MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005838	TGGA	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005838	CCCT	2	8	252	259	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_005838	CCTA	2	8	296	303	25 %	25 %	0 %	50 %	46255072
4	NC_005838	CCCG	2	8	402	409	0 %	0 %	25 %	75 %	46255072
5	NC_005838	CCCA	2	8	629	636	25 %	0 %	0 %	75 %	46255072
6	NC_005838	AGCC	2	8	1100	1107	25 %	0 %	25 %	50 %	46255072
7	NC_005838	GGTG	2	8	1485	1492	0 %	25 %	75 %	0 %	46255072
8	NC_005838	GCCC	2	8	1879	1886	0 %	0 %	25 %	75 %	46255073
9	NC_005838	GCGG	2	8	2004	2011	0 %	0 %	75 %	25 %	46255073
10	NC_005838	GAGG	2	8	2679	2686	25 %	0 %	75 %	0 %	46255074
11	NC_005838	AGGA	2	8	2785	2792	50 %	0 %	50 %	0 %	46255075
12	NC_005838	GGCG	2	8	3849	3856	0 %	0 %	75 %	25 %	46255076
13	NC_005838	GGGA	2	8	3934	3941	25 %	0 %	75 %	0 %	46255076
14	NC_005838	GGGA	2	8	4552	4559	25 %	0 %	75 %	0 %	46255077
15	NC_005838	GGAC	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	46255077
16	NC_005838	CTTC	2	8	4632	4639	0 %	50 %	0 %	50 %	46255077
17	NC_005838	GCGG	2	8	4919	4926	0 %	0 %	75 %	25 %	46255077
18	NC_005838	AAGG	2	8	5293	5300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005838	CGGG	2	8	5486	5493	0 %	0 %	75 %	25 %	46255078
20	NC_005838	AAGG	2	8	6148	6155	50 %	0 %	50 %	0 %	46255079
21	NC_005838	GCGA	2	8	6245	6252	25 %	0 %	50 %	25 %	46255079
22	NC_005838	AGCG	2	8	6602	6609	25 %	0 %	50 %	25 %	46255079
23	NC_005838	CTCC	2	8	6802	6809	0 %	25 %	0 %	75 %	46255079
24	NC_005838	CCGC	2	8	6876	6883	0 %	0 %	25 %	75 %	46255079
25	NC_005838	GGGC	2	8	7113	7120	0 %	0 %	75 %	25 %	46255080
26	NC_005838	GCCC	2	8	7556	7563	0 %	0 %	25 %	75 %	46255080
27	NC_005838	AGGG	2	8	7746	7753	25 %	0 %	75 %	0 %	46255080
28	NC_005838	CTCC	2	8	8117	8124	0 %	25 %	0 %	75 %	46255081
29	NC_005838	CGCC	2	8	8624	8631	0 %	0 %	25 %	75 %	46255081
30	NC_005838	GGAG	2	8	9075	9082	25 %	0 %	75 %	0 %	46255082
31	NC_005838	GCGG	2	8	9565	9572	0 %	0 %	75 %	25 %	46255082
32	NC_005838	GGGC	2	8	9995	10002	0 %	0 %	75 %	25 %	46255083
33	NC_005838	CCCG	2	8	10273	10280	0 %	0 %	25 %	75 %	46255083
34	NC_005838	GGAC	2	8	11650	11657	25 %	0 %	50 %	25 %	46255085
35	NC_005838	CGCC	2	8	12592	12599	0 %	0 %	25 %	75 %	46255086
36	NC_005838	CACC	2	8	12607	12614	25 %	0 %	0 %	75 %	46255086
37	NC_005838	CACC	2	8	13144	13151	25 %	0 %	0 %	75 %	46255086
38	NC_005838	GAAG	2	8	13471	13478	50 %	0 %	50 %	0 %	46255087
39	NC_005838	GAGG	2	8	13588	13595	25 %	0 %	75 %	0 %	46255087
40	NC_005838	CGGG	2	8	14052	14059	0 %	0 %	75 %	25 %	46255088
41	NC_005838	GGCG	2	8	14084	14091	0 %	0 %	75 %	25 %	46255088
42	NC_005838	CACC	2	8	14163	14170	25 %	0 %	0 %	75 %	46255088
43	NC_005838	AAAG	2	8	14663	14670	75 %	0 %	25 %	0 %	46255089
44	NC_005838	GCGG	2	8	15040	15047	0 %	0 %	75 %	25 %	46255089
45	NC_005838	GTGG	2	8	15306	15313	0 %	25 %	75 %	0 %	46255090
46	NC_005838	GAGG	2	8	16345	16352	25 %	0 %	75 %	0 %	46255091
47	NC_005838	CGAG	2	8	16914	16921	25 %	0 %	50 %	25 %	46255093
48	NC_005838	ACCT	2	8	16946	16953	25 %	25 %	0 %	50 %	46255093
49	NC_005838	CTGG	2	8	17395	17402	0 %	25 %	50 %	25 %	46255093
50	NC_005838	GGAA	2	8	18201	18208	50 %	0 %	50 %	0 %	46255094
51	NC_005838	GGAA	2	8	19087	19094	50 %	0 %	50 %	0 %	46255094
52	NC_005838	CGCC	2	8	19714	19721	0 %	0 %	25 %	75 %	46255094
53	NC_005838	GTCG	2	8	20139	20146	0 %	25 %	50 %	25 %	46255095
54	NC_005838	AAGG	2	8	21308	21315	50 %	0 %	50 %	0 %	46255095
55	NC_005838	CACC	2	8	22052	22059	25 %	0 %	0 %	75 %	46255096
56	NC_005838	CCCG	2	8	22413	22420	0 %	0 %	25 %	75 %	46255096
57	NC_005838	GCGG	2	8	22463	22470	0 %	0 %	75 %	25 %	46255096
58	NC_005838	TCCG	2	8	22747	22754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005838	GCCC	2	8	22825	22832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_005838	GAAG	2	8	23439	23446	50 %	0 %	50 %	0 %	46255097
61	NC_005838	GGGA	2	8	23896	23903	25 %	0 %	75 %	0 %	46255097
62	NC_005838	GCCG	2	8	24157	24164	0 %	0 %	50 %	50 %	46255097
63	NC_005838	CTCC	2	8	24641	24648	0 %	25 %	0 %	75 %	46255097
64	NC_005838	AGGG	2	8	25093	25100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005838	GGAG	2	8	25134	25141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005838	GGGC	2	8	25716	25723	0 %	0 %	75 %	25 %	46255099
67	NC_005838	GTCC	2	8	25798	25805	0 %	25 %	25 %	50 %	46255099
68	NC_005838	CCGT	2	8	26633	26640	0 %	25 %	25 %	50 %	46255100
69	NC_005838	CGGA	2	8	27636	27643	25 %	0 %	50 %	25 %	46255101
70	NC_005838	CCCG	2	8	28243	28250	0 %	0 %	25 %	75 %	46255102
71	NC_005838	TGCG	2	8	28511	28518	0 %	25 %	50 %	25 %	46255102
72	NC_005838	CGGG	2	8	28522	28529	0 %	0 %	75 %	25 %	46255102
73	NC_005838	CCCT	2	8	31019	31026	0 %	25 %	0 %	75 %	46255105
74	NC_005838	GGCG	2	8	31202	31209	0 %	0 %	75 %	25 %	46255106
75	NC_005838	CAGG	2	8	31576	31583	25 %	0 %	50 %	25 %	46255106
76	NC_005838	CTTC	2	8	32602	32609	0 %	50 %	0 %	50 %	46255107
77	NC_005838	GGCG	2	8	32916	32923	0 %	0 %	75 %	25 %	46255107
78	NC_005838	GCCC	2	8	33412	33419	0 %	0 %	25 %	75 %	46255108
79	NC_005838	GCGG	2	8	34209	34216	0 %	0 %	75 %	25 %	46255109
80	NC_005838	TGGG	2	8	35419	35426	0 %	25 %	75 %	0 %	46255110
81	NC_005838	GGCC	2	8	35658	35665	0 %	0 %	50 %	50 %	46255110
82	NC_005838	GCGG	2	8	35788	35795	0 %	0 %	75 %	25 %	46255110
83	NC_005838	GGCG	3	12	35811	35822	0 %	0 %	75 %	25 %	46255110
84	NC_005838	ACCT	2	8	37062	37069	25 %	25 %	0 %	50 %	46255111
85	NC_005838	GGGC	2	8	37255	37262	0 %	0 %	75 %	25 %	46255111
86	NC_005838	TGCG	2	8	37417	37424	0 %	25 %	50 %	25 %	46255111
87	NC_005838	CCTC	2	8	37528	37535	0 %	25 %	0 %	75 %	46255112
88	NC_005838	TCCT	2	8	37644	37651	0 %	50 %	0 %	50 %	46255112
89	NC_005838	CCAG	2	8	39538	39545	25 %	0 %	25 %	50 %	46255113
90	NC_005838	GGGC	2	8	39623	39630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005838	GGAG	2	8	39823	39830	25 %	0 %	75 %	0 %	46255114
92	NC_005838	CCGC	2	8	39931	39938	0 %	0 %	25 %	75 %	46255114
93	NC_005838	CCTC	2	8	40680	40687	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_005838	GGCC	2	8	40752	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	46255115
95	NC_005838	CGGG	2	8	41065	41072	0 %	0 %	75 %	25 %	46255115
96	NC_005838	AAGG	2	8	41317	41324	50 %	0 %	50 %	0 %	46255115
97	NC_005838	CCTC	2	8	41578	41585	0 %	25 %	0 %	75 %	46255116
98	NC_005838	GAGG	2	8	41929	41936	25 %	0 %	75 %	0 %	46255116
99	NC_005838	GGGC	2	8	42051	42058	0 %	0 %	75 %	25 %	46255116
100	NC_005838	GGCG	2	8	42371	42378	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
101	NC_005838	AGGG	2	8	42940	42947	25 %	0 %	75 %	0 %	46255117
102	NC_005838	GGGC	2	8	43004	43011	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
103	NC_005838	CGGG	2	8	43203	43210	0 %	0 %	75 %	25 %	46255117
104	NC_005838	CACC	2	8	43293	43300	25 %	0 %	0 %	75 %	46255117
105	NC_005838	AGGG	2	8	43318	43325	25 %	0 %	75 %	0 %	46255117
106	NC_005838	GGGT	2	8	43494	43501	0 %	25 %	75 %	0 %	46255118
107	NC_005838	GCCC	2	8	43524	43531	0 %	0 %	25 %	75 %	46255118
108	NC_005838	CCTC	2	8	43579	43586	0 %	25 %	0 %	75 %	46255118
109	NC_005838	CCTC	2	8	43915	43922	0 %	25 %	0 %	75 %	46255118
110	NC_005838	GCCC	2	8	43965	43972	0 %	0 %	25 %	75 %	46255118
111	NC_005838	GCCC	2	8	44687	44694	0 %	0 %	25 %	75 %	46255118
112	NC_005838	CGGG	2	8	45232	45239	0 %	0 %	75 %	25 %	46255119
113	NC_005838	TGGG	2	8	45529	45536	0 %	25 %	75 %	0 %	46255119
114	NC_005838	GGCT	2	8	45850	45857	0 %	25 %	50 %	25 %	46255119
115	NC_005838	GCGG	2	8	46017	46024	0 %	0 %	75 %	25 %	46255119
116	NC_005838	CGGG	2	8	46038	46045	0 %	0 %	75 %	25 %	46255119
117	NC_005838	CTGG	2	8	46047	46054	0 %	25 %	50 %	25 %	46255119
118	NC_005838	GCCC	2	8	46288	46295	0 %	0 %	25 %	75 %	46255120
119	NC_005838	CGGG	2	8	47151	47158	0 %	0 %	75 %	25 %	46255121
120	NC_005838	CGGG	2	8	47619	47626	0 %	0 %	75 %	25 %	46255122
121	NC_005838	GCCT	2	8	47734	47741	0 %	25 %	25 %	50 %	46255122
122	NC_005838	CGCC	2	8	48230	48237	0 %	0 %	25 %	75 %	46255123
123	NC_005838	CCTG	2	8	50286	50293	0 %	25 %	25 %	50 %	46255126
124	NC_005838	TTCC	2	8	50665	50672	0 %	50 %	0 %	50 %	46255126
125	NC_005838	CGGG	2	8	51053	51060	0 %	0 %	75 %	25 %	46255127
126	NC_005838	CAGC	2	8	51363	51370	25 %	0 %	25 %	50 %	46255127
127	NC_005838	GACC	2	8	51961	51968	25 %	0 %	25 %	50 %	46255128
128	NC_005838	GCGG	2	8	52216	52223	0 %	0 %	75 %	25 %	46255128
129	NC_005838	GGAG	2	8	53208	53215	25 %	0 %	75 %	0 %	46255129
130	NC_005838	GTGG	2	8	53223	53230	0 %	25 %	75 %	0 %	46255129
131	NC_005838	GGGC	2	8	53784	53791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005838	GCCC	2	8	53907	53914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_005838	GAGG	2	8	53969	53976	25 %	0 %	75 %	0 %	46255130
134	NC_005838	CTTC	2	8	54053	54060	0 %	50 %	0 %	50 %	46255130
135	NC_005838	CGGG	2	8	54371	54378	0 %	0 %	75 %	25 %	46255130
136	NC_005838	ACCT	2	8	55121	55128	25 %	25 %	0 %	50 %	46255130
137	NC_005838	GGGC	2	8	55608	55615	0 %	0 %	75 %	25 %	46255131
138	NC_005838	GTGG	2	8	56150	56157	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
139	NC_005838	TGGG	2	8	56310	56317	0 %	25 %	75 %	0 %	46255132
140	NC_005838	ACCC	2	8	56397	56404	25 %	0 %	0 %	75 %	46255132
141	NC_005838	CCTC	2	8	56616	56623	0 %	25 %	0 %	75 %	46255133
142	NC_005838	AGGG	2	8	56981	56988	25 %	0 %	75 %	0 %	46255133
143	NC_005838	GCCC	2	8	57421	57428	0 %	0 %	25 %	75 %	46255133
144	NC_005838	AGAC	2	8	57537	57544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_005838	GCAG	2	8	58514	58521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_005838	GAAG	2	8	58556	58563	50 %	0 %	50 %	0 %	46255135
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