MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006461	CCT	2	6	38835	38840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1002	NC_006461	G	6	6	38875	38880	0 %	0 %	100 %	0 %	55980006
1003	NC_006461	CTC	2	6	38899	38904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1004	NC_006461	CCT	2	6	38922	38927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1005	NC_006461	CCCCT	2	10	38930	38939	0 %	20 %	0 %	80 %	55980006
1006	NC_006461	CCT	4	12	38937	38948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1007	NC_006461	AGG	2	6	38973	38978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980006
1008	NC_006461	TCC	2	6	39005	39010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1009	NC_006461	GCG	2	6	39040	39045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980006
1010	NC_006461	CTC	2	6	39073	39078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1011	NC_006461	TCC	2	6	39092	39097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1012	NC_006461	GCCCTG	2	12	39133	39144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980006
1013	NC_006461	CCTGGC	2	12	39183	39194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980006
1014	NC_006461	GGGC	2	8	39303	39310	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
1015	NC_006461	CTC	3	9	39337	39345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1016	NC_006461	CTTTC	2	10	39351	39360	0 %	60 %	0 %	40 %	55980006
1017	NC_006461	CCT	2	6	39450	39455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1018	NC_006461	CTC	2	6	39484	39489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1019	NC_006461	CCT	2	6	39501	39506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1020	NC_006461	CCT	2	6	39513	39518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1021	NC_006461	G	6	6	39522	39527	0 %	0 %	100 %	0 %	55980006
1022	NC_006461	CCT	2	6	39555	39560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1023	NC_006461	CCT	2	6	39567	39572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1024	NC_006461	CCT	2	6	39576	39581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1025	NC_006461	TCC	2	6	39584	39589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1026	NC_006461	CCTTGG	2	12	39593	39604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980006
1027	NC_006461	GCGG	2	8	39617	39624	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
1028	NC_006461	CTC	2	6	39625	39630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980006
1029	NC_006461	GAGG	2	8	39636	39643	25 %	0 %	75 %	0 %	55980006
1030	NC_006461	CT	3	6	39679	39684	0 %	50 %	0 %	50 %	55980007
1031	NC_006461	TGGG	2	8	39768	39775	0 %	25 %	75 %	0 %	55980007
1032	NC_006461	CTT	2	6	39776	39781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980007
1033	NC_006461	CGC	2	6	39782	39787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980007
1034	NC_006461	TCC	2	6	39817	39822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1035	NC_006461	GCG	2	6	39839	39844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980007
1036	NC_006461	CCT	2	6	39887	39892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1037	NC_006461	TCC	2	6	39895	39900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1038	NC_006461	CCCTT	2	10	39901	39910	0 %	40 %	0 %	60 %	55980007
1039	NC_006461	GCC	2	6	39924	39929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980007
1040	NC_006461	CGT	2	6	39977	39982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980007
1041	NC_006461	CCT	2	6	39995	40000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1042	NC_006461	CGC	2	6	40049	40054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980007
1043	NC_006461	G	7	7	40064	40070	0 %	0 %	100 %	0 %	55980007
1044	NC_006461	TGG	2	6	40072	40077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980007
1045	NC_006461	TCGGCC	2	12	40081	40092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980007
1046	NC_006461	CCCT	2	8	40117	40124	0 %	25 %	0 %	75 %	55980007
1047	NC_006461	GCC	2	6	40134	40139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980007
1048	NC_006461	TCC	3	9	40144	40152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1049	NC_006461	CCGCC	2	10	40169	40178	0 %	0 %	20 %	80 %	55980007
1050	NC_006461	GAGG	2	8	40199	40206	25 %	0 %	75 %	0 %	55980007
1051	NC_006461	GGC	2	6	40208	40213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980007
1052	NC_006461	CCT	2	6	40247	40252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1053	NC_006461	C	6	6	40261	40266	0 %	0 %	0 %	100 %	55980007
1054	NC_006461	CTT	2	6	40281	40286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980007
1055	NC_006461	CTC	2	6	40290	40295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1056	NC_006461	CAC	2	6	40316	40321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980007
1057	NC_006461	CGGG	2	8	40347	40354	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
1058	NC_006461	TGC	2	6	40387	40392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980007
1059	NC_006461	CGGG	2	8	40427	40434	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
1060	NC_006461	G	6	6	40482	40487	0 %	0 %	100 %	0 %	55980007
1061	NC_006461	CTC	3	9	40512	40520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1062	NC_006461	GCC	2	6	40521	40526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980007
1063	NC_006461	CTC	2	6	40554	40559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980007
1064	NC_006461	GCGG	2	8	40571	40578	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
1065	NC_006461	GGCT	2	8	40584	40591	0 %	25 %	50 %	25 %	55980007
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1079	NC_006461	CTC	3	9	41079	41087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980008
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1081	NC_006461	AGCG	2	8	41194	41201	25 %	0 %	50 %	25 %	55980009
1082	NC_006461	CGAGG	2	10	41232	41241	20 %	0 %	60 %	20 %	55980009
1083	NC_006461	GGA	2	6	41274	41279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980009
1084	NC_006461	CGGGG	2	10	41334	41343	0 %	0 %	80 %	20 %	55980009
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1088	NC_006461	GGC	2	6	41550	41555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980009
1089	NC_006461	CAC	3	9	41571	41579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980009
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1091	NC_006461	GCG	2	6	41636	41641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980009
1092	NC_006461	CGGG	2	8	41655	41662	0 %	0 %	75 %	25 %	55980009
1093	NC_006461	CCT	2	6	41675	41680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980009
1094	NC_006461	TCA	2	6	41732	41737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980009
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1098	NC_006461	GCCC	2	8	41934	41941	0 %	0 %	25 %	75 %	55980009
1099	NC_006461	CCA	2	6	41963	41968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980009
1100	NC_006461	AGG	2	6	41969	41974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980009
1101	NC_006461	GGC	2	6	42039	42044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980009
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1103	NC_006461	GCC	2	6	42065	42070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980009
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1105	NC_006461	TCC	2	6	42272	42277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980009
1106	NC_006461	CCG	2	6	42353	42358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980009
1107	NC_006461	TCC	2	6	42389	42394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980009
1108	NC_006461	GTC	2	6	42478	42483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980009
1109	NC_006461	GAA	2	6	42495	42500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980010
1110	NC_006461	GGCCCG	2	12	42501	42512	0 %	0 %	50 %	50 %	55980010
1111	NC_006461	GGA	2	6	42515	42520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980010
1112	NC_006461	CTC	2	6	42522	42527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980010
1113	NC_006461	C	7	7	42604	42610	0 %	0 %	0 %	100 %	55980010
1114	NC_006461	C	6	6	42644	42649	0 %	0 %	0 %	100 %	55980010
1115	NC_006461	GTG	2	6	42709	42714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980010
1116	NC_006461	TCC	2	6	42766	42771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980010
1117	NC_006461	CTCC	2	8	42779	42786	0 %	25 %	0 %	75 %	55980010
1118	NC_006461	CCT	2	6	42815	42820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980010
1119	NC_006461	CAC	2	6	42852	42857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980010
1120	NC_006461	GCC	2	6	42871	42876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980010
1121	NC_006461	ACC	2	6	42877	42882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980010
1122	NC_006461	CAC	2	6	42894	42899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980010
1123	NC_006461	G	6	6	42962	42967	0 %	0 %	100 %	0 %	55980010
1124	NC_006461	AGGG	2	8	42988	42995	25 %	0 %	75 %	0 %	55980010
1125	NC_006461	CAGG	2	8	42996	43003	25 %	0 %	50 %	25 %	55980010
1126	NC_006461	GCA	2	6	43016	43021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980010
1127	NC_006461	CCT	2	6	43067	43072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_006461	GCC	2	6	43081	43086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_006461	GCC	2	6	43091	43096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_006461	ACC	2	6	43120	43125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1259	NC_006461	GGA	2	6	47905	47910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980016
1260	NC_006461	AGGA	2	8	47981	47988	50 %	0 %	50 %	0 %	55980016
1261	NC_006461	CCT	2	6	48019	48024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980016
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1263	NC_006461	TCC	2	6	48090	48095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980016
1264	NC_006461	TGG	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980016
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1280	NC_006461	ACC	2	6	48792	48797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980018
1281	NC_006461	GCC	2	6	48835	48840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980018
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1370	NC_006461	CCT	2	6	51417	51422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980021
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1380	NC_006461	AAGGG	2	10	51800	51809	40 %	0 %	60 %	0 %	55980021
1381	NC_006461	GTG	2	6	51821	51826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980021
1382	NC_006461	CCT	2	6	51883	51888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980022
1383	NC_006461	C	6	6	51924	51929	0 %	0 %	0 %	100 %	55980022
1384	NC_006461	C	7	7	51946	51952	0 %	0 %	0 %	100 %	55980022
1385	NC_006461	GGC	2	6	51967	51972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980022
1386	NC_006461	CCA	2	6	52008	52013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980022
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1388	NC_006461	GGA	2	6	52069	52074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980022
1389	NC_006461	GGA	2	6	52080	52085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980022
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1461	NC_006461	CGTGGG	2	12	54885	54896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980025
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1498	NC_006461	CCT	2	6	55851	55856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980025
1499	NC_006461	AGG	2	6	55880	55885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980025
1500	NC_006461	GAG	2	6	55918	55923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980025

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