MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2752	NC_006461	C	7	7	100981	100987	0 %	0 %	0 %	100 %	55980069
2753	NC_006461	CAC	2	6	100999	101004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980069
2754	NC_006461	TCC	2	6	101031	101036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980069
2755	NC_006461	GGC	2	6	101041	101046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980069
2756	NC_006461	GCCCTG	2	12	101090	101101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980069
2757	NC_006461	CGA	2	6	101155	101160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980069
2758	NC_006461	CCG	2	6	101181	101186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980069
2759	NC_006461	TGG	2	6	101214	101219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980069
2760	NC_006461	GAGG	2	8	101300	101307	25 %	0 %	75 %	0 %	55980069
2761	NC_006461	GGCCT	2	10	101345	101354	0 %	20 %	40 %	40 %	55980069
2762	NC_006461	CTT	2	6	101389	101394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980069
2763	NC_006461	CTC	2	6	101399	101404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980069
2764	NC_006461	CGC	2	6	101431	101436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980069
2765	NC_006461	GCC	3	9	101441	101449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980069
2766	NC_006461	GCCGG	2	10	101509	101518	0 %	0 %	60 %	40 %	55980069
2767	NC_006461	GGT	2	6	101524	101529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980069
2768	NC_006461	GCC	2	6	101588	101593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980069
2769	NC_006461	CAC	2	6	101611	101616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980069
2770	NC_006461	TGG	3	9	101634	101642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980069
2771	NC_006461	GGC	2	6	101644	101649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980069
2772	NC_006461	GCG	2	6	101668	101673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980069
2773	NC_006461	GGC	2	6	101692	101697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980069
2774	NC_006461	CTT	2	6	101716	101721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980069
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2777	NC_006461	GGC	2	6	101779	101784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980069
2778	NC_006461	GAG	2	6	101825	101830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980069
2779	NC_006461	GCCC	2	8	101855	101862	0 %	0 %	25 %	75 %	55980069
2780	NC_006461	GCCCT	2	10	101924	101933	0 %	20 %	20 %	60 %	55980069
2781	NC_006461	GCC	2	6	101948	101953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980069
2782	NC_006461	GAG	3	9	102000	102008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980070
2783	NC_006461	TTC	2	6	102016	102021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980070
2784	NC_006461	CTC	2	6	102027	102032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980070
2785	NC_006461	GGC	2	6	102057	102062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980070
2786	NC_006461	GCA	2	6	102134	102139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980070
2787	NC_006461	GCC	2	6	102205	102210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980070
2788	NC_006461	CGGGGT	2	12	102221	102232	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980070
2789	NC_006461	GAG	2	6	102234	102239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980070
2790	NC_006461	AGG	3	9	102256	102264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980070
2791	NC_006461	CCCTG	2	10	102329	102338	0 %	20 %	20 %	60 %	55980070
2792	NC_006461	GAG	2	6	102342	102347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980070
2793	NC_006461	CCT	2	6	102356	102361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980070
2794	NC_006461	GAG	2	6	102375	102380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980070
2795	NC_006461	CCT	2	6	102407	102412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980070
2796	NC_006461	GTA	2	6	102420	102425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980070
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2798	NC_006461	GCC	2	6	102454	102459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980070
2799	NC_006461	CCGTGG	2	12	102470	102481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980070
2800	NC_006461	GGC	2	6	102516	102521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980070
2801	NC_006461	CGC	2	6	102538	102543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980070
2802	NC_006461	T	7	7	102545	102551	0 %	100 %	0 %	0 %	55980070
2803	NC_006461	GCC	2	6	102598	102603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980071
2804	NC_006461	GAG	2	6	102626	102631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980071
2805	NC_006461	C	8	8	102638	102645	0 %	0 %	0 %	100 %	55980071
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2810	NC_006461	GCC	2	6	102865	102870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980071
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2812	NC_006461	CCAAGG	2	12	103015	103026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980071
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2814	NC_006461	CTC	2	6	103112	103117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
2815	NC_006461	CCA	2	6	103129	103134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980072
2816	NC_006461	CCT	2	6	103135	103140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
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2820	NC_006461	TCC	2	6	103290	103295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
2821	NC_006461	GC	3	6	103302	103307	0 %	0 %	50 %	50 %	55980072
2822	NC_006461	AGG	2	6	103308	103313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980072
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2825	NC_006461	CTC	2	6	103457	103462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
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2827	NC_006461	GGCCAC	2	12	103523	103534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980072
2828	NC_006461	TCC	2	6	103564	103569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
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2831	NC_006461	CCA	2	6	103627	103632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980072
2832	NC_006461	CCA	2	6	103681	103686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980072
2833	NC_006461	TCC	2	6	103698	103703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980072
2834	NC_006461	TGG	2	6	103788	103793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980072
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2836	NC_006461	GGA	2	6	103849	103854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980072
2837	NC_006461	GAG	2	6	104026	104031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980073
2838	NC_006461	G	6	6	104067	104072	0 %	0 %	100 %	0 %	55980073
2839	NC_006461	CGCC	2	8	104073	104080	0 %	0 %	25 %	75 %	55980073
2840	NC_006461	GGC	2	6	104089	104094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980073
2841	NC_006461	AGG	2	6	104108	104113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980073
2842	NC_006461	CCT	3	9	104115	104123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980073
2843	NC_006461	CAC	3	9	104134	104142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980073
2844	NC_006461	GTA	2	6	104158	104163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980073
2845	NC_006461	AGG	2	6	104213	104218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980073
2846	NC_006461	TCT	2	6	104271	104276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980073
2847	NC_006461	GC	3	6	104369	104374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2848	NC_006461	GTC	2	6	104421	104426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980074
2849	NC_006461	GCCC	2	8	104461	104468	0 %	0 %	25 %	75 %	55980074
2850	NC_006461	GGGC	2	8	104473	104480	0 %	0 %	75 %	25 %	55980074
2851	NC_006461	CCT	3	9	104505	104513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980074
2852	NC_006461	CTC	2	6	104524	104529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980074
2853	NC_006461	ACC	2	6	104615	104620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980074
2854	NC_006461	CCCCT	2	10	104627	104636	0 %	20 %	0 %	80 %	55980074
2855	NC_006461	GGA	2	6	104679	104684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980074
2856	NC_006461	GCC	2	6	104689	104694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980074
2857	NC_006461	ACGG	2	8	104719	104726	25 %	0 %	50 %	25 %	55980074
2858	NC_006461	AGGCGG	2	12	104807	104818	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980074
2859	NC_006461	CAG	2	6	105004	105009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980075
2860	NC_006461	GCCACG	2	12	105071	105082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980075
2861	NC_006461	CCGCCC	2	12	105084	105095	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	55980075
2862	NC_006461	GCC	2	6	105127	105132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980075
2863	NC_006461	CCA	2	6	105135	105140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980075
2864	NC_006461	AGGC	2	8	105146	105153	25 %	0 %	50 %	25 %	55980075
2865	NC_006461	CCGTGG	2	12	105198	105209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980075
2866	NC_006461	GCC	2	6	105223	105228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980075
2867	NC_006461	GAG	2	6	105250	105255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980075
2868	NC_006461	CTT	2	6	105328	105333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980075
2869	NC_006461	GGT	2	6	105369	105374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980075
2870	NC_006461	AGG	2	6	105477	105482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980075
2871	NC_006461	GAG	2	6	105505	105510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980075
2872	NC_006461	GCC	2	6	105578	105583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980075
2873	NC_006461	CCG	2	6	105621	105626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980075
2874	NC_006461	CCAGG	2	10	105687	105696	20 %	0 %	40 %	40 %	55980076
2875	NC_006461	GAG	3	9	105714	105722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980076
2876	NC_006461	GGAGAA	2	12	105762	105773	50 %	0 %	50 %	0 %	55980076
2877	NC_006461	CGG	2	6	105788	105793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980076
2878	NC_006461	CCG	2	6	105807	105812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980076
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2880	NC_006461	GAG	2	6	105915	105920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980076
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