	NC_006461	TC	3	6	36120	36125	0 %	50 %	0 %	50 %	55980003
22	NC_006461	TC	3	6	36412	36417	0 %	50 %	0 %	50 %	55980004
23	NC_006461	GC	3	6	36675	36680	0 %	0 %	50 %	50 %	55980004
24	NC_006461	CT	3	6	39679	39684	0 %	50 %	0 %	50 %	55980007
25	NC_006461	GC	3	6	46701	46706	0 %	0 %	50 %	50 %	55980015
26	NC_006461	GC	3	6	47688	47693	0 %	0 %	50 %	50 %	55980015
27	NC_006461	GA	3	6	49880	49885	50 %	0 %	50 %	0 %	55980019
28	NC_006461	GC	3	6	51584	51589	0 %	0 %	50 %	50 %	55980021
29	NC_006461	GC	3	6	55268	55273	0 %	0 %	50 %	50 %	55980025
30	NC_006461	CT	3	6	55562	55567	0 %	50 %	0 %	50 %	55980025
31	NC_006461	GA	3	6	56652	56657	50 %	0 %	50 %	0 %	55980027
32	NC_006461	GC	3	6	57694	57699	0 %	0 %	50 %	50 %	55980028
33	NC_006461	CG	3	6	60869	60874	0 %	0 %	50 %	50 %	55980032
34	NC_006461	TC	3	6	61947	61952	0 %	50 %	0 %	50 %	55980033
35	NC_006461	GC	3	6	64277	64282	0 %	0 %	50 %	50 %	55980036
36	NC_006461	GC	3	6	67479	67484	0 %	0 %	50 %	50 %	55980041
37	NC_006461	GC	3	6	68351	68356	0 %	0 %	50 %	50 %	55980041
38	NC_006461	CG	3	6	71219	71224	0 %	0 %	50 %	50 %	55980043
39	NC_006461	GC	3	6	72108	72113	0 %	0 %	50 %	50 %	55980044
40	NC_006461	CG	4	8	74150	74157	0 %	0 %	50 %	50 %	55980044
41	NC_006461	GC	3	6	74519	74524	0 %	0 %	50 %	50 %	55980044
42	NC_006461	CT	3	6	76020	76025	0 %	50 %	0 %	50 %	55980044
43	NC_006461	GA	3	6	77968	77973	50 %	0 %	50 %	0 %	55980044
44	NC_006461	GC	3	6	78083	78088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006461	CG	3	6	78458	78463	0 %	0 %	50 %	50 %	55980045
46	NC_006461	GC	3	6	80957	80962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006461	CG	3	6	80983	80988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006461	CG	3	6	82231	82236	0 %	0 %	50 %	50 %	55980051
49	NC_006461	GA	3	6	84614	84619	50 %	0 %	50 %	0 %	55980054
50	NC_006461	TC	3	6	90408	90413	0 %	50 %	0 %	50 %	55980059
51	NC_006461	CG	3	6	97556	97561	0 %	0 %	50 %	50 %	55980066
52	NC_006461	GC	4	8	97712	97719	0 %	0 %	50 %	50 %	55980067
53	NC_006461	GC	3	6	103302	103307	0 %	0 %	50 %	50 %	55980072
54	NC_006461	GC	3	6	104369	104374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006461	GC	4	8	112291	112298	0 %	0 %	50 %	50 %	55980080
56	NC_006461	GC	3	6	121605	121610	0 %	0 %	50 %	50 %	55980090
57	NC_006461	CT	3	6	124214	124219	0 %	50 %	0 %	50 %	55980092
58	NC_006461	CG	3	6	126046	126051	0 %	0 %	50 %	50 %	55980096
59	NC_006461	GC	3	6	127800	127805	0 %	0 %	50 %	50 %	55980098
60	NC_006461	GC	3	6	129993	129998	0 %	0 %	50 %	50 %	55980101
61	NC_006461	GT	3	6	131493	131498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006461	GC	3	6	132104	132109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006461	GC	3	6	132151	132156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006461	AC	3	6	132506	132511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006461	AC	3	6	132676	132681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006461	GC	3	6	133331	133336	0 %	0 %	50 %	50 %	55980104
67	NC_006461	GC	3	6	140031	140036	0 %	0 %	50 %	50 %	55980112
68	NC_006461	CT	3	6	140422	140427	0 %	50 %	0 %	50 %	55980112
69	NC_006461	GC	3	6	144337	144342	0 %	0 %	50 %	50 %	55980118
70	NC_006461	CT	3	6	144773	144778	0 %	50 %	0 %	50 %	55980119
71	NC_006461	GC	3	6	150132	150137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006461	GC	3	6	156502	156507	0 %	0 %	50 %	50 %	55980130
73	NC_006461	CG	3	6	158406	158411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006461	GC	3	6	158691	158696	0 %	0 %	50 %	50 %	55980131
75	NC_006461	GC	3	6	160323	160328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006461	GC	3	6	161299	161304	0 %	0 %	50 %	50 %	55980133
77	NC_006461	GC	3	6	161845	161850	0 %	0 %	50 %	50 %	55980134
78	NC_006461	GC	3	6	164488	164493	0 %	0 %	50 %	50 %	55980139
79	NC_006461	GC	3	6	166970	166975	0 %	0 %	50 %	50 %	55980142
80	NC_006461	GC	3	6	167849	167854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006461	CG	3	6	169274	169279	0 %	0 %	50 %	50 %	55980144
82	NC_006461	GC	3	6	181113	181118	0 %	0 %	50 %	50 %	55980154
83	NC_006461	GC	3	6	182357	182362	0 %	0 %	50 %	50 %	55980154
84	NC_006461	GC	3	6	188026	188031	0 %	0 %	50 %	50 %	55980161
85	NC_006461	GC	3	6	189562	189567	0 %	0 %	50 %	50 %	55980163
86	NC_006461	CT	3	6	189578	189583	0 %	50 %	0 %	50 %	55980163
87	NC_006461	AG	3	6	194231	194236	50 %	0 %	50 %	0 %	55980168
88	NC_006461	GA	3	6	199018	199023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006461	GC	3	6	199106	199111	0 %	0 %	50 %	50 %	55980171
90	NC_006461	GC	3	6	205968	205973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006461	CG	3	6	210184	210189	0 %	0 %	50 %	50 %	55980183
92	NC_006461	GA	3	6	212003	212008	50 %	0 %	50 %	0 %	55980185
93	NC_006461	GC	3	6	213434	213439	0 %	0 %	50 %	50 %	55980186
94	NC_006461	GC	3	6	218099	218104	0 %	0 %	50 %	50 %	55980192
95	NC_006461	GC	3	6	226500	226505	0 %	0 %	50 %	50 %	55980202
96	NC_006461	GC	3	6	227310	227315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006461	GA	3	6	229304	229309	50 %	0 %	50 %	0 %	55980204
98	NC_006461	CG	3	6	230267	230272	0 %	0 %	50 %	50 %	55980205
99	NC_006461	GC	3	6	234516	234521	0 %	0 %	50 %	50 %	55980210
100	NC_006461	CT	3	6	241171	241176	0 %	50 %	0 %	50 %	55980221
101	NC_006461	GC	3	6	241916	241921	0 %	0 %	50 %	50 %	55980221
102	NC_006461	CG	4	8	242627	242634	0 %	0 %	50 %	50 %	55980224
103	NC_006461	GC	3	6	244495	244500	0 %	0 %	50 %	50 %	55980225
104	NC_006461	GC	3	6	253707	253712	0 %	0 %	50 %	50 %	55980235
105	NC_006461	AG	3	6	254150	254155	50 %	0 %	50 %	0 %	55980235
106	NC_006461	CG	3	6	255629	255634	0 %	0 %	50 %	50 %	55980237
107	NC_006461	CT	3	6	256874	256879	0 %	50 %	0 %	50 %	55980239
108	NC_006461	CG	5	10	258211	258220	0 %	0 %	50 %	50 %	55980239
109	NC_006461	GA	3	6	260494	260499	50 %	0 %	50 %	0 %	55980242
110	NC_006461	CG	3	6	260923	260928	0 %	0 %	50 %	50 %	55980242
111	NC_006461	GA	4	8	261430	261437	50 %	0 %	50 %	0 %	55980243
112	NC_006461	GC	3	6	262593	262598	0 %	0 %	50 %	50 %	55980245
113	NC_006461	GC	3	6	262629	262634	0 %	0 %	50 %	50 %	55980245
114	NC_006461	GC	3	6	265250	265255	0 %	0 %	50 %	50 %	55980246
115	NC_006461	CT	3	6	265321	265326	0 %	50 %	0 %	50 %	55980246
116	NC_006461	AC	3	6	266166	266171	50 %	0 %	0 %	50 %	55980247
117	NC_006461	TC	3	6	268603	268608	0 %	50 %	0 %	50 %	55980248
118	NC_006461	GC	3	6	269809	269814	0 %	0 %	50 %	50 %	55980249
119	NC_006461	CT	3	6	277303	277308	0 %	50 %	0 %	50 %	55980255
120	NC_006461	GC	3	6	282660	282665	0 %	0 %	50 %	50 %	55980258
121	NC_006461	GC	3	6	283227	283232	0 %	0 %	50 %	50 %	55980259
122	NC_006461	CG	3	6	285099	285104	0 %	0 %	50 %	50 %	55980261
123	NC_006461	TC	3	6	286905	286910	0 %	50 %	0 %	50 %	55980265
124	NC_006461	GC	3	6	292350	292355	0 %	0 %	50 %	50 %	55980274
125	NC_006461	GC	3	6	292423	292428	0 %	0 %	50 %	50 %	55980274
126	NC_006461	CG	3	6	293052	293057	0 %	0 %	50 %	50 %	55980275
127	NC_006461	GC	3	6	293981	293986	0 %	0 %	50 %	50 %	55980275
128	NC_006461	CG	3	6	297044	297049	0 %	0 %	50 %	50 %	55980279
129	NC_006461	GC	3	6	304286	304291	0 %	0 %	50 %	50 %	55980283
130	NC_006461	GC	3	6	305152	305157	0 %	0 %	50 %	50 %	55980284
131	NC_006461	GC	3	6	310836	310841	0 %	0 %	50 %	50 %	55980291
132	NC_006461	GC	3	6	310995	311000	0 %	0 %	50 %	50 %	55980292
133	NC_006461	CG	3	6	314139	314144	0 %	0 %	50 %	50 %	55980295
134	NC_006461	GC	3	6	316172	316177	0 %	0 %	50 %	50 %	55980298
135	NC_006461	GC	3	6	317930	317935	0 %	0 %	50 %	50 %	55980302
136	NC_006461	GC	3	6	319723	319728	0 %	0 %	50 %	50 %	55980305
137	NC_006461	GC	3	6	320830	320835	0 %	0 %	50 %	50 %	55980307
138	NC_006461	GC	3	6	330311	330316	0 %	0 %	50 %	50 %	55980319
139	NC_006461	CG	3	6	331224	331229	0 %	0 %	50 %	50 %	55980320
140	NC_006461	GC	3	6	331867	331872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006461	AG	3	6	332872	332877	50 %	0 %	50 %	0 %	55980321
142	NC_006461	GA	3	6	333824	333829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006461	TC	4	8	338627	338634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_006461	TC	3	6	339565	339570	0 %	50 %	0 %	50 %	55980327
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