MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006461	AGG	2	6	168176	168181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980143
4502	NC_006461	G	6	6	168189	168194	0 %	0 %	100 %	0 %	55980143
4503	NC_006461	GGAGGT	2	12	168208	168219	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980143
4504	NC_006461	CCT	2	6	168232	168237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980143
4505	NC_006461	AGG	2	6	168252	168257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980143
4506	NC_006461	GCG	3	9	168291	168299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980143
4507	NC_006461	AGGG	2	8	168300	168307	25 %	0 %	75 %	0 %	55980143
4508	NC_006461	GTG	2	6	168344	168349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980143
4509	NC_006461	CTT	2	6	168367	168372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980143
4510	NC_006461	GGGGC	2	10	168412	168421	0 %	0 %	80 %	20 %	55980143
4511	NC_006461	CCT	2	6	168424	168429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980143
4512	NC_006461	GGCCGG	2	12	168455	168466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980143
4513	NC_006461	CCT	2	6	168523	168528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980143
4514	NC_006461	CCCCCA	2	12	168598	168609	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	55980143
4515	NC_006461	CCGCCT	2	12	168640	168651	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980143
4516	NC_006461	GGC	2	6	168664	168669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980143
4517	NC_006461	C	7	7	168724	168730	0 %	0 %	0 %	100 %	55980143
4518	NC_006461	CCTGCC	2	12	168772	168783	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980143
4519	NC_006461	GCCGGG	2	12	168789	168800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980143
4520	NC_006461	GTG	3	9	168812	168820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980143
4521	NC_006461	AAG	2	6	168836	168841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980143
4522	NC_006461	CTC	2	6	168863	168868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980143
4523	NC_006461	GAG	2	6	168881	168886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980143
4524	NC_006461	GAG	2	6	168893	168898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980143
4525	NC_006461	TTC	2	6	168935	168940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980143
4526	NC_006461	AAG	2	6	169052	169057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_006461	GGGTC	2	10	169073	169082	0 %	20 %	60 %	20 %	55980144
4528	NC_006461	GCCGG	2	10	169220	169229	0 %	0 %	60 %	40 %	55980144
4529	NC_006461	GGT	2	6	169262	169267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980144
4530	NC_006461	CG	3	6	169274	169279	0 %	0 %	50 %	50 %	55980144
4531	NC_006461	C	6	6	169415	169420	0 %	0 %	0 %	100 %	55980145
4532	NC_006461	TCC	2	6	169421	169426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980145
4533	NC_006461	GGA	2	6	169488	169493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980145
4534	NC_006461	GCGCC	2	10	169533	169542	0 %	0 %	40 %	60 %	55980145
4535	NC_006461	TCC	2	6	169544	169549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980145
4536	NC_006461	CGGAGG	2	12	169601	169612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980145
4537	NC_006461	CCT	3	9	169626	169634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980145
4538	NC_006461	ACC	2	6	169646	169651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980145
4539	NC_006461	CGG	2	6	169691	169696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980145
4540	NC_006461	GCC	2	6	169712	169717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980145
4541	NC_006461	CAAGGC	2	12	169746	169757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980145
4542	NC_006461	CTT	2	6	169758	169763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980145
4543	NC_006461	G	6	6	169795	169800	0 %	0 %	100 %	0 %	55980145
4544	NC_006461	ACC	2	6	169835	169840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_006461	CTT	2	6	169887	169892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_006461	CGCCC	2	10	169919	169928	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4547	NC_006461	CGGG	2	8	169938	169945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_006461	TTC	2	6	169975	169980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980146
4549	NC_006461	TCC	2	6	170011	170016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980146
4550	NC_006461	CTC	2	6	170073	170078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980146
4551	NC_006461	C	7	7	170099	170105	0 %	0 %	0 %	100 %	55980146
4552	NC_006461	C	6	6	170213	170218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4553	NC_006461	CCT	2	6	170300	170305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980147
4554	NC_006461	GAA	2	6	170337	170342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980147
4555	NC_006461	G	6	6	170345	170350	0 %	0 %	100 %	0 %	55980147
4556	NC_006461	CCG	2	6	170363	170368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980147
4557	NC_006461	CCT	2	6	170390	170395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980147
4558	NC_006461	GGA	2	6	170402	170407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4559	NC_006461	GAG	2	6	170424	170429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4560	NC_006461	GGCC	2	8	170437	170444	0 %	0 %	50 %	50 %	55980147
4561	NC_006461	AGG	2	6	170455	170460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4562	NC_006461	GGGC	2	8	170509	170516	0 %	0 %	75 %	25 %	55980147
4563	NC_006461	GCC	2	6	170527	170532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980147
4564	NC_006461	CGG	2	6	170549	170554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980147
4565	NC_006461	CCAGGG	2	12	170594	170605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980147
4566	NC_006461	AGG	2	6	170620	170625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4567	NC_006461	AGG	2	6	170641	170646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4568	NC_006461	CCCAG	2	10	170666	170675	20 %	0 %	20 %	60 %	55980147
4569	NC_006461	GCC	2	6	170685	170690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980147
4570	NC_006461	GAG	3	9	170691	170699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4571	NC_006461	GAG	3	9	170715	170723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980147
4572	NC_006461	TCC	3	9	170807	170815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980148
4573	NC_006461	GTCCAC	2	12	170818	170829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980148
4574	NC_006461	GGC	2	6	170916	170921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980148
4575	NC_006461	AGG	2	6	170924	170929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980148
4576	NC_006461	CCCAC	2	10	170946	170955	20 %	0 %	0 %	80 %	55980148
4577	NC_006461	GGGCCA	2	12	170961	170972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980148
4578	NC_006461	CCA	2	6	170991	170996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980148
4579	NC_006461	CCG	2	6	170998	171003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980148
4580	NC_006461	GCC	2	6	171055	171060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980148
4581	NC_006461	GGCG	2	8	171081	171088	0 %	0 %	75 %	25 %	55980148
4582	NC_006461	CCT	2	6	171126	171131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980148
4583	NC_006461	GCC	2	6	171155	171160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980148
4584	NC_006461	CCT	2	6	171192	171197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980148
4585	NC_006461	AGG	2	6	171275	171280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980148
4586	NC_006461	GGGC	2	8	171303	171310	0 %	0 %	75 %	25 %	55980148
4587	NC_006461	CCA	2	6	171387	171392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980148
4588	NC_006461	GCCG	2	8	171396	171403	0 %	0 %	50 %	50 %	55980148
4589	NC_006461	CCCCA	2	10	171427	171436	20 %	0 %	0 %	80 %	55980148
4590	NC_006461	CCT	2	6	171453	171458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980148
4591	NC_006461	CCT	2	6	171517	171522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4592	NC_006461	GCC	2	6	171539	171544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4593	NC_006461	GGA	3	9	171547	171555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4594	NC_006461	AGG	2	6	171570	171575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4595	NC_006461	CCT	2	6	171613	171618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4596	NC_006461	CCTC	2	8	171631	171638	0 %	25 %	0 %	75 %	55980149
4597	NC_006461	GAG	2	6	171644	171649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4598	NC_006461	AGG	2	6	171711	171716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4599	NC_006461	C	6	6	171733	171738	0 %	0 %	0 %	100 %	55980149
4600	NC_006461	GTC	2	6	171740	171745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
4601	NC_006461	AGG	2	6	171747	171752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4602	NC_006461	CCTCCA	2	12	171757	171768	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980149
4603	NC_006461	CTC	2	6	171797	171802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4604	NC_006461	C	6	6	171837	171842	0 %	0 %	0 %	100 %	55980149
4605	NC_006461	TCC	2	6	171843	171848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4606	NC_006461	TCC	2	6	171882	171887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4607	NC_006461	TCG	2	6	171951	171956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
4608	NC_006461	CAT	2	6	171974	171979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980149
4609	NC_006461	CGC	2	6	171982	171987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4610	NC_006461	CAC	2	6	172004	172009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980149
4611	NC_006461	CTC	2	6	172010	172015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4612	NC_006461	AGG	2	6	172029	172034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4613	NC_006461	GGC	2	6	172047	172052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
4614	NC_006461	CTC	2	6	172076	172081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4615	NC_006461	CCT	2	6	172156	172161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4616	NC_006461	G	6	6	172192	172197	0 %	0 %	100 %	0 %	55980149
4617	NC_006461	GGC	2	6	172212	172217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980149
4618	NC_006461	TCC	2	6	172218	172223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4619	NC_006461	CAT	2	6	172241	172246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980149
4620	NC_006461	GCC	2	6	172275	172280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4621	NC_006461	GAG	2	6	172286	172291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4622	NC_006461	GAG	2	6	172307	172312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4623	NC_006461	TGA	2	6	172351	172356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980149
4624	NC_006461	TTG	2	6	172374	172379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980149
4625	NC_006461	GCC	2	6	172430	172435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4626	NC_006461	CCGCTC	2	12	172436	172447	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980149
4627	NC_006461	CCG	3	9	172462	172470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4628	NC_006461	TTC	2	6	172482	172487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980149
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4654	NC_006461	C	6	6	173500	173505	0 %	0 %	0 %	100 %	55980149
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4658	NC_006461	CTC	3	9	173570	173578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980149
4659	NC_006461	GGA	2	6	173579	173584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
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4700	NC_006461	C	6	6	175720	175725	0 %	0 %	0 %	100 %	55980149
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4703	NC_006461	GCC	2	6	175909	175914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
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4718	NC_006461	G	6	6	176595	176600	0 %	0 %	100 %	0 %	55980149
4719	NC_006461	TCCCCG	2	12	176664	176675	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980149
4720	NC_006461	G	7	7	176677	176683	0 %	0 %	100 %	0 %	55980149
4721	NC_006461	TCCGG	2	10	176731	176740	0 %	20 %	40 %	40 %	55980149
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4731	NC_006461	CGT	2	6	177070	177075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
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4735	NC_006461	GGA	2	6	177241	177246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4736	NC_006461	GAG	2	6	177410	177415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4737	NC_006461	GGTGA	2	10	177416	177425	20 %	20 %	60 %	0 %	55980149
4738	NC_006461	CCG	2	6	177475	177480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4739	NC_006461	CTT	2	6	177530	177535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980149
4740	NC_006461	GGTC	2	8	177568	177575	0 %	25 %	50 %	25 %	55980149
4741	NC_006461	GTC	2	6	177600	177605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
4742	NC_006461	GAG	2	6	177620	177625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4743	NC_006461	CGC	2	6	177638	177643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4744	NC_006461	AGG	2	6	177651	177656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4745	NC_006461	TGG	2	6	177672	177677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980149
4746	NC_006461	GGGA	2	8	177727	177734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4747	NC_006461	GGC	2	6	177739	177744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4748	NC_006461	ATG	2	6	177761	177766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980150
4749	NC_006461	GGA	2	6	177832	177837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980150
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4752	NC_006461	CGCC	2	8	177904	177911	0 %	0 %	25 %	75 %	55980150
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4871	NC_006461	GCG	2	6	182238	182243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
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4873	NC_006461	TCCCCG	2	12	182280	182291	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980154
4874	NC_006461	GC	3	6	182357	182362	0 %	0 %	50 %	50 %	55980154
4875	NC_006461	C	6	6	182463	182468	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
4876	NC_006461	G	6	6	182475	182480	0 %	0 %	100 %	0 %	55980154
4877	NC_006461	CGG	2	6	182490	182495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4878	NC_006461	TCC	3	9	182508	182516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
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4881	NC_006461	GAA	2	6	182615	182620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980154
4882	NC_006461	C	6	6	182675	182680	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
4883	NC_006461	CTT	2	6	182693	182698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980154
4884	NC_006461	CAT	2	6	182714	182719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980154
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4886	NC_006461	GCG	2	6	182750	182755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4887	NC_006461	CTCCAG	2	12	182756	182767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980154
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4890	NC_006461	CCT	2	6	183028	183033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4891	NC_006461	ACTAC	2	10	183039	183048	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4893	NC_006461	CGC	2	6	183103	183108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4894	NC_006461	CGC	2	6	183141	183146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980155
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4902	NC_006461	AGG	2	6	183385	183390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980155
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4961	NC_006461	CCA	3	9	185287	185295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980157
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4972	NC_006461	CAC	2	6	185635	185640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980158
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4984	NC_006461	CTC	2	6	186026	186031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4985	NC_006461	GCG	2	6	186092	186097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4986	NC_006461	GAA	2	6	186176	186181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_006461	GGACCC	2	12	186259	186270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980159
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4995	NC_006461	GCC	2	6	186475	186480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980159
4996	NC_006461	CCT	2	6	186481	186486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980159
4997	NC_006461	CGT	2	6	186587	186592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980160
4998	NC_006461	TCA	2	6	186617	186622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980160
4999	NC_006461	GGC	2	6	186636	186641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980160
5000	NC_006461	TCC	2	6	186670	186675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980160

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