MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006461	C	6	6	129227	129232	0 %	0 %	0 %	100 %	55980100
3502	NC_006461	GGT	2	6	129264	129269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980100
3503	NC_006461	AGG	2	6	129281	129286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980100
3504	NC_006461	GGGAA	2	10	129362	129371	40 %	0 %	60 %	0 %	55980100
3505	NC_006461	AGG	2	6	129380	129385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980100
3506	NC_006461	GGACGG	2	12	129390	129401	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980100
3507	NC_006461	GAA	2	6	129508	129513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980100
3508	NC_006461	CGG	2	6	129532	129537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980101
3509	NC_006461	TCC	2	6	129550	129555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980101
3510	NC_006461	CTT	2	6	129597	129602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980101
3511	NC_006461	TCC	2	6	129607	129612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980101
3512	NC_006461	C	7	7	129645	129651	0 %	0 %	0 %	100 %	55980101
3513	NC_006461	CGG	2	6	129770	129775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980101
3514	NC_006461	CCG	2	6	129818	129823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980101
3515	NC_006461	CTC	2	6	129858	129863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980101
3516	NC_006461	TGGA	2	8	129865	129872	25 %	25 %	50 %	0 %	55980101
3517	NC_006461	GCC	2	6	129876	129881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980101
3518	NC_006461	GTT	2	6	129927	129932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980101
3519	NC_006461	GGC	2	6	129933	129938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980101
3520	NC_006461	ACC	2	6	129982	129987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980101
3521	NC_006461	GC	3	6	129993	129998	0 %	0 %	50 %	50 %	55980101
3522	NC_006461	CGGG	2	8	130096	130103	0 %	0 %	75 %	25 %	55980102
3523	NC_006461	CCATCC	2	12	130212	130223	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980102
3524	NC_006461	GTG	2	6	130238	130243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980102
3525	NC_006461	GGA	2	6	130273	130278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980102
3526	NC_006461	CCT	2	6	130288	130293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980102
3527	NC_006461	ACC	2	6	130313	130318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980102
3528	NC_006461	TCC	2	6	130404	130409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980102
3529	NC_006461	G	6	6	130432	130437	0 %	0 %	100 %	0 %	55980102
3530	NC_006461	GCC	2	6	130459	130464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980102
3531	NC_006461	GCC	2	6	130619	130624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980102
3532	NC_006461	G	6	6	130659	130664	0 %	0 %	100 %	0 %	55980102
3533	NC_006461	C	6	6	130691	130696	0 %	0 %	0 %	100 %	55980102
3534	NC_006461	CGC	2	6	130714	130719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980102
3535	NC_006461	GTG	2	6	130771	130776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980103
3536	NC_006461	CGA	2	6	130791	130796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980103
3537	NC_006461	GGC	2	6	130814	130819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980103
3538	NC_006461	CCT	2	6	130829	130834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980103
3539	NC_006461	CGC	2	6	130840	130845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980103
3540	NC_006461	CAC	2	6	130848	130853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980103
3541	NC_006461	TGG	2	6	130883	130888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980103
3542	NC_006461	CCT	3	9	130941	130949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980103
3543	NC_006461	GAG	2	6	130975	130980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980103
3544	NC_006461	GGA	2	6	131040	131045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980103
3545	NC_006461	GAG	2	6	131149	131154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980103
3546	NC_006461	AGG	2	6	131183	131188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980103
3547	NC_006461	TGC	2	6	131209	131214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_006461	AGGC	2	8	131256	131263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_006461	TTG	2	6	131301	131306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_006461	GGC	2	6	131338	131343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_006461	GCG	2	6	131395	131400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_006461	GT	3	6	131493	131498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_006461	TGG	2	6	131548	131553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_006461	CCA	2	6	131563	131568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_006461	CGA	2	6	131572	131577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_006461	GGCC	2	8	131600	131607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_006461	GCA	2	6	131646	131651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_006461	CGC	2	6	131693	131698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_006461	GGA	2	6	131701	131706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_006461	CGA	2	6	131752	131757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_006461	CAG	2	6	131802	131807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_006461	GGC	2	6	131867	131872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_006461	GTG	2	6	131951	131956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_006461	GGA	2	6	131993	131998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_006461	GC	3	6	132104	132109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_006461	GC	3	6	132151	132156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_006461	GAA	2	6	132250	132255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_006461	TGC	2	6	132331	132336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_006461	CGT	2	6	132342	132347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_006461	CCG	2	6	132397	132402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_006461	AGGA	2	8	132457	132464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_006461	GAC	2	6	132468	132473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_006461	AC	3	6	132506	132511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_006461	AC	3	6	132676	132681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_006461	CCT	2	6	132812	132817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_006461	GCCT	2	8	132837	132844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_006461	T	6	6	132884	132889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_006461	AGG	2	6	132899	132904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_006461	G	8	8	132959	132966	0 %	0 %	100 %	0 %	55980104
3580	NC_006461	TCC	2	6	132983	132988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980104
3581	NC_006461	TGG	2	6	132997	133002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980104
3582	NC_006461	GTC	2	6	133023	133028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980104
3583	NC_006461	CCG	2	6	133075	133080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980104
3584	NC_006461	GAG	2	6	133095	133100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980104
3585	NC_006461	CTA	2	6	133145	133150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980104
3586	NC_006461	CGGTGA	2	12	133177	133188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980104
3587	NC_006461	ACT	2	6	133201	133206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980104
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3589	NC_006461	GGA	2	6	133256	133261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980104
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3592	NC_006461	GC	3	6	133331	133336	0 %	0 %	50 %	50 %	55980104
3593	NC_006461	CCT	2	6	133337	133342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980104
3594	NC_006461	CCGGGC	2	12	133349	133360	0 %	0 %	50 %	50 %	55980104
3595	NC_006461	AAG	2	6	133362	133367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980104
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3598	NC_006461	CCA	2	6	133415	133420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980105
3599	NC_006461	GCCC	2	8	133425	133432	0 %	0 %	25 %	75 %	55980105
3600	NC_006461	GGC	2	6	133445	133450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980105
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3602	NC_006461	CGC	2	6	133577	133582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980105
3603	NC_006461	GCC	2	6	133585	133590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980105
3604	NC_006461	C	6	6	133617	133622	0 %	0 %	0 %	100 %	55980105
3605	NC_006461	CGGGG	2	10	133627	133636	0 %	0 %	80 %	20 %	55980105
3606	NC_006461	TTG	2	6	133696	133701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980105
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3608	NC_006461	CCCCAC	2	12	133824	133835	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	55980105
3609	NC_006461	GAG	2	6	133872	133877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980105
3610	NC_006461	GGC	2	6	133884	133889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980105
3611	NC_006461	CCCA	2	8	133908	133915	25 %	0 %	0 %	75 %	55980105
3612	NC_006461	C	6	6	133919	133924	0 %	0 %	0 %	100 %	55980105
3613	NC_006461	TGG	3	9	133960	133968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980105
3614	NC_006461	CAT	2	6	133971	133976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980105
3615	NC_006461	C	7	7	134000	134006	0 %	0 %	0 %	100 %	55980105
3616	NC_006461	C	6	6	134051	134056	0 %	0 %	0 %	100 %	55980105
3617	NC_006461	CGGT	2	8	134080	134087	0 %	25 %	50 %	25 %	55980105
3618	NC_006461	CCCCG	2	10	134100	134109	0 %	0 %	20 %	80 %	55980105
3619	NC_006461	CAC	2	6	134127	134132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980105
3620	NC_006461	GCCC	2	8	134137	134144	0 %	0 %	25 %	75 %	55980105
3621	NC_006461	CCA	2	6	134195	134200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980105
3622	NC_006461	GCG	2	6	134244	134249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980105
3623	NC_006461	CTC	2	6	134256	134261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980105
3624	NC_006461	CGC	2	6	134294	134299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_006461	C	6	6	134357	134362	0 %	0 %	0 %	100 %	55980106
3626	NC_006461	CGGG	2	8	134392	134399	0 %	0 %	75 %	25 %	55980106
3627	NC_006461	TCC	2	6	134449	134454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980106
3628	NC_006461	GGT	2	6	134472	134477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980106
3629	NC_006461	CGC	2	6	134505	134510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980106
3630	NC_006461	CCA	2	6	134570	134575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980106
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3632	NC_006461	ACC	2	6	134738	134743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980107
3633	NC_006461	CCT	2	6	134748	134753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980107
3634	NC_006461	AGGGGC	2	12	134759	134770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980107
3635	NC_006461	ACC	2	6	134807	134812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980107
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3642	NC_006461	CTC	2	6	134986	134991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980107
3643	NC_006461	GCC	2	6	135004	135009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980107
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3645	NC_006461	AGCC	2	8	135191	135198	25 %	0 %	25 %	50 %	55980107
3646	NC_006461	C	6	6	135256	135261	0 %	0 %	0 %	100 %	55980107
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3650	NC_006461	CCG	2	6	135381	135386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980107
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3652	NC_006461	CCCT	2	8	135448	135455	0 %	25 %	0 %	75 %	55980107
3653	NC_006461	CAC	2	6	135460	135465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980107
3654	NC_006461	GGGCG	2	10	135466	135475	0 %	0 %	80 %	20 %	55980107
3655	NC_006461	TCG	2	6	135482	135487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980107
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3658	NC_006461	CCCG	2	8	135561	135568	0 %	0 %	25 %	75 %	55980107
3659	NC_006461	GGC	2	6	135595	135600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980107
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3663	NC_006461	CTC	2	6	135847	135852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980107
3664	NC_006461	GGGC	2	8	135898	135905	0 %	0 %	75 %	25 %	55980107
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3686	NC_006461	CCT	2	6	136765	136770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3687	NC_006461	ATG	2	6	136844	136849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3688	NC_006461	TGC	2	6	136895	136900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980109
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3712	NC_006461	TGG	3	9	138005	138013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980109
3713	NC_006461	CGG	2	6	138162	138167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3735	NC_006461	CCGGGG	2	12	139068	139079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980111
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3742	NC_006461	GAG	2	6	139376	139381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
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3744	NC_006461	GGT	2	6	139453	139458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980111
3745	NC_006461	GAA	2	6	139567	139572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980111
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3748	NC_006461	GGGC	2	8	139740	139747	0 %	0 %	75 %	25 %	55980111
3749	NC_006461	GCC	3	9	139764	139772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980111
3750	NC_006461	GGA	2	6	139780	139785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
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3752	NC_006461	GGT	2	6	139880	139885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980112
3753	NC_006461	TCAGGG	2	12	139919	139930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980112
3754	NC_006461	TCC	2	6	139951	139956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3755	NC_006461	TGA	2	6	139967	139972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980112
3756	NC_006461	CCT	2	6	139985	139990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3757	NC_006461	GTC	2	6	140010	140015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980112
3758	NC_006461	GC	3	6	140031	140036	0 %	0 %	50 %	50 %	55980112
3759	NC_006461	CAT	2	6	140079	140084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980112
3760	NC_006461	GGC	2	6	140134	140139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980112
3761	NC_006461	GAG	3	9	140148	140156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980112
3762	NC_006461	CCCG	2	8	140188	140195	0 %	0 %	25 %	75 %	55980112
3763	NC_006461	TGG	2	6	140257	140262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980112
3764	NC_006461	CCT	2	6	140315	140320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3765	NC_006461	CCA	2	6	140330	140335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980112
3766	NC_006461	CCT	2	6	140381	140386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3767	NC_006461	CT	3	6	140422	140427	0 %	50 %	0 %	50 %	55980112
3768	NC_006461	GCC	2	6	140469	140474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3769	NC_006461	TCC	2	6	140517	140522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
3770	NC_006461	C	7	7	140542	140548	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3771	NC_006461	GGC	2	6	140566	140571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980113
3772	NC_006461	CCCTC	2	10	140604	140613	0 %	20 %	0 %	80 %	55980113
3773	NC_006461	CCG	2	6	140615	140620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980113
3774	NC_006461	C	6	6	140659	140664	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3775	NC_006461	GCCG	2	8	140686	140693	0 %	0 %	50 %	50 %	55980113
3776	NC_006461	AGG	2	6	140751	140756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
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3778	NC_006461	GGA	2	6	140770	140775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3779	NC_006461	TCC	2	6	140874	140879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
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3781	NC_006461	CCA	2	6	140926	140931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980113
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3786	NC_006461	GAG	2	6	141056	141061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
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3790	NC_006461	CGGG	2	8	141131	141138	0 %	0 %	75 %	25 %	55980113
3791	NC_006461	C	6	6	141183	141188	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3792	NC_006461	GGT	2	6	141211	141216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980113
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3800	NC_006461	TCC	2	6	141440	141445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
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3803	NC_006461	GAG	2	6	141577	141582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
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3812	NC_006461	GGGA	2	8	141824	141831	25 %	0 %	75 %	0 %	55980114
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3815	NC_006461	TCCAG	2	10	141891	141900	20 %	20 %	20 %	40 %	55980114
3816	NC_006461	AGG	2	6	141923	141928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
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3820	NC_006461	TCC	2	6	142019	142024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3821	NC_006461	CTT	2	6	142087	142092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3822	NC_006461	CCGC	2	8	142160	142167	0 %	0 %	25 %	75 %	55980115
3823	NC_006461	CCT	2	6	142193	142198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980115
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3826	NC_006461	C	6	6	142244	142249	0 %	0 %	0 %	100 %	55980115
3827	NC_006461	CGA	2	6	142286	142291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980115
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3836	NC_006461	CCTG	2	8	142624	142631	0 %	25 %	25 %	50 %	55980115
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3857	NC_006461	AGG	2	6	143521	143526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980117
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3864	NC_006461	CAC	2	6	143798	143803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980117
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3866	NC_006461	CACC	2	8	143828	143835	25 %	0 %	0 %	75 %	55980117
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3869	NC_006461	AAG	2	6	143934	143939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980117
3870	NC_006461	CCCT	2	8	143941	143948	0 %	25 %	0 %	75 %	55980117
3871	NC_006461	C	6	6	143959	143964	0 %	0 %	0 %	100 %	55980117
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3873	NC_006461	AGG	2	6	143998	144003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980117
3874	NC_006461	C	6	6	144101	144106	0 %	0 %	0 %	100 %	55980117
3875	NC_006461	GCCC	2	8	144114	144121	0 %	0 %	25 %	75 %	55980117
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3877	NC_006461	CGC	2	6	144152	144157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980117
3878	NC_006461	GC	3	6	144337	144342	0 %	0 %	50 %	50 %	55980118
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3885	NC_006461	CTC	2	6	144602	144607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3888	NC_006461	TCCCC	2	10	144666	144675	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3983	NC_006461	G	7	7	149051	149057	0 %	0 %	100 %	0 %	55980123
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3993	NC_006461	AGG	2	6	149339	149344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980124
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3999	NC_006461	C	6	6	149605	149610	0 %	0 %	0 %	100 %	55980124
4000	NC_006461	TGG	2	6	149645	149650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980124

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