MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006461	ACCCCA	2	12	20421	20432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979989
502	NC_006461	GTC	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979989
503	NC_006461	CTT	2	6	20476	20481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979989
504	NC_006461	GGA	2	6	20484	20489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
505	NC_006461	CCA	2	6	20505	20510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979989
506	NC_006461	CCCGG	2	10	20574	20583	0 %	0 %	40 %	60 %	55979989
507	NC_006461	AGG	2	6	20603	20608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
508	NC_006461	CGC	2	6	20657	20662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979989
509	NC_006461	C	7	7	20662	20668	0 %	0 %	0 %	100 %	55979989
510	NC_006461	CCT	2	6	20695	20700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979989
511	NC_006461	CCT	2	6	20703	20708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979989
512	NC_006461	CCCG	2	8	20711	20718	0 %	0 %	25 %	75 %	55979989
513	NC_006461	AGG	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
514	NC_006461	GAG	2	6	20743	20748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
515	NC_006461	GTC	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979989
516	NC_006461	CTC	2	6	20815	20820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979989
517	NC_006461	GC	3	6	20825	20830	0 %	0 %	50 %	50 %	55979989
518	NC_006461	GAG	3	9	20836	20844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
519	NC_006461	AGG	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979989
520	NC_006461	GGAGC	2	10	20866	20875	20 %	0 %	60 %	20 %	55979989
521	NC_006461	ACC	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979989
522	NC_006461	CTC	2	6	20941	20946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979989
523	NC_006461	GCG	2	6	21016	21021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979989
524	NC_006461	GTC	2	6	21043	21048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979989
525	NC_006461	ACC	2	6	21073	21078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_006461	ACC	2	6	21094	21099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979990
527	NC_006461	TCG	2	6	21151	21156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979990
528	NC_006461	CCG	2	6	21167	21172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979990
529	NC_006461	GGC	2	6	21177	21182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979990
530	NC_006461	CGG	2	6	21197	21202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979990
531	NC_006461	GAG	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979990
532	NC_006461	GCG	2	6	21220	21225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979990
533	NC_006461	AGG	2	6	21238	21243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979990
534	NC_006461	CGCTC	2	10	21278	21287	0 %	20 %	20 %	60 %	55979990
535	NC_006461	AGG	2	6	21292	21297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979990
536	NC_006461	GAG	2	6	21306	21311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979990
537	NC_006461	GCC	2	6	21316	21321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979990
538	NC_006461	GGC	2	6	21357	21362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979990
539	NC_006461	CTC	2	6	21363	21368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979990
540	NC_006461	AGT	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979990
541	NC_006461	CAC	2	6	21450	21455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979990
542	NC_006461	CCG	2	6	21485	21490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979990
543	NC_006461	CGC	2	6	21502	21507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979990
544	NC_006461	GAGG	2	8	21558	21565	25 %	0 %	75 %	0 %	55979990
545	NC_006461	GAG	2	6	21579	21584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979990
546	NC_006461	G	7	7	21614	21620	0 %	0 %	100 %	0 %	55979990
547	NC_006461	G	6	6	21639	21644	0 %	0 %	100 %	0 %	55979990
548	NC_006461	CCTTGG	2	12	21677	21688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979990
549	NC_006461	GGC	2	6	21725	21730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979990
550	NC_006461	CAC	4	12	21791	21802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979991
551	NC_006461	GGGA	2	8	21869	21876	25 %	0 %	75 %	0 %	55979991
552	NC_006461	ATG	2	6	21894	21899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979991
553	NC_006461	CGT	2	6	21934	21939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55979991
554	NC_006461	CCA	2	6	21958	21963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979991
555	NC_006461	CACCCG	2	12	21977	21988	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55979991
556	NC_006461	GGAC	2	8	21997	22004	25 %	0 %	50 %	25 %	55979991
557	NC_006461	C	6	6	22016	22021	0 %	0 %	0 %	100 %	55979991
558	NC_006461	GAG	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979991
559	NC_006461	GC	3	6	22059	22064	0 %	0 %	50 %	50 %	55979991
560	NC_006461	G	6	6	22101	22106	0 %	0 %	100 %	0 %	55979991
561	NC_006461	ACC	2	6	22164	22169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979991
562	NC_006461	CCT	2	6	22240	22245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979991
563	NC_006461	CCCT	2	8	22293	22300	0 %	25 %	0 %	75 %	55979991
564	NC_006461	GGC	2	6	22432	22437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979991
565	NC_006461	TGGGCT	2	12	22444	22455	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55979991
566	NC_006461	CTC	2	6	22490	22495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979991
567	NC_006461	ACGGGG	2	12	22533	22544	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55979991
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569	NC_006461	CCA	2	6	22588	22593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979991
570	NC_006461	CCG	2	6	22626	22631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979991
571	NC_006461	CCG	2	6	22693	22698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979991
572	NC_006461	CTC	2	6	22724	22729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979991
573	NC_006461	GGGC	2	8	22744	22751	0 %	0 %	75 %	25 %	55979991
574	NC_006461	GAG	2	6	22754	22759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979991
575	NC_006461	TCC	2	6	22770	22775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979991
576	NC_006461	GTT	2	6	22877	22882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55979991
577	NC_006461	ATG	2	6	22896	22901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979991
578	NC_006461	C	6	6	23021	23026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
579	NC_006461	GCCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	55979992
580	NC_006461	C	6	6	23132	23137	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
581	NC_006461	TCT	2	6	23138	23143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979992
582	NC_006461	GAGC	2	8	23152	23159	25 %	0 %	50 %	25 %	55979992
583	NC_006461	GCC	2	6	23176	23181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
584	NC_006461	TCC	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
585	NC_006461	TGG	2	6	23207	23212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
586	NC_006461	GC	3	6	23232	23237	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
587	NC_006461	CTC	2	6	23242	23247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
588	NC_006461	GGGCC	2	10	23259	23268	0 %	0 %	60 %	40 %	55979992
589	NC_006461	GAG	2	6	23305	23310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
590	NC_006461	CTC	3	9	23320	23328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
591	NC_006461	AGGGC	2	10	23339	23348	20 %	0 %	60 %	20 %	55979992
592	NC_006461	TGG	2	6	23351	23356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
593	NC_006461	GAA	2	6	23424	23429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55979992
594	NC_006461	TGG	2	6	23432	23437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
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596	NC_006461	GGA	3	9	23517	23525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
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598	NC_006461	C	6	6	23559	23564	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
599	NC_006461	GGA	2	6	23583	23588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
600	NC_006461	GGC	2	6	23637	23642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979992
601	NC_006461	CCT	2	6	23667	23672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
602	NC_006461	GC	3	6	23698	23703	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
603	NC_006461	GCC	2	6	23713	23718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
604	NC_006461	CTC	2	6	23746	23751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
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608	NC_006461	G	6	6	23815	23820	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
609	NC_006461	GGT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
610	NC_006461	ACCCC	2	10	23843	23852	20 %	0 %	0 %	80 %	55979992
611	NC_006461	CAC	2	6	23901	23906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979992
612	NC_006461	CCT	2	6	23916	23921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
613	NC_006461	G	8	8	23949	23956	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
614	NC_006461	C	6	6	24086	24091	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
615	NC_006461	TGG	2	6	24110	24115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
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617	NC_006461	GGA	3	9	24141	24149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
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619	NC_006461	CCT	2	6	24261	24266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
620	NC_006461	CGC	2	6	24279	24284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
621	NC_006461	CGA	2	6	24291	24296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979992
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625	NC_006461	GGA	2	6	24474	24479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
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628	NC_006461	CCGG	2	8	24596	24603	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
629	NC_006461	G	6	6	24640	24645	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
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631	NC_006461	CTT	2	6	24912	24917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979992
632	NC_006461	TCC	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
633	NC_006461	GGT	2	6	25005	25010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
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635	NC_006461	GGA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
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740	NC_006461	TGG	2	6	28873	28878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979996
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747	NC_006461	GCTCAA	2	12	29093	29104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55979996
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752	NC_006461	TCC	2	6	29361	29366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
753	NC_006461	C	6	6	29370	29375	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
754	NC_006461	TGG	2	6	29388	29393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
755	NC_006461	GGC	2	6	29422	29427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979997
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758	NC_006461	TCC	2	6	29457	29462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979997
759	NC_006461	CCT	2	6	29473	29478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979997
760	NC_006461	GCCC	2	8	29548	29555	0 %	0 %	25 %	75 %	55979997
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