MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006461	GCC	2	6	222412	222417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980198
6002	NC_006461	CGC	2	6	222513	222518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980198
6003	NC_006461	CGG	2	6	222533	222538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980198
6004	NC_006461	AAC	2	6	222553	222558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980198
6005	NC_006461	CCA	2	6	222585	222590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980198
6006	NC_006461	CCA	2	6	222602	222607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980198
6007	NC_006461	TGG	2	6	222647	222652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980198
6008	NC_006461	CTA	2	6	222675	222680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980198
6009	NC_006461	AGG	2	6	222689	222694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6010	NC_006461	G	6	6	222713	222718	0 %	0 %	100 %	0 %	55980198
6011	NC_006461	CTC	2	6	222765	222770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980198
6012	NC_006461	CGA	3	9	222774	222782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980198
6013	NC_006461	AGG	3	9	222800	222808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6014	NC_006461	GAA	2	6	222822	222827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980198
6015	NC_006461	GAG	2	6	222880	222885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6016	NC_006461	GAG	2	6	222889	222894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6017	NC_006461	GAG	2	6	222904	222909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6018	NC_006461	AGG	2	6	222938	222943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6019	NC_006461	GAA	2	6	222946	222951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980198
6020	NC_006461	C	6	6	222964	222969	0 %	0 %	0 %	100 %	55980198
6021	NC_006461	AGG	2	6	223022	223027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6022	NC_006461	CTC	2	6	223030	223035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980198
6023	NC_006461	AGG	2	6	223037	223042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980198
6024	NC_006461	GGGT	2	8	223052	223059	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_006461	GAG	2	6	223105	223110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980199
6026	NC_006461	GTG	2	6	223129	223134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980199
6027	NC_006461	GGA	2	6	223143	223148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980199
6028	NC_006461	C	6	6	223226	223231	0 %	0 %	0 %	100 %	55980199
6029	NC_006461	GGC	2	6	223239	223244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980199
6030	NC_006461	GCC	2	6	223270	223275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6031	NC_006461	G	6	6	223374	223379	0 %	0 %	100 %	0 %	55980199
6032	NC_006461	ACC	2	6	223439	223444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980199
6033	NC_006461	CCG	2	6	223478	223483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6034	NC_006461	GGT	2	6	223491	223496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980199
6035	NC_006461	ACG	2	6	223514	223519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980199
6036	NC_006461	CCT	2	6	223527	223532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980199
6037	NC_006461	GCC	2	6	223537	223542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6038	NC_006461	CGA	2	6	223548	223553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980199
6039	NC_006461	AGG	3	9	223601	223609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980199
6040	NC_006461	GAG	2	6	223615	223620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980199
6041	NC_006461	GGC	3	9	223716	223724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980199
6042	NC_006461	CCG	2	6	223748	223753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6043	NC_006461	TGA	2	6	223799	223804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980199
6044	NC_006461	GGT	2	6	223827	223832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980199
6045	NC_006461	GCC	2	6	223879	223884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6046	NC_006461	CCT	2	6	223899	223904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980199
6047	NC_006461	CTC	2	6	223912	223917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980199
6048	NC_006461	CCCCTA	2	12	223950	223961	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980199
6049	NC_006461	CGC	2	6	224007	224012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980199
6050	NC_006461	ACT	2	6	224027	224032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980199
6051	NC_006461	ATC	2	6	224046	224051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980200
6052	NC_006461	TGG	2	6	224056	224061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980200
6053	NC_006461	G	7	7	224075	224081	0 %	0 %	100 %	0 %	55980200
6054	NC_006461	GGAG	2	8	224117	224124	25 %	0 %	75 %	0 %	55980200
6055	NC_006461	GAG	2	6	224133	224138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980200
6056	NC_006461	ATC	2	6	224196	224201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980200
6057	NC_006461	GAG	2	6	224220	224225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980200
6058	NC_006461	GGA	2	6	224263	224268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_006461	GGA	2	6	224485	224490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_006461	GTG	2	6	224532	224537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980201
6061	NC_006461	GGA	2	6	224564	224569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6062	NC_006461	GAA	2	6	224582	224587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980201
6063	NC_006461	GAA	2	6	224663	224668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980201
6064	NC_006461	AGG	2	6	224677	224682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6065	NC_006461	GGT	2	6	224687	224692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980201
6066	NC_006461	AGG	2	6	224752	224757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6067	NC_006461	C	7	7	224758	224764	0 %	0 %	0 %	100 %	55980201
6068	NC_006461	GGA	2	6	224777	224782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6069	NC_006461	AGG	2	6	224815	224820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6070	NC_006461	AGG	2	6	224824	224829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6071	NC_006461	AGG	2	6	224902	224907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6072	NC_006461	CGC	2	6	224939	224944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980201
6073	NC_006461	GAG	2	6	224979	224984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6074	NC_006461	GGA	2	6	225020	225025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6075	NC_006461	GGA	2	6	225046	225051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6076	NC_006461	GAG	2	6	225072	225077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6077	NC_006461	CCCGCC	2	12	225104	225115	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	55980201
6078	NC_006461	CGCCC	2	10	225122	225131	0 %	0 %	20 %	80 %	55980201
6079	NC_006461	GGA	2	6	225149	225154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6080	NC_006461	CCG	2	6	225176	225181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980201
6081	NC_006461	ACCT	2	8	225318	225325	25 %	25 %	0 %	50 %	55980201
6082	NC_006461	GTG	2	6	225345	225350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980201
6083	NC_006461	GAA	2	6	225359	225364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980201
6084	NC_006461	GAG	2	6	225393	225398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6085	NC_006461	CTA	2	6	225422	225427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980201
6086	NC_006461	GTG	2	6	225474	225479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980201
6087	NC_006461	GCC	2	6	225553	225558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980201
6088	NC_006461	GGA	2	6	225566	225571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980201
6089	NC_006461	TCACCA	2	12	225589	225600	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	55980201
6090	NC_006461	CAT	2	6	225635	225640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980201
6091	NC_006461	CAT	2	6	225728	225733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980201
6092	NC_006461	CCTCTC	2	12	225737	225748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980201
6093	NC_006461	ACC	2	6	225754	225759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980201
6094	NC_006461	TGG	2	6	225763	225768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980201
6095	NC_006461	GGC	2	6	225779	225784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980201
6096	NC_006461	TCA	2	6	225802	225807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980201
6097	NC_006461	G	6	6	225897	225902	0 %	0 %	100 %	0 %	55980202
6098	NC_006461	CGC	2	6	225909	225914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6099	NC_006461	GCC	2	6	225922	225927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6100	NC_006461	GGCG	2	8	225957	225964	0 %	0 %	75 %	25 %	55980202
6101	NC_006461	G	8	8	225969	225976	0 %	0 %	100 %	0 %	55980202
6102	NC_006461	CCA	2	6	226001	226006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980202
6103	NC_006461	CTC	2	6	226012	226017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6104	NC_006461	CGC	2	6	226020	226025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6105	NC_006461	CCA	2	6	226035	226040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980202
6106	NC_006461	GAA	2	6	226092	226097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980202
6107	NC_006461	CGG	2	6	226101	226106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980202
6108	NC_006461	GGT	2	6	226119	226124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980202
6109	NC_006461	CTC	2	6	226153	226158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6110	NC_006461	CTC	2	6	226177	226182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6111	NC_006461	TGG	2	6	226199	226204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980202
6112	NC_006461	AGG	2	6	226211	226216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980202
6113	NC_006461	AGG	2	6	226343	226348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980202
6114	NC_006461	CCT	2	6	226362	226367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6115	NC_006461	CGG	2	6	226374	226379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980202
6116	NC_006461	G	7	7	226378	226384	0 %	0 %	100 %	0 %	55980202
6117	NC_006461	CCG	2	6	226413	226418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6118	NC_006461	TCC	2	6	226460	226465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6119	NC_006461	CCG	2	6	226484	226489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6120	NC_006461	CCT	2	6	226491	226496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980202
6121	NC_006461	GC	3	6	226500	226505	0 %	0 %	50 %	50 %	55980202
6122	NC_006461	AGG	2	6	226514	226519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980202
6123	NC_006461	ACCAAG	2	12	226534	226545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55980202
6124	NC_006461	GAA	3	9	226560	226568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980202
6125	NC_006461	CCG	2	6	226595	226600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
6126	NC_006461	GCG	2	6	226604	226609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980202
6127	NC_006461	GAG	2	6	226615	226620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980202
6128	NC_006461	GTG	3	9	226621	226629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980202
6129	NC_006461	TGG	2	6	226640	226645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980202
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6132	NC_006461	C	8	8	226785	226792	0 %	0 %	0 %	100 %	55980202
6133	NC_006461	CGC	2	6	226827	226832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980202
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6136	NC_006461	GAAGC	2	10	226930	226939	40 %	0 %	40 %	20 %	55980202
6137	NC_006461	GGGC	2	8	226940	226947	0 %	0 %	75 %	25 %	55980202
6138	NC_006461	AAGGTG	2	12	226951	226962	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55980202
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6141	NC_006461	GAG	2	6	227041	227046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980202
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6147	NC_006461	GCCCC	2	10	227267	227276	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6148	NC_006461	GC	3	6	227310	227315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6149	NC_006461	AAG	2	6	227331	227336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6150	NC_006461	G	6	6	227367	227372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_006461	CCA	3	9	227402	227410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_006461	GCCC	2	8	227427	227434	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6153	NC_006461	CCGC	2	8	227447	227454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6154	NC_006461	G	6	6	227506	227511	0 %	0 %	100 %	0 %	55980203
6155	NC_006461	TCT	2	6	227530	227535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980203
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6182	NC_006461	CCT	2	6	228785	228790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980204
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6192	NC_006461	GA	3	6	229304	229309	50 %	0 %	50 %	0 %	55980204
6193	NC_006461	GGCCAC	2	12	229364	229375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980204
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6233	NC_006461	AGGT	2	8	231357	231364	25 %	25 %	50 %	0 %	55980206
6234	NC_006461	CCCT	2	8	231444	231451	0 %	25 %	0 %	75 %	55980206
6235	NC_006461	GTG	2	6	231495	231500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980206
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6249	NC_006461	AGG	3	9	232011	232019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980207
6250	NC_006461	GAG	2	6	232022	232027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980207
6251	NC_006461	AGG	2	6	232032	232037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980207
6252	NC_006461	G	6	6	232180	232185	0 %	0 %	100 %	0 %	55980208
6253	NC_006461	TCC	3	9	232292	232300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980208
6254	NC_006461	CTT	2	6	232354	232359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980208
6255	NC_006461	CCCG	2	8	232394	232401	0 %	0 %	25 %	75 %	55980208
6256	NC_006461	GGC	2	6	232425	232430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980208
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6261	NC_006461	TCC	2	6	232679	232684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980208
6262	NC_006461	ATC	2	6	232760	232765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980208
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6274	NC_006461	GGGGT	2	10	233298	233307	0 %	20 %	80 %	0 %	55980209
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6279	NC_006461	TGA	2	6	233536	233541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980209
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6286	NC_006461	CGG	2	6	233803	233808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6343	NC_006461	A	8	8	236632	236639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6344	NC_006461	G	6	6	236646	236651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6345	NC_006461	C	6	6	236658	236663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6346	NC_006461	GCT	2	6	236716	236721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6347	NC_006461	CTG	2	6	236726	236731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6349	NC_006461	C	7	7	236770	236776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6350	NC_006461	GGC	2	6	236800	236805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6351	NC_006461	GCC	2	6	236811	236816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6352	NC_006461	C	6	6	236824	236829	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6353	NC_006461	TGG	3	9	236871	236879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980215
6354	NC_006461	CGGAG	2	10	236889	236898	20 %	0 %	60 %	20 %	55980215
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6358	NC_006461	GAT	2	6	237064	237069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980215
6359	NC_006461	TTGGGG	2	12	237101	237112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980215
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6362	NC_006461	TCCA	2	8	237197	237204	25 %	25 %	0 %	50 %	55980215
6363	NC_006461	TCT	2	6	237216	237221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980215
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6370	NC_006461	GCG	2	6	237364	237369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980215
6371	NC_006461	GGC	2	6	237445	237450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980215
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6373	NC_006461	AGG	2	6	237491	237496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980215
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6375	NC_006461	ATC	2	6	237582	237587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980216
6376	NC_006461	GCG	2	6	237591	237596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980216
6377	NC_006461	GGT	2	6	237608	237613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980216
6378	NC_006461	TCT	2	6	237628	237633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980216
6379	NC_006461	CCGG	2	8	237683	237690	0 %	0 %	50 %	50 %	55980216
6380	NC_006461	CGGG	2	8	237742	237749	0 %	0 %	75 %	25 %	55980216
6381	NC_006461	TGGCCG	2	12	237823	237834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980216
6382	NC_006461	ATG	2	6	237858	237863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980216
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6388	NC_006461	ACC	2	6	238015	238020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980217
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6409	NC_006461	C	6	6	238934	238939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6433	NC_006461	CTG	2	6	240283	240288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6459	NC_006461	TCC	2	6	241611	241616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980221
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6462	NC_006461	ATC	2	6	241700	241705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980221
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6464	NC_006461	C	7	7	241711	241717	0 %	0 %	0 %	100 %	55980221
6465	NC_006461	GGC	2	6	241772	241777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980221
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6483	NC_006461	GGCCCG	2	12	242318	242329	0 %	0 %	50 %	50 %	55980223
6484	NC_006461	CCT	3	9	242335	242343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980223
6485	NC_006461	CCT	2	6	242386	242391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980223
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6490	NC_006461	CTC	2	6	242515	242520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6491	NC_006461	ACC	2	6	242522	242527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6492	NC_006461	GCGTT	2	10	242542	242551	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6493	NC_006461	AGG	2	6	242587	242592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6494	NC_006461	CG	4	8	242627	242634	0 %	0 %	50 %	50 %	55980224
6495	NC_006461	CACCC	2	10	242708	242717	20 %	0 %	0 %	80 %	55980224
6496	NC_006461	GGA	2	6	242719	242724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980224
6497	NC_006461	GAA	2	6	242740	242745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980224
6498	NC_006461	ACG	2	6	242850	242855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980224
6499	NC_006461	CCT	2	6	242889	242894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980224
6500	NC_006461	GGA	2	6	242905	242910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980224

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